EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-10416 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr6:91668470-91671910 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 46             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EBF1MA0154.3chr6:91671666-91671680ACTCCCCAGGGACC+6.27
EsrraMA0592.2chr6:91669024-91669035TTCAAGGTCAT+6.62
EsrrgMA0643.1chr6:91669025-91669035TCAAGGTCAT+6.02
Myod1MA0499.1chr6:91668631-91668644AGCAGCTGTCTCT+6.32
MyogMA0500.1chr6:91668630-91668641CAGCAGCTGTC-6.14
Nr5a2MA0505.1chr6:91669048-91669063GAATTCAAGGCCAAC+6.29
Nr5a2MA0505.1chr6:91669021-91669036ATGTTCAAGGTCATC+6.57
RFX1MA0509.2chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA+6.64
RFX1MA0509.2chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA-6.64
RFX2MA0600.2chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA-6.68
RFX2MA0600.2chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA+6.91
RFX3MA0798.1chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA-6.95
RFX3MA0798.1chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA+6.97
RFX4MA0799.1chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA+6.47
RFX4MA0799.1chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA-6.78
RFX5MA0510.2chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA-6.65
RFX5MA0510.2chr6:91670336-91670352GGTTGCCATGGTGACA+6.74
Tcf12MA0521.1chr6:91668630-91668641CAGCAGCTGTC-6.02
ZNF263MA0528.1chr6:91671093-91671114TCCTCCTCCTCCTCCTCCCCC-10.39
ZNF263MA0528.1chr6:91671118-91671139TCCTTCTCCTCCTCCTCCTCC-10.48
ZNF263MA0528.1chr6:91671112-91671133CCCTCCTCCTTCTCCTCCTCC-10.49
ZNF263MA0528.1chr6:91671141-91671162CCCTCCTCCTTCTCCTCCTCC-10.49
ZNF263MA0528.1chr6:91671115-91671136TCCTCCTTCTCCTCCTCCTCC-11.11
ZNF263MA0528.1chr6:91671087-91671108CCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.04
ZNF263MA0528.1chr6:91671090-91671111TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr6:91671175-91671196CTCCCCCTCCCCTCCCCCTCC-6.01
ZNF263MA0528.1chr6:91671161-91671182CCCCTCCCTTTCCTCTCCCCC-6.03
ZNF263MA0528.1chr6:91671096-91671117TCCTCCTCCTCCTCCCCCCTC-6.23
ZNF263MA0528.1chr6:91671167-91671188CCTTTCCTCTCCCCCTCCCCT-6.68
ZNF263MA0528.1chr6:91671159-91671180TCCCCCTCCCTTTCCTCTCCC-6.73
ZNF263MA0528.1chr6:91671156-91671177TCCTCCCCCTCCCTTTCCTCT-6.79
ZNF263MA0528.1chr6:91671147-91671168TCCTTCTCCTCCTCCCCCTCC-6.7
ZNF263MA0528.1chr6:91671172-91671193CCTCTCCCCCTCCCCTCCCCC-7.17
ZNF263MA0528.1chr6:91671150-91671171TTCTCCTCCTCCCCCTCCCTT-7.57
ZNF263MA0528.1chr6:91671084-91671105CTGCCCTCCTCCTCCTCCTCC-7.59
ZNF263MA0528.1chr6:91671135-91671156CTCCCCCCCTCCTCCTTCTCC-7.97
ZNF263MA0528.1chr6:91671129-91671150CTCCTCCTCCCCCCCTCCTCC-7.99
ZNF263MA0528.1chr6:91671178-91671199CCCCTCCCCTCCCCCTCCTCT-8.07
ZNF263MA0528.1chr6:91671106-91671127CCTCCCCCCTCCTCCTTCTCC-8.19
ZNF263MA0528.1chr6:91671132-91671153CTCCTCCCCCCCTCCTCCTTC-8.22
ZNF263MA0528.1chr6:91671100-91671121CCTCCTCCTCCCCCCTCCTCC-8.5
ZNF263MA0528.1chr6:91671103-91671124CCTCCTCCCCCCTCCTCCTTC-8.71
ZNF263MA0528.1chr6:91671109-91671130CCCCCCTCCTCCTTCTCCTCC-9.35
ZNF263MA0528.1chr6:91671138-91671159CCCCCCTCCTCCTTCTCCTCC-9.35
ZNF263MA0528.1chr6:91671121-91671142TTCTCCTCCTCCTCCTCCCCC-9.57
ZNF263MA0528.1chr6:91671144-91671165TCCTCCTTCTCCTCCTCCCCC-9.64
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04116chr6:91668013-91671342Cortex
mSE_04116chr6:91671457-91672638Cortex
mSE_08160chr6:91668046-91670035Kidney
mSE_08519chr6:91668000-91670577Liver
mSE_10984chr6:91668022-91671114Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GCTAACTCTG GGAGCTGGGA CTTGGTGCCT CTTTGTCTTA GAGTATAGAG GCAAATACTG 60
GGGAGGGAGG GGCAGTTTTA ATCAACTTCA AGACCTGCCT GGCTGGTACA TGGATGTCTG 120
AGGGCCACAG GGACTAGACA GGCTCTGGGA GGGAAGTGGG CAGCAGCTGT CTCTGAGTCC 180
CGAGTCTGTG AGCTCTGCAT CTGACAGGGC CACTTCTCTG ACCCAGCAGC CCTATGTATG 240
TTCAATAGAC TCTTCTGATC TGTACTCTGC TGTAGGCATG AAGCAAGATG GGGATTCTGG 300
CTCCATCTGC CCTGGCCCCT GTGTGTAGCC TGGGGCAGGC TACCATTTTC CTATCCACCC 360
ATCTGCTTCT GTTGTGTGGG AACACTTTAG AAGTCTCTGT GCGCTGTGGA GCAGCTCAGT 420
GGTAGAGCGT TTGCCTGGCA TGTGCCAGGC CTTTGGTTCA AACCTCAGAA CTGCATAAGC 480
CCAGGGGTGA TGGTGCTGGC CTGTAATTCC AGCACTGCAA AGGGAAAGGT GGAGGCAGGA 540
AGGGGGATCA GATGTTCAAG GTCATCTTTG CTATGAGTGA ATTCAAGGCC AACCTGGGAC 600
ACATGAGACC CTGTCTTCCC CCTCAGCACA CCTCCCTTCC TGTCCTCCAA AGAATGACAG 660
AATGGGAAAC AGTTCTGAAA TAGGTTAGCC TGCGTGCTAA AAACATCTGA TGTTTTTAAC 720
CTGGCCAGAG GGTACAAAAG TACATCTGGC TGATGTCACT GGCCCCGGGG TCAACCTGAC 780
TGTGTATGTG GCAAAACTTG TCAGTGATCT TCACGCAAGC CAGCATTCAG GCACAGCTAC 840
ATCTGGCTTG CCACCCCTGG AAAAGGGACA GTGTTTTCAG TATGGGGAGG GACACTTAGC 900
CCTGGAGCTT ATAACTCCAT GCATTCTAAT CACCTGTAGC TGTGGTAACC ACGAGGACGC 960
TCCCAGAATG AGAATTAGGG ATCTACACCA CTGCAGAACA ACCCCAGGCA GGCCCTGAGC 1020
CAAGAGAAAA CAGCTCCTGG CTTGGAGAAG CAGGCTGCAA GCAGATGGTG TGAAAGGGCC 1080
TCACTGCACT GTGCTGTGGC CACTTGATCA CTATGGGGGT GGACTGGTCT AAGTGTGAGT 1140
CTGTAAAGGG TGGACCCTAG GGAGGATGTC TCAAGAATTC AGTCTGAGCC AGCAGAGGGC 1200
TGGCAGAGGC AGACTCAGGG TCTGTGTGAT ACCAGCTCAT TCCAGTGACC TGGATTCAGA 1260
GTTAGCGGAG CCTTTCTCAT TTCTCCCTGA GTGGATAGAG AAGGCCTTAT CCACAGTGAC 1320
ACTAGCTATT ATTTTAGGGT GTGCTTGCTA CATGCCATTT GCTGTTCTGA GCTATTCTCT 1380
GCACCCCCTC ATTTCTTCCT CTGTACCCCA TGACAGGCAC TACTGCTCCA CAGATGAGAA 1440
CATTGAAGAC CAGAGAGGCT GAGAAGTTGC CTAAGGTCGT TCAGCCCTTC TAAGTGGCTC 1500
TCAGCTCCTT TGTCAAGTCT CATGTTCCCT TCAGGGGGCA TAGGGTGTGA GAGGAGCTAC 1560
AGCACTCCTG TGGGGCCAGT GATCCACAAG GGGGGATGGG GGTCTAAGGG TTTGCTTGAG 1620
ACCTCGAAGG ACCAGGGGGT GGGGAGAGGC CTTGGGTTTC CCTCTAGCAA TGAACCGAGA 1680
GAGCTGGGGG TCCATTCTGA ATGTGATTTC TAAGCTGCCT TCAGCTGTTG CACGAGAATA 1740
GACTGGGGGC AGCAGAGCAG CAAGGAGACC TATGAGGAGG CTGCTGTAGA TGCCTGCGCT 1800
AGGGGCTGCT GGCTGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 1860
GAGAGAGGTT GCCATGGTGA CAGGGAAGTG GGGGTGGATG CCAAGAATGT GCAGAGTGGA 1920
TCTGCAGGTC TTGCTGCTGG AATGGTATAT CGCAGGGCCG CTGGTCAGGC ACACGCGACA 1980
ATCTTGGAAT AAGAATGTAA GAGGAAAAAG GGCAGGGTGC CTGTGTCTCT GCAGGACCTT 2040
CTCTGGATCC AGGAAAGTCC AGAGCCTGGG TGGTGCCCTG CCCCCCACGA CAGTAGCCCT 2100
GTGATTTCTA GCCAGCCTGA GGGTGGGAGG TGATGCTGAG GCAGGACCAC TGAGCCCTGA 2160
GTTCTCCAAA GGCAAATGGG TTTGAACCAC ACTCTCACAG GTAGGATGGT GAAGAAGGAT 2220
CAGACTTCTG GATGCACCCG AGTGACTAAG GTGTCCCCAT GAAGACCTCC CAGTGCCAGC 2280
CACAGGACAG ACACTGCGCT GTCTCACTCA GGCCCCAGCC ACCATGGTTC AGTCTCGGGT 2340
GACATGATGA TAGATGGAGG CCCGAGAGTA TCCAGGGATA GATTTCTTAT GTAGCAAATC 2400
AGTCTAGACA CAGGGGTCTT TGGGAATCCT CTATTCTCTG GGTTCTCTGA GATCAGACTT 2460
GTTTGTGGGT CTAAAGGCCA GGACCTGGGC TGTCAGGGCA GCAGGCCATA GGGCATCAGA 2520
ATATGGCTTC TTATAGGACC AGCCTTGGCC AATAGCTGAC AGTGAGGTGA GGAGACTTGT 2580
CCCACTCCCA TCCATCTCTC CCTAGTGCTG GAGGCTGCCC TCCTCCTCCT CCTCCTCCTC 2640
CCCCCTCCTC CTTCTCCTCC TCCTCCTCCC CCCCTCCTCC TTCTCCTCCT CCCCCTCCCT 2700
TTCCTCTCCC CCTCCCCTCC CCCTCCTCTT AAGTTTAAAG GCTAGGCTGA CCTTGTAAAG 2760
TCTCAAGGAC TGAGACGTGT CCAAAGGGTG GATCAGCCCT TCTCTGTTGG AGGCTCCAGG 2820
TCATTCTTGA GCGGACCCTT CCCTGGGAGG GAGCGGAGTC CCACATCCTC CAATTATGCG 2880
CCCACCACAG GCCACAATGA GCTGTTGAGA TAACCATCGG GGTCTGCTGA CCTGCTGCAG 2940
GAACAATGCT GGCTGCCCGA GCTGTTTTCA CAGTGGCCAC AGACCTGCAG AGCCATGAGG 3000
CCCCCGGGGA GCCGCAGAGA AAGGCCATGC GGATGCTCCC CCAGACAGAG GAAGGACTCC 3060
GGGGTCTGCC CAGTGGCTCC AGGAAGCCTT TCTTGGTCTG CTTACTACCA GATAGTGAAA 3120
CAATTGGGGT CCCCCACCCC AAGCCAGCCA GTGAGAGGAA GGAGGCGTGG GGGAAGCAAA 3180
GTTATTGCGC ACCCCCACTC CCCAGGGACC TGGTATGTCA TTCCTGTGTA CTTTAATGTC 3240
TCCGTCAGAC ACACTGAGAC TTAGCGCAAG GCCTCACCAT ATCCCCCTTG GAGCTGAGGT 3300
TCTGTTGTCC TACTGTGTGC CGGGCTTCCT TCTCTCCACA AGCCTACGGG CTGGCTGTGG 3360
GGAAGACAGC AGCTGAGTTC CTGTTCAGGT AGGGTTGGCT GTGGCAAGAC AAATGCAGCC 3420
AAGCAGGTGA AGGTACTCTC 3440