EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM071-08256 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Heart_E12.5 
Coordinate
chr3:86953060-86960100 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr3:86953941-86953951AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr3:86953941-86953951AGCAGCTGCT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:86958927-86958945CCTTCCTGGCCGCCTTCC-6.35
Foxj3MA0851.1chr3:86956774-86956791TAAAAATAAACAAATAC+6.81
LEF1MA0768.1chr3:86957563-86957578AAAGATGAAAGGAAT+6.42
MAFKMA0496.2chr3:86955681-86955700TCCTCCTGACTCAGCATCT-6.04
MEF2AMA0052.3chr3:86956766-86956778TCTAAAAATAAA+6.07
Nr5a2MA0505.1chr3:86956728-86956743AAATTCAAGGCCAGC+7.04
RFX1MA0509.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.1
RFX1MA0509.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.1
RFX2MA0600.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.37
RFX2MA0600.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.4
RFX3MA0798.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.35
RFX3MA0798.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.3
RFX4MA0799.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-6.56
RFX4MA0799.1chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7
RFX5MA0510.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA-7.57
RFX5MA0510.2chr3:86958783-86958799TGTTGCTATGGCAACA+7.58
RXRGMA0856.1chr3:86957648-86957662TGACCTTTAAACTG-6.11
RxraMA0512.2chr3:86957648-86957662TGACCTTTAAACTG-6.01
STAT1MA0137.3chr3:86958291-86958302TTTCCAGGAAA+6.62
Sox3MA0514.1chr3:86954599-86954609AAAACAAAGG-6.02
Sox6MA0515.1chr3:86956842-86956852AAAACAATGG-6.02
Stat4MA0518.1chr3:86958291-86958305TTTCCAGGAAAGGA+7.1
TCF7L2MA0523.1chr3:86957563-86957577AAAGATGAAAGGAA+6.1
ZNF263MA0528.1chr3:86958860-86958881CCCCCTCTTTTTTCCTCCTTT-6.32
ZNF263MA0528.1chr3:86958735-86958756CTTTCTCCTTCTACCTCCCCC-6
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04919chr3:86953059-86956760E14.5_Heart
mSE_04919chr3:86956842-86957641E14.5_Heart
mSE_05534chr3:86953143-86956780E14.5_Limb
mSE_09399chr3:86952731-86959453MEF
mSE_10288chr3:86953013-86956757Embryonic_stem_cells
mSE_10288chr3:86956799-86959261Embryonic_stem_cells
mSE_11862chr3:86953097-86956666Placenta
Enhancer Sequence
GGTTAGATAG TTTTTACAAA GTTAAGAGCA GACTCAGGAA GAAAACGAAG ATGCAGGGTA 60
CCTGGAGAGT CAAAACCAGA GGAGTGAAGC AGCCAAGAGG AAAGTGCACA GCACGGAGCC 120
AGTCGGGTGG CTTCTGCTCT CTCAGTGAAC CCTGGGTCGT GGTCACCGAG AATGGGGACA 180
CAGTTGGAAG AATGAAAATA TCTCATATTT CTCATTCCCA AAACGGACAG CTCTGGGACA 240
CAGCGTTTCT GACCCAATGA TTGAGGCTTT GATTGAGATG GCAGCCCACA CTGGTCATTT 300
TTAGGCTGTT GAGGTTGGGT CCACAACCTT CTAGGCTCAG CCCATGTCCC AGAATGGGTA 360
GCGACAGCAA GAATCACAGC GGATATGGGC TGCTGCTTCT TCCTCCTCAG ACCCACAATT 420
CCTCCGCTCT CGAGGCAGCC CTATCATCAG CTGTAATGAA ACACGGATCT CAGTCATCTA 480
CCGTCTATCA CGCCACACCA GCAGGGGTGT GGGCCACACT GAGGTCAGTT CTGATTGGCG 540
CTGGAACTCG TGGTGGAGAA TTTTTAGCAG CAACTATTAT CCTATAGGGA AGATAGCACA 600
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACATA CATACATACA CGGTTTTCAT 660
CTTCTCAGAG TACATGTTAC ATGACAGCAT AAATTGCTGA GCTGGAGGAC AAACCAGACT 720
GTGTACTGAA CATTCATTAC AGAGACTCGA CAAATGGATA ATCTAACCCC CCAGGACAGG 780
GATGTTAACT CAACAAGGTT GCTATTCTTC CCAATTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 840
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTAC ACTTACTGTA GAGCAGCTGC TCTGACACTC 900
CACTATGAGG TTAATAACAT AACCAAGCCA CATTCTGTCT CCTGAAGATC AGAGAGCACC 960
GGGCAGTAAA CAGCTCACTC TAGTTCAGCA GGGACAGAAT CTACAGAGGT ACAGGCAGTT 1020
GCTCTGGAAG CCCAAGGGGA TGGAGCAGTT ATTCTTTGGG AAACTGAGAG GGCTCCCTGG 1080
AGGGCTTGCA AAACGCATCT GGATGGCAGA CTGGGCAGAG GCGGCCTGGA CTGCCCTGCG 1140
CAGGACACGG AGGGGAGACA TGCAAACAGA CCCCTACAGC CTAGTGACTT AGGAGGGATC 1200
TCATCCCAGG TGAGGCAAAG CACAAGCCTC AGGGGTGTCT AGACAGACAG ACAGACACTC 1260
CTGCCCACTG CTTGCAGCCA CCCCTATCTC CTCTTAGTGA GCTTCTTCTT AAGGAACTTT 1320
CCTCTCACTG AGAGCTGAAA GAAAGAAAAA AATTCACCCT GGGAACAAAT TCCTGTGCGA 1380
GTCCACAACA GTTTATTTTC AACTTCAAAA TTACTCAATT CAGCACTAAT TTTTCTGGGA 1440
TTCCCACATC TGGGGACTTT TTCTTTGGGA AGATTGTTAC AGTGGGGGCT TTTGTTTCAG 1500
CCGGCCGCCC CTCTAAACTC TTTTAATTGA GCCTGTTTTA AAACAAAGGG AAAAGAATCA 1560
GGAGAGGAGG CAGCTCCCTT TGCCTCCAGC CCCTTGCCCC AGCTCTGCGG TTAACACTCA 1620
GCAATGATCC TACAAGCCTG GAATCTGAGG AATTTCCTGC CTGTGCTCCC TGGAAGAGCC 1680
GAGAGAGAAC CTAGCAATTA GGCCTCCAGT TTCCATTCCT GCCTTCTTCC ACCACAGCCA 1740
GTGGACTGAG CGAAAAGCTG GTGGAGGGCC TGGGAGGACC GCATCTGTAC GGTCCTGCGG 1800
CTGAGACAGC GGTGCCCAAG GTTACTCTCT CCTTCCTTTC TCGCCGATCA ATCACATCTT 1860
TTCCTTTGTC TGCCTGAGAG AGTGGGAACA GTAAGGGACA CGAAGAGTTG TAATCCTTCC 1920
CGAAGCCATC TTGTTTCTCT GCAGTGTTTC TCTCCCCTCA ACACCACAGG AGTCCAGGCA 1980
CTCCGAGGCT GCCCACCCCA TCCTCTGGGG CTATTGTCAT TCGCCCTAAG CCCACATGCT 2040
CGTCACGGGT CTGTTCCAGG GAGCGGGTCA CAGGACTGCC TGCCCCAGGC AGTATGTCTG 2100
CCTAAGGGAT TTCTAAGAGG CAGGTTAGAG GCTGTGGACC TCTGTATTTT GGTTCAACTT 2160
AGAGACAGAG AGGCAAGAAG ATGAAAGGCA TTCCCAGGTT GTCTGAAGGA ACCACACACA 2220
GGTTTTGTGG GTGCTGCAGC AGCTGTGTGT AGCAGAAGCA AATTTTTCTT TTAATTATGT 2280
TTAGCTCCGG CTAACATTGA AATCAGGTCC TATGTTCTCT CAACTTATCA ATTGGTGGCT 2340
GGATTCCAGG TACTAGGGCA AAAGCAGCCT GGGACTTAAA AACTTGCCAC AAATAGTTCC 2400
CAAACTGGCC AAGCCAATCC CTTAGCAGGG CCTGCTAGGC CACATCTGTG TGGCCTCCTG 2460
CCAGAGTGCT GTCCCCCACT TCCCTACCCC TGTAGACTCT AGAGATCCCT GCAGTCCAGG 2520
GTCCTGCTGG CAGCACTTCC TCATTCTAGC TGTCTCACAG CACTGTATCC CTAGCTTATA 2580
TGGAACCTAC TTTACAGCAA AGGGTATTCT GAAACCCCTG ATCCTCCTGA CTCAGCATCT 2640
CGTGCTGAGT GGGAACTAGA CCTAGCTAAT TGTCTCATTC TTATAATGCA TGTATTTTTA 2700
TTTTATGTGC ATTGGTATTT TGCCTGCATG TGTCTATGTG TGGTGTCAGA ATCCCGGGAA 2760
CTGAAGTTAC AGAGACCTAT GTACTGTCAT GTGTGTGCTG GGAATTGAAC CTCCTCTGGA 2820
AGAGCAGCCA GTACCCTCAA CCACTAAGCC ATCTCTCCAT CCCCTAATTG TCTCTTGATA 2880
GCCTTCAATA ATCCTCCATG TAACTCTCTA CTGTCTCTCT TTATCCATTC AGAGGACATC 2940
TCTGAGTTGT CTCTGCCCAA AGTCTCAGAA ACGCTAATGG TTGCAGTGAC TCAACACCTT 3000
CCCTGTCTGC CATCTTAGTC ATGGCGGCGA CAGGGCAGTG ATCTCCCTAC TGACCAAGAA 3060
TGTTGCCCAG TCCTAAGCCT TACCAGATCT CAGCTCTGCT CACTGGCTTC TCTTTCCCTC 3120
TCCACAAACA GAAGGCTGGG ATGACAGCCA GCACTCAAGA CCTCTACCTC CAGCCCCTGG 3180
AGTTTCCGTA GACTCTTGAC AATTCTGACA CAGTATGGAA CTAAAATGGC TGCTTCCTGC 3240
TTCCCCTTCC TTCTCTTGTT GAGTCTTTGC TCTCCACACA CTCTGCCAGC CACAGAGGAG 3300
CCAGACTCAG AAATCCTCCA CGTCTTCAGT GGGAATAGCC ACTGGTCTAC ACATTTCCTC 3360
CAACTCAAGA TATTTGCCTT TTGAGGGCCA ATTCCCAGTT CCCCCACCCC TGCCCTGCCC 3420
TCACATTCCC TTCAAACAAA GCTTTCCTGT TAGGTTTTGA CCCTGATGAA GATTCTTAAC 3480
TGATTTTTTT TGCATTTCCT TTCCCCCTTC CTTTCTCAAT TCTGAAGGGT CTTTTGTCTT 3540
CTGAGTCAAA CAGCTCAGAC TGAGGGGACT AGAGCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT 3600
CTCTCTCTCA TAATCAACTG GGAAAGAATG AGGGAGGGGG CGATAGAGGA AGTGGGTATA 3660
GGTCTGGAAA ATTCAAGGCC AGCCTGGGCT ATATAAAAAT CCTTCTTCTA AAAATAAAAA 3720
TAAACAAATA CAGGTTGTAT GTCGGGGGGG GGCAATTATG AAATTATTTT CTTTCTTAAA 3780
AAAAAACAAT GGAAATAAAA AAGGGGGAGG CCTTGAAAAT GTGAAAGGAA AAAGAGGATC 3840
CTGGAAGGAG AGGGGAGGCA AAAGAAGGAA TAGAAAACAA GGGAAGCCTG CAGACTTCTT 3900
AAGCAAGGGA GAGAGACAAG ACATGTATCC ACTGAGTAGC TTCTCCAATT CAGAGGAGGA 3960
AAAAAAAAAA ACTGGATTCA CTCCAGCCTG TGAGCCTGGG TCTATCAGTC CAACCAGTGA 4020
TCTCACATGC AATTGTCATG AATGAGTATG GGACTCAGCC AAACAGGGTT CCAAGGTTCC 4080
TTCTTACCCT GGTCCCAGCA GGAGTGGAAG GATTGGTGGC AAACCAACAC ACACAAAAGA 4140
AATGGAACTA GATAGAGCCT CCCCCTTGAA TGAAGGCAGG TGGCTCCCAG CTGAGAAACA 4200
GGCCTCTCTG GGGCAGCTCT TATCCACCTA CTCTGTCTTC CTGAGACGGC ATTCTCTCCC 4260
TGCCTGGCGG AGCAAAACAG AATCAATGAA ATGCTGCCAG TTCTTCAGTG ATACATACGT 4320
TTCTCACCCT GAAGATTATC CGTGGAAAAA AATCTTAATC CCGGGCAGAC TTTTACACCC 4380
AGAATGTTTG AGTATGAGCA AGGAATTAGA AGCTTGCTTA AATAGCATCC AAGTCAATTC 4440
GAAAAAGCAA ACAAGCCTGG TTAATATCCT CAAAGACATG AAGCATTCCG CAGTGTGTGT 4500
GGAAAAGATG AAAGGAATCA GGTTAGTGGG TGTTAAAATG TTGAGGCACC GTCCAGTACA 4560
GTCAACGGGG CGGGGTGTTC ACTGCAGGTG ACCTTTAAAC TGAGGAGTTC TCTGAGGTCT 4620
CCAGTCCCTC TTTACAGAGC CTCTAATGGA AGGCTAGAGA TGATGCGGGT TATTTGTTTC 4680
CATGAAACAG TAGTTGGCAT TTTCTCTGCT TTCTTACTAC TGGCCAAGTG CGACACTGTG 4740
TTAATACAGC TTAACTCATT TAATTAGTTT ATTTGCTCCA TAAAAGATTT GAGGCAACAC 4800
AAATAGACAC ATCTGGTCAG TAATATAAAA AGTAAACTAA GAGAACAGCG AGTGGGAATG 4860
GTTACGGCTA GGAGAGGGGA AAGACCACTT AGGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 4920
GTGTGTGTGT GTATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGAGTGTGT GTGAGTGAGT 4980
GTGTGTGTGT GAGTGAGTGA GTGTGTGTAT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 5040
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTAC CAATGGGTCC TCATGAAAAG ATGCTAACAC 5100
GGGCAACATT GTTCAGTGCA CACCACAGGC ACCATGACAA ACGCTCAGCT CAGTCAGGGC 5160
AAAGACTATT TGGTCTTGGT TCACAACTTA CCACCCTGAT GCCTGACTCT CTAAAGGTAA 5220
AACTGACAGT ATTTCCAGGA AAGGACTAGA GTGAGCATTC ACAGAGAAAC TCGCTGTGGC 5280
ATCAAACACA GCCCCAGCGA TGCCCCCGGC AGAATGCTGT TCCTCTGGAC CTTTGGAGGA 5340
ATGCGGCAAG AGCCCTGTCA CCCCAAGGCT AGGGCAAGCT TACCCTCCAG AAAGATTTTA 5400
TTTTCTTTAT TTTTTTACCT TGTTCTGAGG AGCTGGGACT ACAGGAGGGC AGAGGACTAG 5460
ACAGGCATGG CTGAGCCTGG AATTCCTGGC TGCCTCTTTG AAGTTTTCTT GGTGAGCTAG 5520
GGGTGGGGAA TGGACGGGAG ACACCAGGCA GAAGTAGGCC AGATCTTAGG CCAGTCTCCT 5580
GACACATGCA GGACTAAAGA GCCCGCAGTG TGTTACTTAA TTATCTGTAA ATGGTTTTTG 5640
TTCCTGTCTT TAAACATTTA CCTCTATTGA ATAATCTTTC TCCTTCTACC TCCCCCTTTT 5700
ACAAGCTATC TCCTTTTCTT TGCTGTTGCT ATGGCAACAA CTCCAGGCAT ATAACCGCTC 5760
TCGGATTTTA AATAAAAGTT GAGACTTCTC TCTTTCCCTT CCCCCTCTTT TTTCCTCCTT 5820
TTTCATCTTT CTAGGGATGA GGCTTGTCTC GTTTCCTCTT CCCTTCACCT TCCTGGCCGC 5880
CTTCCATTTC ACACCCGGCG GTTTCTTTAT CAAGTTCCGT CATTTTCTCT TTGCATCAGC 5940
CTCCTGTCTA AGCCCTCTTC TCTGTCTTTG GGCTTCCAAA CTGGTCTGAA CCTCCTGGTA 6000
GCCATGACAG CAATAGTTGA GCCCCCGAGG AGGCATGGGG ACAAAGGCTT ATCTGGGGAA 6060
AATAGGGACC TGCTGGTGGT CCAGGACCTG GGGAAGGGTC AATCTATGCT CCCGAGGGTT 6120
CACAACCTTC CTTTCTGAAC CTTAAATCCT TTAGTGGCCA TGGGCAGCAG GCTCCTTATA 6180
TTGCCAACCA CCTGACACCC AGAGAGGCCT TTCAGATCTG CACAGGGAAG GCAAAGCAGG 6240
GCGGGCTGGG GAGAACTGGA GGAGGCAGGA GTTTTCTAGC ATGTGCTGGT GGCTACTAAG 6300
AAGTTATGGT AAGCAGGGCC AGGAGGGGAG GCCCACAGCT CTGATCCTCA CCTGGCGCTT 6360
CCTTATTCTC CATGTTTTTA TTTGTATCGT TCAGGGGTAG ATGAAATCTT GACTTTCAAG 6420
ATTCTTAACA CTCTTAAGGT GTCCAAGGCC TGGGAGATGG CTCAGCAGAC ATTTCAGGGA 6480
TGGGCCCTTC CATCCTTGCC AGGTAAGAAG GCAAGATGGA GGCGAGCATC TAAGACTGTT 6540
ATCTGCCATC CCCAGGGGTA AGATTTTGCC CATTTAAAGC AGAGGTATGG TAGATCTTCC 6600
AGTGCCCTTT CCGGGAATCA GAGCCTCATC TACGAGATGC CCAGGACCTG TGCTTGCCCC 6660
CTTCCTAACC CAAACCTTGG ATGGAGATAA ATCATGGCTT AAACAGGAAG CTTACCATTT 6720
CCAAAACGGA TGAGGGGATA AAACATTTCC TCATTATCAT TAACTGAAAA CCTCTCAATT 6780
TTATGAAATA TTGATCTAGG ATATATGTGT GAAGGGAGGT GGAGACATGC GGCAATTTTG 6840
GAAACTCTAC GACTGGAAGT TAGGCCTTTC TCCTTCTGGC TCCTCCTCAT GCGAGCTCAG 6900
GGGTCCTCAG GTGGGGGCAA CTTTGCTTCA CAAGACACTT CTGGTAACAT CTGAAGGATC 6960
ATTTTCTGTC ACACCTAGAG AGGGGGTACC ACTGGCTTTC GGTGTATAGA AAGCAGTGCA 7020
AGGAAGGGTC ATCAATCAAC 7040