EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-11198 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr7:80750470-80753530 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR1MA0162.3chr7:80751889-80751903GCTGCGTGGGCGGA-6
EGR2MA0472.2chr7:80751891-80751902TGCGTGGGCGG-6.32
EGR3MA0732.1chr7:80751889-80751904GCTGCGTGGGCGGAA-6.13
FOXA1MA0148.4chr7:80753347-80753363CAATGTTTACTTAGTA-6.13
FOXC1MA0032.2chr7:80753349-80753360ATGTTTACTTA-6.02
FOXD2MA0847.2chr7:80753349-80753362ATGTTTACTTAGT-6.32
Foxa2MA0047.2chr7:80753350-80753362TGTTTACTTAGT+6.44
ZIC1MA0696.1chr7:80751806-80751820CTCAGCAGGGGGGC-6.18
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00389chr7:80728813-80754010pro-B_Cells
mSE_01523chr7:80662346-80773459Th_Cells
mSE_02681chr7:80731224-80764627HFSCs
mSE_03000chr7:80728755-80771487TACs
mSE_03459chr7:80752445-80752863Bone_Marrow
mSE_03982chr7:80751273-80752089Cerebellum
mSE_03982chr7:80753028-80753344Cerebellum
mSE_04060chr7:80751282-80753626Cortex
mSE_04416chr7:80751110-80753688E14.5_Brain
mSE_04807chr7:80751431-80753544E14.5_Heart
mSE_05509chr7:80751081-80753496E14.5_Limb
mSE_06583chr7:80751249-80753369E14.5_Liver
mSE_06612chr7:80751246-80753522Heart
mSE_07229chr7:80751242-80753696Intestine
mSE_08080chr7:80751435-80753991Kidney
mSE_08614chr7:80751335-80753561Liver
mSE_09049chr7:80751325-80753714Lung
mSE_09494chr7:80751426-80754236MEF
mSE_10229chr7:80750482-80751256Embryonic_stem_cells
mSE_10229chr7:80751258-80752906Embryonic_stem_cells
mSE_10773chr7:80751274-80753605Olfactory_bulb
mSE_11288chr7:80751310-80752907Placenta
mSE_11971chr7:80751381-80752954Spleen
mSE_11971chr7:80752979-80753451Spleen
mSE_12651chr7:80751315-80752082Testis
mSE_12651chr7:80752108-80752838Testis
mSE_12880chr7:80750510-80751237Thymus
mSE_12880chr7:80751301-80754308Thymus
Enhancer Sequence
TTAAAAGGAA ATAAATGGTT TATTTCTTGT GAGTACAGCT AACAGATTAT CGGCTACCAA 60
TAACCAGATT AACTTGGCCT GCTTATAAAG TCCTGTCTTG TCAGGACCTG GTGTTTGTAA 120
GACTGTTTAT GCAATACTGA AGCAGTTTTT TCCCCTCTCC ACTTTGTGAA CAGGATGGAG 180
GGTGACAGAA GATTGCTTGT ATGTAACGAT AGTTTTTTCA GTGCCTGCTA CCAAGGTTTT 240
CTAGGTTTGG GCCTTCTGCT CCAAGGTAAA AATTGCTCTG AGCATTAATA CCCAATACAA 300
AGGTGGCAAT TCTGAGTCAG ACTTTCCCAC GGCTCCCAGA GACTGTTGCA TGTACATTCC 360
CAGCTCACCT GCAGCACGCA GGAGTGCAGG CTAGAACAAG CTAGCCTCAC CTAGGCTCCT 420
TCTGGATATT TTAGTGCAGG CTCCACCAGC AGCAGCATTT TAGGCGGTAA CAATTTCCTT 480
TTGTCTTACT TTCTAAATCT GTAAAACATT CCTAGCTTGC TTGCAGTTTG CAGAGGGAGT 540
GCAGGACTGA AGGAGGTAGC CTGACACCAG CTCCTAAAAC TGGTCTTAGC ATAGCACTTG 600
GCAGAGTTGA GTTTCAGGAG CTGTAATTGG TATTATTTAG CAAGGCACAA AAGTTCTGAG 660
ATACACAGCA AAGTTCATAT CCCTAAAGAA ACTTTCACTC CAATACGGAT TTTCTTTTTT 720
TTGGTTTTTT CGAGACAGGG TTTCTCTGTG TAGCCCTGGC TGTCCTGGAA CTCACTTTGT 780
AGACCAGGCT GGCCTCGAAC TCAGAAATCC GCCTGCCTCT GCCTCCCGAG TGCTGGGATT 840
AAAGGCGTGC GCCACCACGC CCGGCCTCCA ATACAGATTT TCATAGCACC ATCTGACCCT 900
ATCTGGGCAG AAACTAAATT TTAAATAGAA AAATGGGCAG GTATTTTAAA CGAGGGAATT 960
GTATCACTTC CCCAAGTGAA CATGTTCCTA GAGTTAACCA TCCCTGCACA GTTTAAATCT 1020
CCTTCTGAGC TACATTAACA TGAAACAAAT TCAACAAATT TTATCCAAAG AACGTGGGGG 1080
ATTGCACCAG TTTTGAGGCC TCCATTCCTA TCCTGGAAAC CATAGCTCAT GTCTTGAGGC 1140
ACGCCCCAGG CTTTTCTCCC ATCTAGAACA CTTGTGGGAA GGGAGCTTTG TGCAGTTGTG 1200
ATAGTAAACA TTCCACACTC TAGAGACCGA CATACAACTC TCTCTGCTGA GCTCAGGCTG 1260
GGCCACTGGC TTTGTTCTCC GCACACATAA ATATAAGTTT TGGAGGCCAT CTTGGAAACA 1320
GGAGAACTCT GGGCGCCTCA GCAGGGGGGC TGACCGTAAC TAAGCAACGG AGGCGCACCC 1380
AGTGCCGCGC AGCCGCAGAG CGCCGCGCAC GAACGCCCCG CTGCGTGGGC GGAACTGATG 1440
GGGGAGGGCG GCGGCGGAAA ATTACCTTAG GTTCTTCTTA AAGGCACAGA GGCCTTACCT 1500
GCTAAAGGTC CAATCGCCAG CCGATCTAGG GTGCATGTTT TACAAAGCCT ATTTGTAATG 1560
CAGTCGACCT TATATTTCTC TGTGAATACG AATTTTATTT ATCTTCTCAG AGAAATAGAA 1620
TCCAATCCCA AATTAACTTC CCCGTGTAAA CTTCAGTCAC TAAGTAAGCA AATAGTGGAA 1680
TAAACAGGCT TCTTCAAAAT CAAGTTAACG GGCATGGGGA GGGGAGAGCA AATCAAACAA 1740
AACAGCCACC AAATTAACCC TAAAATGTCG AATGGCGAAG AAAGAGAGCT AATGAAGTCA 1800
GGAAGGGGAT GAAGTGAGCA CCCAGGAATA AAGTCACGAC TGTGTAGCAG CTTTAAAAAT 1860
GTACAGATTC TGAAGCAAGG AAAATTTATT CTTGACAGAT GGATTGGCAG ATTATAGTAT 1920
ATACTAAAAA TTAACAGAAA AACAAGATGT CTGTTAAGTA AAGCGGGATC AGAAAACTCT 1980
CCGCATAGGT CACTTTTTTA CAGCAAATAA AACCATAAGA CTTTTTGCTC TTCTTTTTAG 2040
AAAAAGAAAT GCAGTTTTTA AAAGTGTTTG GTGGCACACG GGTGCTGATG GCGGTGCAGT 2100
TATACCACAG TACGCTTGTG GAGGTCGGAG GACCTTGCAG GGAGTTTGTT CTCCCATGTA 2160
TGTTCGGAGG ATTGAATTCA GGTCTTCAGA CTTAGCAATA ATCACTTTTA CCCTCCGAGC 2220
CTTATCTCCA GCCTCCACCT CGCTTCTTAT CAAAGACATT TCCTTCGATC TAGCAGTTTC 2280
TATGATTTAC AAGTTAAGGA ATAATTCATA ATGGTCCTAC TTATGTGAAA GAATAAACGC 2340
AGGGTCTGGT TCAATGGAAA TCTGCAGGGG ATAATGTGCT GCTCTGCAAG TCTCTACAAT 2400
TAATCTCCTT ACTAAAAGCC TTCCTTGAAA ACAACAACAA AACAAAACAA AACAAAACAA 2460
ACAACGGAAG AAAAAGAAGA AGAAAAGAAA AGAAAAGTAG GAAAGAAAAG AAAAGGAAAA 2520
GGAAAAAAAC GTGTCCTCTC TGAAATAAAG CCATTCCCAC ATTCCGAATC TCCATTTCCA 2580
ACGACAGAAG ATCTTTTGCA CTCCTCAGAT GGTTTGCTTG TTATAAATGA TTTCTCTTCC 2640
AAACTGCCAT TAGGTGTACC CTAATAAACA GCACCATACA TCCTCGGAAG CACCTGGGGC 2700
TCTCACCACA AATGGGGGGA TGTTCCAGTC CTATCACGGC CCTAACAAAC CAATTGTCAA 2760
TCCCAGAATC GACCATTTCT TCCCATGCTT CTCAGCCATT TTAAACCTAA TTTTCACATC 2820
TACTTTAAAT CCCTACAAAT CTTCCCCCTT GTCCCTACTG TAAAGTCTTT ACAATGTCAA 2880
TGTTTACTTA GTAATTTGTA AAGGGTACCG TGTTCCTTTC AGAATATGGA ACCGTGTGAT 2940
CTTGATACTA AGAAAATGTT TTGCAATGGT TTAGTGTGCA GCTTGTTAAG TTTCAATTTG 3000
GCTATTAAAG AAAGGACCAC ACTAACTTTC TAGAAGCACA GGGAGATAAG TCCTTTAGAT 3060