EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM068-00334 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
GMP 
Coordinate
chr1:89752630-89755350 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:89752919-89752930ATGACCTTGAC-6.32
EsrrgMA0643.1chr1:89752919-89752929ATGACCTTGA-6.02
IRF1MA0050.2chr1:89753371-89753392AAAGAAAAAATAAAAGAAAAA-6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:89752926-89752941TGACCTTTTGATCTT-7.29
Nr5a2MA0505.1chr1:89752918-89752933CATGACCTTGACCTT-6.8
Nr5a2MA0505.1chr1:89752889-89752904GCTGGCCTTGAACTT-8.42
POU3F1MA0786.1chr1:89753777-89753789AAATTAGCATAT-6.11
POU3F2MA0787.1chr1:89753777-89753789AAATTAGCATAT-6.14
POU3F3MA0788.1chr1:89753777-89753790AAATTAGCATATA-6.71
RARAMA0729.1chr1:89752923-89752941CCTTGACCTTTTGATCTT-7.86
RarbMA0857.1chr1:89752926-89752942TGACCTTTTGATCTTT-7.61
SOX10MA0442.2chr1:89753544-89753555AAAACAAAGAC+6.14
SPI1MA0080.4chr1:89753961-89753975TACTTCTGCTTTTT-6.45
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00241chr1:89743208-89763671pro-B_Cells
mSE_12094chr1:89753013-89753657Spleen
mSE_12094chr1:89754465-89755293Spleen
Enhancer Sequence
GTAGCCTCAA CTGACCTGGA ACTCATTTTA TAAACCAGGC CGGCCTCAAA CTCAGAGATC 60
TGCCTGCCTC TACCTCCCAA GTGTTGGAAT AAAAGTCATG AGCCACCACA CCCTGAAGAA 120
ATGTTTATAT TTTTGATGTC AAATGTAAAG TGTTTTTTTT TTTTCCTTTG CGAAATGAAA 180
AGTAACAGAA AGTAAGTAAA GGGATCAAGT TTTATTTTTT ATTTTAGTGT TTGGAGGGAA 240
ATGGTTTCAT GTAGTCCAGG CTGGCCTTGA ACTTGCAGTG CAGCTGAGCA TGACCTTGAC 300
CTTTTGATCT TTTGTCCTAC CTCCTGAGTA TATGCTATAT GCCCTACCTC CTGAGTATAT 360
GCTATATGCC CTACCTCCTG AGTATGTGCT ATATGCCCTA CCTCCTGAGT ATATGCTATA 420
TGCCCTACCT CCTGAGTATA TGCTATATGC CCTACCACGC CTAGTTTTTG CAATCCTGAA 480
AATTGAATTC AGGGCCTCAA TGCTAGATAA ATTGTCTACC AGCTGAGCCA CATCCCCAGC 540
CTTCAAGTTT TAAAAGACTT GAAAAGCTCA GGTTTATGAA ACACAACTAT GGCTAGGAAA 600
GTAGCTCAGT GGGTAGTGTG TTCCTCTAGC ATGTGTGAAG CCAGTGTGAT GGGGCATGCC 660
TGTAACCCCA GCCAGAGAAT CAGGAGTTTA GGGTCGCCTT TGGAAACTAG CCCAGGGTAC 720
AAGGCTCTGT CTCAAAAAGT AAAAGAAAAA ATAAAAGAAA AAAGGGACTA TAATTCACGT 780
GTCATTTGAT TTCCTCATGT AAGCAGTGGT TTGCCTGGGA ATAGTGGTAT TTCTAATCCC 840
AGGTGGTGTG GAGGATGAGG CAGGAGAGTA TGGAATAGCT TAGGCTATAT TAACAGGATC 900
TGGTTTTAGA AAACAAAACA AAGACTCTAC AGTTGGATGA CTTTTGGCAT GTTCACAGTT 960
GTGCAAGCGT CACCACAGCC AATTTTAGAA CTTTTCATCA CTGGTTCCTC TCAGCTCCCT 1020
CAAACCTAGG CAACTGCTCA TGTAATTTCT GTCTCTGTGC TTGCCCATGC TGTTTAGTTT 1080
TTAGAACTGG AGTCGTTTAG TATGCTGTCT TTTGTGTTTT TTTTTCATTA AGCATATTTA 1140
AATTAAAAAA TTAGCATATA AAGTGATGAG TTTCATTGGA ATACTCACAT ATATACTGTA 1200
TCATTATACT TACATTCGGT ATATTTTCAG GATTCCTCCA AGTTATATTG TGTGTCAATA 1260
CCACATTCCT TTTTACTAGT ATTCTGCAGT AGAAATAGGC TTCATTTTGT ACATTTATCA 1320
GTTAATGGGA TTACTTCTGC TTTTTGGCCT TTCTAATAAC TCTCCTGTGA GAATTTGTGT 1380
ACATGTTTGT ATAGATGTGT TTTCATACAT ATATACACAC ACACATACAT ACATACATAC 1440
ACAGACACAG ACACACAGAC ACACACACAC ACACCTAGGA GTAAAAAAAT TTTTTTTCTC 1500
TGTATAGCCC TGGCTGTCCT GGAACTCACT TTGTAGACCA GGCTGGCCTC GAACTCAGAA 1560
ATCCGCCTGC CTCTGCCTCC CAAGTGCTGG GATTAAAGGC ATGCACCACC ACCACCCGGC 1620
TAAAATTTTT GAGCTTTATG GAAACACTGT TGAACATTTT GAGGACCTGC TGGGCTGTCT 1680
CACGAGTCCT GGCCTCAGTA TGTGAGGAGC TCCAGGTCTC TGCATCCTTG TCATAGTCAC 1740
CATCGTTTTT ATTATGGCTG ATCTAGTAAG TGTGAAGTGG TATAAGATTT TTTTCCCCAC 1800
TTCTTTTTCT TTTTCCTGTG CTAAATAAGA GATGAAGCCA GATCCTCATG TGGGCTAGGC 1860
AAGTGCTGTA TCATTGAGCT ACACTTGCAG CCCATATAAA TATATGTTCA AGTCTTCCAC 1920
AGACTTTACT ATGTATAACA TCACATATAT AGGGGTCCTG TCCCTACCAG ACCAGTTACC 1980
CCTACCTAGA TGGAGAAACT GCCACCCATC AATGGAATCC TCAGCAAGGT TCAAACCCAG 2040
AAAATGATAG CTGCCATCCC AAGCTGTTTT GGTTGATCTT AGCAAGGACT CCAGGTCTTG 2100
ACATGTTAAG TGTTATGCCA GGCACTTGGT GTTTTCTTGA ACACCAGTAA CTTTCAGGGA 2160
GGTTAGGCAG GAGTCTAGTC AGGAGCCCAT AGGCAGGATG GCCATGAGGT TAACAAGAAG 2220
AGGTGATGTT AATGAGACCA GGGTGCTTTG AGAAGACATC AGGGTGAGAC TCACCTAAAC 2280
ACAGGGAGAA CTGCCAAGGA CTGCTTGAGG AAGTGACCTT GGCAAAGTGT GAGAAGAGAG 2340
ATCAGAGGGG AGCGGAGAGA CTGAGCCACA CTGGTGAGTG CAGTGCTAAG TGGCAGGGTC 2400
TGATGTGAGA TACTGGCTAG GCTACGGAGA GGACCATGAC CCTTGATGAA TGTGAATGTG 2460
ACATTGGAAT TGCATTTGCC TTTGGAATTA GGACTGGGGT CTGTAGTGGG CATGGTGTCT 2520
TCCCCAAATC TGATCTGACC CAAACCTCAG ACATGACCTT ATAGAATCTT TGCAGCTAGC 2580
TAAGGATCTT GAATTCAGGG TGAACTCTGA TGTCTGGAGT CTTTATAAGA GGAACTTTGG 2640
ACCCAAAGAC TCAGAGGAAA AGGTAATATA TAAACAGCTG GGTACCGGGG CCAGCAAGAT 2700
GGCTCAGCAA ATAAAGCACT 2720