EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-11778 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr8:28214120-28218400 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr8:28216556-28216573GCTAGTTAATTAATGGG-6.07
Alx4MA0853.1chr8:28216556-28216573GCTAGTTAATTAATGGG-7.2
GSCMA0648.1chr8:28216571-28216581GGGGATTAGC-6.02
MNTMA0825.1chr8:28216828-28216838ACCACGTGCC+6.02
MYCMA0147.3chr8:28216827-28216839GACCACGTGCCC+6.02
NR2F1MA0017.2chr8:28214709-28214722AAGAGGTCAAGGG+6.14
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr8:28217250-28217261CTTGAGTGGCT-6.62
RARA(var.2)MA0730.1chr8:28218106-28218123TGACCCCAAGTTGACCC-6.61
RESTMA0138.2chr8:28216214-28216235ATCACCACCACGGCCAGCTTT+6.11
RREB1MA0073.1chr8:28217357-28217377GGGGTGGGGTTGGGGGGGGA-6.16
RREB1MA0073.1chr8:28218287-28218307GGGGTGGGGGTGGGGGGTTG-6.29
RREB1MA0073.1chr8:28218291-28218311TGGGGGTGGGGGGTTGGTGG-6.95
Rarb(var.2)MA0858.1chr8:28218106-28218123TGACCCCAAGTTGACCC-6.46
SP1MA0079.4chr8:28214981-28214996TGTGGGCGGGGCCAA-6.57
SP4MA0685.1chr8:28214979-28214996TCTGTGGGCGGGGCCAA-6.22
XBP1MA0844.1chr8:28215580-28215594ATAGCCACGTCAGC+6.06
ZNF263MA0528.1chr8:28218169-28218190TCCTCACCCACTCCCTGCTTC-6.32
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05628chr8:28214513-28215595E14.5_Limb
mSE_05628chr8:28217425-28218244E14.5_Limb
mSE_09663chr8:28214043-28219306MEF
Enhancer Sequence
ATGAGTTAGT TCATTGATAC AGTACTTCTG AGCATAGGCT TTCCCAGTGA AGGCAGTGTT 60
CTTCCTTTGT AAAGACTTCT GTACATGTAA GGTATTTGCT ATGTGTAGTT GTCCAGATTT 120
CTCATCATGT GTCTTTCTTT TGTATGTCGA GGGACATATA TGAAGACCAG AGGACATTTT 180
ACTGGGGTCC ACCACATAGG TTTTGAGGCT AAGATGCAAG CTTAGTGGCG AGTACCTTCC 240
CCTGCAGAAC CGTTTTGCAG GCCCCAGTTG TTCTGAGACC CTAAAACTCC GTGTCTAGTC 300
CAAGGTCCTC TGGAGTACTG AGACTACAGA TGCAATCACC TGTGTGTCAG TCACTAAGCC 360
CAGCTCTCGT CGTTTGTAGT GCTGGTGATG TATTGGTTAG CGCCCCACAC ACGTTAAACA 420
AGTAGTGTGC CATAGAGCCA CCCCCACCCT CTCGTGGAGG GCTCCTTCCT TGTATGTGTC 480
TCCGTCTGGA TCCTCCACCA AGCACATATA ACGAGGAATG GGTTGGTAGA TAAATCTTCA 540
GGGCTCTATG AAGATGCCTC CATGCGGCCA CTGGACAGAC ATGCCCCAGA AGAGGTCAAG 600
GGAGAAAAGA GAGAGAGAGA GAGACTGAGT ATGCAGAAGG GTGTGAGACT CCACGTGGAT 660
GTGGACCCAC GGAGGCTTGT GTGAGGCTGG AGCAGAGGGC CCAAGGAGGG GAGCTCGCTC 720
TGCTCGGTGT GATTTGTCAT TGCCTAATGA GATTAATGAG CCCTGAGGGC TGGTATGCAG 780
AGGGTGCCGG GGCACTCATT AGAAGCAGAT GCTCATGGGA ACGAACAGGG CAACTCTCTA 840
GCCAGGTGGT TTCTATTAAT CTGTGGGCGG GGCCAAGGGT GAGGCCTGGG GCTCTGTCTC 900
TCCATTCCGT TCTTGTTCCC ACTAACACTG GGGAGGGATG ACAAGGAGAA GCTGTCCTGG 960
CCTCCAGTAC AGCTGAAGCC CTGGGAGATG GCTAACAAAG TCAGGGACAG CCCCCTCTTG 1020
TTTGCCTCTG TCAGCATAAG TGCCGGGCAC AGTGTATGTG CTCAATAAAT ACCTGTAGAA 1080
GGTTTCAGGA GCAGAAGCCC TGGAGATGGT GGGAAGGTGA GAGGCTGGGA CCATAATGGG 1140
TTTCCTTGAC CACAAGATTC TTTTTTTTTC TTCCCCGAGC AACCTCTATA CCGGCAGGGG 1200
TGTCCTGGCC AGTTTTGCAG CCAGCCTGCG CTTTCAAGTT GAACTCTGGA AACCTTGTAG 1260
GGCTCAGGGC AAGTTGCTGT GTGGCCAGCA AGCCTATAAT TTGGTTTTCA GACCTACAAG 1320
CAGGGAGGTC TGTGGGGGCT AAGAGGAGTG AATTCTGTGC AACCCTACTC TGTCTGGATG 1380
GCGTGTGAGC GCATACATAC ATACATAGTC ATACACACTT AGTCACACAC ACATAGTCAC 1440
ACATACATAG TCACACACAC ATAGCCACGT CAGCTCACAC TTTTGACACC TCCAACATGA 1500
TGTAATTTAT ATCGCCCATT GAAAGTGCAT GATCCAGTGA GCCCTGATAT ATTTCAGAAA 1560
ATTGTGTAAC CGTCGCTGTC ATCTAATTTT AGAACATTTT CATCATCCAC AAAAGAAAAC 1620
TTGAATCATT AACTGTCGGT CTCCGTTCCT CTGCCAGACC TAAGCAACCG CTAATATCCT 1680
TCCCATCTTT ATGGAGTTGC TTGTTCTGGA CATGTATAAA TAGACATACA ATATGTGATC 1740
TTTTATAACT AGATCCTTTC AGCCCATGTT AACATTTTCC AGGTTCATCC TTGCTTTATC 1800
AGCACTGGTT TCCCTTTGTG GGCAAATAAT AAGTAGCTCA CTCACTGAAC ATAGTGTTCT 1860
TTAAATCTTT TACTTATTTA TACATTGATG GATACTTGAT ATTTTTGTCT TTTAGGCTAT 1920
ATGATGGAGT TCTTTCGGGA ACTTTTACCT GGTGGGCCTT TTGTTTTGTT TTGCTTTGGC 1980
TTCTGCTTGT TTTTGGGTTT TTGGAGACAG GTTCTGGTTA GATAGCGGTG GCCTGGCCTC 2040
AAAACTCACA ATCCTCCTGC TTCAGTCTCC GAAGTGCCAG GATGGAAGGT TGGAATCACC 2100
ACCACGGCCA GCTTTGATCT CTCCCTGCTG CGCGCCCACA CTCAGGTTGT GGAAAGCTCA 2160
CAGGGCATGA CTGCCCTAGA AGTCTCCATC TACCTTTGCT GTCAGGGGTC CCTCCCTTCA 2220
TGCTGACACT CATAGTGGGA GAAGGGTGTG CCTGGAGTCA GGGCAGCTAG CATATGATCA 2280
AGATTGGACA AAAGGCAATG GGGATAGGGA CACTCTGTTG GTGCAGCACC TCTTCCCCAG 2340
GTCCAGAGCT CTGAGGAAAT AGACGGGGAG TCATGCAATC CATATTCTAG AAACAGCTCT 2400
GTGTCCTTCG ACTGGTTACT TTGGCTTGTG ACCTCAGCTA GTTAATTAAT GGGGGATTAG 2460
CTTAGATAAT CTGGAGCTAG GGTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTTAACC 2520
ATGGTCTTGC TATGTAGACT AGGCTATCTG AAACTCATAA AGGTCCACTT GTCTGTGCCT 2580
CCTGAGTGCT GGGAGAGTGT TTTTCATTGT GGGGTGGAAC TCAGGGCTTA CACATGAGGT 2640
AAGAGCTCTC TCCCACTAAG CCCCAACCTC AGCTCTGTGG AGCAAGGGTT CTTCCACGGC 2700
CCTTCAAGAC CACGTGCCCA GTGTTAAGTG TAGAACATTC TTCTAGGGTG GGAGTCGAGG 2760
CCTTCATCAG CTTTCCCCAA CAGTATTAAA CAGGAAGGGT TCAGAACAGC CAATTGAAAA 2820
GAGCCTTGGA TTTCTAAAAC ATACAGTTCC TGGGGTAGCA TTTCCTCCTG TCCCTGGGGA 2880
GGTACAGCCC TGAGCCACTT CCCTTATTCG GGGACCAGGA GACTTGGCTT GTCCCTAGGC 2940
CCACTGGGCT GTCAGGGTTC AGCCCAAGAA GCAGTCCCCC TGCATTTGCC CCCAAAACCT 3000
GGTGTCCCAG GGCTGGCCCA CCCCCTAGGG AACTAACTAC AAGAGACCAT CTTGGTCACC 3060
TCTGAGCCCG ACTTGAAGAA AGGGGAAGAC CCACTGCCTG TCTCCATGGA AGCTGCCCTA 3120
TAGAGAGGGC CTTGAGTGGC TCAGCTGCAG GAAACAGGGC AGGGAGAGGG GCTGGGGCCC 3180
CAGGGCTGCC TTGCTCCCAT CTGCAGAGCA TCAGTGGGAC AGGCGGGTGG GGTTCACGGG 3240
GTGGGGTTGG GGGGGGAGGA GGAAATGAGA ATAAACACAA GTGAGCAGAG AGGGAAGGGG 3300
CGGGGGGCTG CCCCTTTGGC AGCCCATGAA GGGAAGTGAC ACACAATGAG GAATGTGTTT 3360
CCCTCTACCC GCCCCTGCAA GGGGGTGGAG GCAGATCCCT GAGAATGGCC AGACCCCAGC 3420
AGAGGCCAGG GGGCACAGGC TGGATCAACA GAAGAGGGTG GAATGGAAGG GTGGAGCCTG 3480
ACAGTCAAGG GGGGTGCGCG GTGATACACA GGAAGGGCAG TCCTGGGCAG GGGGACTTAC 3540
TCTGTCCTCT TGACTGGGCA TTCAGGCAAT CTAGGACCAG GCCAGGGCCT TCCACATTCT 3600
CAGCTTATGC CTAGCACCGA GGCACCACCC CACAGCTGGG GCTTTCTCTA GGACGATGAG 3660
CCCTGATGTT AGCGTCCCCT TCTTCGTCCC CTTCTTCCTT ACCGGAACTC ACCTTCATCC 3720
GAGTCTTCTG TGTGAGAGGG AGCTGAGGTA CAAACAGCCT AAGTAGAACT TCATCTCTGC 3780
CTCTTGTCTC TCAGTGTTTC TTTCCCCAAC AGGGACTGCA CAAACAGGCC TCCTGGTGGG 3840
ACAGGACAGC CCCTCCCCAT CCCCAGACAC CCATTTCCTT TTACCCAGCA GGGACATAGC 3900
TGAGTTAACT CTCTCCTGTC CATAATTCAG AGCTGTCTCC AAGGCCTTCA GCCTTGGCTG 3960
GAATGGCTGA GCTTTGGAAA CCACGTTGAC CCCAAGTTGA CCCCCAGATA TCTTTGTCAG 4020
ATTCTGCCGT CTTCCCCTCC AGGAATGGCT CCTCACCCAC TCCCTGCTTC CCGGCTCCCA 4080
GGCTCTCTTA AGTAGGAGCA GAAAAGATGA GCCTTACTTA GTGCTATAGG CAGCCTCAGT 4140
TTCAGTCTGT GTTAGTTTAG AAAAGATGGG GTGGGGGTGG GGGGTTGGTG GAGCGTTGGG 4200
TAGGTGGAGC TTTGGGTAGG TGTGTCATGA TCTGTAGCCC TCTGTAGCCA TGCACAGCAT 4260
AGAGGATAAT GCAGAAGATG 4280