EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM065-19741 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E 
Coordinate
chr7:52408490-52409670 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
Pold1ENSMUSG00000038644
Atf5ENSMUSG00000038539
Akt1s1ENSMUSG00000011096
Tbc1d17ENSMUSG00000038520
PnkpENSMUSG00000002963
Ptov1ENSMUSG00000038502
Med25ENSMUSG00000002968
FuzENSMUSG00000011658
Ap2a1ENSMUSG00000060279
Irf3ENSMUSG00000003184
Bcl2l12ENSMUSG00000003190
Scaf1ENSMUSG00000038406
RrasENSMUSG00000038387
Prr12ENSMUSG00000046574
NosipENSMUSG00000003421
Prrg2ENSMUSG00000007837
Rcn3ENSMUSG00000019539
FcgrtENSMUSG00000003420
Rps11ENSMUSG00000003429
Rpl13aENSMUSG00000074129
Pih1d1ENSMUSG00000003423
Cd37ENSMUSG00000030798
Lin7bENSMUSG00000003872
Snrnp70ENSMUSG00000063511
Gys1ENSMUSG00000003865
Ruvbl2ENSMUSG00000003868
Ftl1ENSMUSG00000050708
BaxENSMUSG00000003873
DhdhENSMUSG00000011382
Nucb1ENSMUSG00000030824
Ppp1r15aENSMUSG00000040435
Rpl18ENSMUSG00000059070
Sphk2ENSMUSG00000057342
Grwd1ENSMUSG00000053801
Kdelr1ENSMUSG00000002778
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF5MA0599.1chr7:52409658-52409668GGGGCGGGGC-6.02
NFYAMA0060.3chr7:52409089-52409100TCTGATTGGTC-6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr7:52408530-52408545TGAACTCTGGACCTT-6.32
RFX1MA0509.2chr7:52408640-52408656GGTTGTTATGGCTACC-6.23
RFX1MA0509.2chr7:52408640-52408656GGTTGTTATGGCTACC+6.24
RFX2MA0600.2chr7:52408640-52408656GGTTGTTATGGCTACC+6.08
RFX2MA0600.2chr7:52408640-52408656GGTTGTTATGGCTACC-6.25
RFX3MA0798.1chr7:52408640-52408656GGTTGTTATGGCTACC-6.27
RFX4MA0799.1chr7:52408640-52408656GGTTGTTATGGCTACC+6.08
RFX4MA0799.1chr7:52408640-52408656GGTTGTTATGGCTACC-6.1
RarbMA0857.1chr7:52408530-52408546TGAACTCTGGACCTTT-6.42
ZNF263MA0528.1chr7:52409251-52409272GGGGGAGAGGGAGAATGAGAA+6.41
Enhancer Sequence
TTATAGGATG GTTGTGAGCC ACCATGTGGT TGCTGGGATT TGAACTCTGG ACCTTTGGAA 60
GAGCAGTCGG GTGCTCTTAC CTACTGAGCC ATCTCACCAG CCCTTAAAAA GATATTATAA 120
TTGTTTTGCA ACCCTACCTT TGTTTCAAAA GGTTGTTATG GCTACCATTT TAGGAACACC 180
TTGCAATAAT GTCTTTACTA CAGAAGGTTA TTATAATGTG TATGTTCTGC TCCTGTAACC 240
TCAACTATTT TGGTGGCCAA ATCCCCCTAT CCACAAACTA TATATAAAAA CCTTGTCTTT 300
CTCACATCCA GGACTGACTT CTAGAACCAA AGCTTATTGG GGAGGCAGCT TGTGTCCTCA 360
AAAAAAAGCT AGCTTAATTA ATTACTTGCT TAAATTACTT TGGCCGTGAT GATTTCGGGT 420
CAGTGATCTT TCTCCTTGTA TCTTTGGGAT CAACACTCTA AACTTTATAG AGTGTTTTAT 480
GCTGTCCCTC CAAAGCTGGA GTCCTTTTGT AGTGTGGTGA CTCCTCTTAA GAGTCTAAAG 540
ACTCTACAAC CTCCTAATAC CTGCTTGGAT GCTGGAAGAA TTTCTGGGAC CCTGGGCATT 600
CTGATTGGTC CTTGGTTTTA AAGAAAATCC CAGGAACCCT ACCACATTCC GATGAGGCTG 660
CAAGAGGGTT CTGGAGCCTT GGGCCAGGAG GCTCTAAAGG AATAATATAA ATGAAGTACG 720
AAAACAGGAA AATCTCCCAA AGAAATCCAC TAAACTTGGG AGGGGGAGAG GGAGAATGAG 780
AATAGGATGG GCTAGGAGGG TCAAGAGAAC TCAGATGACG TTCGAAGGGG CAGGAGATCA 840
CAGAGCACCG TAAGGATATT GAAACAAGGG GAGCAGTCAT AGCAAGTTTT GGACGAACTT 900
GGGGTTCTAA ACGAACTTGA GGTTCTAAAC GTTCCCGCGA GCCTCCAAAG TGCCGGGGGC 960
CACAAGGAAC CACGATCTAG CAAGGTGAAG ACTCAGGAGG ACCGCGAGAG GTATGGGGAT 1020
TTAGTGACCA CCCGTTCCTG AAGGGTCCTG GGGAAACACT ACGGCGGCGT TCGGGACCGT 1080
AAACGAAAAC CGCGAGGACA ACCATCGCCG CCCACCGCCA GCCGCCCAGC CCAGGCTTCC 1140
GCACTGTAGG GGAAATCACG CGCTCAGAGG GGCGGGGCTT 1180