EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM065-01953 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E 
Coordinate
chr10:79443460-79446650 
Target genes
Number: 43             
NameEnsembl ID
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
BsgENSMUSG00000023175
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Ptbp1ENSMUSG00000006498
Prtn3ENSMUSG00000057729
BC005764ENSMUSG00000035835
ElaneENSMUSG00000020125
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
Dazap1ENSMUSG00000069565
Rps15ENSMUSG00000063457
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Adamtsl5ENSMUSG00000043822
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Rexo1ENSMUSG00000047417
Klf16ENSMUSG00000035397
Fam108aENSMUSG00000003346
Csnk1g2ENSMUSG00000003345
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR1MA0112.3chr10:79443616-79443633GGGGTCACCATGACATG+6.76
ESR2MA0258.2chr10:79443617-79443632GGGTCACCATGACAT+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:79445705-79445723GGAGGGCAGGAAGGAAGA+7
FOXD2MA0847.2chr10:79443553-79443566ATGTTTACATTAC-6.2
NR2C2MA0504.1chr10:79446617-79446632TGGGGTCAGGGGTCA+6.67
NR2C2MA0504.1chr10:79446631-79446646AGAGGTCAGGGGTCA+7.19
NR2C2MA0504.1chr10:79445281-79445296TGCCCTCTGACCCCT-7.58
NR2C2MA0504.1chr10:79446624-79446639AGGGGTCAGAGGTCA+9.03
Nr2f6MA0677.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.03
RXRBMA0855.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.04
RXRBMA0855.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.06
RXRGMA0856.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr10:79446632-79446646GAGGTCAGGGGTCA+6
RXRGMA0856.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.01
RxraMA0512.2chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+6.98
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03404chr10:79445313-79453117Bone_Marrow
mSE_06348chr10:79445348-79451828E14.5_Liver
mSE_07798chr10:79445937-79453081Intestine
mSE_09619chr10:79446247-79454263MEF
mSE_12142chr10:79446084-79453231Spleen
Enhancer Sequence
CTATGTGTCT GTGTGTAGGG GGGTCGCCTA ATTCAGTGGT ACCTGTGGGT CGCAACCCCT 60
TCAGGGGTTG CCTAAGACCA CTGGAAAACA CAGATGTTTA CATTACAATT AATAATAGCA 120
AAATTAGTTA TGAAGTAGGA ATAGAAACTA TGGTTGGGGG TCACCATGAC ATGAAGAACT 180
GTATTAATGG GTTGCAGTAT CAGGAAGGGT GAGAACCGCT CGCTGCCCTA ACCCATGCTG 240
AGTGGAAGCA GGGATGTCGT GCAACACTTG CAGACAGCAC ATGCGCACCA TGAGCACTGG 300
GCTGAAAGAG ACCCAGTACT CCATGTAGCT GTCTAGGGTC ACCCTCCTCT GTGGCCCCAA 360
CTGACACCCT AGCTTCCCAC CATGTCTCTG CTGGCCAGCA TAGGACCCTG GCCCAATAAG 420
GTGCCCAACA TAGAGTAGGG TGATGGGACT CATGAGGTCC TTACATCCCG GCACACCCAC 480
TGTGTGCACT CACATCCCTG CACCCTTCAG GGACGAGACT GGATTCCCAG ACCACAGTCC 540
TAAGGGACTC AGCCACAGCA AGCACAGTAG GGCCCTCCCC ACCTGCTGTT AGGCAGCAGT 600
GTAAGGGACA GAAGCAGGCA AAAAGGCCCT GCTCCATATC CTGATGTGCC TGTAGCCAGG 660
CCTCTCCTCT GCAATCTAGT GACAGAGCTG GACCCACAAA GCACTCAGCC CATCTAGCAG 720
TGACCTGAGG GAATACAGAG CATGTGTGGA AGGCCCAGGG ACTGAGACCA AGGCTACAGT 780
CTCCAGCGAG CCACACCTGA AGCTGCACCC ACCCTGTCAA CTGTGAGGTT CACCCTGGGC 840
AAGAAATCAT TTCTGTATCA GGTGAACTGA AGGCCAAGCA GCCCAGGCTG AGACCGCAGC 900
AGTCACTCCT CCCAGTCCAA TCCAAGAGCC AGGAACTGTA TCCCAGGTCC TGTTCCACCT 960
ACTGGGCATC TAGAGTCAAC ATAAGATAGC CACTGGACAG GGGTTATAGC CTGGGTCCTC 1020
TCTTCCCACC ATGGCCACTG TGGCCAGCCC ACGAGTCCTC ACTGGTCACT GACTCGTGCC 1080
AGTCACCCCA CTCAGGCCCT TGGGCACTCC TCCCTCATGT GCCCACTTGA TGCCACATAC 1140
ACAGGCACTG AACTTGGTTA TACCGGCCTG GTGGGGCTGC ACACCATCAC CTCCTACAGA 1200
CACCTCAATG CCAAGACCTA GGGTTCTTGG GAAACCTCCT ACCCTGTAAG CGGGGGTGGG 1260
ATGGAGTATT GCATTGTCAC CCCAGTCTTG TGTCTGGGCT GTCAGTTCAT CTGACCAATG 1320
GGAAGCCTGC ACTGGGGTCA GAATACCAGC CTCACTCATA TGCTTGCTTC TCTCTTGTCC 1380
TCTTGGGCTC TTCCTTTCCC CCTCTCTCCC CATGCTCACG GCTGTGGCCG GCCTCGACTT 1440
CTCTACTCTC TATCTCTACT ACACTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTGAGAC 1500
AGGGTTTCTC TGTGTAGCCC TGGCTGTCCT GGAACTCACT TTGTAGACCA GGCTGTCCTC 1560
GAACTCAGAA ATCCGCCTGC CTCTGCCTCC CGAGTGCTGG GATTAAAGGC GTGCGCCACC 1620
ACCGCCTGGC TCTCTATTAC ACTCTTAACT CCCTTCCCTG AGCCATGAAT AAACTCTATT 1680
CTACACTATA AAGACAAAAC CAAATACCAG CCTCAGCCAG GATCTCCACG AGATCATGAC 1740
CCACCCAAGG GTGCCACTTA GCACCTTTCA GGGCTCAAAT CCACTTGGTG CAGGGACTTG 1800
AGCTGGTGCC ACATACCTCC TTGCCCTCTG ACCCCTGCCA CATCCTAAGG TCTAAGGCAC 1860
CATGCTGTGC CCCCCTATCC CATGGCTGCC CAGTTTCGGT CCTTGAGGCT CTGAAGCCAG 1920
CAGAGGAGAT ACCAAGCCCA ACAGTTCTTC TCTGGGCCTC TGTAGGAGCT GACACCTAGG 1980
CTGGGGTGGG AACAGGGCGC AGGGTGGTAC AAGCCTAGCA GGCCTTGGCT GTGAGGCGTC 2040
CCTTCTAGGA AGGTTGGGTG GAAGCTGGGC AGGCAGGACG GGCAGGAAAC ACAGCAAATG 2100
GGCTCCCAGA AACGTCAGCA GCTCCAGAAA CCAGCTGCTG TGTGGCTTGT TTATCCCAGT 2160
TAAGAAAGAG GATAAGGTCT ACTGTCATCC AGCCGACCCT GTCTCTGACT AGACATTGGG 2220
CACCCACCCG GAGCCCTGAG GGTGTGGAGG GCAGGAAGGA AGATGGAGCA TGGGCTCATC 2280
TGCAGCCAAT GAACTGGGGC CTGAGGGGAT GCCCACAGCT GTCTTGAGCT CAAGCTAGAT 2340
CTACCTATGA AACCCCCGAA CGCTCAGTTC TGAGAAGCAC CAGGAGTGAG TCCCAAACTC 2400
ACCAATGCCC TCCAATATCA GCATGCCAGC CACCAAGCCA TGACCCCAAC ACCAGAAGGC 2460
CCAGGCAGCT CCTCAGAGAG AGCCTGGTGC CATCCCTCGA GTAGCCTTTG TGACCGAGAA 2520
CCGGGATCTC CCGGGAGCAC ATGAAGAAGA CACAGCCAGG GCAGGTGCTG GCTGTAGAGG 2580
TCCCTGGCCA ATCTGGCTGT GACTCTGTGG CTGACCCTAG TGAGATGACC TCACCCAAAG 2640
CCACAGAAAA CCTGGCAAGA GTCTGAAAAC AGTGAAGTAA CAGAAAATTT GAGCAGTGAC 2700
ACTGGGGGGT AGGGGGCTGT CCCCAGGGGG TTGGTTCAGG GTGTGCTGGA ATGGGACTGA 2760
CTAGTAGAGA CTGGACTGAG AGAATCAGGG TAGAATAGAA ATGACAGGCG GGACAGGGCC 2820
TCCAGCACAG GAGGTGGTCT ACAGTGGAAA GTCAGGAATG GAATGGAAAT GACCATATTG 2880
TTCTCAGTGG AGGTGCAGGA CAGGATGGGA GTGACAGGTG GGAAGGTGGA CCTCGAGTCC 2940
AAAATCCTAC TCCAAGAGGA CACTGGGCTC TGGTCTTGAG TGGAAAAATT TGGGGCCTAG 3000
GCTCCCAAGT GGCAGACTGA GGCCAAAGGG CAGGAGGCGG GGCCTGAGAG CTGAGGAAGT 3060
GAGGACCAGA GATAGCATCT GTAAGAGTGG TATCAGGGTA TCCAGGCGTC AGGAGCCAAG 3120
TGGTAAAGTT GCCGGGGGTG GGCGAGCGGA TGACAGCTGG GGTCAGGGGT CAGAGGTCAG 3180
GGGTCAGAGG 3190