EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM065-01986 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E 
Coordinate
chr10:79512580-79516230 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
Cdc34ENSMUSG00000020307
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Ptbp1ENSMUSG00000006498
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
ElaneENSMUSG00000020125
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Rps15ENSMUSG00000063457
Apc2ENSMUSG00000020135
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Adamtsl5ENSMUSG00000043822
Mex3dENSMUSG00000048696
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Rexo1ENSMUSG00000047417
Klf16ENSMUSG00000035397
Fam108aENSMUSG00000003346
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr10:79514262-79514273TTCAAGGTCAT+6.62
EsrraMA0592.2chr10:79515884-79515895TTCAAGGTCAT+6.62
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EsrrgMA0643.1chr10:79515885-79515895TCAAGGTCAT+6.02
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Foxd3MA0041.1chr10:79514202-79514214AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr10:79513792-79513813TTTTTCTTTTTCTTTTTTTTT+6.09
Nr5a2MA0505.1chr10:79515881-79515896GGGTTCAAGGTCATC+6.92
Nr5a2MA0505.1chr10:79514259-79514274GAGTTCAAGGTCATC+8.03
RELAMA0107.1chr10:79513182-79513192GGAAATTCCC-6.02
SOX10MA0442.2chr10:79514116-79514127AAAACAAAGGA+6.32
Sox3MA0514.1chr10:79514116-79514126AAAACAAAGG-6.02
Stat6MA0520.1chr10:79514373-79514388GCTTCTCAGGAACTG-6.51
ZNF263MA0528.1chr10:79514708-79514729TGAGGCGGGGGGGGGGGGGGG+6.69
ZNF740MA0753.2chr10:79514714-79514727GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514715-79514728GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514716-79514729GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr10:79514717-79514730GGGGGGGGGGGGG-6.03
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03546chr10:79513881-79517704Bone_Marrow
mSE_10175chr10:79512205-79516153Embryonic_stem_cells
mSE_11700chr10:79512223-79516177Placenta
Enhancer Sequence
ACATGCCTTC CTGACCCAAG CGCAGAGGAA TACAGGTCTC AAACCCCAGG GTGAGGTGTG 60
TGGGAGGAGT GGGGATTGGA GAGTAAAGGC AACAGCAGCA GCTGGGCCTA GGAAACCAAG 120
CAAGTTTCTT AAAGAGAACA GCATCCCCCA GCAGTGGTGG CATGCCCACC GCCTTTGATT 180
CTGGAGGCAG AGGTTGGAGG AGCTCTGTGA GTTTGAGGCC AGCCTGGGCT ACACAGGAAA 240
ACCCTGTCTC AAACAAACTT ACTTTCAAAA TCTGGCATCC TATTCCCAGG TAGGGAATGG 300
TCTCCTAAGA CAGCAGAGAG TGAAATCAGA CAATGTTTGC AAAGCGCACT GGGGACATCT 360
CAGACACGGC TTGCCTTAGG GCCTGTCATC ACAGCCATTC AGGGGAGAAA TCTGGCTTCG 420
TGGGGAACAA AACCTTAACT TTGAGGCTTA GGCCCCAACC CCAGGCTGGA CCTTGCCTTG 480
TGTGCCCCTA GACAAAGGGA CTAGGGTTCC CTTTGTCCTG CACTGGGGTC TGAGAGAGCC 540
TGGGGCTGGT TTGGCTCCCA ACACTCGAAC AGTGAGAAAT CTCTCAACAC AGATCGCTGA 600
AGGGAAATTC CCAAGAGCAC CTGACCGGTT CTGGCCAAGG CACAAAGGGT GCAGCCAATA 660
ACAACAAGCC ACTTAACCCA GTGGTTCTCA ACCTTCCTAA CGTTGTGACC CTAAATACAG 720
TTCGTCATGT TGTGGTGACC CCCTAGCCAT AAACCTCCCA TTGCTACTGT AATTTTGTGA 780
CTGTTATGAA TTGTAATGTA AATATCTACT GTGCAGATGA TTTGATAGGG AAGAACCTCC 840
GAGAAAGAGT CCCCAAAGGG GCCTCCACCC GAGGTTGCCT CCGCTTGTAT GGTTTCACGG 900
CCCCAACTTA TTTCGAGCAG TTAAACATGT TCGACAGAGG CAGAAACTCC AAGGCTGTTT 960
GGACGAAGGG GGGAGATTTA CAGTTTAAAT ATAATTTCAG TCTTTTGGTC ACAGACTAGG 1020
GGCCTGTTGC CTGGCAGAAT CCCGCCCTTC CTGCGAGTGG CCTTGAGGAA AGAGGGGATG 1080
GACTAGCCAC AGGACTCATG GGCCACCTTT GAACCCCAGG GCTTTGATAT GGGGGGACCC 1140
GGTTACAGGC CAGCTGTGAG CCCGGAGTCA GTCTCCTTTT GTTATGGGGA TGAAGCTTAA 1200
CTGGCTAATC TTTTTTTCTT TTTCTTTTTT TTTTTTTTAA TCCCCCCCCC CTTAACTGGC 1260
TAATCTTAAT AACAAACCTG AAGGCTATTC TCTGTCCTCC GTTTAGCGGC CCGGCCTACT 1320
GTCCCTAGGT GGCTGCTCTA CCCGGAGCAC TCCCTTAGTT AAATTCCACT TTGCATAACT 1380
TAATCTTTCT TAAGTCCTTC TAGCAGGTTG TCCACGACCG CGGCTTCTCA TTCCCAGGGT 1440
CCCCTGTTGG TGGCAATGGC TCTGTCTTTC CAGTGCTTGG GGAGCAAGAG GCGAGAAGCT 1500
CCGAGGAGCC TGGGGAAATT GGAGACCTGG TCTCAGAAAA CAAAGGAAAT TAGAAACAAA 1560
GGCTGGGGCT TAAGGCCTCA CTTGGTATGT GTAAAACCTG GGGTCCACAC CCAGCACCCG 1620
ATAAACAAAC AAACTTGTCA TCCCGGCAGG CACTCAGGAG GGTGAAGTAG GGGGATCAGG 1680
AGTTCAAGGT CATCCTTGGC TACAAAGTGA GTTTCAGGCC AGCCTGGGCT ACGTGAGACC 1740
CTGTCTCCAA AATAACAATG AGGTAAAAGT CAGGCTCTGT CCAGAAGCTG GTAGCTTCTC 1800
AGGAACTGCC AAGTAGCTTT TCGCAGAAGC CCAGATCTTC ATTTCCCAAC TGGCTGAATT 1860
AGGGTGAAGT TGGGGTCACT TGGGAGAGGA AGGCACTCCA TATGCAGATC CCTCCCAGAG 1920
CCTGGGGCTG GGTTCCTGAG TGGCCGCCTT CAGCCCCAGC CCTTCAGCCC CAGCCCCTCG 1980
TCCAGAAGTA CGGGCCTTTG AGACGCCCTG TGAGGGTGTG TTGTGTATTT ACAACTTAAG 2040
CTAAAGCTCA AGTGCAAGTC CCTTAGAGGT CTTCAGTGAC TCTCAGTGTC ACCCCAGCTT 2100
GGGGGCTGGG AGGAAACAGC TGACTTCCTG AGGCGGGGGG GGGGGGGGGG CCCTCAGGGC 2160
AACTGAGAAC TTACAGGACA GGATTGGGCA AGAATGTATC TGACACCCCA GATCATCTTA 2220
ACCTTGGGGG GGGGGGTGTC TGCCCGTGGG GCGTGAGCTC CCTTGGACCC AGATCCCCGG 2280
GAGGGCTCCT GTCTCGCGGA TGGCTTACTC CAGGGTTCAG AAAAAGAGGA TTGAAGGGAT 2340
TAGAGTCCAG GCGAGGGCGT GGACAGGCAG CTGAGCTGAG GAATGTCCTG AGTCACTCCT 2400
GTGACACGGG GAGGGCAAAG GGCCCAGTGC TGGGCTGAGA GCTGTGGGGG CTGGACAAGG 2460
CCATAGGTGA AGTTGCAGGA GGAACTGTTG GGCCTTCAGC TTCTCACTTA GGCCCCTAAG 2520
ACCTGTGGCT TCTTTGATGT AGGCAGGGAC CTCTGAGGAC AATAGTAACT ATTTATATGT 2580
CTCTTGCCAC CTTGCTTTCC TGACACAGGG TTCACTGTAG CCTTGGCTGA CCTGGAACTT 2640
GCTTACCAGA CCAGGCTGCC CTCTAGGCTC CAAGGGCTGG GGCTAAGAGT GTGACCACTA 2700
GGCCCATCTC CATCTTGGTT TTGAGGCAGG TTCTCTCTCT GACCACGAGT ACTTGGGTGA 2760
CCTGACTTAG CTGCAGGGAT GCTCCAGCCT CGGAATCGCA GGTTCTGGAA TTACAAGAGC 2820
ATCCTTGTGC ACCAGATTGC GTGGGTGCTT CGATTGGGAC ATAGTCCTGT GTTTTCATGG 2880
CAATGGCTTT CTCACCAAGC CCTCTTATCA CCCCCTCAAA TCAACTTCAC AGGAATCAAT 2940
ATCTACAGGT GACAAGATAG GGCCTGGTGT CATTGACCTA TCTATCACCC TAGTACCTAG 3000
GAGTCTAAGG CAGGATTGCT GAGTTCTAAG ACCGGCTGAA CTGTAAAATT GGGGGTCGAG 3060
GGGGGGGGGA GAAGCTACAT CTGGGGTTCG GGACTCAATG GGTTGAGAGC CCTCACTTGC 3120
ATGCTGCAGG TTCTGGGTTC CATCCCTACA CCTCATGGCA GCACACTTTT GCCATTCCAT 3180
AGTTTAGGTT AGCCTGAGCT ACAGGAGGCA ACCTCTGATA AAGAAAATAG AAATGGAAGG 3240
GATGTGGGGA TTGGCCGACA CCGAGATCCC AGCACTCAGT AGGCTGAGGC TGGCGGTCCA 3300
GGGGTTCAAG GTCATCCTCT GCTATATAAA CAGTCCAAGG CTAGCCTGGG TTACATGAGA 3360
TTCTGTTTCC AGTAGAAAAA GGAGACTCCT GTACTTTCAA AGGGGCTCTT TAAGGGGATG 3420
ACTTTGACAC GCTTTCTATT CCCAGAGGTT CCCCAAAGCG CCCTGGCACC CTGCTCCGCT 3480
GCAGGCAACC TCGCGGATAA CTGTCCACAG CCCTCCAACG CGTCGTCCGC GAGAACGCGG 3540
CTCCCGTTTC TCCCGCGTCC CTATCACTGG GCATGCGCAG TTGCTGATAA CAACAAACTC 3600
GTAAGCCCAG CCCCGCCCAA GCCGTCCCTT CATTCAGGCT TCCCATTGGC 3650