EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-04389 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr13:53235620-53239420 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr13:53235864-53235875TCAAGGTCAAT+6.02
EsrraMA0592.2chr13:53235863-53235874TTCAAGGTCAA+6.14
HNF4GMA0484.1chr13:53236806-53236821TGGACTTTGAACATT-6.07
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr13:53238552-53238567GGGGTCACAAGGTCA+6.65
Nr5a2MA0505.1chr13:53235860-53235875GGGTTCAAGGTCAAT+6.16
RARAMA0729.1chr13:53238552-53238570GGGGTCACAAGGTCATGG+6.97
RREB1MA0073.1chr13:53238452-53238472CACCCCCCCACCCCACCCCA+6.17
RREB1MA0073.1chr13:53238462-53238482CCCCACCCCACCCCCGCCAC+6.23
RREB1MA0073.1chr13:53238456-53238476CCCCCACCCCACCCCACCCC+6.74
RREB1MA0073.1chr13:53238457-53238477CCCCACCCCACCCCACCCCC+7.67
RarbMA0857.1chr13:53238551-53238567TGGGGTCACAAGGTCA+6.52
Enhancer Sequence
ATTAAAGGAT TTGGAGGTCA GATCCCATCC AGCTAAGTTT AGATCCAGGC ATGGTGGTAT 60
ATACCTTTAA TCCCAGAAGA ACAAAGCCAA ACAGATCTCT GAGTTCAAGG CTAATCTGGG 120
GAAACAAAAC AAAACAAAAC AAAACAAAAC AGGTACTGGG TGAAGAAAAG CTTAAATCCA 180
GGCATGGTGG TACACACCTT TAATCCCAGC ATGACAGGAG ACAGAGCTAT GCAGATCTCT 240
GGGTTCAAGG TCAATCTATA GAACAAGTTC CAGGAAAACC AAGCTTGAGC AGTGAGGGAG 300
TTGGAAAACA GAAAGCTGGT AATCAGAATA AGGGAGCTCT GGCTATAGAG TGAAAAATAG 360
AAGGAACTAC TGGGACAATT GATGCTGGCT AGCGGCGATT TAGAAGAGAT CAGTACCACT 420
GAGGTGAAAT CTTCAGGGAA GTGTTTTCTG AGAGCACAGA GAAGCTGTGT TCCAGAGAGA 480
GCCAAGGTTG TAACTCGTGC TGCAGCTGTA CTTGGTAATA TGTAAGAATC ACCCAGGAGG 540
TACTGGTTTT GAAGGCTGAA GGGGTCATGA AGAACAGCTG AGGCTTGCAA CTATGAGAGG 600
CCATGGAAGG CCATTGGTGA AGGTGCAGCC TCAGTTGTAG TTGACAGCCC AAGACTGAAG 660
GGATCTTGAA AAGAAGTTGA GGCTTGGCAC CATGAAGAGA GCCTATGAGA GGCTAGTGGT 720
AAAGCATAGT TGCAGCAGAA GACCTCAGTG TATTGGAGAT GCCAGTTCCA TGGGATGATC 780
ACCAAGAACA GCAGCAGCAG CAGATTGGAT CAACCTGAGT TTAAAGTGGC ACAGAGGGCA 840
GAGCTGGAAA AGTAACGCCA GCCCTTTGGA GAAGGCCAGA ATATCATGTG TAGATCCCTG 900
ACATTGAAAC AAGAAGCTGT AACATTGAAG TTGCCTTGGA GACTCCAAAA TTTTTGAGAT 960
GCCAAAGCCA TAGGATATCT CCTGAGGAAA GCTGCTACCA ACAGGGAGTG GAACCAGCCC 1020
AGGAAAAGAA GTTTGCTGTA GTCAACAAAG ATCAAAAAGC AGTTAGAGAT CTGAAAACTG 1080
CTTTGACATT AGACATGGAG ATGCAGAGTT TGGAGTCTGT CCAGCTGGTG TCTGTCTTGA 1140
TTTGGGGATT ACAGTTAAGT GATTGGACAG ATCTCACAAG ACACTTTGGA CTTTGAACAT 1200
TGTTGATATT GCTATAGACT ATGGGGACTT TGGAAGTTGC ACTAACGGTA CTTTTTGCTA 1260
TGGCTAGATA TGGGTTCCAT AGACTCATGT GTTTAAACAA GCCTATGGGG GCCAAGGAGT 1320
GGAATGTCGT GGTTTGAATA TGCTTGGCTC AGGGAGTGAC ACTATCAAGA GGTGCAACCT 1380
GGTTGGAGTA GGTGTGTCAC TGTGGGCATG GGCTTTAAGG CCCTCATCCT AGCTGCCTGG 1440
AGGTCAGTAT TCTCCTAGGA GCCTTCCGAT GAAGATGTAG AACTCTCAGT TCCTCCTGCA 1500
CCATGCCTCT GGATGCTGCC ATGCTCCAGC CTTGATGATA ATGGACTGAA CCTCTGAACC 1560
CGTAAGCCAG CCCCAATTAA ATGTTGTCCT TATAAGACTT GCCTTGGTCA TGGTGTCTGT 1620
TCACAGCAGT AAAATCGTAC CTAAGACACA TGGACATTCC TTTATTTTAT TAAAAGCTCA 1680
CTTGATTTTT TTATCCTGGC CCATCACCTC TCCTTGGAGG GAATCCTGCG CTATCCAGTT 1740
CCTAGTTCTA GAAGGAGACA CTGAAGCACT TATTCTCCAT CTGGATCTTC TAACCCTGGG 1800
CACTCTCCTC CGCGGTGTCT ACTTTCTGCA GTTGTTCCAC TCCAAATGGT TTGCCTTCAA 1860
CATTTCTAAC TGCTCTTTGG CTAGGACACC TACGTCCTAC TGGTGTCTGT TCTGAAATCC 1920
ACAGACTTAT CAAGTCTGCA GCATGGCCTC AGGGCCACCC TACTCTTCAA CGGGTACCCA 1980
GAATTCAATT CCCTTTCATG GGACTCTTGA ACATGAGGAA CCAGGAAGGT CAGATTGTTC 2040
TCCAAGGCTG CAAATGTAGA GAGCTGCTTA GAACAGCCCT GCCCTGGCAG ACCTGGGCTG 2100
TTCCTTTCAA TCCCTTCCTT TCTCTTTCTG GCTCCTGGGC ATCGCTCCAT TTTGCTGGTA 2160
TGTTTGCCAA AGCATTTACG GCGTTTCCTA ATATTTTTAC CAAGCACGTG CATGTCGCTG 2220
ACCCGAGACA GCTGCCAAGT GAGCTTGGCA CACCATTCTC TCCATCATCG ATTCTCCTGA 2280
GGCCAAACCT GAAAGCAGGC TAGAGAGCAA GTTCCCTGGA GACTGTGCAC CAAACCCCTT 2340
CCCCCTTGGG GTTGAATCTG CAGCCGGCCA GTTAACCTCT CAGCGAAATA TAAGGCTCAC 2400
GCAGATCACT TTCTAAGCTC TCCGTTAGCT TGCAGACATT GCTTTGAGCA GCCTCAAAAC 2460
CTGTAGACAA CTGATCAGGT TATAAGTACC CAGGCAGCAC TGATGGAGAA TTTCATTGAA 2520
GACCTGGCTA GCACAGGCCT TCGATGGCAT GGATAGGAAG AGAAATTCCC CACTTCAATT 2580
CTTCCATATG AGTTCCCCTT CTGCATGAGA CAACCTTACC TGCCCATGCA AGGAGCTTCA 2640
TCTCTGCAGC AGCCTGGTCA GCTCTGTGCA GGGGCTGAGT CCAGACATTA AGAGATCCCA 2700
GAGACTAAAG GAGACTCCCA TCGCCAGAAA ACGGCACCCA TCTGCCCAGC TGCACACAGA 2760
TCAATGATTA ATGATTTTTA TAGCCCAATC AAGTATCCAG ACGGTCACCC ATGTTGTCAA 2820
ATGACTTAGG ACCACCCCCC CACCCCACCC CACCCCCGCC ACCTCCCCCA ACTGGCTTCC 2880
TGATCAGGGC AACCCTGTGT AGGAAAGGAA ATAAAGAAAG CCTTCTGTGC CTGGGGTCAC 2940
AAGGTCATGG GGTTTCGATT GGTGGGAAAC AAAACAGACA ATTTCCTGGA GGGGGCAAGT 3000
GAAAAGGAGA CCCTGAGGGT CGCAGGAGGG AGGTAAAGCT GCCAACTTCA GAGGAAAATA 3060
TTTACAGGTC AATAAACCAG CCAGAGGCCA GAGCAGGGGC CTGGGTTCAG GCTTCCCTGT 3120
GCAGCGTGCA CAGAGCCACT GCTGAAAATG GGGGAAAGAG GAGAGAATGA AAGACCCTGG 3180
GGAAAATAAG AAGACAAACG ATGTTGGGGG TGTGGAGGGC ATGAGAGAGC TTCGTCAGTG 3240
AAGTGCTTGC TCTGAAAGCA AGAGGCCGAG TTCCAGCCAA ACCCCTAGTA CGAGGTGTAG 3300
AGGTATGTGT TTGCAATCCA AGCACTGGCT GGTTCCTGGG GCTCGCTCCT AGCCAGCCCA 3360
GCCAAGCCAG TAATATCCAG GAGAAAGCGA GACTGTCTCA AAAAAGAAAA AACAAGGAAA 3420
ATGATATCTG AGGGACAGAC ACTGAACTTT TCTCTGGGTT CTACACGCAT ACACTTACAT 3480
GTGCATGTAT GATCCCCACA AGTGCTTCTG CATAGGTATG CATGCGAAAA CATGTAAGCA 3540
GGCATACTCT CTCTCTCCTC TTACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 3600
ACACACACAC ACAGAGGAAC CTGAGCGACA GAGGCCACTC AATGGTGTTT GGCTGGTGTT 3660
TTACTTATTT ATTCATTCTT TCACTCAGCT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 3720
TGTGTTTGTG TGCAGTATGT ATTTTACACA GAAGAGTGAG TCCCTAGTGC AGGCATGAAT 3780
CACGTATGTT GCTAAGAACG 3800