EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM063-00998 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_E13 
Coordinate
chr15:25702610-25705580 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr15:25702921-25702933GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702925-25702937GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702929-25702941GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702933-25702945GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25702937-25702949GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25703328-25703340AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr15:25703332-25703344AAACAAACAAAC-6.32
LHX6MA0658.1chr15:25703873-25703883ACTAATTAGC+6.02
Nr5a2MA0505.1chr15:25703027-25703042GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RFX1MA0509.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.31
RFX1MA0509.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.31
RFX2MA0600.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.19
RFX2MA0600.2chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.23
RFX3MA0798.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC+6.06
RFX3MA0798.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.34
RFX4MA0799.1chr15:25703896-25703912GGTTGTCATGGTGACC-6.25
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00789chr15:25691500-25704859Myotubes
mSE_04513chr15:25702984-25705660E14.5_Brain
mSE_09963chr15:25702945-25705541MEF
mSE_10057chr15:25701025-25704620Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
CAGTATAATA TTAGCCTTTA TATGGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 60
GTGTATGTAT CTGTAGGCCA GAAAGCTAAC TTCAGGTAAC TTCTACTGCT TGCCAGTTTT 120
TTGGTTTTTT TCCATTTAGA TTATTTATCC ACCTTTGAAA GGAACATATT CATGGGTGGG 180
GTCAGTTCCC TTCTATGTGT CCCTGGGGTA AAATTCTGGT GGAAACACTT TTACCTACAG 240
AGCCAATTCA GTGACCTACC AGATTATTTT TAGTCAAGGC CTCCCACTGA ACCTGAAACC 300
CTCTGGGTTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT GGGGTGTGGC AGGGGTGTTT 360
CCAATCATTG TTTCTCTGTG TAGCCCTGGC TGTCCTAGAA CTCACTCTGT AGACCAGGCT 420
GGCCTTGAAC TCAGAAATCC ACCTGCCTCT GCCTCCCAAA TGCTAGGAGC CCGGCTGGAG 480
CTCTGTTTGG GCTAGACTGG TGGGCCTAGT GAGGTCCTAA GATCTGCCTG TCTCTGCTGC 540
CCAGTACCAG GGTCACAGAA GTGCCACTGT GAGCAGCTTC CATTTAGATC ATCTCCGCAG 600
CCCTGATCAG TAGTGATTTT TTGACACGGC TGACAGACAA CCTGCCAAAC TTCAGAAACC 660
TGGGGGACAA AATGCAGTTT CTACTGCAGT GAACCTTCCT TGAGTATGAA TCAGCAAAAA 720
ACAAACAAAC AAACAAAAAA ATAAAAAACA AAACCTTTGC ACATAGTAGG TGTTTAATAG 780
CTATTCACAA TGCTATCTAG CTGGGGCTGT AATTGCCTGG GGTTGGGACT GTTCCTTCCA 840
AAAATCCAGT CTATTTGTTC TCATAAAAAC CTAGCTCTTA GTGCTCTGCA GGCAGTCTTT 900
GTTGGGGTGC AGCCCTGCCT TGGAGAACTG GTAACCCATG AGGACTAGCA AGCATTAGGC 960
TGGCTTTGAA AAGCAAAATG CTCCTTGTCC AGCCTCCAGC TGTGACAGCT TTGAAAGTTA 1020
AATTCACCAG AAAAGGAAGT TGCCACTGAA AACCGAAGCG CCAATGGAGA GCGGGGGTTG 1080
TCCCCTCGTG ACCACCGGAG GCGGGTTGCC CAGGGCGACA ATCGCCTATA GATCCCCCTT 1140
TTCCCGGTTA AATTACTGGG AAGGGGCAGG AACACAATGG CACTGGGAGT CTGCAAAAAG 1200
CTACAGCTCC CAGCGTCCCT CACTCCCTTC CCAGAGCTGT ATCAACTCCT AGAACCACAC 1260
CACACTAATT AGCCCGGAGT GGAAGGGGTT GTCATGGTGA CCGGGTACTT TTTAAAGCAC 1320
AGGAATGGTG TTCATTATTG TTCCAAGTCT TTAGCTGTGG GGAAAAGGTC AGGGTAGCAG 1380
TTGTTTTCCC GTATGAAGTT TGGCCAGAGA GCCTAACAGA AGGTGGAATG TCCTTTGGAG 1440
ACGCCGGAAG ATGGTGAGTG TTGATCGGGC GTGGAGGGGT GGCCCTCGGA GTCATATCTT 1500
TCAGAATGTT TTAATAACTT GGGTGCCAGG CTAAGGAATT ATACGGAGGA AGGAGAAGGC 1560
GGCAGGGCCA GAATGTGGGT CGGGCACAGC CACAGCTGGA GGGAAGGGGG GTTAAGAATT 1620
CTCCCTCCAA ACCTCACATC ATTAAACCAG TTAAAAGTTT CTCTGCTTCC AAGGAAGTGT 1680
AACCAAATTG AAACAGTCTG GCACTTTCTT TGAAATTCAC TTTGTAAATA AACTCAGTGC 1740
TGGTCCTTGT AGATCATTAC CACTCAGATT TTATTTTCCA GTCTATAAAG CCCAAAGTGC 1800
CAGGGACACA CGCATTTAGA GCAGCCACTT AGCATGCTGT AAGCCAGAAG TTAAAGTGTG 1860
TCAGGACTGA CTTGGTTTCA TAGCCTTATG CTTTCTTCCT TTTCTAAGGA GTTCAGACGC 1920
ATAGACTAAA AATCCAAGCA AGCCACTGGT CTCTGGCTGC TTGCCGTAAA TTGCCGGCTA 1980
CACTTGGTTA GAATACAGCT AAGTAAAGAC AACGTGACCA CTGTGTTTGT ATAAGACATT 2040
TTTGGGAGAC GTCTGCCTGC CAGAGACAGG GCAGCTGTTC CATCAGGGTG TGTGTGTGTG 2100
TGTGTGTGCG CGCGCGCGCG CGCGCACGCA GCGCTCTGTC TTAATTTTAG TTTTTAAAAC 2160
TGTAGAATAC CCTAGCTTTA AGCCTACTTT GGTGTTCATG GCTCATTGTG TGTTTTTTTA 2220
AGGGTCAGGG AGTAAGCCAC TGTGTTTTTT GGACTTTCCA ACAGTATGGC TCCGTCTTTC 2280
GGTCCTTTTA TTAGACTTCT ATAGAATAAC AGCATACAAG TTAATTAAGG GGACTAGGAG 2340
CCTGGAGTAG AAGAGCGACT TGTCATCCAA AAAGCTGCAA GTGGGAAATG ACCCACTCTG 2400
CTTTCCCCTG GCAGACGATG GTTCAGCAGC AGTGCCAGCT GGCAGCTGCA GAGCTGAGCT 2460
GGGAGCACAG ACTGCAGAGG AGGCAGCTTG GCCCGACTCC TCCCTCAGGC CTGTGTGTCC 2520
TTGGGCTCAC TTCTGGTGGG ACTCCCAATA AGTGGGGTAT AAGGCTGGAA CAAACTAGGA 2580
GTCGTCTTGT CTCTTTTACC CTCTGGCATT TCTAGCCCCC CTCCCTCATT CCTGTGTGTG 2640
TGTTTGTGTG TGTGTGCGCT TGTGTGTGCT TGCAAGTCCA TGTAATGTGT GCTCCTCAGT 2700
GAATACTGTA TTGTTTAACT CAGGAACACC TCTATATCCT AAGTTAAATA AACAGGTGTG 2760
TGCCTGATAC TTTAGACTTT TGAAAAAGGT GATCACAGAG ATGAGAGTGA ACAGCAGTGT 2820
CTTTGTGACA CGGACACTTT GTGACATGTG TGAACGTGGA CACTGATGTT TTAGGAATTT 2880
TTGGTACCTT TCAAGACACA ATAATGGTGA AACTATGATA TATGCTAAAG TATCTACTGA 2940
AATTAAATTG GCAAAAGATC TGAAGCAGTA 2970