EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-00931 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr1:168209640-168213580 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARHL2MA0635.1chr1:168212399-168212409GCTAAACGGT+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:168211182-168211200CCTTCCTTCCGAACTTCC-6.6
LEF1MA0768.1chr1:168211600-168211615AAACCTTTGATGTTC-6.2
RFX1MA0509.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.08
RFX1MA0509.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.1
RFX2MA0600.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.3
RFX2MA0600.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.43
RFX3MA0798.1chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.26
RFX3MA0798.1chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.37
RFX4MA0799.1chr1:168212932-168212948GGTTGCCGTGGTTACC+6.04
RFX4MA0799.1chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6
RFX5MA0510.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA-6.54
RFX5MA0510.2chr1:168210964-168210980AGTTCCCATGGCAACA+6.59
SOX10MA0442.2chr1:168209734-168209745TGCTTTGTTTT-6.02
Tcf7MA0769.1chr1:168211603-168211615CCTTTGATGTTC-6.11
ZNF263MA0528.1chr1:168210015-168210036GCCTCTCCCTCCTGCTCCCTC-6.09
ZNF263MA0528.1chr1:168210874-168210895TCCCCCTCCCCCTCATCTCCC-6.46
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_10800chr1:168209731-168210666Olfactory_bulb
mSE_10800chr1:168210990-168211673Olfactory_bulb
mSE_10800chr1:168211757-168213654Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GCTTTCGGTG ATTTTTTTTT TAATTTCATT TCAAAGGCCC CTGGATTTAA AAATTAATTC 60
TCCACAGAAG GTAATTCCTC AAATCGCCAT TCACTGCTTT GTTTTGGTTT AATATTGTTT 120
CCATCGCAGA AAGAAAAGAT TTTGCTTATT GATCGCACTT TAAACCAAAC AGCAAAGTGG 180
GGAAGAAATT ATCCCTGCTG TCACCTTGAA CTGTCACATT TCCACAGTTA TTTTGATCGC 240
CAGGGATAGA GGTTCCAACT GACTTGGGTG TATCTTTTGG CATAGGTAGC AGGCAAACCC 300
CAGGGGCATC CCCAGATTCA ATAAATGAGC TCTGGTGGCT GATCGATCAG TGTGTCACAG 360
AGCAGGGCTG TTCTTGCCTC TCCCTCCTGC TCCCTCTTCA GCTCCACTCT CGGGCAAGGT 420
CTCTTCACAT GAAACAATGA GGAGCTGGGC AGGCCCCTGC CTCTGCCTGC CTCAGGATAG 480
ACAGCTGCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTGCA AAACTTCTAG CCCTGCTGTT GGAGGGAGGC 540
AGTCCACCCC CACTGGGGCT ACAGAGGGAA GAAGAAGCCC TTTCCCGAAG GAAACCAGGC 600
AGTTGTTTCC AAATGAAGAG GAAAGGAATG CCAGGCAGGC AAAAACACAC ACTGTTAACA 660
TTTTGTGGAA TTCGTCATCA GTTTCTGCTT CGTTATGGGC CAAATGTAGT GCTAACTGAG 720
GAGGCCAGAA ATAGGTGTGC TCTCAGCAGG TCCCCACGAG TAGGCACCAA TTTGGGATTG 780
ATTCTTTCCC ATAAATACAA TGCTGTAGAA TTACCTTTGT CTTCCTGTCA TTTTTCTATT 840
TTTTTCCTCC ATCTCCTCCT GCGACTTACC CAAGAGTACT GCGTAGATTA CCTAGGCAAG 900
TAAAAGAATG GGCGGGCATG GACCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC CTTAATTCAA 960
GCTATTCACA GTCCTGTGTC TGGTAGAAAA TAAATGTCTC TGCTCACTAG TGTTTTTAAA 1020
AGCCATTAAG AACCGATTAA CTAATCAATG GATTTGAGGG AGGGGATATC TCCCAGGAGG 1080
TGACTCCAGG GCTACTTAAT GGAAGTATTT CCTAAGATTG TGTGGAAATG CCCTGGCACC 1140
CATCCCTGCT TCCCTGCAGT TCCAGTTTGA ATCCTGTCCC ACATCCCAGT GATTTCAGTT 1200
CAGGCTGTTC AGAGAGGCTA CTTGTTGCCA AGACTCCCCC TCCCCCTCAT CTCCCTCTTT 1260
GCCAGCCATA GCCTGGTGCT GCTAACCAGG GAGATTTGCC CATTAGAAGG GCCTCAGCTC 1320
CCAGAGTTCC CATGGCAACA GCCTCCTTGG AGGTCTTTTG TTGCCTGCTA AAACTTTGAT 1380
CTCAGAGAGT GGCTGCTGCT GTTTCTCTCT GGAAGATTTA CAAACAGAGG GAGAACGGTA 1440
AAAGAATTGG GGAAGAAAAA AGAAGTTTAC TCCTGGCAGA AGGGAGAGGT GGGGGAAAGG 1500
AATTATCAGA GCCACACTCT GGCCCCAAGT CCAGAGAGAG AACCTTCCTT CCGAACTTCC 1560
TAATTCTGCA TTCCTCTCCC CACATTTCAT TTGCAGACTT GACCATGCTT CAGGCTTGGG 1620
CTCATCCCTG GTAGGGTGGA AGCATCCTAC TTTAGCACAC ACCAGCACCT TCAGAATTCT 1680
AGATGGCTTG AGATAATTCC AAAGACTCCC ATGAACAGAG GGGCAAAATG AGGGGTGGGC 1740
TGTTCTGGGC AATGCTCTCA TGTCTCTTCT CCAGCCTCTT TGTCCTATCC CTGGCCTGGT 1800
CTGCCCTAAA ATTTACTCAG ACGCCCTTGC TGTTTTTATG AAGAATGAGA AAATGTATTG 1860
AAAGGAGAGA GGAGAGCCAG AGGAGTTACC CAGGCATCTA ACTCCTCTTA GAAACTGTAG 1920
CTAGGAGAAG AGGCAGAGAG TCCCTCCAAG ATATGGAGCC AAACCTTTGA TGTTCTGGGC 1980
AAGCTTCTCT TAGTTTCAGG AACTCATTGC ATAATCCTAA TCTTGCTCAC TGATAGACAC 2040
CACAGAGCAG GTCAGTATTG CTTCAATTCA GATTTATATT TAAATTGTGA TAAAAAAAAT 2100
TTCATGAGTA TTTTTAGCTG TACTGGGATC CCACACAATG AAGACACAAA ATACATAAAT 2160
GACTTCATTG TGTCCCTGTT AAAACTTTGT GTCCTTTATG AAGATAAAAG TTGTGGTTTG 2220
GTGGCGATGA AAGAACAGTT AAAAAAAAAA AAAGGATTAA AGCTGTGCTT GGATAATAAG 2280
TATCTGTGTC ACAGGTTCTC AGTAGAGGGG TGCTTGCTCT GCAGGAGACA TTTGGCAGTG 2340
TTTGGATGCC TGTTTTGCTT GTCACGCTGG CCAAGAGTTA TGAACCCAGT GAAGAGAGGC 2400
TGGGAAGGCT TTGGAGCCTC CTACAATACA GACTAGTTCA CGATACTCAT GCTCTGACTT 2460
TACACATCCC AGATGCCAAG TGTAAGGAAG TCCACTTGGA TACTGCACAT GGTCCAGTGT 2520
GAGCATGGCA TAGAGGCTTG GGGCCAGACA GCCCTTGGTA TACTAATACG AGCTTAGTTT 2580
CCCCAATCTG TAGGAGAGAG GGGTCTTAAA AGTCATCCCA AAGGCTGGTT GTTAAGAAAA 2640
AAATCCAGTA GCTATTAGTT CCTTCTCTTA CCTCTTGCCA CTCTCCACAT GCCCCCACCA 2700
GTGTGTCATC TCTAATCTGA GGGAACCCTC TTTAAGGAAA TCTATGTTGA AGTATTCCTG 2760
CTAAACGGTT GGTTTTTTCT TAAGCAGATT TAATGAGTCT CTTGTGAATT GACCGCTAAG 2820
AATAGACTCA CATTTTCTCA TTGACGTCCC AGCCCCCTTT GAAATCATCC TGATGGTGAT 2880
AAACTTGGGG TTTATCTGAC CCAACACACT TTGTTATCTT TGGGTTGTCT CATTTTGGCA 2940
CCCCGTTTTC TGAGGCATTA GGATGTACAG CTCCCTTCAA CTACATCAAT CAAGCACTGC 3000
AGCCCAGGGA AAGAAGGTGC CTTCATGGAA TGGTAGCTGG TTGGAAAATA TACCCAAAGA 3060
CTTCTGACCT GACACAGCTT TGCATTGCCC TGCGTCGCTT AAAAACCAAA TGAGGCCTGG 3120
CAGACGCTCT TCATGAGTGC CCAGTCCCTC AGCCACCCCA GCCAAGGCTG GCCCCAAGCC 3180
TGCTCTACCC TCCCTCCTCA CAAGCAGCCC AGCTCACTGT TTTTGCCTCA CTTGTTGCCC 3240
ATCCCTGTGG GAGGAACACG GCCTTCAATT AGCGTGCATT CCTGACCACC TCGGTTGCCG 3300
TGGTTACCCC GGGAGGTGCT GGAGCAGCTG GGTCAACCCG CGCGCTCTTT GTAGTCTTCT 3360
GAGCCCTTGC GTGGGGGAGG GGACACAGGG CCAGCGCTGG AGTGGGTGGT ACCGGGAAAT 3420
CGGCTCAGTC CCCCAAGGAA AGAATGGCAG TCCGTCAAAG CGGGTCAGGA GACAGTTCCA 3480
TTTTCTCCAA AGCCAGCTGC CTCTATTCAA TGCATGCAGG TTTGGTTCAC ACGGGGACAG 3540
CGCCTCGGAT TTTGTTGAAT TGGCTTCCCA GAGAGGGCTC TGGGAAAGGG TCCATCATGG 3600
AAGCCCTTTA TACCCCAAGA GCGCTTCGCC ACCAAGGAAA GGGCAGGAAC TCTGGCCTGA 3660
ATGACCTTAT AGCAGTGTAC CCTCAGTGCC TGTCTGAGAC CTCAGGGCTT TTTTGGTTAA 3720
GGAAAGTAGT GGTCCCTGAA TATTGGATCA AGTCTAGTGG ATATCATTGT GCAAATCTGT 3780
TTCACCCAGC ACAATAAAGT GCAAGAAACC ACACTGATCC CCACAAACTC AATTTCCTCC 3840
TTCAGTGGTG TCCCGCCATC CTCATCGAAT TTTGAGTCAG TCTAGCTCTC TTCTATATTC 3900
CATCATCTCA GACCAAGTCA AGCATGTTAT ATTACTAATG 3940