EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM076-23258 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Hindbrain_E11.5 
Coordinate
chr9:44294300-44297210 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr9:44294623-44294641CCCTCCCTCCCTCCTTCC-7.12
Foxa2MA0047.2chr9:44296315-44296327TGTTTACTCTGG+6.11
SP2MA0516.2chr9:44294591-44294608CAAAGCCCCACCCCCCA+6
ZNF263MA0528.1chr9:44295705-44295726TGTTCCGCCTCCTCCTCCACC-6.25
ZNF263MA0528.1chr9:44296473-44296494GGAGGAAGATGGGCAGGGGGT+6.2
ZNF263MA0528.1chr9:44294633-44294654CTCCTTCCCCCTCCCTCCCTC-6.46
ZNF263MA0528.1chr9:44294622-44294643CCCCTCCCTCCCTCCTTCCCC-6.53
ZNF263MA0528.1chr9:44294641-44294662CCCTCCCTCCCTCTCTCCCTC-6.8
ZNF263MA0528.1chr9:44294629-44294650CTCCCTCCTTCCCCCTCCCTC-6.9
ZNF263MA0528.1chr9:44295193-44295214CACCCCCCCCCTCCCTCCCCC-7.17
ZNF263MA0528.1chr9:44294623-44294644CCCTCCCTCCCTCCTTCCCCC-7.29
ZNF263MA0528.1chr9:44294649-44294670CCCTCTCTCCCTCCCTCCCTC-7.4
ZNF263MA0528.1chr9:44294645-44294666CCCTCCCTCTCTCCCTCCCTC-7.96
ZNF263MA0528.1chr9:44294619-44294640CCTCCCCTCCCTCCCTCCTTC-8.3
ZNF740MA0753.2chr9:44296950-44296963CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01579chr9:44283882-44346451Th_Cells
mSE_02832chr9:44286065-44295721HFSCs
mSE_03074chr9:44286113-44304971TACs
mSE_03933chr9:44296237-44297637Cerebellum
mSE_05031chr9:44294367-44299267E14.5_Heart
mSE_05569chr9:44294630-44297596E14.5_Limb
mSE_06832chr9:44293205-44298719Heart
mSE_07386chr9:44290376-44294629Intestine
mSE_07386chr9:44294652-44297605Intestine
mSE_08113chr9:44290514-44300152Kidney
mSE_08453chr9:44290375-44299754Liver
mSE_09170chr9:44290412-44297653Lung
mSE_09452chr9:44293961-44298712MEF
mSE_10864chr9:44295508-44296441Olfactory_bulb
mSE_11946chr9:44294689-44295225Spleen
mSE_12687chr9:44295268-44299665Testis
Enhancer Sequence
CCTAGGGATC CGAGCAGAGA GGCTCAGGTT AGTCCAAGGA GCTTAGTAGG GCTCCTTCCA 60
GGACTGGGCA TCTCTTCCAG GGATTACTAA ATTTTCCCAA GTCTGGACCT CTGAGTTCCA 120
GAGCTGGAGC TGGAGGGCCG GGTGGGGTGG TCAGGACCAG GAGCTGAGGG GGACGTGGAG 180
ATGGCCCTAG TCATGAAGAG CTACTTGCAG CTTGTCACTT GGATGGGTGG CCCTGAAGGC 240
AGCCTGGAGT TATGGCCTGG AATTTCCTGC CGGGTGCCAG GGCCAGGCCT CCAAAGCCCC 300
ACCCCCCAGC CTGGCCTGAC CTCCCCTCCC TCCCTCCTTC CCCCTCCCTC CCTCTCTCCC 360
TCCCTCCCTC TGTCTACTTT CCCTGGAGGT TGGAGGAGGG GCAGTGAGAA CATTCTGGCT 420
ACCAGGGAAA GGTGACTTCC TGGGTGTGGG GTACTTGGGG GGAAACTGAG GTGATTGCTC 480
ATGAAGACTT CTAGGGGACA TGTTCCCTTA GCCAGTCCTG AATGTGGGGA CATTTGCCCC 540
TCACTGTCTC ATGACTCTTA CTAGCTAGGG AACCAGAGCC GAGGCCATCT TCCGGAGAAC 600
AGGGATGCTC ACCTTGTTCT GTGTGTAGGT AAGGGGTGTG GTGGCTTCTA ACTTTCAGTC 660
TTGAAGGGAG TGGAGGCTCC CTTTGCCTCC GCACGTCTCC TGTCAGTGGC AAAAGCCACT 720
GGAGACCTTT CCTTTGCCTG CGTCCAGCAG GCAGGGCCCT CCCTTCTTGG TTCTAGGCCA 780
GCTGCTCCTC CTAAGTTGGT AGCCCTTTCC GGGTCCCCTT CTCCACTGGC TGAACCACCT 840
CTGTCTGGCC CTTTCTTCCT CCTTGTCCTG GTAGCTCCAC ATTGTTCTGT GTCCACCCCC 900
CCCCTCCCTC CCCCAAGCTT CAGGAATGGC CCTGAATCCA GCATTTCCAG CGTTTCGAAA 960
CCAGGATTGT TTTGAAATCC TGAGTGCTTC CCCGCCGCCC CCTCTGACTC CCCTCCTCAC 1020
TCACAGCTCA CTGTCTTCCA ATCTGACTTT TCGCTGGGCT GCACTTGAGG TAATCCATCT 1080
GAGTGTGTGT GCTTGCACAT GGATACAAAC CGTACTACTA TGTATGCGGT GGCTCTGCGT 1140
GTGTCCCGGA GTGGGTGTGT CTGTGTCAGA TTTCTGTGTG ACTGGCTAAT GATGGCTGGC 1200
AGTTTCCTGA GCATTCTTTT GGTTGCCTCT GAATTTGCCA CTCTCGTGGG TCTGAAGGAA 1260
AGTTTGGGCT ATTTAAGGAG GTACCTTGAA AGTGTGTCTG CTTGCCTCTC ACTTGTGTGT 1320
GTCTGGGGGT GGGGGGGTTC TTTCTGAGGA GTGCGCTGGA GGCTGGAGGT GTGTCTCTGA 1380
TGTGTGCTTA CGTTTGCTTT GCATCTGTTC CGCCTCCTCC TCCACCCTGG GAACGTGTCT 1440
GGGGGGTGTA GTCACAGGTC TGCAGCTCCC TGGGACGTGG AGTCCTCTGC CCTTTGATAG 1500
GAGGTTTCCT GGAGTGAGGC CCAAGCTCCT GGCAGCTCTG AGGCCTTGGA GAAAGAGTGG 1560
TGGAGTTGGG GAGACGCCTA GATAAGCTGT TGCCAGGGCC TGGTCCTCTC TTTCTCTGGC 1620
CTTGTATGCT CAGCGGCACC AGGCAAGCCT GTGTCCTGAG GGTGTAGTGA TGGCTGATAG 1680
AGGGAGCATA GGGACTAAAG GGACATGTTC CTTTCACCTC TGCAGTCACC TCCTTCACTG 1740
GAGACCAGGA ACAGTCGGTC ACAATTTACC TAGGAGTGTG GTGGTGAGTT TCAGGTTCAG 1800
AAAACTTGAC TTCTCCACTT ACAGTTAGTT GCTTAACAGA ACAAGCTCAA AATCTAATCC 1860
CAAGCAAAAG GCAGAGGTGC CTGGAATGCA GGCGTCTGGG ATGGACCATT GCAGCCCTGG 1920
TCCAGGGAAG TCTTACTGAT GTCTCCCTCG ATTCCTTCCT ACTACCAGTG AGGTTCTGCA 1980
CTGGGGTGAG AGGCAGCCAT GAGTGTTTTG GTTTTTGTTT ACTCTGGCTA AAGCCTAAGC 2040
ATTGGTAGTA TGTTTAAGCT GGTTGGCCAT ATACACTGGG ATGCTCAGAG TCCGTGCTAG 2100
GACTCAGCTT TCTATCTTAG GATCTTAGGC AGTAACTGAA TGCTTTTCTG CAAGTACATG 2160
CAGAGGTCAG AGAGGAGGAA GATGGGCAGG GGGTGTTGCT GTGAGTGAGG GGCCGGTGGA 2220
GACCTCCCTC CCTCTGGAGG TGGGCCTAGG CTAGGCTTCT TTCCCCGACG TTTCCTTTGG 2280
TCCCCAGTAC AGTGGGAAGA AAGGAGTAGT ACAGGCCCCT GTTGGTACAG GGCTCAGTGA 2340
CCCAGCAGGA GGAGGGCCTT GGCAAGGAAT TTTCAGTTTG TTTCTCAATC TCTGTCTCTG 2400
AGACATGCAC ACGGGCACGT CACTGCAGAC ACCTCTGGGA GTTGAGTCTA GAAAAGTCAC 2460
CTAGGTGGTG GTAGGGTAGG GCGGTGTGCT TGGAATCATA AGGGAGACAG CCTTTTTTGG 2520
GCGGGGGCAC GTTGTGCTTT CTGTCTCCTG TCTCTGGAAG TTGGGTGCAG TCAGGGCCCC 2580
CTTCTAACAG CCCCATCTTG AGCCAAGAGC AACACAGGCT GCAGAGGGTT AAGTCTGGTT 2640
GGCAGGGACA CCCCCCCCCC CCCAGTGCAG CAAGAGAGAG GGAGGAGGGG TGGTTAGCAG 2700
CTTGCTCTAG TTGGCGTCTC TCCCAGAATT CTTCGGAAAA GAACTCCCCT TTGACCCCCA 2760
GTACAAACTG AGCCCAGCCA CCAGCCTCCC TCCCTCCTGC TGTGGGAGCT TCACCCAGTG 2820
CTACTAAACT GCTAAACCTT CTTTGCCCCA GGCCCTGGTA CGGAGACCAG GTGCCCAGGA 2880
CTCGTTGTCT TTAGGGGACC AGGGTGTTAT 2910