EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM065-09942 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E 
Coordinate
chr17:35036860-35038460 
Target genes
Number: 37             
NameEnsembl ID
Gpsm3ENSMUSG00000034786
Rnf5ENSMUSG00000015478
Atf6bENSMUSG00000015461
Stk19ENSMUSG00000061207
Dom3zENSMUSG00000040482
Skiv2lENSMUSG00000040356
RdbpENSMUSG00000024369
CfbENSMUSG00000090231
Zbtb12ENSMUSG00000049823
C2ENSMUSG00000024371
Ehmt2ENSMUSG00000013787
Slc44a4ENSMUSG00000007034
Neu1ENSMUSG00000007038
Gm8696ENSMUSG00000092557
Hspa1bENSMUSG00000090877
Hspa1aENSMUSG00000091971
Lsm2ENSMUSG00000007050
VarsENSMUSG00000007029
Ng23ENSMUSG00000036185
Msh5ENSMUSG00000007035
Clic1ENSMUSG00000007041
Ddah2ENSMUSG00000007039
Ly6g6dENSMUSG00000073413
Abhd16aENSMUSG00000007036
Gpank1ENSMUSG00000092417
Csnk2bENSMUSG00000024387
D17H6S53EENSMUSG00000043311
Bag6ENSMUSG00000024392
Prrc2aENSMUSG00000024393
Aif1ENSMUSG00000024397
Ncr3ENSMUSG00000086076
Lst1ENSMUSG00000073412
LtbENSMUSG00000024399
Atp6v1g2ENSMUSG00000024403
Nfkbil1ENSMUSG00000042419
Ddx39bENSMUSG00000019432
H2ENSMUSG00000073411
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr17:35037277-35037289GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr17:35037281-35037293GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr17:35037285-35037297GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr17:35037289-35037301GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr17:35037293-35037305GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr17:35038026-35038047TTTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.59
POU2F2MA0507.1chr17:35038413-35038426AACATTTGCATAT+6.21
RREB1MA0073.1chr17:35037581-35037601TGTTTTTTGTTGTTTTGTGT-6.11
SPICMA0687.1chr17:35037950-35037964TATTTCCTCTTTTT-6.13
STAT1MA0137.3chr17:35038280-35038291TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr17:35038280-35038291TTTCTGGGAAA+6.32
Enhancer Sequence
GGTGAGAGTG TGGAAGTTGG GGTGGAGAGA CTTGGGGAGT CTCTGGGTCG GATTTTTTGT 60
TTTGTTTTGT TTTTGTTGGT GGTTTGTTCT TTTGGGTTTT TTTTTTTTTT TTTTTCCTTC 120
TTCCGGGATT TAGCCTTAGA CCTCTTGTAT TCAGATTTTT TTTTTCGAAT TTACCAATAG 180
GCTACCAAGT GTCAGCTGTT GGGCTGGGCC TCTGTGAGCA GAGTAATTGT CGGCTTCCTG 240
GAGTTTGTGT TCTTTGGGGA GGGGTGGTCA GCAGAGGAGA CTGACAGATG TAGAATTAAT 300
TATATAGTTA TTGTCCTAAT TACACAAATG ACTGGGCAGG ATCAGCCTTC CCAAGTTTGT 360
GTTTTTTTTG TTTTGTTTTT TGCCTCTGAA CAAATGCTTA GGGAGGTTGG TTTGTTCGTT 420
TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTTTCAA ATCCCTACTT TGAGACCAGT CTCAAACCAG 480
ATAAAGTTTT TACTGGGAAC TCTTCCCTGG GAAGGCCACA TAATGACAGA ATGTGGGCGG 540
AGGCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGACAAG AACCTGGAAA TCAAAATTAT 600
GTCAAGGTTT TAAGGGCTCT TGATTCAGCT TAAGTATGGC TTGTGTAGCC TTCCTCTGGG 660
TCTTGTTTCG TTTATTTTGT TGTTTGTTTT GAGCTTTATT TTGTTTTGAG AGAGTAGTTT 720
TTGTTTTTTG TTGTTTTGTG TGTGTGTGTG TGTGTAACAG GGTCTCACTG TGTAGCCCTG 780
GCTGGCTGGC TGTGTAGACC AGGCTGGCCT TTAACTCACA GAGATCTACC TTTTTCTGTC 840
TCCTACATCC TGGGGCTGAA GGTGTACACA CATGCCTTTT ATTTATAATC TTTTTTTTAA 900
AAAAGATTTA TTTATTTATT TTATGTATAT GAATATACTG TAACTGTCTT CAGACACACC 960
AGAAGAGGGA ATCAGATCCC ATTACAGATG GTTGTGAGCC ACACCATGTG GTTGCTGGGA 1020
TTTGAACTCA AGACCTCTGG AAGAGCAGTC AGTGCTCTTA ACTGCTGAGC CATATCTCTG 1080
GCCCTTGTTT TATTTCCTCT TTTTGAGATG GTCTCATGTA GACTGAACTT GCTATGATCC 1140
ACCCCACCCA GCTTCTACAT TTAATTTTTT TCTTTCTTTT TTTTTTTCTT TACTCTTTCT 1200
TTTTTTAAAA ACTTTTAAGC TTCTGGGTGT TTTACCTGCA CATATGTCTG TGTACCACCT 1260
TGTGTGTCTG GTGCCCTTCA AGTCAAGGGG GCAGTAGACC TTGAGTTTGA AGGGGTTGTG 1320
AGCATCTTGT CAGTGCTGGG CAATTGGACC TGGGTCTTCC ACAAGAGCAG CAACCGGCTC 1380
TTAACCACTG CACTACCTCT CCGACAATGC TTGTTTTCTT TTTCTGGGAA AGTGATTACC 1440
TCACCATGGT GTGGCTGTTC TTCTCTGGTA CAGAAGTTCG TGTTTGCTCG GGCTCCTCAT 1500
ATAAAATTAT GAGAGCCAGG TGGATCTCTT AAGGTCTGGG TCAGCTAAGA ATCAACATTT 1560
GCATATGCCT TACACGTATC TGTCTTCCTT GTAGATACCT 1600