EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

EnhancerAtlas 2.0

Tag

Content

EnhancerAtlas ID

MM075-03044

Organism

Mus musculus

Tissue/cell

HFSC

Coordinate

chr4:127030380-127031270

Target genes

Number: 10
Name	Ensembl ID

Sfpq	ENSMUSG00000028820
Gm12940	ENSMUSG00000085334
Zmym1	ENSMUSG00000043872
Gm12943	ENSMUSG00000082220
BC003266	ENSMUSG00000042380
Gja4	ENSMUSG00000050234
Gjb3	ENSMUSG00000042367
Gjb4	ENSMUSG00000046623
Gjb5	ENSMUSG00000042357
Gm12947	ENSMUSG00000079998

Enhancer Sequence

GATTGTATGT GTGCATTTGT GTGTGTATAT ATGTGTATGT AAGGGATAAG GATTGTATGT 60
GTGTGTTTGT ATGTGTATGT GTGTTTGTGT ATGTATGTAT GTATGTGCGT GTGTTTGTGT 120
TTATGTGTGT GTATTGTGTG TTTGAATGTA TGTGTGTGTT TGTATGTGTG TATTATGTGT 180
TTGTGTGTAT ATGTGTGTTT GTGTGTGTGT GTATGTTGTA TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 240
TGTGTGTGTA TAAGGGATAA GGAGGAGGCA GGGGCTGGGT ACCGGCATGG TCTTTGCCCC 300
ACCACTGATC TTTCTTCCCA GGTGCACCCC TCTTCTCTGA CTGCCTAATT AGTGGCTGGC 360
TGAGAGTCAT GTCTCTCATT TTCATACAGG CCATGTTTGT GTACCCCAGC CTTGTGCTCC 420
CTGGCTCTGG GGTACTTAGG GTGTTCCATC TCAAGCCGTC CTTGTACCAT CCCTGACTCA 480
GCTCCTGGTT TCTGCAGCCA TGTATCCCTG GGACACGTGC TGAGGCCCCT CTGTCTTCCA 540
CTGCAGGGAG CATCACCCAT ACCTCATTGG CCCAGGCTTC CTTGTTAGCC TGCTGGAGGC 600
TGGAAGGCAA ACTGGACGTC TCTGTCTCCT GGGACAAAGC TTTTTGTCAG GCCCAGTGCA 660
TTCTCAATGG ATCCTAGCTG AACTGAGCTA TGGCTTACTC TTTCCCAATC TCTTCTGGAT 720
TCTCCTCTGG TCCTCTGTCC TCTGTATAGC ACATTTCCTT TCCTCTGTGG AGTTTTCCTA 780
GTGTTCTTTC AGGGTCCCTG CCCACCCCTG GTTCCCTTTG GGAAGCTAAG TCCCCAGCCC 840
TAGGTTTCCC CGGGGACCTC CCCCCACAGC CGTCTCCAGC TGTATTCGGT 890