EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-12034 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr8:87245710-87247620 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr8:87247606-87247617GCCCCGCCCCC+6.02
KLF4MA0039.3chr8:87246874-87246885CCACACCCTGC+6.62
KLF5MA0599.1chr8:87247606-87247616GCCCCGCCCC+6.02
SP1MA0079.4chr8:87247603-87247618TAAGCCCCGCCCCCA+6.95
SP2MA0516.2chr8:87247602-87247619TTAAGCCCCGCCCCCAT+7.83
SP4MA0685.1chr8:87247603-87247620TAAGCCCCGCCCCCATC+7.46
STAT3MA0144.2chr8:87247201-87247212CTTCTGGGAAA+6.62
Number of super-enhancer constituents: 11             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03537chr8:87246191-87251569Bone_Marrow
mSE_03671chr8:87246268-87248386Cerebellum
mSE_03995chr8:87246095-87248543Cortex
mSE_04466chr8:87246118-87248482E14.5_Brain
mSE_04899chr8:87246129-87248474E14.5_Heart
mSE_05496chr8:87245196-87250281E14.5_Limb
mSE_06307chr8:87245428-87251632E14.5_Liver
mSE_06705chr8:87246312-87248188Heart
mSE_08837chr8:87246350-87250720Liver
mSE_09292chr8:87246237-87248561Lung
mSE_09430chr8:87245897-87248474MEF
Enhancer Sequence
GGGCTCCCTG TGTGCACACA GGCAGGGGAG AGAAAGGGTG TGAGAACAGC CACGTGGAAA 60
AGCAAGACAC AACGGCTGGC AAAAGGGCTG AGGGTCCTGA GGAAGAGGCA GGATGGGGCA 120
GAAGCACTGT GTCAGGCACA AAACGCCTCA GTCATCTAAG TTAAAAAAAA AATCAATGCA 180
ATAAAATAAA ATAAACTGGC AGGCTAGTAC CTGAGGGCCA GCTGCTTGCT TTTATAAATA 240
CTGTTTGCCG GGAGCTGGCG TGGGGGTTAG CTGAGGCAGG TGAACAGCCA GCTACCAGCG 300
CAGGGTTGGG TTGGCCTATT TAAAATTGTT AGGATGTTGC TTTTCTGGTT GGTTTGTTGC 360
TATCTTGTAG CCGGGGCTGA ACTTGATGAC CTTAAATTCT GGACCCTCGC AGGCACGTGC 420
TGGGCACTTT CTTGTTGTTT GTTTTCGGAT GGTTGATTTT CTTTTGTCTT TGCAGTACTG 480
GGGTGTGCTT TCTGCCACCA CGCCTCAGTC CCAGCAAACT GTTACAATGT TACTTGCTTC 540
TCATAAGGTT TTGCTCTTGT TTGGTTTTTG AGACAGTCAT AGGGCCTCCA ATTCTTGATC 600
CTCCTGCCTC AGCCTCCTGT GTGCTGGGAT TTCAGGTGTT AGACTCACCC TATGCTTTGC 660
AACTGTTTTT ACTGTTTAGA AACAACACAC TAATATGTTA CTTATTGCCG GTTGAGTTTT 720
TTTAGTATCC TTGACATTTT CCTTCTTTTA CCCTTGGCAA ACACCTCACT TGCCCCGTCC 780
TAGGTGTGAG CCTGCCTGAA AGGACCGACA CCAGATTACC ACAGCCCCGT GGTCTCTGGA 840
CAAGCAGACC CTGCCTGTGC AGGATCGGCA CCCGGCACAC ACACAACTCC AAATGTGTAA 900
GTGGATGCTT AGGCCCCCCT CATGTGTTGG CCCTGCCGCT GTGAACTCAC AGTTCCTACC 960
CCTGTACAGG CCTCAGCTCT TCCTCAAGTT CTCCCCCTTC CTGTCTGTTT CCAATCAGCT 1020
CACTCTTGCT CTCAGTTTCA TTAGGGGGCT GAGGAAACTT GGCTTCTCTC TGGAGTTCAT 1080
AAAAATGGAG CGCAGCAGGG TGGAGCCTGC CTCCCTCCTG CCGCCTGCAC AAGGCCTGGG 1140
CTCCCTGCCC CCACCTTGTG GCCACCACAC CCTGCCCCAG TGCTGGCTGC CTCTGGGCTC 1200
TAAGCCAGGA GGCCCCAAGG AGGAAGCCGG GAGGTAAACC TCCCTGTCGC GTCCTACAGA 1260
AGAGAAGAGA GGCATGGCAG ATACAGGGCC ATGTGCAAAC AAAAGCCAGG CCTTTGCTGC 1320
CAGATGGGTG CTGAGGCGGA AGCAGCACGT GCAGGAGGGC CAGGTTCCCG GGTATCCTGC 1380
CTGGCCCCAC CCTCAGGAAG ATCCAGCATC TTCTCAGGGC CTGAAGATGC CCTCAGAGCA 1440
GCAAGACAGT CCTTTTCATG GTGAGCCTTG TCCTTCTGGC CCAGCCCTTC ACTTCTGGGA 1500
AAAGCAGGGA GGCCCAGATT TGGTGCCGGT TTGCTCTAGG ACAGACACCA GGAACCTGGA 1560
CTGCTGAGCA GTACTCTTTC TAATCCACAG GAGAGCAACT TGGCTCAACT ACTTGCTGGT 1620
GGGGGAGGGG GAGGCTGCAT GCAGCTCCCA GTGAGCATGT GCAGACCATG CACCCAACAC 1680
AGACTTAACA CAGCCAGAGT TAGCATGTGG GAGGGATTCT AGGAACCGAG TGGGCAGCCT 1740
GGTTCTCAGA GTTACACTGC CCATCCCATG CCACCCCACT GCTGTGCCAC GACCCACTTG 1800
GGGAGCCCAG ATCTATAACT TAGATTGATC CCTGGCCCCC TGTTGCTCCT GGCCAGCTGC 1860
CCCTTGCTGT GGCTGCCTCC CGCAGTGTCC CCTTAAGCCC CGCCCCCATC 1910