EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-08194 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr3:133899850-133900700 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:133899972-133899989TGTATTAATTAATTAAT+6.32
HNF4GMA0484.1chr3:133900025-133900040TGACCTTTGATCTCC-6.19
Lhx3MA0135.1chr3:133899974-133899987TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr3:133899977-133899990TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr3:133899978-133899991AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr3:133899981-133899994TAATTAATTAATC+7.34
Nr2f6MA0677.1chr3:133900025-133900039TGACCTTTGATCTC-6.72
POU6F1MA0628.1chr3:133899975-133899985ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:133899979-133899989ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:133899983-133899993ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:133899975-133899985ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:133899979-133899989ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:133899983-133899993ATTAATTAAT-6.02
RXRBMA0855.1chr3:133900025-133900039TGACCTTTGATCTC-6.29
RXRGMA0856.1chr3:133900025-133900039TGACCTTTGATCTC-6.44
RxraMA0512.2chr3:133900025-133900039TGACCTTTGATCTC-6.45
ZNF263MA0528.1chr3:133900311-133900332AGAGGAGGGAAGGGGGGGGGA+8.1
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04674chr3:133898138-133904076E14.5_Brain
Enhancer Sequence
GGTAAGTGAT TGTTCTTTCT CTTCCTCTGG CTTCCCCGCT TCTCTTTCTC TCTTAAATGT 60
TTGCTGTCCG GTGGGATTGT AAAAGTAGAT TAATGCTGGT CTCCAGCAAT AAAAACCGTG 120
ACTGTATTAA TTAATTAATT AATCTGCACC GGCCCCTCCT CCTGAATGTT AAATATGACC 180
TTTGATCTCC ATGTCTCTGG TAGATCAGAC ATACAGTATT AGGCATGTAC AGTCACATTG 240
TTCAGAGGCA AAGCAGGATC ATGAAGTATG GATGTTTATT TTAGCTTTGG TGTTAGAACT 300
ATAGTTATTG GTGTGTGCTT TATTTTGTTG CTAAATAAAA GCCAAACAAT AGCTGTGGCT 360
TAGGTACCTT TTTTTCATGC TCCAGGGATG CATTGATTAA ACAATAATGA CCTGGATGCT 420
GGGCACAATC CTTTTCTACA GTTTCTGGTG GTATTGAACC TAGAGGAGGG AAGGGGGGGG 480
GAGGTAGTAG CAATTGGAGA AGCAAGGACA GCTTGTTTGG AAACACCATG CTAAGACTCT 540
GAAAGGGGGA TATTAGATCC CTTCTTTATT TGGAACAAGG TCAAAAGACT AAAATGTTAG 600
TGTCCCCTCC CCTCAGTGGG ATGATGCCCA TTGCATGGTT GGCGGAACTA GTTTCTAGTG 660
ACTAGCAGTT ATTATGATCT TGCATCTTCA ATGTAATTCA CAGAAACGGA AGCTGTATGT 720
GTATTCTTAC TGTGTCTTTC CCCCCAGACC CTAGCAAGTG TCAGGAATAT TTAGCCAGGA 780
GGATTTGGGG GGCACCTTTG TATTGTCATC AGGCCTCAGA AGGGAGCAGT TTTCCCTAAT 840
GTGAAACCAC 850