EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM064-16829 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E-ER4 
Coordinate
chr6:124855510-124858390 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
Clstn3ENSMUSG00000008153
Gm5077ENSMUSG00000079343
Lpcat3ENSMUSG00000004270
Emg1ENSMUSG00000004268
Phb2ENSMUSG00000004264
snoU89ENSMUSG00000088835
Gm15884ENSMUSG00000087327
Gm20531ENSMUSG00000092482
Ptpn6ENSMUSG00000004266
Grcc10ENSMUSG00000072772
Atn1ENSMUSG00000004263
Eno2ENSMUSG00000004267
Spsb2ENSMUSG00000038451
Tpi1ENSMUSG00000023456
Usp5ENSMUSG00000038429
Cdca3ENSMUSG00000023505
Leprel2ENSMUSG00000023191
A230083G16RikENSMUSG00000055818
PtmsENSMUSG00000030122
Mlf2ENSMUSG00000030120
Cops7aENSMUSG00000030127
Zfp384ENSMUSG00000038346
Ing4ENSMUSG00000030330
AcrbpENSMUSG00000072770
Lpar5ENSMUSG00000067714
Chd4ENSMUSG00000063870
Nop2ENSMUSG00000038279
Iffo1ENSMUSG00000038271
GapdhENSMUSG00000057666
Scarna10ENSMUSG00000089617
Ncapd2ENSMUSG00000038252
Mrpl51ENSMUSG00000030335
Vamp1ENSMUSG00000030337
TapbplENSMUSG00000038213
Cd27ENSMUSG00000030336
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr6:124856214-124856226GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr6:124857979-124858000TTTCAGTTTCAGTTTTGTTTT+8.07
IRF9MA0653.1chr6:124857983-124857998AGTTTCAGTTTTGTT-6.95
NR2C2MA0504.1chr6:124855620-124855635CAGGGGCAGAGGTCA+6.72
Nr5a2MA0505.1chr6:124858111-124858126GAGTTCAAGGCCATC+7.49
Nr5a2MA0505.1chr6:124855641-124855656ACTGACCTTGAACTT-7.91
Nr5a2MA0505.1chr6:124857425-124857440GCTGGCCTTGAACTT-8.42
Nr5a2MA0505.1chr6:124855965-124855980GAGTTCAAGGTCAGC+8.73
PKNOX2MA0783.1chr6:124857609-124857621TGACAGCTGCCA+6.02
TGIF1MA0796.1chr6:124857609-124857621TGACAGCTGCCA+6.04
TGIF1MA0796.1chr6:124857609-124857621TGACAGCTGCCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr6:124857609-124857621TGACAGCTGCCA-6.07
TGIF2MA0797.1chr6:124857609-124857621TGACAGCTGCCA+6.44
ZNF263MA0528.1chr6:124856801-124856822GGAGCAGGGCGGGGGGGGGGG+7.67
ZNF740MA0753.2chr6:124856811-124856824GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr6:124856812-124856825GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr6:124856979-124856992CCCCCCCCCCCAC+6.92
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01504chr6:124833396-124882303Th_Cells
mSE_04420chr6:124852983-124855959E14.5_Brain
mSE_08548chr6:124853561-124856198Liver
Enhancer Sequence
CTGAAAAATC AGAGGGGAGA GATCTCATGG GAGCCTCGAC CCCTTAGCTG TCATCAGTGT 60
TACAATCCTC TCATTACCTA ACCCTCACTG GGATCAGGCT GGGAAAACCT CAGGGGCAGA 120
GGTCATAGGA CACTGACCTT GAACTTCCTA TGTAGCCAAG CATAACCTTG AACTCCTGAT 180
CCTCCTGCCT CCATCTCAGA AGTACTGTGT TTACAGGGCT GTCCCATCTG GCCATTAGTC 240
ATCTTAATAC TGTACTCGAA ATGTTCCCAA CCCTTCAAGA CATTATTCAA ACTGACTGGT 300
GCTGAAGGCC ACAGAGGCAG TACTTATGCT GAGATGTACC TCAGTTGGCA GAACACTTTC 360
TTAGAATGCT TGAGTTCGTG GGTTCAGTTC CCAGCATCCC ATAAACTGGT GTGGTGGACA 420
CAAGAAAATC AGAAGCTAAA GATTCACTAT GCACTGAGTT CAAGGTCAGC CTGAGCTACA 480
GGAGACCTTG TTTTAAAACA TAAAATAAGG TTGGAAAGAC GGCTCAGTGG TTAAGAGTAC 540
TTGGTGTTCT TCCAGAGGAC CCAGGTTCAA TTCCCAGCAC CCACATGGTA GCTCACTCTT 600
GTCTGTAACT CCAGATCCAG GAGACCAACA CCCTCGTCTG TTTCTGTGGG TACAGGACAC 660
AAATGTACAA GCAGGCAAAA TTCACATATA ATAAGATACT TTTTGTTTGT TTGTTTTTCA 720
AGATAGGGGT TCTGTCTGTA GGCCTGGCTG TCCTGGAACT CACACTGTAG ACCAGGTTGG 780
CCTCAAATCA AAGATCTATC TGCCCCTGTT TCCCCAGTGT TGGGATTAAA AGTGTGTGCT 840
ACTACCTGGC TTATTAAATA CATTTTTAAA TAAAATGAAG AGGTGGCTCA GAGTTTACTA 900
AGATATTAGG GTTTACTGCT CTTCCAAAGG ACCCACATTC AGTTCATAGC ACTCACACCT 960
GGCAGCTCCA GGGAACCCAA CACTCCATTC TCACATCTCC TTGGACACCC ATGTGTGCAC 1020
ACTCACACAG AAACACATAA CTCACAAGAA TTATTCTCTT CTAAACTGCT CAGACTCTCA 1080
GGGCTTAGTC AGATGAATCA GCACCCGGTA CTCCCAATGA CATCCCAGGC CCCCATCACT 1140
TCTCTCACAC CAGTGCACCC CCCAGTGACC CCAGCTTCAT GGTGCCTCTG GATGAAGGTT 1200
ACGGCGGCTT CTTGAATGTT TACAGAACAA GTAAGCAACT GATTGATCCC CAGGCAGAAT 1260
ATGTTCCAAG TTGACTAGAG AAAGGATGGT AGGAGCAGGG CGGGGGGGGG GGGGGACTTT 1320
AGTAACACAG ATATCCAACT TTCAAGTTTA GACCATGACT CTAGCATTTG GCAGTGGTGT 1380
GACCTTGAAT ACTCCTTCTC TGTAAAGCAC AGATGTCAGT CTCTCTCCCC CTGAGCACAG 1440
CTGATTTTTT TTTCTTTCTC TCTCTTTTCC CCCCCCCCCC ACTTGGGTGG AGGGTGGGGG 1500
GAGGACAGGG AGGGATTCTC TGTGTAGCCC TGGCTGTCCT GAACTCACTC TGTAAACCAG 1560
GCTGGTCTCG AACTCAGAAA TCCGCCTGCC TCTGCCTCGA AAGCAGAAGT GCGCTAGAGC 1620
ACTAGAAAAC ATTAAGGGCT GCCTTTATGG GTGGGCTTTG GTGACTGTTG AATGTGGCAA 1680
AGGGGGGGTT TGGGAGGAGT GGGATTCCAA TGGCGTTGCT AATAGACTAA GTCGGCAAAG 1740
GGGTGACTTA AAAAGATGGG GTTCCCTGTG AAGCTGAAGG GTTGAGTCAA CATAATATCA 1800
AGATAAAGTT ATAGAAAATG TGTGTGGGAT TCAGGGTTAC CAGTATGTGT TAGGTCATTT 1860
ACTCATTCAT GTATTCAGTG TCTGTTTGTT TTAAGACAGA GCTCATGTAG CCCAGGCTGG 1920
CCTTGAACTT TCCATGTACA TTGGGGCTAG CCTTGAGTTC CTGGTCCTCC TACAAAGTGC 1980
TAGGATTTCA TCAGTGTCCA GCCTCGCCTG GCTCCAATAT AAATTGCTAA GCGGCTATCA 2040
CGTGGTGCTG CTTAATAGCC GAAAATAAAT AACCATAGAT GTAGCTGATC TGTCACAGCT 2100
GACAGCTGCC AATCAATGAA CACATACTTT CTGATTTGGG GTTGTTTTGG TTTGGTTTTG 2160
GTTTTGCCTC TATTTGTTTT ATTTTGCCTT AAAATAAAAC AAAAACAAAA ACCTTATTCA 2220
CTAAATACTG ACAAGGGACG GATTTATCAG CTCCTTCGAA ACCCAGGTCA ACTCCCACAA 2280
TTTTAACAGA GCCCTAGGCC AAAAGCAGAC AAGGGTTCAA AAATATATGC CTCATTCTTT 2340
TAACCATTCA AATTTTTCTT TCAAATTTTT ATCATCTCTG TTTCTACCTT CTTGGACATC 2400
CTGGCAATTC AGAGTAGGGG AGTCCCTCAG AGAAGAGTGG AACGTTTATT TTGTGACTCA 2460
AGGGGAGATT TTCAGTTTCA GTTTTGTTTT TTGTTTTGTT TTATCACAGG GGTGAAAAAA 2520
AAAAAACAGC TCATAATTTG ACAGGCACAG TAGTACATGT CTCTAGTCCC AGCACTTGGG 2580
CCTTGTAAGC AGCAGAATCA GGAGTTCAAG GCCATCCTAA GCTAAAGGAG AAAAGGTGCT 2640
TTCTGTGCAA ACCCTAGAAC CCAGAGAAAG GTGGGTAGAG AGAACTAACT CCACAGAGTT 2700
GTCCAGTGAC CTCAAATACA TGCTGAGGAA CATATACTGG TCATGCGCGC GCGCACACAC 2760
ACACGCACAC ACGCACAGGC ACACGCACAC GCACGAATGC ACACACCCCT CTCTGACAGC 2820
CAACACTCCC ACCCTGTTCT TTCTCCCTGA GATGGAAACT ATTCCATTCC CACCTGTGGC 2880