EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM063-00136 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_E13 
Coordinate
chr1:164003440-164005900 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:164005764-164005783TGGCCAGCAGAGGGTGGCT+6.15
Nkx3-2MA0122.3chr1:164004237-164004250ATAAACACTTAAC+6.08
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05676chr1:164002464-164006437E14.5_Limb
mSE_09388chr1:164002671-164004812MEF
mSE_09388chr1:164004843-164009426MEF
Enhancer Sequence
AAGCAATTAA AAAAATAAGG CATGGGGTAA TAAAGACCAA TACCACTGAA GTCTCCACCC 60
TTCAATTACA AGTCAAAGCA GTGAGCACTT GTATTTTTGA GAGCCTTACT TTCAACCAGC 120
TTCTTCCGCA CTACAATACC AGATATTCAT GCTGTACAGG GCAGGCTGTG GAGGCCCTGA 180
GGGCCTGAGG TCCTGCAGGG ACTTCAGCCC TATTCCAAAA GGTTTAATGA ACAATAGTTT 240
ACAATTTTTG AGGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTAGGTAT 300
TGAACTACAC ATGTGCATGT GTGTATGGGC ATGTGTGTAT GTGTGTAGGC AGTATATGTA 360
CATGCATACA TGCATAAGTA AGTATGTACA TGGAAGTCAA AGGACAACTT TGGATGTAAT 420
TCCTCACGTG CTATCCGTAT TAGTTTTTGA GACAGAGCCT CTCATTGGCC TTTTCTCAAC 480
AGGTAAACTA GGCTCCTGGC CAAAGAGCCA AGGGATCTGC CTGTGTCTAT GTCCCTAGTG 540
CTGGAATTAC AAATATACCA CCATGCCAAC TTTTCACACA GCTGCTAAAG ATTGAACTCA 600
GGTCTTTGTG CCCACAAGGC AAGCATTTTA AGGCTGAACT ACCCCACTCC AGCCCCAATA 660
GTTTATATTT TCTCATTCCC TTCATCTAGT GAGCTGAAAA AAAAAAACAC AGCAAACTGT 720
ATCCACCATA GCATCCATGA GCTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 780
TGCATGTGTG TGATTTTATA AACACTTAAC CATCCATGAA CTTCTTGAGA AAGGAACAAA 840
TCATGGTGCT CCTCTCGTGA GCAGAGTAGC ATCTCCCCAA ATGTCAGCAG CTGGCTCCCT 900
ATCAGTGTAC CCACAATTAA CCCAGGGCAT GCATGGCTGC TTGGATGGAT GGTTGGCTGT 960
TTTGTTTTCA AGTAACATGA ATGCATGAAC AATGCAAAAA GTTTCAGACA AGAGATCTAC 1020
TGTGGTGCAA ATGATCAGGA TAAAATGCTT ATAATTCAAG AACTGAAATA CTATAAGAAT 1080
TAAAACATGA GTTTCACATT TTGTTCAAAT ATTTGTCCCT AAGAGTTGTT GTATTATTTA 1140
GAAATACTAC CCTTTCCTTT GTGGAAGAAG CCTTGAGTTT ATTATTTTAA GTGACCTGCT 1200
ATTCTCCTTT AGAAGTGTGC TCTAAATGAT GTGAGTTCAC CTCCTTCCTT CTCCATAGAT 1260
GTACATTTCT GGCATTATTT TAACTTTATT AAATAGCATT GCCTGGGTTG TGAGCAGCTC 1320
TATCAGAGTA TAAATTTATG AAGTGACACA TTTTTTAGGA CCAGCCATCT CTGTCAATTT 1380
ACTCCATAAT AACACATTCC ACCAAATTAA ACTGCAAAAT ATTTCCCACA TTTGTTTTAC 1440
ATTCTATACA TATGGCTTAT GAATAGCAAG CTTGATGAAT TCCAGCTGCT TTAGCTATGC 1500
AGGCCAACTC TTATATAACA GATTCCTTTC CATTCCTATT GTATCCACCG AGGCCCATTT 1560
TAAGCGGGCC ACCTGGTAGG ATAAACGACC GTTACAAGAA GGAAAAACAA AACACAACAA 1620
GAAACCCCCA AACAACAATA AAGAAAACCA GCCTGCCGAA TGCAAGACTA CTTTCCCCAG 1680
CTATACGACT CTTATATTTC TAAGAAAATG GGAAGTAGCA CGAAGCTTTT GGGAAAGTTA 1740
CATGAAAATT TAACCAAACG AGTAACGCCA CGAAGCAGCA TTTTCTCATT TATCTGTTGT 1800
AACGAGAACA TTAAAACTGC TCGCACCATT CATGTGTGTT GCCCTGCCCG TTATACAGAC 1860
GGTTCAGCCT CCCCTCAACC TCCCCACACT CTCCTGCTTC CACGCAGCTG GAATTCATCA 1920
AGGATGTAGG AGCCAAGTCA AATGTTGACC CCACCCTCCT CCTCCATTTT AAGGCCCCTT 1980
CAAAGCCAGT GAACGGATCG AGTTCAGTTT TGCCAACAAA GCCTGCCATA CTGCCCTTTA 2040
AGGCTCCAGT TTGGAGGTTT TATAACTGCA CAAGCTTTGA TTTGGGGTCA GTTCTTCAGC 2100
TACACTGAGT TCCATCAGTT TGAGGAACCC TTCTGTGACA AATCCTTACC ATTCCTTTGC 2160
TCAGAGTTGG TCTTTTTCTT TTGCGTGACC CCTCTGACAT GTCCCATAAC CAGCTCTGAA 2220
AACATAACTT ATTTCCCTTC CAAGAAGGCC AAAACAGAGC AGCCACTGTG GCCATCCACA 2280
CACATTTCCC CTGACATTTG CATTGCCCCA TAGACTCCTT GGAATGGCCA GCAGAGGGTG 2340
GCTATCCCAA GATACATAGA ATCACGTTTG TCAAGACAGC ATGCAGGAGC AGAGGCTGGG 2400
CATGCAGGAG CAGGGGCCGG GGAGACAGGA AACACAGAAG AGCCGCACTA GGGCAGAGAA 2460