EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-09435 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr5:74592180-74593290 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr5:74593197-74593209AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr5:74593201-74593213AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr5:74593205-74593217AAACAAACAAAC-6.32
RORA(var.2)MA0072.1chr5:74593049-74593063TTGACCTACTTTTG-7.19
ZNF263MA0528.1chr5:74592315-74592336CCCCCTCCCCCTTCCCCCTCC-6.21
ZNF263MA0528.1chr5:74592541-74592562TCCTCCCCCACCCTCTCCCTC-6.63
ZNF263MA0528.1chr5:74592311-74592332CCCTCCCCCTCCCCCTTCCCC-7.62
ZNF263MA0528.1chr5:74592312-74592333CCTCCCCCTCCCCCTTCCCCC-7
ZNF263MA0528.1chr5:74592318-74592339CCTCCCCCTTCCCCCTCCCCC-8.18
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04830chr5:74591312-74592618E14.5_Heart
mSE_04830chr5:74593119-74595446E14.5_Heart
mSE_05858chr5:74592866-74595272E14.5_Limb
mSE_11010chr5:74590365-74592323Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GCAGGTGAGG AAACGTACGG AGACCAACCC TGTTGGGATG GCCGCCCTCA TTTCTCAGTA 60
CCTTTAAGGA CACTTCCTTC AGAGTGACAG TGTTTAGCAT CAAGATTCTG CTACTTCCAA 120
TTCTGCACGC CCCCTCCCCC TCCCCCTTCC CCCTCCCCCC AGCTGCCATC TGGCCTCATT 180
CCATTCTTGG CGCATTCATC ATTTTATCAA GTGCCCGAAA GTATTCCCTG TGGTATGTTT 240
TAACTATAGG GACCCCAGTT GGAAGCACCG TTTGTACTCC AAGGCCTTGT CCTTTAAAAC 300
ATGCCTGCAA AAGTCATAAA AAAAAAAAAT ACCCAACCAA ACAAAAAACC CAGCTGCAAG 360
CTCCTCCCCC ACCCTCTCCC TCTGCTGGCT GCCTTTCAGG GGCGACCTTT GAAAGCAAAG 420
GCCAAAGAAG AGTTGTAAGC CTAAAGTTCT TTCCTTAACA AAGACAAATA AGTAGCTGCT 480
ATGATTCTAG CAGGGGGAGA GCAAATTGCT TAACTAAGTA GACTGTATGG TTAAATTAGT 540
AGACTTGTAT TAAGTACCAG TTGGGGATTT AGTTGAAATG AGCCATATAA GCTGTCCCAA 600
GATAAGACCT GGTGGCCTTC TGCTTTGATA TAGAGCTGAT CAGAATCATG GCACATATTC 660
ATGCTAAGAG GGATGCTAAC TGTGCATTTA CTAACCGTGT TTGCTTATGA AGCTATTGTG 720
GGCAAAATAT AACTGTTCAG AGAATGATAA TATAAAATAA AAACAGAAAC CCTGCGTATA 780
CTGAGCCAGA AACTTTCCTC CGTGGAACTA CTCTAAATAT GGAAACTCAG TTAAAATTAG 840
ACCAGCAAGT TTCTAAAAAC CCACAAACTT TGACCTACTT TTGATAAAAT TTGATAATCT 900
ACTAGCAGGG GCTTAAGACT GCACGTGGCC TTTAAACAAG ATCTGAATTA AGTGCATTAA 960
CTAGAAGTAA ATCACATCTT TCTCTTGTGT GTATCGGTGC AAGTCGTGGT ACATTAAAAA 1020
CAAACAAACA AACAAACAAA AACCCAAACC ATAATGTTTC CCGAGGCTGC ACATGAAAGA 1080
GGAACACACT CTCCTTTCTC TGTCTTCATA 1110