EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM064-01715 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
G1E-ER4 
Coordinate
chr10:79445050-79446650 
Target genes
Number: 50             
NameEnsembl ID
Gm16517ENSMUSG00000020308
Cdc34ENSMUSG00000020307
GzmmENSMUSG00000054206
BsgENSMUSG00000023175
Hcn2ENSMUSG00000020331
PolrmtENSMUSG00000020329
Rnf126ENSMUSG00000035890
Fstl3ENSMUSG00000020325
PalmENSMUSG00000035863
Ptbp1ENSMUSG00000006498
E130317F20RikENSMUSG00000091994
Gm17134ENSMUSG00000090860
BC005764ENSMUSG00000035835
Med16ENSMUSG00000013833
Kiss1rENSMUSG00000035773
C030046I01RikENSMUSG00000035781
Arid3aENSMUSG00000019564
Wdr18ENSMUSG00000035754
Grin3bENSMUSG00000035745
ORF61ENSMUSG00000013858
Cnn2ENSMUSG00000004665
Abca7ENSMUSG00000035722
Hmha1ENSMUSG00000035697
Polr2eENSMUSG00000004667
Gpx4ENSMUSG00000075706
Sbno2ENSMUSG00000035673
Stk11ENSMUSG00000003068
Atp5dENSMUSG00000003072
DosENSMUSG00000035640
MidnENSMUSG00000035621
CirbpENSMUSG00000045193
1600002K03RikENSMUSG00000035595
Efna2ENSMUSG00000003070
Mum1ENSMUSG00000020156
Ndufs7ENSMUSG00000020153
GamtENSMUSG00000020150
Dazap1ENSMUSG00000069565
Gm15122ENSMUSG00000087672
Rps15ENSMUSG00000063457
2310011J03RikENSMUSG00000020133
Pcsk4ENSMUSG00000020131
Reep6ENSMUSG00000035504
Mbd3ENSMUSG00000035478
Uqcr11ENSMUSG00000020163
Tcf3ENSMUSG00000020167
Rexo1ENSMUSG00000047417
Scamp4ENSMUSG00000078441
Btbd2ENSMUSG00000003344
Mob3aENSMUSG00000003348
Ap3d1ENSMUSG00000020198
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr10:79445705-79445723GGAGGGCAGGAAGGAAGA+7
NR2C2MA0504.1chr10:79446617-79446632TGGGGTCAGGGGTCA+6.67
NR2C2MA0504.1chr10:79446631-79446646AGAGGTCAGGGGTCA+7.19
NR2C2MA0504.1chr10:79445281-79445296TGCCCTCTGACCCCT-7.58
NR2C2MA0504.1chr10:79446624-79446639AGGGGTCAGAGGTCA+9.03
Nr2f6MA0677.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.03
RXRBMA0855.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.04
RXRBMA0855.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.06
RXRGMA0856.1chr10:79446618-79446632GGGGTCAGGGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr10:79446632-79446646GAGGTCAGGGGTCA+6
RXRGMA0856.1chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+7.01
RxraMA0512.2chr10:79446625-79446639GGGGTCAGAGGTCA+6.98
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03404chr10:79445313-79453117Bone_Marrow
mSE_06348chr10:79445348-79451828E14.5_Liver
mSE_07798chr10:79445937-79453081Intestine
mSE_09619chr10:79446247-79454263MEF
mSE_12142chr10:79446084-79453231Spleen
Enhancer Sequence
CGAGTGCTGG GATTAAAGGC GTGCGCCACC ACCGCCTGGC TCTCTATTAC ACTCTTAACT 60
CCCTTCCCTG AGCCATGAAT AAACTCTATT CTACACTATA AAGACAAAAC CAAATACCAG 120
CCTCAGCCAG GATCTCCACG AGATCATGAC CCACCCAAGG GTGCCACTTA GCACCTTTCA 180
GGGCTCAAAT CCACTTGGTG CAGGGACTTG AGCTGGTGCC ACATACCTCC TTGCCCTCTG 240
ACCCCTGCCA CATCCTAAGG TCTAAGGCAC CATGCTGTGC CCCCCTATCC CATGGCTGCC 300
CAGTTTCGGT CCTTGAGGCT CTGAAGCCAG CAGAGGAGAT ACCAAGCCCA ACAGTTCTTC 360
TCTGGGCCTC TGTAGGAGCT GACACCTAGG CTGGGGTGGG AACAGGGCGC AGGGTGGTAC 420
AAGCCTAGCA GGCCTTGGCT GTGAGGCGTC CCTTCTAGGA AGGTTGGGTG GAAGCTGGGC 480
AGGCAGGACG GGCAGGAAAC ACAGCAAATG GGCTCCCAGA AACGTCAGCA GCTCCAGAAA 540
CCAGCTGCTG TGTGGCTTGT TTATCCCAGT TAAGAAAGAG GATAAGGTCT ACTGTCATCC 600
AGCCGACCCT GTCTCTGACT AGACATTGGG CACCCACCCG GAGCCCTGAG GGTGTGGAGG 660
GCAGGAAGGA AGATGGAGCA TGGGCTCATC TGCAGCCAAT GAACTGGGGC CTGAGGGGAT 720
GCCCACAGCT GTCTTGAGCT CAAGCTAGAT CTACCTATGA AACCCCCGAA CGCTCAGTTC 780
TGAGAAGCAC CAGGAGTGAG TCCCAAACTC ACCAATGCCC TCCAATATCA GCATGCCAGC 840
CACCAAGCCA TGACCCCAAC ACCAGAAGGC CCAGGCAGCT CCTCAGAGAG AGCCTGGTGC 900
CATCCCTCGA GTAGCCTTTG TGACCGAGAA CCGGGATCTC CCGGGAGCAC ATGAAGAAGA 960
CACAGCCAGG GCAGGTGCTG GCTGTAGAGG TCCCTGGCCA ATCTGGCTGT GACTCTGTGG 1020
CTGACCCTAG TGAGATGACC TCACCCAAAG CCACAGAAAA CCTGGCAAGA GTCTGAAAAC 1080
AGTGAAGTAA CAGAAAATTT GAGCAGTGAC ACTGGGGGGT AGGGGGCTGT CCCCAGGGGG 1140
TTGGTTCAGG GTGTGCTGGA ATGGGACTGA CTAGTAGAGA CTGGACTGAG AGAATCAGGG 1200
TAGAATAGAA ATGACAGGCG GGACAGGGCC TCCAGCACAG GAGGTGGTCT ACAGTGGAAA 1260
GTCAGGAATG GAATGGAAAT GACCATATTG TTCTCAGTGG AGGTGCAGGA CAGGATGGGA 1320
GTGACAGGTG GGAAGGTGGA CCTCGAGTCC AAAATCCTAC TCCAAGAGGA CACTGGGCTC 1380
TGGTCTTGAG TGGAAAAATT TGGGGCCTAG GCTCCCAAGT GGCAGACTGA GGCCAAAGGG 1440
CAGGAGGCGG GGCCTGAGAG CTGAGGAAGT GAGGACCAGA GATAGCATCT GTAAGAGTGG 1500
TATCAGGGTA TCCAGGCGTC AGGAGCCAAG TGGTAAAGTT GCCGGGGGTG GGCGAGCGGA 1560
TGACAGCTGG GGTCAGGGGT CAGAGGTCAG GGGTCAGAGG 1600