EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-09007 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr4:139145460-139147820 
Target genes
Number: 5             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LEF1MA0768.1chr4:139145540-139145555ACTCCTTTGATGTTT-6.42
PKNOX1MA0782.1chr4:139145497-139145509AGACAGCTGTCA-6.37
PKNOX2MA0783.1chr4:139145497-139145509AGACAGCTGTCA+6.22
TCF7L2MA0523.1chr4:139145541-139145555CTCCTTTGATGTTT-6.78
TGIF1MA0796.1chr4:139145497-139145509AGACAGCTGTCA+6.14
TGIF1MA0796.1chr4:139145497-139145509AGACAGCTGTCA-6.37
TGIF2MA0797.1chr4:139145497-139145509AGACAGCTGTCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr4:139145497-139145509AGACAGCTGTCA+6.27
Tcf7MA0769.1chr4:139145543-139145555CCTTTGATGTTT-6.92
ZBTB18MA0698.1chr4:139147235-139147248GAACATCTGGCTG-6.32
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02613chr4:139137371-139156823HFSCs
mSE_03926chr4:139145266-139147417Cerebellum
mSE_10415chr4:139145044-139147042Embryonic_stem_cells
mSE_11727chr4:139145276-139147733Placenta
Enhancer Sequence
AGGCCAGCCC CGTGTCTCCC CTTTCTGCTG GGGTGACAGA CAGCTGTCAC CCTTAGCAGG 60
CAGCTGCCTT AACTTATCGC ACTCCTTTGA TGTTTGGTCT CTGTTTTGAG ACACATGTAC 120
AGATAGCAGA ATACAGCCTT AGGCTGGATC CCAGATTAGT TTACTGGCTC TGAGCTGCCT 180
CCCTCAACCT GAGCATCAGT TAGTGGAACT CCCGAGGGCC ATCTTTTCCT TGCTAGACCA 240
GTTTGGGAGT CCAACCCCTG CCCCCAGGCT AGAACCATTG AAAATCCTGT TCTCTGTTCC 300
AACTGCTCCT CTGGGCCTGC CCCTTCCTGG TGCCTTCCAG CAACCTTTCC CACTGGGATA 360
AGCTTCCTGG TCTATAGACA CAGTCCTGAA TGCTTCGCTC CCCTTTGTGG TTTTTTACAA 420
AACAAGGAGA GAGGTCATTT GAACATCACT GCCTGGGGAA CAAGGCAGCT CTATGCCCTG 480
CTCCCTCCTC TGCTGCCATC CTGGGGGTTT GCGTTGACCC AGACACAAGC TAGGGCCTGC 540
TCTGTAGGAG GCTCTGCCTG GGCTTCGGAT CTGACTGGAG TCTCATGAAT CCCTTTAAAA 600
CAGAACTGGC ATGTCTCCCT GGCCCAGACC CATCTTTCTT GGTGGGGAAA CTGAGTCCCA 660
GAGAGGTTGA ACCCTGTGGC TATGGCTGCT CAGCCAACAC AGCAGAGCTG GGTGCCAGCA 720
TTCACCAGTG GCCATGTTTC TGTTTGGATA GAGCCTGGAC CTCCAGCATG GGGTGGTGCC 780
TGAGAGGTGG TGGTAGAGGG TTGTTCTGGA CTGGTATCCC AGGAAGGAAG AAACCAGTGC 840
CTTGTGCCTC CATAGATCAC CTTCTCTGTG TGCCAGGAGA CCTGAGATTC TACTCCAGAT 900
CCTCACTCGA CCCCAGGGGG GCCCCTCAGT CTCTCACCGT AGGGGGTGGC CAGAAGGCCT 960
GAAAGTGCAC TGGTAAGTGC TCAGGGAAGG AAGGGGTTAA GCAGTCTTGC CTTCCAGGCC 1020
TAGGTTCCCA GCTGGTGTCT TGGCCCCTCA GGTCAGCCAG GCCATCTGGC TGACAGATGC 1080
CTTCCTATGT CCCATCTGTC CCAAGGCAAA GTCACCAGGA GGAGACCCGC CTGCTGTCTT 1140
TGTGAACCTG TGGGCAAGTC TGCCTGTCCC TGTGAGTCTA GGCCACTTGG GAAGGGTCCA 1200
TGGCGAGCAG GCTGGCCTTT GGCCACTCTC CCTGATGCCT GGGGTCTCTG CTGTATGGTG 1260
AGAGAGTCTG ATCTTTTGGT AAAGATAGTC TGAGAGAGAT GCAGGGACAG GCCCAGGGTC 1320
ACACAGCGGG TTAGTGTGGG CAAGGAGAGA CATGGGACAT GCACAGCTCT TGGTCATAAG 1380
CTTATTCACC TAGCAAACAT CACTTGAGGG CCTATTGTGT GCCTGGGAGT AGGAACTATG 1440
AGAACAAAGG TTCCAAGGGA TGAAGGGCAC ACTGTACCCT GGCACACACT TGGGGCCTGG 1500
ATGCTGTGAC AGCTCTTCCA GCAGCCAGCA ACCGGCCCTG TGCTCATCAT CACAAGCCAG 1560
TGTTGTTACC CCATTTTACA GATAAGGCAA CTGAGGCTCA AAGAAATGAA TTCAGTTTTG 1620
CTAGATCACT GGCTTGGGGG TGACCGAGTT GGGTCATCCT TGCTGGTTTG TCTGATGTCA 1680
AAGCATTTGG AGTAGAGGTA GGGGACACGT AGACATGGTC TCATCCCTAC CGGGACGTGG 1740
ATTCCTGATG TTTTGGTATT CAGACATTTT CCTTTGAACA TCTGGCTGAA TCCAAGCTGA 1800
AGGTCATGTA GCTGGAGGGG CCAGTCTCAG AGCGCGTCTC GGGTGAGGAC AGCTTAGTCA 1860
GTAATGTGCT TGCCTTATGA GTATAGTGAC TCGAGTTCAA GCCCCGGAAC CCACATATGA 1920
AAGTGGAACA CAGAGGTATG TGTGTGTGTG TGATCCCAGA GCTAGAAAGC AGCAGACAGG 1980
GGGACCTTGG AGTCTGCTGG CCAGCCAGCC TACCCTACAT GGCCAGCTCC AGGATCAGTG 2040
AGAGATGCTA TCTCCAAAGA AAAAGGCAGA AGAGAGGCGG GCAGAGAAGA ATGACCTCAG 2100
GGTTCCACAC GCAGATGCAC ACACGTGTAT GCATGCCCTA TGGATGGACA TGCACACACA 2160
TACATACTCA TGCACACATA CATGTGTATA CACACACACA TACATGTGTA TACACACACA 2220
CATGTACACA TAAATTGGGT GGGAAAAGGG AAGCTATTGG TGTTGCCAGG TGGGGTTGGG 2280
GCCCTTGCAG GCACCATAGA CAGCACATGG GGGGACTCTT TGGGCTGTGG AAGGAGCCAT 2340
ACAGGCCTGG CAGTCCAGAG 2360