EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM064-12897 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E-ER4 
Coordinate
chr3:88960840-88963700 
Target genes
Number: 36             
NameEnsembl ID
Lamtor2ENSMUSG00000028062
Ubqln4ENSMUSG00000008604
Ssr2ENSMUSG00000041355
Arhgef2ENSMUSG00000028059
2810403A07RikENSMUSG00000028060
Rit1ENSMUSG00000028057
Gon4lENSMUSG00000054199
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
Rusc1ENSMUSG00000041263
FdpsENSMUSG00000059743
PklrENSMUSG00000041237
Hcn3ENSMUSG00000028051
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
Gm16069ENSMUSG00000086718
Fam189bENSMUSG00000032657
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Trim46ENSMUSG00000042766
Dpm3ENSMUSG00000042737
Slc50a1ENSMUSG00000027953
Efna4ENSMUSG00000028040
Dcst1ENSMUSG00000042672
Gm15417ENSMUSG00000074466
Zbtb7bENSMUSG00000028042
Flad1ENSMUSG00000042642
Cks1bENSMUSG00000028044
Shc1ENSMUSG00000042626
Pygo2ENSMUSG00000047824
Pbxip1ENSMUSG00000042613
PmvkENSMUSG00000027952
Ube2q1ENSMUSG00000042572
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr3:88960963-88960984AAATGAAAAGAGAAAGGAAAA-6.56
RESTMA0138.2chr3:88963258-88963279TTCAGCACCACGGACAGCAAA+9.12
SPICMA0687.1chr3:88961059-88961073AGAATGAGGAAGTC+6.1
Enhancer Sequence
TATTGTTACT TTATGGCAAA ATTATTCTTA TTGTTCAATA CTATTTTCTT TATTTACAAG 60
TTAGAATCAA GAGACAAAAA ACGATGGCCC AAAGGACCAA GGAGGCGAAT AACTAAAACC 120
TCTAAATGAA AAGAGAAAGG AAAAAGGAGA AAGCAGAAAA AGAAGATCAG CAAAAAAGAA 180
AAAAAGCACA GAGAGGTTCT TCCTCTTCCT TCCCCACTGA GAATGAGGAA GTCAAATACA 240
TAGCGATATG TTAGTGTGTG TGCGTGCACA CGCGTGTACA TGTATGCATG CCACAGCACA 300
CATATGAAGG TCAGAGGACG GCTTGTAGGA ATCAGTTCTC CCCTTCCACC ACGTGGGTCC 360
CAGGAACTAA GCTTACATGG TCAGGCCTGT TGGCAGATTC AGTACCACAG AATAGAATGC 420
AGGAATAAAG ATGCAGTTCA GAGGCAAACT GTGCACCTGG CGTGTCTGAA GATCTAGCTT 480
CAGTCCCTCG CACATCTCAC CCACCCATGA AAAGTGAGAA TAGTGGATTT GAGAGAAGAT 540
TGTGAGATTA AGCCGGATGG TGGTGGTGCA CACTTGTGAT CCTACCGCTT GGGAGGCAGA 600
GGCAGGTGGA TCTCTGAGTC CAAAGCCAGC CTGGTCTACA AAGTGAGTTC CAGGACAGCC 660
AGGGCTACAC AGAGAAACCA TGTCTCAAAC AAAACAAAAA ACAAAACAAA TAGCAACAAC 720
AACAAACATA CCAAAACAAA AGCCAAACAA ACAAAAGCAA AACCCCACAC GCGCACAGGC 780
TGGAGAGCAG TTAAAGGCAC TCGCTGCTCT TGCCGAAGTC CCAGTTTCAG TGCCCAGCAC 840
CCATATGCCA GCTTACAACC ATCCGTTAAT CCAGTGCCGG GGGATCTGAC CTCCTCAGCC 900
ACTGCATGCA CATAATGCAC AGACTTATAT GCAGGCAAAA CATTCATACC CATACAATAA 960
ATCTCATTTT TTTCAAAAAG TAAATGTGAG CACAGCTACA AACACACCTA TGCACACACA 1020
CTCACATGCG CGCACACACA CACACACACA CACACACACA GACACACACA CACACACACA 1080
CACATATACT AGCACCAAGG TTGTTTTGTA ATTTTCTAAA ACTAGGGAGC CTGCGCTGAC 1140
CTCACTGGGC TGTCAGGCTC AGCAGTGCTG TCTACACTGT AGCTGTTGCT ATGGTGCATA 1200
CACTCTTTAT CTCTTTATCT CCAGACTTCT GGAAATTCTT TTCCCGTCTC CAGGTCTCTA 1260
TTTCTAGTCT AGGCTGTCCT TCCCTTCTCT ATCATCCCCA CTCCAACATG AGAACAGGAA 1320
TGATGATTTC CTGTAGGTGA GGAACTGCCA TCCTTGGTGG GGGTGGGGAC GGGAAGAGGC 1380
TACCCTGTAC TCATTTAAAC TGGGCCTTTC AGGGATGCCC ATCCCCCTCC ACAGATGGGC 1440
TATGCACATA GAGGATTCCC TGGGAGATCC CAAGGCATCG AGGCTTGAGC TATGCACCCC 1500
TTCCCTCCTC CAGGCTACCT GTGCTAAGAT GCGCAAGGAC AAGCTACATT GCCTCAGAAG 1560
AAACTGTAGA TATGAGGTCA GGAGGGGAGC AGGGGACAAC ATTCAGAGGA AAAAAACAAA 1620
AAACAAAAAA CACTGGAGCA CACATGACGG TTTCAGGGCT AATCCCAGCG TAAGTCCTAA 1680
ACACAGTCCC TTCTGATTCT GATTGCAAAA ATCAATCCTC TCAACCTCCA AAAAAGCTTG 1740
TTAGTTCCCA AGTCCAGACC CACCCCCGAA TGCCCCTCAG ACTTGAATGT TTTCACTCAG 1800
CAACAAACCC CTGATGTTTC TTCCTCCCCT TCCACAGCTG CAGAGGAGAA ATCTTGCACT 1860
GTGAGACACT GGGAGAGAGG AGGAAAGGTT GGCCGCGCCA TCAGAGCATC TTCACAGCCT 1920
GACTCACAGG CAGTCACAAG CCCAGCGGGT GATGTGGTAG AGGACTGCGA AGCAACACAA 1980
CTCTGAGGGG GATATGGCTT CTGGGGATAT GTCTGAGGGT GAACTGGGGG AGGGGAGGGG 2040
ATCTGCTGGA GAACAGATAG GCAGGTGAGA GCGAAAGAAT AAAGAGGACT GGAAAGAACA 2100
ACGCAGAATA GGGGACTATT TACAGGGAGT GAATGTTTGA GAATGGAAGA TACTGTCTGG 2160
GCCTCCGATT GTGTTTCCAA GCTCCAGAGA CACACCTCAT TTCTTCAACT GAAAGCTGTC 2220
CTTCACTGTC CCCAAGGGCA GGGCTGATTT TCTCCCCTAG CGACCTTGAT GTAGACGTAC 2280
AGCCTGAAGG GGACAGTGAA ATGGCTACAT CCCAGTTCTC TGTCCCTTTT CTCTCCGGGA 2340
AACACCTGGG CGGTGGCTGA GCCCCTGCTT TCCTTCCCAA TCTTTCTGAG TACCCGCCCC 2400
GCCCAGCCGC ATTCCGCCTT CAGCACCACG GACAGCAAAC AGAGCTGTGG ACCCGACTGA 2460
CCCCTGTTCT TCTCCAGCGT TCCCAGCGTC CCTGATCTGT TCTACTGAAC TGGGCAAGTG 2520
CTCGGTGTGT GGTTAAAGCG TGGTAGAGAG TGGAACTAGG CTTCTTCCTC AGGTCTCCAA 2580
GCTTTGGGGC ATGATATAAT TTCCCACATC CCCAGAAAAC AGTACTGAAA AGAGGCAAGG 2640
TTTCCAAACT CCGATGCTCT CTGTGGTCAT TGAGGTTCCT GCATTGGGTG CACTAAGTCC 2700
TCGGAGATTA CCTGATGTTC GCTGTCCCTT ATGCTTCCCT AACCTGACAA AACACTGAGG 2760
ACCTCGGGGA AACCCGCCTA GGAATTCCCA GGCTGGGTTG GGGGAGGTGA CTCCACCCGG 2820
CCGGTAGCAC TGGTGTCCCT CGCTCTCCCC GTTGAGCCCC 2860