EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM077-00873 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindlimb_bud_E11.5 
Coordinate
chr1:164001360-164005900 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:164005764-164005783TGGCCAGCAGAGGGTGGCT+6.15
Foxd3MA0041.1chr1:164002312-164002324AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:164002316-164002328AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:164002320-164002332AAACAAACAAAC-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr1:164004237-164004250ATAAACACTTAAC+6.08
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05676chr1:164002464-164006437E14.5_Limb
mSE_09388chr1:164002671-164004812MEF
mSE_09388chr1:164004843-164009426MEF
Enhancer Sequence
TATGAAAAAT GGTCAGTAGA AAGCAGAGCT TCACCAAATA GGAAACCTGA TGGATAACTA 60
CCTTCCCCAT TGACAGGAGG TGGCCAAGTC CATCAGCCTT GCTGAAAGCA TCCAGGAATG 120
GCTGGGCAAG GTATTGTTAA ATGGTGGAAA AAGCAGGTCC TTGGATAGGA CTCTCCCTCC 180
TGCCTTTTCT TGTAGCACAA GGCTCTTTAG TATGTAGGAG GTTACTGAAT TTCACTGTGT 240
TATAGCTCAA TACAGATACT ACAAACATAG AATTCTGATA TTGAAATATA TTATTCAATT 300
TCTCCTTTTC AAATGAGATG TAGTCAGTCC TATACGACTC CTGGGGAAGT ATAAGACACC 360
TTTATTTAAA AAGACTGAAG TTAAAATAAA AGCAAAGTTA ATGTTTTTCT TTCAAAGGGT 420
AAAAAACTTT TTTCTATAAT GTAAAACTTT TAGAAGAACT AATATTGGGT CTAGATTTCT 480
CTATATTTCC ATTTGATTTT TTGCACAAAA TCATGCCGGG CGGTGGTGAC ACATGCCTTT 540
AATCCCAGCA CTTGGGAGGC AGAGGCAGGT GGATCTGAGT TCGAGGCCAG CCTGGTGTAC 600
AGAGTGAGGT CCAGGACAGC CAGGGCTACA CAGAGAAACT GTCTCGAAAA ACCAAAAAAG 660
TAAAAAATAA ATAAATAAAT AAAATCACTC ACCATTTGTT ATAATGTCTT ATTTCTTACA 720
TTTAAATTTT TTCTATCTTG AATTCTCTAA CTTTAACAAA GATACTTAAC CAAACTCTTT 780
GATAAAGAAA TAATATTTAA AGTTTACTAA ATCTCTAGAA ATGTCCTTTC AGAGAGAAAC 840
TAAATTATGT AGGGAAATGA AATGTCTTTT CTTTAGGACT GAGCATGGAA ATTAATTGTT 900
ACCTGAAGAC CTCAGGTTTG CAGATGGTTT CTGGTTGGTG TTTGTATCCA ACAAACAAAC 960
AAACAAACAA ACGTAACAAA CACCAATCAA GCGCTTTCAT CCTTTATCAT ATATGGCCTG 1020
CTGTTTGTCC ACATTCCCCG TGCTGATGCA TGGCCTGGAT TCTTGCCTTC TTAATGAAGA 1080
CATGAACTTC TATAGTCAAG AGCAACTTGT CTAAGGGGGA GAGAGACTCT ACTGTGAGCA 1140
ATTTAGAATA TCACAGTGCC AGAGATGAAT ATTTTCCAAA GGAAAAATAA GTAATATTCA 1200
AAAGAGGATT TTCCCCCAAG TAACTATGAC TTTCTGATAA AGGGAAAATA CTCCATTTTC 1260
CAGGAGAAAT AGCACTAACT ATCCAATGAG GAATGTAAGT ATTATTGTTT TGTTCTATCA 1320
TGTGCCCGTA ATGTAAGGCT CTATGTGTTT CTCTAATAGG AACTGGTGCT CTACATATGG 1380
ATACAGTATG GAGGATGAGC TCCAAACTGT AAGCATAAAT TAAAGATGGA TGAGGCAAAT 1440
CTGTCACTGA GAAAATGAGC ATCAGGGTTG TTCCAAATAC CCTGGGTTCT ATGTGAGCAT 1500
GAGGGGGGAT TCTATGTGGG CATGAGGGGG GATTCTATGT GGGCATGTGG GGAGATTATG 1560
TGTAGGCATG GGGGGGGAAT TCTATGTGGT CATGGAGGTG GGTATGTGCT AGACTTGCTG 1620
TGTGTAGGGA GAGGAGTTTG TTGTGCTCAT AAAGAGAGTT AATTAAACAG AGTTTACTTT 1680
CTTAGGATCT GGTTAACATC CCGAATGCTA AAATGTCATG CACTCAGTAA ACAATGAGCC 1740
TTCTCAAATC TGAAATGAGC CATACTTTAC AGCTGGCTCT CCTATATGGC AGGTATGTTG 1800
CCTTAGGGAC AACTCAGAGC AGTCATTCCA ACATGAGAAG GGGAAAGACG AATCTCACAT 1860
TCTCCTTCGA AAGAAGCCAG ATCTATACTC TGGAGACAGC ACAGCTTGGC TTGCAGTGTT 1920
TTCCATTTAC ACTGAAATTC TAAGCTACAG GAAAATAGCA TACAGATGTG GCGCTTTTGA 1980
TTCGAGGGGA CTCTCTCGTG CCAGAATCTC TGGTCAGGAG TATGACCACA TTTAAAAAGT 2040
ATTAGCATAT TTTTCACAAA CTATCACTTA TGCATAGTAT AAGCAATTAA AAAAATAAGG 2100
CATGGGGTAA TAAAGACCAA TACCACTGAA GTCTCCACCC TTCAATTACA AGTCAAAGCA 2160
GTGAGCACTT GTATTTTTGA GAGCCTTACT TTCAACCAGC TTCTTCCGCA CTACAATACC 2220
AGATATTCAT GCTGTACAGG GCAGGCTGTG GAGGCCCTGA GGGCCTGAGG TCCTGCAGGG 2280
ACTTCAGCCC TATTCCAAAA GGTTTAATGA ACAATAGTTT ACAATTTTTG AGGTGTGTGT 2340
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTAGGTAT TGAACTACAC ATGTGCATGT 2400
GTGTATGGGC ATGTGTGTAT GTGTGTAGGC AGTATATGTA CATGCATACA TGCATAAGTA 2460
AGTATGTACA TGGAAGTCAA AGGACAACTT TGGATGTAAT TCCTCACGTG CTATCCGTAT 2520
TAGTTTTTGA GACAGAGCCT CTCATTGGCC TTTTCTCAAC AGGTAAACTA GGCTCCTGGC 2580
CAAAGAGCCA AGGGATCTGC CTGTGTCTAT GTCCCTAGTG CTGGAATTAC AAATATACCA 2640
CCATGCCAAC TTTTCACACA GCTGCTAAAG ATTGAACTCA GGTCTTTGTG CCCACAAGGC 2700
AAGCATTTTA AGGCTGAACT ACCCCACTCC AGCCCCAATA GTTTATATTT TCTCATTCCC 2760
TTCATCTAGT GAGCTGAAAA AAAAAAACAC AGCAAACTGT ATCCACCATA GCATCCATGA 2820
GCTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGCATGTGTG TGATTTTATA 2880
AACACTTAAC CATCCATGAA CTTCTTGAGA AAGGAACAAA TCATGGTGCT CCTCTCGTGA 2940
GCAGAGTAGC ATCTCCCCAA ATGTCAGCAG CTGGCTCCCT ATCAGTGTAC CCACAATTAA 3000
CCCAGGGCAT GCATGGCTGC TTGGATGGAT GGTTGGCTGT TTTGTTTTCA AGTAACATGA 3060
ATGCATGAAC AATGCAAAAA GTTTCAGACA AGAGATCTAC TGTGGTGCAA ATGATCAGGA 3120
TAAAATGCTT ATAATTCAAG AACTGAAATA CTATAAGAAT TAAAACATGA GTTTCACATT 3180
TTGTTCAAAT ATTTGTCCCT AAGAGTTGTT GTATTATTTA GAAATACTAC CCTTTCCTTT 3240
GTGGAAGAAG CCTTGAGTTT ATTATTTTAA GTGACCTGCT ATTCTCCTTT AGAAGTGTGC 3300
TCTAAATGAT GTGAGTTCAC CTCCTTCCTT CTCCATAGAT GTACATTTCT GGCATTATTT 3360
TAACTTTATT AAATAGCATT GCCTGGGTTG TGAGCAGCTC TATCAGAGTA TAAATTTATG 3420
AAGTGACACA TTTTTTAGGA CCAGCCATCT CTGTCAATTT ACTCCATAAT AACACATTCC 3480
ACCAAATTAA ACTGCAAAAT ATTTCCCACA TTTGTTTTAC ATTCTATACA TATGGCTTAT 3540
GAATAGCAAG CTTGATGAAT TCCAGCTGCT TTAGCTATGC AGGCCAACTC TTATATAACA 3600
GATTCCTTTC CATTCCTATT GTATCCACCG AGGCCCATTT TAAGCGGGCC ACCTGGTAGG 3660
ATAAACGACC GTTACAAGAA GGAAAAACAA AACACAACAA GAAACCCCCA AACAACAATA 3720
AAGAAAACCA GCCTGCCGAA TGCAAGACTA CTTTCCCCAG CTATACGACT CTTATATTTC 3780
TAAGAAAATG GGAAGTAGCA CGAAGCTTTT GGGAAAGTTA CATGAAAATT TAACCAAACG 3840
AGTAACGCCA CGAAGCAGCA TTTTCTCATT TATCTGTTGT AACGAGAACA TTAAAACTGC 3900
TCGCACCATT CATGTGTGTT GCCCTGCCCG TTATACAGAC GGTTCAGCCT CCCCTCAACC 3960
TCCCCACACT CTCCTGCTTC CACGCAGCTG GAATTCATCA AGGATGTAGG AGCCAAGTCA 4020
AATGTTGACC CCACCCTCCT CCTCCATTTT AAGGCCCCTT CAAAGCCAGT GAACGGATCG 4080
AGTTCAGTTT TGCCAACAAA GCCTGCCATA CTGCCCTTTA AGGCTCCAGT TTGGAGGTTT 4140
TATAACTGCA CAAGCTTTGA TTTGGGGTCA GTTCTTCAGC TACACTGAGT TCCATCAGTT 4200
TGAGGAACCC TTCTGTGACA AATCCTTACC ATTCCTTTGC TCAGAGTTGG TCTTTTTCTT 4260
TTGCGTGACC CCTCTGACAT GTCCCATAAC CAGCTCTGAA AACATAACTT ATTTCCCTTC 4320
CAAGAAGGCC AAAACAGAGC AGCCACTGTG GCCATCCACA CACATTTCCC CTGACATTTG 4380
CATTGCCCCA TAGACTCCTT GGAATGGCCA GCAGAGGGTG GCTATCCCAA GATACATAGA 4440
ATCACGTTTG TCAAGACAGC ATGCAGGAGC AGAGGCTGGG CATGCAGGAG CAGGGGCCGG 4500
GGAGACAGGA AACACAGAAG AGCCGCACTA GGGCAGAGAA 4540