EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-11067 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr3:118377480-118379580 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr3:118379492-118379508ACTTGTTTACTTAGGC-6.5
FOXD2MA0847.2chr3:118379494-118379507TTGTTTACTTAGG-6.78
Foxa2MA0047.2chr3:118379495-118379507TGTTTACTTAGG+7.22
HNF1AMA0046.2chr3:118377849-118377864AATTAATAATTAATT-6.07
HNF1AMA0046.2chr3:118377849-118377864AATTAATAATTAATT+6.26
Lhx3MA0135.1chr3:118377852-118377865TAATAATTAATTT-6.25
MNX1MA0707.1chr3:118378572-118378582GGTAATTAAA+6.02
POU4F1MA0790.1chr3:118377850-118377864ATTAATAATTAATT+6.36
POU4F3MA0791.1chr3:118377850-118377866ATTAATAATTAATTTG+6.4
POU4F3MA0791.1chr3:118377847-118377863CTAATTAATAATTAAT-6.68
RFX1MA0509.2chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA-6.04
RFX1MA0509.2chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA+6.06
RFX2MA0600.2chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA+6.24
RFX2MA0600.2chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA-6.36
RFX3MA0798.1chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA+6.28
RFX3MA0798.1chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA-6.39
RFX4MA0799.1chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA-6.16
RFX5MA0510.2chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA+6.14
RFX5MA0510.2chr3:118377498-118377514GGTCACCATAGCAACA-6.36
RUNX1MA0002.2chr3:118379137-118379148AAACCACAGAG-6.14
Enhancer Sequence
AGCAGTGAGG TAAGTCTGGG TCACCATAGC AACAGTCACA GATGTGGTAA AGAAAAAGTC 60
ATTCTTCATT ATTGGGGGAA CAAATGAGTT CATCGCCAGC ATTCAGCTCT GTTCTCTAAG 120
GTATTAATTT GTCAGTGGAG AAACTTCCCT TGAGGCTGTA CTTTTGGTTT TGAAGCTGCA 180
TAAATGTTAA GCCTCAGTGC ACAGTAAAAA ATGTAAATGT TTAATTTGTT ACTTAAAATG 240
CTTACGGGGT GTCTTGTTTT ATATTTAGAC TAAGTTGTGG GATTGAATGG AAATATTGTT 300
CATCTAAATT CTGCCTGTGA GTTTAAAATA AACATTGTGT AAAGGTAGTC TAGCTGAGTA 360
CTATTTCCTA ATTAATAATT AATTTGAAAA AGGTTTCTTT TTTCTTCATT TCATCTTCTG 420
TTTTATTTCA TTTAAAAAGT ATTTTAAAGT GACTTACATT ATCTCACAAT TCCAAAACAT 480
AGAGCTACTT CCACTTGCAT GCAAAGCCCT ATGAATAACC TTATTTTATT CACTTAACAT 540
TTGTATTTTT ATTTTCTCAA CACTCACTCC AGCCTTGATA TCATTTTTTA AATAACCTTT 600
AATGAAGCAT CCTTTAAATT CATTTGATCA AAATCAAAGA AAATGTGACC AGGCATTAAC 660
AATGTGTGAG CACTAAGCTT GTGATCCTTA GAACAAGGAA GTCACCAACA ACAGTAGCAC 720
TAAAAGTTCC CAGCTTGAAC CATACAGCAG CAGTCTTCTG CATTTATACA ATGCAGTGGT 780
ATTTTCTTCT TGTTGTTGTT GTACTCATAA AACTAACGTT ACTTTAAAAA AATATCTTAA 840
AGTTCGTTAT TTAAGATGGC TTTAAGATAT AGAAAGTTAA AATACGGGAA ACAGGAAATC 900
TAACAGACTG GCTGCTTGCA GGTTTAAACA CAATTTTGTT ATTGCTTGCA CACAGCTACC 960
ATATACTTTA GTTTAGAAGC CACTCTCATT TAGCAACATC CCTTTTACCA TGCAAGCAGC 1020
AGGAGAAAGT AATTAAATTT AATAGAAGCT GCCCTCATTT TGAAGCCACT TCTATTTAAA 1080
ACCACAGGGG GAGGTAATTA AATTTACAGG AAACAGTAGC TTCTACACAA AGATACATGG 1140
TACTTCTGTA TAGATGATTA TGATGTCACA AAAAGGGGAA TAATATATTA CTAGTGTGGA 1200
GGAGAAATTA CCAGCTGGAG CAAGGAAACC TATTTTATTG TTAATGCCTT TACTAATAAA 1260
AAAGATGGAA AAATAAAACT GAGTGTGCAA TCGAGAATTT GTGTCTGTAT AAAATACACT 1320
GACAGTCTAA GAAAGTTTGT TATCCAAAAT AATTTTAAAT TAAAAATTAA AAACAAATTA 1380
TACTGTAGAA AAGTCTAGGA CAGGAATTAT GAATGAATTC CTGTTTTTAA ATATGTCCTG 1440
GATTCTGTAC TGAAAACCAC GGTGCCACTA AAAATTGAAC ATGCCATTTA TGTAGAGTTT 1500
ATAATTTTGA ATACATGAAA TGTGCATACT AATATCTATT TAGAAACCAA TTATTTTGGC 1560
AATTTAATTT CTATTCATCT TGAAATAAAC ACGTTGAAAA CAGGAAGACA AAGAGGATGC 1620
CAGCTCTCAT GCTTTTGAAT AAAAGAACTG AAGACCAAAA CCACAGAGAG AACTGAAAAG 1680
GGCCATGTGA ATGGATATGG ATGTGAATGG GGAAACACAG TGAACACAAG GACTTGTGAG 1740
CATTGGAGGA GATCTGTCCT CCAGAAAAAC CAAGTCGAGA ATTGTAGGAG AGCTGTAGAT 1800
AAAAAAGATC ATTATTAAAT TCTGCCAATT TAAAAAATCA CTACTATTTA TGCCATACAG 1860
GGAGATCTTG CTCGTAAAAT CAGAATGAAT GGATGGGGGT GGGAACACAG CATTAATTAC 1920
GTAGTTGGGG TGACCTCTGA CTACCCATGC AGTGAGTAGG GCAGCAGTCC AGATAATTCA 1980
ATTCAGAATT TAATCACATG GTGGTGAAAT GCACTTGTTT ACTTAGGCTG ACTATTTTAT 2040
GTGTCCACCT ACACATATGT ATGCACACAC ATTCATGTCT GGACTCACCA GACGCAGTGA 2100