EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM064-08275 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E-ER4 
Coordinate
chr17:24555550-24557150 
Target genes
Number: 40             
NameEnsembl ID
Hcfc1r1ENSMUSG00000023904
Thoc6ENSMUSG00000041319
Pkmyt1ENSMUSG00000023908
Srrm2ENSMUSG00000039218
Kctd5ENSMUSG00000016946
Pdpk1ENSMUSG00000024122
Amdhd2ENSMUSG00000036820
Atp6v0cENSMUSG00000024121
Tbc1d24ENSMUSG00000036473
BC028777ENSMUSG00000085185
Ntn3ENSMUSG00000079662
1600002H07RikENSMUSG00000024118
CcnfENSMUSG00000072082
Abca3ENSMUSG00000024130
Rnps1ENSMUSG00000034681
Eci1ENSMUSG00000024132
Dnase1l2ENSMUSG00000024136
E4f1ENSMUSG00000024137
PgpENSMUSG00000043445
9930021D14RikENSMUSG00000045744
Mlst8ENSMUSG00000024142
Caskin1ENSMUSG00000033597
2610019E17RikENSMUSG00000093565
Rab26ENSMUSG00000079657
Pkd1ENSMUSG00000032855
Tsc2ENSMUSG00000002496
Nthl1ENSMUSG00000041429
Zfp598ENSMUSG00000041130
GferENSMUSG00000040888
Noxo1ENSMUSG00000019320
Tbl3ENSMUSG00000040688
Rps2ENSMUSG00000044533
Snora78ENSMUSG00000089255
Snhg9ENSMUSG00000090101
Ndufb10ENSMUSG00000040048
Sepx1ENSMUSG00000075705
HaghENSMUSG00000024158
Nubp2ENSMUSG00000039183
Mrps34ENSMUSG00000038880
Nme3ENSMUSG00000073435
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr17:24555713-24555725AAACAAACAAAC-6.32
RARAMA0729.1chr17:24556723-24556741AATTGAACTTAGGACCTT-7
TBX20MA0689.1chr17:24555677-24555688GAGGTGTGAAG+6.02
Enhancer Sequence
GTACCAGGTG GGGCAGAGGG AACCATGTCT TCCTTCACTG TGAAGCCCTC CAAGAACTTC 60
TTTGGGGGAA AGGGGTGACA CGTGTGTGTT GTGAAGGCCA AAAGTATGTT AAATTTCTTC 120
CTTTGGGGAG GTGTGAAGGC CATCTGCTCT TCCATGTTCC CACAAACAAA CAAACCTAGG 180
TCCAGTTCAG CAAAGTTCAC TCTAGGAAAT CAGTGAGTTT ACCAGGCTTC CAGTGCAGTG 240
GGTGAAGGAT AATTGGCAGG AATGTGGGTG GTAACTGCCC TGTGAATGTT CCCTCCCCAC 300
AGTCCCCTAC TTAAAGCCTT TGCCTGAGAC CTGAGGACCT GTGCAAATAG GGCAGAATTA 360
CAACTGGTTT GGAGGGGTGG CTGGATACTC CAGTGAGGGT CCCTTGACCC TGTCCCTTCC 420
AAGAGAGACA AGCCCAGTGT GATGATCGTT AGTGAGCAAG CCCAGTTGAA GTGAGAATGA 480
CAGCAACTTT TCTGCGAGGG TAGTCCTGTA TGTGTGGCTC CCTAAGAGCT GTCTGCCTAG 540
CTTTTCCATA CAGGATTTCA TTGCTTCCTG CAGCTTGCCA ATTGAATTGA GCTGGTTGCC 600
CAAGGGAAGA CTACGTTGTC TTAACTACAT TGAAAACAGA CCCTAGAGTT GTTGATAAGA 660
CCCTAATATA GCATGCAGGT TTTGTTTCAT TATATATGTT ATGTGGTCTT GCTGTGTAAT 720
GTGTGTTTGT GGATATAAAC TCTCCTATGA TACTAAAGTG TGATGTTTGG ATAATGGATG 780
AATTGTTTCT CTTGCAAGTA TGTATTCATC CTGAAATGAG AATGACTGGC TTCAGGCTGG 840
AGCCTTTTTT TTTTTTTTTA AACTGTGTTT ATACATGCAT ACCATGTGTG TGCCTGGTTG 900
TCACACAGGC CAGAAAGGTG CATTGGGTCC CCAGAAACTA GAGTCACAGG CAGTTGTGAG 960
CTGCCATGTG GGTGCTAGAA ACCAAACCTG GTTCCTCTTA CCTGCAGAGA CATTTTTCAG 1020
CTCCCAGTCT GCTCCTTTTT TTATTTAAGA TGTATTTATT TTTATGTTAT TTATGTATTT 1080
ATTTTAATGT GCACGGTCAC TGTCTTCAGA CACACCAGAA GAGGTCATCA GATCCCATTG 1140
TGGATGTTTG TGGGCCACCA TGTAGTTGCT GGGAATTGAA CTTAGGACCT TGGAAGAACT 1200
GTTAGTGCTC TTAAACTCTG AGCCATCTCT GCAGCCCCTC TTTCTTTTTA TTTTTAAGTT 1260
GAAAACCTGC CTGAATTGGT CTTCAGCCCT GTTGATCTGA TTTTTGCTAG GCTGCTGCTT 1320
TTTCCTCATT GGTAAAAATA AGGATTCTGT GTAGGTAACA ACAGCCCATC TCATACGGTG 1380
TTGGGACTTG TCAGATGTCA TTACTGGTGA AATGGGGCTT AAGCAGGAAA GCACCGGGCA 1440
GTGGTGGCGT ATGCCTTTAG TCTTAGTGCT TAGGAGGCAG AGGCGGGCAG ATTTCTGAGT 1500
AAGAACCAGG AGAGCGATAT CCTCTACTGA GCAGTCAGTC TTCTGTGCAG AAATAGGACT 1560
CTTGCTCATT GACTCTGTGA CACCCCCACC TTGTCCTCAG 1600