EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-10360 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr6:86428080-86430650 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4GMA0484.1chr6:86428335-86428350TGGACTTTGAACTAT-6.26
Hnf4aMA0114.3chr6:86428333-86428349GTTGGACTTTGAACTA-6.61
MyogMA0500.1chr6:86430233-86430244GACAGCTGCAG+6.62
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr6:86429577-86429588AGGCACTCAAG+6.14
Tcf12MA0521.1chr6:86430233-86430244GACAGCTGCAG+6.14
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04601chr6:86430282-86430902E14.5_Brain
mSE_05131chr6:86427730-86430954E14.5_Heart
mSE_05692chr6:86428055-86431189E14.5_Limb
mSE_06804chr6:86426868-86432155Heart
mSE_07594chr6:86429543-86431037Intestine
mSE_08230chr6:86427892-86431832Kidney
mSE_08730chr6:86427785-86429373Liver
mSE_08730chr6:86430044-86431223Liver
mSE_09131chr6:86427067-86431486Lung
mSE_11195chr6:86426823-86428540Placenta
mSE_11195chr6:86428601-86431050Placenta
mSE_12694chr6:86430060-86431049Testis
Enhancer Sequence
CAGGGTAGCT AGTGCTTTAA ACTAATGTCT GGGCAGCACT CATGAGAAAC CATCACACCT 60
ATACTTGCCT AAACTGTCAG CTGCCTCTCT CTAATCCACT GCTGGAGTTC CAACGGCCAT 120
GACTTCCCGC TTCCCACTGG CACTGCTTTA GTTCAGCAGC TCCATCCTTT TTCTGGACTC 180
TTGGCATAGT TGATAACTTG TCTTCCTGTA TCCACTCTCC CCTTACTGTA ACTCTACTCC 240
ATAAGTTTGG GGTGTTGGAC TTTGAACTAT CCTGTAACAA GGTGCTTGTT TCAAATTCAC 300
CATGCTCCTT TGTTTAAACC CCTCTCAGAG TAGAGCTCGG GCACAGTGCT TTTCTAGCCT 360
GCAAGAAGCC CCAACACCCA GGAGCTGGAG GCAGAAGGAT CAGAAGTTTG AGGTCATCCT 420
ATGCTACATA GTGAGTTTGA GGCTGGTCTG AGTGACAGGA AATGTCTCAG AAACAAAACT 480
GAATCTTTCA AAGGCTCCTC CAGGTTTTAC TGATAACTGT ACCTGTTACT TTTACTTTAA 540
ATTTCTTCAT GATACACATA AGATCCTGGT TCCTATGGAA TGGAATGCAG CTCACGGGTA 600
GGGTGCTTGC AGTGTGTAGT CAATGGCCAA GATGTGAACT CCAGCACCAC AAGAGACCAA 660
AACAGCCCCT GAGCCGGCTT TATTCTGTCC ATTCTCCAGC CATCCTCCCC TTTCCCCAAC 720
GTGCTCCCTT ACTCTCAGCA CTCAGGAGGT GGAGCCAGGC AGACCTCTGG GAGTTTGAGG 780
CCAGTCTGGT GTACATATTG AGTTCTCTAA CAGCCAGAGC TACATAATGA GAACCCTGTC 840
TACACACATG CAGACAGAGA GTGTGTGTGT GAGAGCCTCA GCTCAGCCAC CTTTGCACTT 900
CCTACAGTGC TCCAAGGCTA GGTATGTTTT CGTTTGCTGG GGTTGTGATT TGTGACTGGG 960
TAAATGAGTA GGTGAGCCCT GTCTGCTGCT GCACTCCACT GACAAGCCCG AAGTTGATCA 1020
GGCTTGGTCC CAACACCTCC AGGCTCACTG CTTATCTTGC ATAGTGAATA ACCCAGCACT 1080
ACGTTTTGCC AGGTGGGAGA CATGCAGGCC CCTCATAGTC CTGCCTCATC TTCCCCAGTG 1140
CTGGAATTAC TAGCATTGGA CACCATACCA AAGGGCTAGA AGGGTTAGGG ATGGAGTTGA 1200
GGGTTAATAC GTTAATACCT GCTGTTGAAT GGTATTTTGC AAACTTGACA AGAGTCTCTG 1260
TGTCTCAAGG CCACCTTCTG GCATCTTCCA ATCTTTCAGT GTCACAAGCC AGGATGTCCT 1320
GTCAGGAAAC CTGAGTAACA CCAGCCTCTC TCTCTGTGGG TGAGCTTTGT GGGGGTGAGC 1380
GGGGGTCACT TCCTTGGAAG CTCCTTGCTG CTTCTGACAG GCTTTGCTGA GCCCTGCAAG 1440
TGTGCTGGAG AGTGACCAGC CTCCAGGGCC TTCTGCTCTT TGTCCTCAGC AATCTAAAGG 1500
CACTCAAGGG AAGGAAGGTG CATCCTCTCT GGGGAGGAAT GGATTGTTCT AATGTCTGCG 1560
ATCTGGCCAC ACTTGGCATC TGTGAAAGCA ACTTGCTTTC AGAGCACATG GAGCGCACCT 1620
GGCAGAGGTC TCAGATCACA TGCATGAGCT GAGGAATTGT AGCTAAAGAA AGCTAAAAGC 1680
TGGATGCTAT GGCTGTCAGG GTCAGATTAA TGAGTTATTG AGGTTGTGTG AATTAGTTTA 1740
TACTTCAGCT ATCTGTGATC TTTGCAATAT AAAAGCTAAT TCCCCAAAAA CACTTAAGAA 1800
AGAGCAATAA AGAGAGGCAG AGGCAGGCAA ATTTCTGTGA GTTCTAGGCC AGCCCTGTCC 1860
ACATAGTGCC AGGAGGAATT ACATAGTGAC ATCCTGTCTT AGAAAGAAAT GGGGGTTGGG 1920
AGGAAAGCAA TGATCATAAA TTGTATGTTG TCACACACAG TGTGGTGACC TTAAAATGGC 1980
TAATACCATG AAAATATCTA CAACTTGGTG ATGTGATTGG TTTACTGAAA ATGTATTTTT 2040
TTTTAAGCAA AGTATTCCAG ACAATGATAG CCAATTGACA ACCCCCTAAC AACCCTCACA 2100
GATGTCAGGG CAGGAATTTG GTCTCATGTT TCTGCCCCCA ACTCCTGGCC TCAGACAGCT 2160
GCAGATACAT ATTCCATGTA GCTCCAGTCT CTGAAATACC AAATGGAAAT TTACTGGGGC 2220
TCTCAACTAA GCCAGACTCT CACACAAACT GTACTGCCCC ATGGGACTCT CCACAGGGCC 2280
AGATATTTTA TGAGAACGGG CATTCCCAGT TGATTGGGTC AACAAAACGA AACCAAGGAA 2340
CTGTGTCTTA AAACTAATGT ATCCTGTTTA ATTGTACACA AGGGACACTC CACTCCAAAG 2400
CAAGAGCCAG GCAAATCTCA GGTTTGTAGA CTCGGTGAGA ATATTGGAGG CTTTTGTGGA 2460
GCTTTGTTTT CTTTAGAGAG GGATGACCAG CTGGCAGGGG GCTGGACGCT GCCTTGCAGG 2520
AGGAGGGCAC CAGCAGAGGA GACAGGAAAA CACAGTCAGC AAAACTGCGG 2570