EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-08223 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr3:141190200-141193890 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 31             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr3:141192726-141192737TCAAGGTCATA+6.62
EsrraMA0592.2chr3:141192725-141192736TTCAAGGTCAT+6.62
EsrrgMA0643.1chr3:141192726-141192736TCAAGGTCAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr3:141191675-141191687GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:141191679-141191691GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:141191683-141191695GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:141191687-141191699GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:141191691-141191703GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:141191695-141191707GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:141191699-141191711GTTTGTTTGTTT+6.32
HLTFMA0109.1chr3:141192800-141192810ATATAAGGTT-6.02
HSF1MA0486.2chr3:141192437-141192450TTCTAGAACATTC+7.52
HSF2MA0770.1chr3:141192437-141192450TTCTAGAACATTC+7.52
HSF4MA0771.1chr3:141192437-141192450TTCTAGAACATTC+7.52
MEF2BMA0660.1chr3:141192562-141192574GCTATTATTAGC-6.07
MafbMA0117.2chr3:141190808-141190820AGTCAGCAATTT-6.92
NRLMA0842.2chr3:141190808-141190821AGTCAGCAATTTT-6.3
Nr5a2MA0505.1chr3:141192722-141192737AAGTTCAAGGTCATA+7
PRDM1MA0508.2chr3:141191766-141191776GTGAAAGTGA-6.02
RFX2MA0600.2chr3:141192806-141192822GGTTGCCAAGGTAACT-6.05
RFX2MA0600.2chr3:141192806-141192822GGTTGCCAAGGTAACT+6.06
RFX3MA0798.1chr3:141192806-141192822GGTTGCCAAGGTAACT+6.01
RFX3MA0798.1chr3:141192806-141192822GGTTGCCAAGGTAACT-6.31
RFX4MA0799.1chr3:141192806-141192822GGTTGCCAAGGTAACT-6.18
RFX5MA0510.2chr3:141192806-141192822GGTTGCCAAGGTAACT+6.55
RFX5MA0510.2chr3:141192806-141192822GGTTGCCAAGGTAACT-6.78
RREB1MA0073.1chr3:141191331-141191351GGTGAGGGGGTGGTTGGATG-6.1
RREB1MA0073.1chr3:141190841-141190861CCACCCCCCACCCCCAACAC+6.38
RREB1MA0073.1chr3:141191283-141191303TGGGAGTGGGTGGGTGGGAG-6.54
RREB1MA0073.1chr3:141190837-141190857CCCCCCACCCCCCACCCCCA+6.69
RREB1MA0073.1chr3:141190834-141190854CCACCCCCCACCCCCCACCC+7.47
Enhancer Sequence
TTCCCTCTAC AGACTGGTGA TAACTTGGGA TAACCAGTAC AGTCAACCCA TTCTATGATC 60
TCACAGTGTT TGGTTTGATG GCCGTGAAAT CATGCCCTGG CTCCTTTTTG TCTCTCGGAG 120
CTGTTATTTT CAACCATCTT TTCTAGCTCA TTCTCCTCCT CACATTACAC AGCCTGTGAA 180
CTCCACCCTA TCCTCTGATT CTCTCTTGTA TGTGTCTTGA GCTGTGTGCC ATGTTCTGAT 240
TATCTTTGAG GTGGTGTCGT TTAGTCTAAC GAGTTGAAGT CTCATCGACC TGCTGATGAC 300
ATTTAAATTC CACAACACTG GTGCTGAACT TCCCCCTGAG ATCAATATGT ATTTACTAGG 360
CCCACCTAGA ACAAGAATCA TGCAAGTACC TTCCATGAGA GAATTATTGG TCTCCTTCAG 420
CCCAAAGCTT CTCTCATGCA TCTCATCCTA TCCTTTTTTT TTTCCAGTGC TAGAGCAACA 480
GCATCCCCTG AAATTCTGAT TCCACAGCAT AGTGTGCCTC TGTCTGCTAA TTGTCTGCTA 540
AATGTCTACA CACACTCCTC TGTGTCTTCT AGGCCCCTCT AGTGTAAGAC CCATATCTCC 600
AACACAGCAG TCAGCAATTT TACCTGCTTC TGCCCCACCC CCCACCCCCC ACCCCCAACA 660
CACAAACATT TCACATAAAG ATGCAGAGAG ACTCTTAAAA TCCACAAAAG GTCTGGGGCT 720
CTCCTGCATG TCACTGTCCA GTACTTTCTC TTCACAGTCA GAAGAAAGTC ATCACTAGGT 780
TCTGTGCTTT GCATGGCCCA TGCCTTCTGT CTCCCCTCAT CAGCTCAGAT TAGAGACTAA 840
GCCACACTCA CAATATCTGA GTCCCAGGTG CTTATTTGGT TCCTTAAAAC TACTAATTGG 900
ACCCCCCCTC CCCCAGCGCT CCCAGGAACT AAACCACCAA CCACAGCATA CACATGAATG 960
GGTCCATGGC TCCAACTACA TATACAGGAG AGGATTGCCT TATCTGGCAT CAATGGGAAG 1020
GGACACACTT GTTCCTGTGG AAAATTGATG CCCCAGCATA AAGGGGATGC TAGAGCAGTG 1080
AGGTGGGAGT GGGTGGGTGG GAGAGTGGAG GAGCACCCTC ATAGAGGCGA AGGTGAGGGG 1140
GTGGTTGGAT GGGAGGTTTG TGGAGGGGAA ACCAATAAAA AAGTACTTTT CCTTCCCAGC 1200
TGAGCCTTTG ACTCCTCTAT CTGCAGTGAG CTGTGTTTTC ATGGAGACTT GTACACTAAA 1260
TGCTCCTTTC ATGACTTCCT AGAGCTTGAA AAGTATATAT TTTTTCTTCC TCCCCCCCTT 1320
TTGATTCTCT ACATTCTCTC ATTTTATCAT GTAATTATAT CCCTGTCTCC ATGATGAGTA 1380
AGACCATTTA CCTAACAAAG AGTTGTACCC CCAAGACACT TGGTGCTTCC ATCAACTCCT 1440
TGTGAGTTGC TGTTGTTTGT TGCTGTTATT GCTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTG 1500
TTTGTTTGTT TTAGCTGTTC TCCCTTTTGA GGGTGCCTCT GGAATCTGGA GAGCATGCAC 1560
CCTTGTGTGA AAGTGAGCTC CTAGTCCATC TAATATTACC TTATCTAAAG TTATCTAAAT 1620
ATTTGAAATA TTCTGTGCTA ACAATTCTTG CCTCCTCCTG AGACTTGGAA TAAAATTACT 1680
TCCAGATGGT CCTAAAGTCC CAGCATATTG CTACAGTTAA CAAAAAGCTT TTGTAAATGG 1740
TATATTAACC ACTAAGGGGC ATGTGGTACC ATTAACTTGT GCTATGAGTT CCTGTTGTTA 1800
ATGGTAAAAT GTGCCTGAGC ATGCATTTTT CTTTTTAAAT CATACATAAT TACAGTATTC 1860
ATTGTACATG ATATTAAAAA ACAGACAGGA AAGTTCTCTT TAAAAAACTA TAGGGTACAC 1920
ATGTGAACAA GCATTGAAAT TTCAGATGGT ATAAAATTTC AGAATATTTG AAACTTGGAG 1980
ATAATTTGAT CCTAAAACCT GCAAATACAA AACTAGAAAT ATTTGAGATG TTTTTGCCTT 2040
TTATCTTTTC TAATTTGCCT AATATAAAGT GAATTAATGA AAAGTTATCT TTCAAATATT 2100
GTTTTTATGC TTAATTATTA TTGTGAATAA TAACTGGTAG TATATCATAT AAATAGTGCT 2160
TTGTTCTTTC TTGTTGAATA AGCTTACTTG ATTAATACAT TTAACATCAA AATTTCTGCT 2220
GTTGACTCAC TGGTTATTTC TAGAACATTC CTAGACCAAG GACTGTTTAA AAGTTCTCTG 2280
TCCTTACTGT AGATTGATGT AGGAGTCTGT CTGCCTTGAG GATTGTGCTA GTTTGTTAAG 2340
GAGTAAAAAG ACTAAAGTTA TTGCTATTAT TAGCAAATTA CAAAATATTA ATGATGTTTT 2400
GAAGAAAATG AGACAGGTTT ACTAGAAATC CTCTTAAGCC TAAAGTTTGC TTAAATGAAA 2460
AAAGGGAGGA AAACCTGAAA ATTAAAATGC CATAGTGTAA GAGGAAGGAG CTAGCCACTA 2520
ACAAGTTCAA GGTCATAAAG TGTACTTCCT ACTTGTTATA AGAACCTAAG GCTGTAGTTC 2580
CTCTTACAGA CTGCCACCTT ATATAAGGTT GCCAAGGTAA CTTCCTGCTC TAAACTATGC 2640
TCTGAGAGAC TTGATTACAT CCTTTTAATT TAGACCTCAA ATTTAGATTC TACTTGGAAT 2700
AACTAGGATG TGGTAGGGGA GAAATCACTA ATAACATTCA TAGTTTTTGC TAAGACAAAA 2760
CATTTTTGCT GGCATGTATG CACTTATAGT AGACTAAATC AATAGAGAGT ATGCCCAGCC 2820
AGCTCCCCAG TCTAGCCAGG CTGGTTTCTT TGTTTATGTA AAGTAACTTA AAGAAAAAGC 2880
CATGTTTTAC TTGGGCATTT TTTTTTAACT TGGGCATTTT TTGCATGTGA ATATTAAAAA 2940
TATTGTATGG ATTTACTCCC TGTATAACAA TATCTTTTTT TGTCATAGTA AAAATGTACT 3000
AGAGATTTAT GAGCCTCTAT TGAAATGCAA ATATGTATTT AGAGAGACTC AGAGGCACCA 3060
CAGTCAACCA ATCAAATCTT TCATTCAGTT TTAGAGCTAA CTATCTATTC ATTATCTTAT 3120
TTGTTCAACA ATCACATACT GACCCACTAG AGGGGCAAAG CGTTGTATGA GCTCTACTCT 3180
TGCCCAAGGA GTAGAAGAGT GTTAATCACC ATAGCACATG GCGATCAACT CTTTAACAGA 3240
AACGTTCTTC ATCAGACCAT GACACCCAGG ATGCCTTTTG GAAAAAGGAA TACATTAGAC 3300
ATGTTTAAAG ATATGTAGAT GGCAACTCTA GAGAACAGGT TTGAACTTGG GGGTATTTGT 3360
CATGGAAGAC TGTCATGGGA GCCTGGCTGG AAGGGATCTG GAGTACAAAT AAGAGCCCCA 3420
TAGACTTGAA AGGCATTGTG TTATTCCTGT AGGAAACAAG AGCCAAGCAG GACACTGACA 3480
ACAGGCATGC TAATGCAGGA GGCCAGTGTG GAAGCAGCAG TGACATAGAC TCAGAGAATG 3540
TTCGGGTGAG AAAGGAGCTT AGTTGCAAAT GACCATGGCT TTTAGGTTTG ATGTCCCCTA 3600
CAGTGATGCT TGGTCACTGT AAAGTTTGGG AAGGGGCTTA TTCAGACTTT CATCTTGCCT 3660
TGCTAAATAC AGAGCTCTTT CAGGAACATT 3690