EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-11217 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr3:138519100-138522350 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:138521077-138521088TTTTATTGCTT-6.32
CREB3MA0638.1chr3:138519156-138519170TGGTGACGTGGAAC-6.75
Foxd3MA0041.1chr3:138520584-138520596GTTTGTTTGTTT+6.32
RFX1MA0509.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.02
RFX1MA0509.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.03
RFX2MA0600.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.39
RFX2MA0600.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.4
RFX3MA0798.1chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.06
RFX3MA0798.1chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.46
RFX4MA0799.1chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.32
RFX5MA0510.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.35
RFX5MA0510.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.39
ZNF740MA0753.2chr3:138519450-138519463CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:138519451-138519464CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:138519452-138519465CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
TTTCTGCCTT GAAGCCAAAC TTGAGGCCCA TGGAAAGAGT CTCCAGACCA TGAGTATGGT 60
GACGTGGAAC TCTGTCTCAA TCCCCTTCAC CACCGACAAA CCTAGGCCCA TTTACCTAAG 120
GGTCCATAGC TGTCACCGTT CACCCTTCTG CTTGTTGTCA CAAAGTCCTC TGGCCTTATG 180
GCTTCTCATA GTCTTCGCGC AGATTTTCCT GCTCCTTCCC GCTTTGGCTG GTGTCTTTCT 240
CACCAGGATG GCTGCAATGG CCTCCCAGCT AGCCTAACTA CTAACAGCTT GGCCTCTTTC 300
CCTTTGTTCT CTGTACTGTA GTGAATAAGT TGTCCAAGCT GCAAACCTAG CCCCCCCCCC 360
CCCCCGTCCT GCTTGGAGCT CTCACTTGGT CTCCCATGGC TTGGTGGTCC CTGGGTGTAC 420
ACACCACACA TGGTGTGCTA ACCATGCCCT AGCTTAACCC TCTGGCCTCT AGGTTCTCAA 480
GCTTAAAACA TCACCTGCCT GGGATTGAAG AGATGGCTCA GCTGTTAACA GCACCTCTTG 540
TTCTTACAGA AGACTCAGGT TTGCTTTCCA GTATCTTCCT AGTACCTTGT AACCCAGTTC 600
TAGGTGCCTC CTTCTGTCCT TTCTGGACAC AAGGCACACA TATGACACGC TCGTACCTGT 660
AGGCAAAGCA CTCATTCACA TAAAATAAAA ACCAACCTTT TTCTTTAAAA AAGCCACGCA 720
TCTCGGTGAC TGTGCAGGCA GGTTACGGAG AGAGCTGGCT GCCTTCAGCC AGTTTTCATG 780
GGGCGGGATG AGGGATGCCT GAGATGGTGC ATTTCTGATA AGTCCCCTGG TGCAGAGCCA 840
TCCTGTGAGG ACCACTGCTG GCCTGAGCCT TGTCGCACGC ACGCATACTT GCAGACCCCT 900
CAAGGGACCC ACCATGCCAC ACTTTGATCC TTCTGCATCT ACTGTTGCCT GTGCAGGAGT 960
GAGGCTCCCT TTGTCTCCCC TTTCAAACAC AGCTAGAATG TTGCTTCCTA GGAAGTTTCC 1020
TCTGTCAGCA CCCCCACCCC AATGCCTCTG TTTCTATGGC AACTTGTCTA TGCCTCCAGG 1080
AAGACTCCAT TCCCTGCACC TAAGTTGTGA TTTTATTTAT GTGCCCCCAT TAGCTCTCTA 1140
ATAAAAGACA TCATCTGTTG TTGTTTTTTT CCCTTTTGGG GGAGGGGCGG GCAAGGAGGA 1200
TGGCATTCAA GACAGGGTTT CCCTGTATAG CCTTGGCTGT TCTGGAACTG GCATTGTAGA 1260
CCAGGTTGGC CTGGAACTCA GAGATTCATC TGCCCCTGCC TCTAAGTGCT GGAATTAAAG 1320
GTGTGTGCCA CCCCTGCCCG GCTTTCTCAT TCTCCTTTCT ATCCCTGGCA CCTAGCTCCG 1380
TGCCTGCTCA GTCCTGAACA TATGAAACAT GTTGTATGAT TTAATCCTTC TTCCACCATT 1440
ACAAAGAAAA ATCCTATTTT GAATTGTATT TGTGTTAACT ATTTGTTTGT TTGTTTTAGC 1500
TCTTAAAACA TGTCTGTGGT ATTTTGCTTT TAAGTTAACA AGATCTTTGA GTACAAAAGC 1560
TGTGCATCTA AGAGTACTAA ACTTCTAGAC CGAGTTGGTG AGTGCTCTGC ATCTTGCTGC 1620
TTAACTCAAA CAGTGAGAGC CTCTTCCCAC AGAGGTTCAT GCTTGCCTAC AGATAACTGA 1680
CTTTTTACGC CTGTAGTCTG ACATACTTCC AGTCCATTTC AGCCTTCAGT GCGCCCCTCT 1740
GGTGTGTTTT CAGCCTTGGC TTTGTCTAAT GGCTGGGGGA GGGGTAAGCA ATAGAGCAGC 1800
CCATCAGGGC AAGCCTTTTT TAAATTTTAT TTATTTATTT TTTTAACTGT AAGACAAGCA 1860
AAGATTAGTG AGCTGTAAGC TTGCAACTTC CACGTTTCTA TCCAGAAGTG GATAGCTAAT 1920
CCCTCATGTT CCTTTTTTAT ATGCTTGCAT TGCCTGGGTA ATTTCCAAGA ATATGGATTT 1980
TATTGCTTGC GTAGCCGTCC CCCTCCCCAT CTCAGATTAC AAGCTCTTGC TCAAAATGTC 2040
AAGGTCCAAG TTCTAACAAA GAGCTCTCTA GACCAGACTG CCTCAGACTG TGGGCATTTC 2100
TTTAAGGCCT TCTCCTGGAA CAGTGTGCAT TCAAAGGGAA AAGCCCTTTC ATCGTCTCTG 2160
GGAAGATACT GCGGGCTCTT GGTGCTACGC AGTTCCAAAG AAGTCCCCCT CCTGGCCCCT 2220
TTTTCCTTTC CCAGGCTCTG TGTGATGGAC TGCTCCAGAT CCTGTTCTTG GCTTCGAGCC 2280
CCAGCAGTCT GTGTCCGCAA TCCCATAAAC AAGCAGAGGA CTAGCCCTTC AGGTGGATGG 2340
TGGAGACTGA ATTAAGTATT CTTGCCTCTC GTGCCCGGTC ACAACAGCTG GCCCAACAGT 2400
TTAGAACATC TGGGGTTTTC ATTGAGCTGC CCTGAAAAGA GATCACAGCT TCGTACAAGT 2460
CAGAGGAAGC CCCCAGCACT GTGGTTGTAG GCTTCTCTGA ATGTTTTGCT CATGCAGCAT 2520
GAGAATTATG TGGATCCCCT AAAACTGTGG GTGTAGGTAT TTTATAGCCA TTCATGTAAA 2580
GGAGCAGAAT AGATCTCAAA CTAGAGTCCG TTAGTGTCTC TTAAATATAT AACTATTTGG 2640
AGCACAGTTC TGGAAGGATG CTCAAGCCGG TGACAGAAGA AGGAGAATTA AACAGCACTC 2700
AGGGGCCGTC CGTCACCTTT GCTTTATCCA TGCACGTGCT CAGTGATTAG TATAGGCCCT 2760
GACTGTCCTA CTGTCTGACG TGAGGTGTTG TCATTCTTTC CAGTCCTGTG TACACATGTA 2820
GGCAGGACAA GGCCATACCT GGTATGGCAG GGAAGCTCTG AGGACAAGGG GGCCTGAGTT 2880
CATCTTCTAC CAGGGCTTTT CTGACTCTGA AAGGGGAGCT GCCTGTTAAG GTGGCCACTG 2940
TGGGAGGAGT TGGGGAGCAG GCAGGGTAAT GTCTGAGGAG CGATGGGGGG CAGGGAATAA 3000
TCTGCACAGA CTCCTTGCTT ACAGTTGGCT TTCATGTGGT TTCGTGGACC CCACAGTTTG 3060
CAGCAGTTAG TAACATCAGT CATTGGTTAG ATCAGGCAAG GCCTGCAGGC TCTGGGAAGC 3120
CAAAGAACCC TTCAGGGATT CCTGCCCCAT CTGAGGACAC AGTGTAGTCT TCTCAGTGGC 3180
CTGTGCAGCC TGACACAGCC TGGCTACTGT GAGCCTCTGA GCTGTGCTTC TCCGTTCCTG 3240
GCACTTTGTG 3250