EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-10284 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr3:8985640-8990680 
TF binding sites/motifs
Number: 34             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:8989396-8989413TTGTATTAATTAATTCT-6.07
FOXA1MA0148.4chr3:8989173-8989189GCCTAAGTAAATAAAC+7.18
GabpaMA0062.2chr3:8987511-8987522CCGGAAGTGAC+6.14
GabpaMA0062.2chr3:8987530-8987541CCGGAAGTGAC+6.14
MITFMA0620.2chr3:8988303-8988321CAAGGTCACGTGAGCAGA+6.07
MITFMA0620.2chr3:8988303-8988321CAAGGTCACGTGAGCAGA-6.07
Myod1MA0499.1chr3:8986990-8987003AGGAACAGCTGCG-6.71
NR2C2MA0504.1chr3:8986069-8986084GCAGGGCAAAGGTCA+6.4
NR2F1MA0017.2chr3:8986075-8986088CAAAGGTCACAAG+6.29
Nr2f6MA0677.1chr3:8986070-8986084CAGGGCAAAGGTCA+6.45
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POU3F1MA0786.1chr3:8989441-8989453AAATTTGCATAA-6.62
POU3F2MA0787.1chr3:8989441-8989453AAATTTGCATAA-6.32
POU3F3MA0788.1chr3:8989441-8989454AAATTTGCATAAA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:8989400-8989410ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:8989400-8989410ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:8986217-8986237ACACACCACACCCCCCACAC+6.07
RREB1MA0073.1chr3:8986186-8986206CACCACACCACACACACACA+6.11
RREB1MA0073.1chr3:8986265-8986285CACCACACCACACACACACA+6.11
RxraMA0512.2chr3:8986070-8986084CAGGGCAAAGGTCA+6.09
SOX10MA0442.2chr3:8987200-8987211GTCTTTGTTTT-6.14
USF2MA0526.2chr3:8988303-8988319CAAGGTCACGTGAGCA+6.12
ZNF263MA0528.1chr3:8988163-8988184GGAGAAAGGGGAGAGAGAGAA+6.01
ZNF263MA0528.1chr3:8988209-8988230AAGGGAAGGAGGGGAAGGGGA+6.14
ZNF263MA0528.1chr3:8988136-8988157GAAGAAAGGGGAGAAAGGGGA+6.1
ZNF263MA0528.1chr3:8988210-8988231AGGGAAGGAGGGGAAGGGGAA+6.28
ZNF263MA0528.1chr3:8988142-8988163AGGGGAGAAAGGGGAGAAAGG+6.38
ZNF263MA0528.1chr3:8988151-8988172AGGGGAGAAAGGGGAGAAAGG+6.38
ZNF263MA0528.1chr3:8988160-8988181AGGGGAGAAAGGGGAGAGAGA+6.3
ZNF263MA0528.1chr3:8988145-8988166GGAGAAAGGGGAGAAAGGGGA+6.52
ZNF263MA0528.1chr3:8988154-8988175GGAGAAAGGGGAGAAAGGGGA+6.52
ZNF263MA0528.1chr3:8988213-8988234GAAGGAGGGGAAGGGGAAAGG+7.68
ZNF740MA0753.2chr3:8986222-8986235CCACACCCCCCAC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:8990066-8990079CCCCCCCCCCCAC+6.92
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07318chr3:8987498-8989299Intestine
mSE_07318chr3:8989431-8991146Intestine
mSE_10456chr3:8987662-8989294Embryonic_stem_cells
mSE_10456chr3:8989519-8991142Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TGGGTCCTCT CTCTATGCAT GGGTCCTCTA AGTTAGATGA TGCTGCAGAT GCCAGCAAGG 60
GACAGGTAAA TGGTTGGCTG CTCCTGTAAC ACATGGAAAG CTCTGGATGG GAGATTAACA 120
TTCCCTAGTG GCTACTGAGT CGGGAAGGAT TCCCCTCCTA ACTGACAACA GTTCAACTGG 180
TCCTCCTGAT GTCTTCTGAA GAGCAAGCAC ATGACAAATG GCTAACTGTA ACAGGAAGAA 240
GGGCCAGCAA CCATGGCGAG GGGAGGCTGA ACAGTACAGG CCTTGTTTAA GAACAGCTAT 300
TTAGAATGTC TTTTGTTGTT CTGTTTGTTG AAGCTTTGAA TTACAGGCAG CAGCAAGCAG 360
CTGGCTCCCA GTCCCCGCTG CCAGTCCCAG CTGCCGTCCT TGCACTTTCT GGAGCTGTGT 420
TGTGGGGCCG CAGGGCAAAG GTCACAAGAG CAGGAGACTT GAGGGAGAAG TAATGAGCCT 480
TACAGAGGTA CCCGAAAATC CTGAGCAAGC AGGTTCAGCA CAGCAGAGCC TAAGACCACA 540
CACACACACC ACACCACACA CACACACACA CACACACACA CACCACACCC CCCACACACA 600
CACATCACAC ACACATACAC ACACACACCA CACCACACAC ACACATCACA TACCACACAC 660
ACACACACAC ACACACCACA CCACACACAC ATCACACACA CAAGTACACA CACCACACCC 720
CACACACACA TCACACACAC AAGTACACAC ACACACCACA CACACAAATA CACACACACC 780
ACATGCCACA CACACACACA CACACCCCAC ATACCACACA CACACACACA ACAAAACACC 840
ATACACACAC ACACAGTTTC CTCCATTAAC TTCACAGCCA GAAATGGGAG AGGGGAAAAA 900
AAAGAAATCA AACTTGGGCC CCTCCCACTG CCTGCACCAC CATGCCAGGT TTATATGGTG 960
CTAGGGATCG AACTTGGGTT CTCATGCATG CTAGCATCTG AGCTACATCC CCAGCCCTGA 1020
AGCATTTAAA AAGTGAAAAC CGAATTGATC TAGACCTCAG GGGTGCATGG CATTACCACC 1080
GACACCACAG GCAAGGACTT TAAAAGCTGG TTTCTAGAAC AACCTGGATA CCCTGCTTCA 1140
CTCTCTGATA AAGAACAAGC AAAGTTTCTC TCGAAAAAGA ACTCTGCAGA TTCCACTGGG 1200
AAAAAGCTAA AACCATTTTC ATGTCTGGCT TTGGCCATAT CAGTGGTTGG CGTTCAACCT 1260
TTTCTTCTCG TGGGTACGGG AGGCCATCGC CGCCCACTTG TACTCTGACA CAGCAAAGGA 1320
GCCCTGCTTG AAGCCACAGT CAAACTGTAG AGGAACAGCT GCGAGTCACT TTCCAAGCCT 1380
CGAGTCTTCA CTCTACAGAA ATATATATAA TTCTCTTACA GCCTAAGAGC AAACACAGAG 1440
CTCAACTCTC AACAACAGCA GTAGAAGGAT TATTCTTTGT CTCTACAGAC TAGATCTAAA 1500
ACTTAAGAAA AACAGTGCAA GTGATATTTT TTAAGGCATG ACAAAGAAAA ATTCCAGGAA 1560
GTCTTTGTTT TAGACCCAGC TATTGCATAA GGCCAGATCA AACAGAAATG GAGTCACTGG 1620
CCTTAAGTGC CATGCAGTCA AACTGAAAAA TTAAGGGGGC TGGGTGTCCA AACAGTGCCC 1680
ATTGGAATGT CTGTTCCATT TTGTTTTTGG GAAATCAAAG TCAATTAGAG TTATGTTTGC 1740
TGCTATTTTG TCTTCTGAAA GGTGCACACA CCAAATGATC TTTATATGAT TTATCCATCC 1800
TTACGGAGTT AACGGCAAGT AAAAAGCATG GCACCTAGCA TGATGTCAGA CGCCAGACAT 1860
GATGCCAGAC GCCGGAAGTG ACGGCAGACG CCGGAAGTGA CATCCTTGTA TCAGTACTTT 1920
GAGGTGATGC CAAGTCTCCA GGCAAGCAGC TTTCTGTATA AACAAGAACC CTGTGTCTCA 1980
GTTACTTCAA AGCAGAATGC TGCAACTCTG GGGTTTCTGG GGCACCTTCT GAAACATATC 2040
TGATTAGCAT TAATAGTTTA AAGAAGGAAA AAACAAAATC TTCCCTGTCA ACCTGACACA 2100
CACAAATCTG GACGTATCTG GGAAGTAGGA TTGTGAGTTG AGTTGTGGCT ATCAAACTTG 2160
CCTATAGTCA AGTCTGTGGG TCATTTTCTT AGTGACTGAT AGGGGAGATC TCCTAGGTAG 2220
GCGGGCTTGG GTGCATAGAG CATGCTGAGT GAGATGATAA ACATCACTCC TCCCCCAGTC 2280
TCTGCTTCAG TTCCTGCTTC CAGGTTCCTG CCTCGACTTT CCTCAGTGAT AAACGTGGAA 2340
ATGTAAGATA AAATAAACTG TCAGGTGTGG AGGACCACAT CTTTAATCCC AGCATTTAGG 2400
AGGCAGACAC AGAATGTCTG GGAATTCAAG AACCAGCCTG GTCTATAGAA TTCCAGGACA 2460
GCCAGGACTA TGTAGCGACC CTGTCTCGAG AAAAAGGAAG AAAGGGGAGA AAGGGGAGAA 2520
AGGGGAGAAA GGGGAGAGAG AGAAAGAGAG AGAGAGTGAG AGAGAGAGAA AGGGAAGGAG 2580
GGGAAGGGGA AAGGAAAACC TTTTGTTAGA GAAGCAGGGA AGAGAACAGC CTACCGAAGT 2640
TGGATGCACC CTAACATAAC TGACAAGGTC ACGTGAGCAG AAATAAGCCA CAGAAGCACC 2700
AAGGCAGGAA TACAAACCTT TTATGAAAAT AGCCGGGCTG GCAAGATGGC TTAGTGGTTA 2760
AGACTGCTCT TCCGAAGGTC CCGAGTTCAA ATCCCAGCAA CCACATGGTG GCTCACAACC 2820
ATCCGTAACG AAATCTGATG CCCTCTCCTG GAGTGTCTAA AGACAGCTAC AGTGTACTTA 2880
CATATAATAA ATAAATAAAT AAATCTTTAA AAAAAAAAGA AAGAAAGAAA ATAGCCTTCC 2940
TCAACACCAT TCTTCAAAAG AATGTTCATC ATACTGCAGA CCTCAGAGGA TGTCAGAGGG 3000
TGTCTTAGGA GACAAAAGGC AAGCACAAGC AGGTTCCAGG TTCCCTTTGA ACGCAGGAAA 3060
TCTGATCCTT GAAGGACGGC CAAACAAAGC ACCCAGTGTT TCAGGGAAAG GCCTGTGATT 3120
AAGAACTTGA ACATTGACCT GACAGGGTGT GTGCAGGAGA GGGAGAGAAA TGTAGTGAGT 3180
GGAGAAAATG ACTTTTATTA GCATGGTCTG AAGCTTCTGT TAGCACCTCT ACCCCTTGCT 3240
GTACACGTAC AGCCAACCCA AGAGTAGGAG AAGTGTTTAA GCATGCTGAG GTTTCAGTAA 3300
GACACTTAAG GCTGTGAGTT GAAGCAGGAA GGTCCCCCAC CAGCTTCGTT TTAAATGCCT 3360
GCTCCCAGTC TGTGACTCTA TTTTAAAGGG CTGTAGAAAC CTTAGAAGGT GACCTTGCTG 3420
GCAGAAGTAG GCCATCTGGT TCCTGCCTCA CTTCCTCCTC CTGATAGAGG AGCCTGCCTG 3480
CCCCTGTCCC TCGGCTCCCC TACAGGAAGG ATCAAAATGC TCTGAAACTG TGAGCCTAAG 3540
TAAATAAACA AACTTTCTTC ATGTAAGTTG ACTCTGCCAA GCATTTTGGC CACAGTGGCA 3600
GAAAAGTAAA CTGATATGCT TAATTAATTG ATAAAATATG AAATTTTTAA TTTTATTCAC 3660
TTATATATAA ACATAAGACT ATATTGTAAA TTACATATAA ATATATAAAT TTTATATATT 3720
GCATATAATA AAATACAATG TTATACATAA AATATATTGT ATTAATTAAT TCTAAAATTA 3780
ATATTCTTGA TTTATTTAAA TAAATTTGCA TAAATAAAGG TTTTAAAATA TGATTTCCTA 3840
TTAAATGCAT TATTGCTATG CTTTCCTATC TGTTTCTATA CAACAGATAC AGATAACTCA 3900
TGGTGAAAAC GGAAAAGAGG TGAAGAGTAA CTTCCTAGAA GCAAGCAGAT CAGGAGTTCA 3960
AGTCCAGCCA GAGCTATATA ATGAATCTGA GGCCAGATTT GACTCTATAA GACATCACCA 4020
CCTCCACCAC CACCGTAACC AGCACTAACA CACAAAAAAA TACATGAAAT GCAACTGCTT 4080
TGATTTTCTA ATGCCCACAA GGTCAGCCAT CCTAACATGG AAGGTGAAAA CTGCTCAATG 4140
GTAGAACCAG CAGCAAGTTT GCTGTCTCCC TAGGGAAAAT CCTTCCTCAG CAGCTGGAGA 4200
GACGCACAGA GCCTCCTCTG CACTGGCCCA TCCTTTTTGC CCTTTCCCCA CTCCTAGGCC 4260
TCAGAACTTC TCTCTCCAAA ACAGCACCAG CAAAATTTGC TCCACTGGTA ACATTAATAG 4320
ATAACTCAGA ATGCCAAGGC CAGATCCCTT AAGATTCGGT TTCTGGACTG GGAGATGCCT 4380
GGGTCAGCAA AGGGCGTGCC CTGGCAGTCC GAGGATCTGA GTAAGACCCC CCCCCCCACT 4440
CTGATGTAAA AAGCTGGGTG GGCATGCTAG CGCATACATG CTAGCATACA TGCTAGCGCA 4500
TACATGCAAC CCCATCTGTG GGAGGTGGAA CCAGGCAGAT CCCGAGACTC ACTGGCCAAC 4560
CAGCTCAGCC TGTTTGGTGA GCTCCAGGCC AGTGAAAGAC ATCCCCAAAA CACCCAGATG 4620
GCCAGTGCAG AGGCAGCAAG AGCTCAGGCT GGCCTCTGCC TCCACGTGTG CACATACACA 4680
CCTTGAACAC ATGAACACAC ATTGCTGTTT TTTAAGTAAA CCAGTTTCAT TTTGGCAACC 4740
CCATTTAGAC AAAGGGTTCC GACATCAATA GCAGGTGATA AAATACTGCA GTCTTACTTT 4800
CTGATGTTGG AGAACTCCTT ACACCCTGTA AACTTTAAAC TCGGCCACCA GTAAACCGGA 4860
AAAGATCACG GGACAGAAAC TAGGACTTTG AAAGCATTTG ATAAAAGTTA GCATCATCAG 4920
CAAATAAAAA TGCTTTCTGT TCTACACAGT ACTGACTGAA AAGAATTAAA AACTTCAAAT 4980
TCTCCAGACA CTCCAGAGTC CAAGCTGTCC CCTGTGCACT GTCTGAGCCC CCTCCCACCA 5040