EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-08021 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr3:99058000-99066230 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr3:99061410-99061427CACATTAATTAATCTTC+6.33
Arid3bMA0601.1chr3:99058591-99058602ATAATTAATAT-6.02
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EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:99063413-99063431CCTTCCTTTCTTTCTTTC-7.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:99063409-99063427CCTTCCTTCCTTTCTTTC-8.57
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:99063401-99063419TTTTCCTTCCTTCCTTCC-9.07
EWSR1-FLI1MA0149.1chr3:99063405-99063423CCTTCCTTCCTTCCTTTC-9.6
Foxd3MA0041.1chr3:99065009-99065021AAACAAACAAAC-6.32
Gfi1bMA0483.1chr3:99061344-99061355AAATCTCAGCA+6.32
IRF1MA0050.2chr3:99058408-99058429TTTCTCTTTTAGTTTCTCTCT+6.24
Lhx3MA0135.1chr3:99061411-99061424ACATTAATTAATC+6.03
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MSCMA0665.1chr3:99058729-99058739AACAGCTGTT-6.02
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MYF6MA0667.1chr3:99058729-99058739AACAGCTGTT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:99061413-99061423ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:99061413-99061423ATTAATTAAT-6.02
Tcf21MA0832.1chr3:99058727-99058741GGAACAGCTGTTGT-6.65
Tcf21MA0832.1chr3:99058727-99058741GGAACAGCTGTTGT+6.99
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05814chr3:99057197-99062373E14.5_Limb
mSE_09668chr3:99052790-99059948MEF
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mSE_09668chr3:99064901-99068036MEF
Enhancer Sequence
CCACCCGGGT GAGTGTGTCG GATCGGACGA CGGGAGGCGG GTGGAGAAGG AACACCAGCC 60
GGTATCCCCG CGAGTGGAGG GAGGCCCTGC CTGCTGACTC CCTGCCTCAC TCCGACGGGG 120
GTTCCTTTTT CTTGGCATAA ATACCTTGAG CCTCCCTAAA TTCGCCGGAA CCAATTTGGG 180
GGCCTGGCCC GAGCCTTGCA TTTTAATCGC CAATTTCAAG GCCTACTTGC GTCCATCCCC 240
CTTCTCTTGT GTCAGAGACT GAGGGCTGCG GGTCCCTGGG TTTGAAAGAG CTCAGTCAAA 300
GACACTGGAG AAAGAGCCCA GTGGATCTGA GACTTGCTTC CGTGCTTCTG AGAGCCCCCG 360
AGTGCTGCCA GACGAAGCCT ATAAGGCAGC CATGGGAAAT GTTCCGGTTT TCTCTTTTAG 420
TTTCTCTCTC AACTAAGTTT TAGATGGTGG AGTATAATTA TTTCTATTTC ACTGGGGACA 480
TAGTAGATAG ACACTGTATC CTGAGACCCA GGTCTTTAAT CCGTGCCCAC ATCTCAGTAT 540
TTGGGTGGGT GCACGTTTCA ACTAATTTTC TTAGATCTCT CCATATTGTA CATAATTAAT 600
ATGCACAAAA CACTTAAAAC TCAAGGCGGA TGTCAATGTG TGTATTTTAA CAGAACCCTA 660
AGAGGGAGAA AACAGCTTCA CATTTTGTAT TTAGTGCCAA GATTTCAACA GTGCAAAACA 720
GCCCGGGGGA ACAGCTGTTG TCAAAATCCT GTAAGCACGC TCACAAACAC TACACTCATA 780
ACTCGGTTTA GCGGCTTCAG AATATTTTCA ACAACTAGTA TTTTCAGCCC AGATTTCTAA 840
GGCCCTGCAG AAGGTGTCCC TGCGGACCAG CTAGGATCCA GGACTAGACT CCTTGTCCTA 900
CACGGCTTGG GGGTGGGGGG GAAGAGTCAG GCAGCCGCCC ACACAGGAAT GGGAGCAGCA 960
GTAGGCTCGG GAGCTTGAGG ATCCTGGCCT GAAAGCTAGC CAAAGCCCGA AGAGGGACAG 1020
CTGTCGCTTA CATTTTCTCT TTCAGCAGTG ACAGTTCAGT TTCCACGCTC CCGAGGCTAA 1080
TAATAACTCG ATTAGCCAGA GACCTGCAGA GACAGAGTTT CATGAATTCT CCGTGTTCTT 1140
GCGGCCCGTT ACGGAATTTG GGTTTAGTGC TGGGGAATTA TTTTTATTAG TCGATGAAAA 1200
GAAAATTAAA AGGAGATTTA TTTCATCCAT CCACGACTTT CTCTCTTTGG GAGCAAGGGC 1260
AGGTCCACTC GGTCTGCTGT GTGGGCAATC CAGGAAGGAA CCGAAGATAG CTAATATGTG 1320
TCCTCTATTC TGCCATCCCG TCACCCAATT TATCTGTTGT CAGGATTTCA GTAAGGGTCT 1380
GTACAGTTAT TGGAATGACT TATGGCAACT TTCGATTTGG GAATCTCTTG TTATTTTATC 1440
TTCCTGACAG TGGATAAGGG AGAAATTATT CGATTTAGGA AGACTGATGT CAAGGGTGCT 1500
TTTCTCTGGG GGAAGAGTCT GGGTTGCTGG GAGTGTGTCT GGTGTGTCTA AGCTCAAAAG 1560
GGCCGGCATG TGGGGGTCTC TGAAACCATT GGTATAGTTC AAAGCTCTCT CCTTCCGTCT 1620
TTCTCACCCA TAAGTGAGGG AAGCAAAGAG AGGAATTGGA AAAGAGAATA TTCCAGTCAC 1680
GTGAATGTGG AGAGCTAGTC TCCAGAATTT TGTTTAGTAG CTCTAGTCTT GGCCTGACAA 1740
AGATTCGATG GAATATAGAG CTAACCCTTA GTGACACACT TCAGCCGCTC TGTTCCATTA 1800
TTTGATTGCC TGTTTTAAAA GGAAGAGGGT ACACTGAGGC TAGGAAACAA CGAAATGAAT 1860
TAATGAGCAA GGTTCCTGAA GAAGGGATTC AAAATTGAGA ACATTGGGTA GCCCAGCATG 1920
GCCTTTGGCA GATGAGACCC TCAGGTTGGA GCTCAGGCAA GGACTTAAAG GCTTTCTTAT 1980
CCTCTGGATT TGGGATGAGA AATTATCCTT CAGGGAAAAA GGGGAGGGGG CTTGGTGTGG 2040
AGACAGGCCG AACCCTGCCA TAGCTGCCCA TTCTGGACCC AACCACACAA TTTGTGAGCA 2100
GAAATTGCCA GCTGCGTAGC TTTTCTTCCT CCTCTAGTAT AGTTCCCTGT CCCCCACTCA 2160
AGGCCACATT TAGAAACACT TATGAAAGAA TAGCTTAGAT GGCTGAGCTA TCCTGTGCAG 2220
AGCAGTACCT TTCTTCTACT GTGTTTCAGG ATCTGTCTTC TGCTAGGGTG GGAGAAGTTG 2280
CTGTGTGAGT TGTTGGTCTT AGGCAGAGGG GGGAAAACAC AAAATAAAAC CAAACTGCCT 2340
GGGGCCTGGG GCAAGATTAA ATACTCATCC GGCCAAAGTA GCTGTGTTTG TCCTTCTCAC 2400
CATCTTCTCT TGGACCGATG ATTCAACTAT TTTCGGCTGG CCCTACCTGA GCCTGAAACC 2460
AACAGGACCG GCAGACAACC CAGGGCCCAA ATTGTAAAGT TGAACAGCAA AGCAAACTTT 2520
TTTAATTCAG AGACTCGGGC CGGCCCTTTG CCTTTTCAAG ACCCGATTTT CTTTCCGGGT 2580
CTGGACAAAG CTGGCTTTAG TTGGCGCCTG AGCACCCGAA GCCTGGGGCG CCAACCTGTA 2640
GCAGGGGGAT AGGTGTAGGG GGGCAGCCAG CCAAGACCTC CACTCTGGAG GGTACTCATA 2700
GGTCAGAGGA CACAGCACTA TTTCAAAAAC TTCCATGGAA GCCTTGTGGC CTCCCAAATT 2760
TCAAGGCCTG CGGGTACAGA TGCCTGCCCT AGTCTCTTAA GGGCACTCGC TCTCGCACTC 2820
TCTGTCTTTC GGATAAGTCT CTAGGACTTG GAGGCCACCG GCGGGAGAGA GTCTCCAGGC 2880
CCTGGCCGGT GGATAAGCCC AACAGAAGAA ACTTTTCACC CAGGATTGGC GGAGCAGCTG 2940
CGGTGACTGC GGCCTTGAAA ATGTATTTTG AGCGCGGGGC GGCGCCCTCT GCACTCGGAC 3000
CATCCAACGC TCCACTGGGC TTCCTTCCCC CATCTTTGGT TTGGACATTT CCCGCCCGAA 3060
TCTTCAGCGA AGTACAGCCA AGGCCCGGTC TCCTGCGGAG CGAAATAATT CAAACCTTCT 3120
GGGGGAGGGA TTTCTCCTTT TCCAGCCTGC AGGCCGAAGG CCTTTCGGCC AGCCACGGGT 3180
TCCACCGGCC TAGAGAGGTG GCATCAGTCG CGGGTGGGCA GGTACAGGCA GGCACACTCA 3240
AGCACACTCA CAATCGAACT AAGCAGAATT TCTTAACATT TTCGTTTGCA TCCACGCGCG 3300
CAAACCCTCA TGAAATGAGA CAGGAGAAAC TTCTGTCCAA GCAGAAATCT CAGCAGTCCC 3360
AAAGCACTTT GTTTCTAGTT ACTAGTAACT TCTAGTTTCT AGTAATTGGT CACATTAATT 3420
AATCTTCCAG TGTATTGTTT GTTTGCTTGG AGCAAAACTG AGATTTTAAT CCTGACATTA 3480
AACCCACCCC ATTTCCATGG GGTGAAAGAG CAAGTGAGTG GGCGCTGGCG TTGATATTTA 3540
AGAAATGGAT ACAGAGGGAT GAGCTGGGTG GGAATACTGA TGTCAAGCAC TAGGTTCAGG 3600
TGGCCAGGGT AAGGTGTGCG GAACCTAAGC TCCTGCCGAG GCTCTGCCTG GGTTGAGGCC 3660
TGCGCATGGG ACTGTTATTC CTCTGTGCTG TGGGCACTAC CCCGGACACA TTCATGCGTC 3720
CAGGGTGTAC CCGGCACCAG AGAAGGGATT ATTAAGTGGG ACTTGGAAAT CTGCCTTCAA 3780
AACAGCCTTC CTCAGAGGCC ACCTCTTTGG TAAGTGATCT TGTGTGAAGA AGAAGCAGAG 3840
GAGGAGGTAA GGATCGAATT TGTCTTTGGT TGGAGAGGAT GGTCCAACCA AAGACATTCA 3900
GCTATTCACT GGAAGATAAG GGCCAAGGAG TGTCTTTTCA AACGTGTGTC AGTGTCTAAG 3960
GCAGACGTCT GTGGATGCGC GGGGCTTGGA GAACGGGACC GAGGCTAGGC AGTAGGAATT 4020
GGTTGTGGAG ACTCTGTAAA ATCCCAGTGG TGGTAGGAGG TAGTGGTTGA AAAGACAGTA 4080
ATCCCAATTA CACCTCACAG AAACAACAGA GGCCCCGGAG TGAGGGAAGT AGATGGCCAG 4140
GGTTTCTTGT GAGGGGCGGC TACGTGGGCC TTCCTACGGT TTAGTTCTTG GTAGCTAACC 4200
CCATCCCCAA GCTTCTGAAC CCGAGGCTCA GGCTGACAAA CTGATCTGCA TAATAATCGC 4260
TGAGGTTCGG GCTCCCCGAG GAGTCACCCC TACACCTCTA GACTACAGTG CTCCGGATCT 4320
GATTCCTCTC TTGCACCCCA CCTCCACCCC CAACGAAGGC TTCCCTATGG AAATCTGTTC 4380
ACAACCCAGG GGCCTTGAAA GTCTCAATTC GTCTTTCCCT TGGATTCTCC ATCTCTTACA 4440
TTCTTACATT AGTCTTAGCC GTCGAACAAT GCTTCCGAAT TTCCATCCAG CCACTTTGCA 4500
TCTCCTGAGT TTGTAGATGA GGTTCCCAGA GTTCCTCAGA TGATGGCTGT GCAGGGAGAA 4560
AGAATTACAT TTCTTGGAGC GAAATTCAAA CGGAAATTAA CTGCACCCTC ATATCAATAA 4620
CCCCTGAGAT GTAAAATTTT AATTTTGAAA GACAATTATA AATGCAAAAT ATTTTTAGTT 4680
TGTGTGGTGT GAGTGAAGAA TGCTCTAGAG CTCCTAACCT GAGGATCAAA TAACAACAAC 4740
AACAACTAAA CAAAATAGTA ATGTGTATTC CCTGCTTCTC TGTACAGTAT TTGTTTTTGC 4800
ATGTGGACAC AACCCTAATG GAAATGTACC CTCCATCTTT AATCACTCAG ACTAGACAAA 4860
TGCAAAAAGT CAAATGCAGC CCAGTTCAGA AGACCTAAAT GTTGTTGACT CAAGCCTACG 4920
CTATGGTATT CATTGCTTTC ATTAAAAAAA CAGAATATTC CAGATCCATC ACAGCAAGAC 4980
TGTTAGCAAA AAAAAAAAAC AAAAAAAAAC CAAGATATTA ATATGAGAGA CAAATTCTTT 5040
GGAGATTCTA ATCATGGACC CCAATAGAAC TCTGCTCTTA TTACCCAGGA CAAATATAGT 5100
TACTGTAAAA AAAAAAATGT GTGTATAAAT TCCTTTCAGT GTGGTAGTGT GGTCTCAGAG 5160
GAGAAAAAGT GTGCAAGTGG GGGGGGGCAA GGGAGGGTTG ACTGGTGCAA ATTCCGCAGG 5220
GCTAAAGAGC AGACTGGAAT GCTGTTCTCC TTTCTCCATC CTGGAAATGC AGAAATCTAG 5280
TTGATGAACA TCCTGGAAGT ATAGCTGGTT CTTTCTTACT CACAAAAGTC AGACCAGTTG 5340
AGTAGACATC ATTGAAACCA CTCTCTCATC TATGGCTCAC ATTTTGACTT TTTGAATACT 5400
TTTTTCCTTC CTTCCTTCCT TTCTTTCTTT CTTTCTTTCT TTCTTTCTTT CTACGAGGGG 5460
CAAAGCAGGG AACTGCTGAG TGTGGAATCT CTGCGCCCTC TTCTGTGCAT AGGGTTTATT 5520
CTGACTTTAC CCTTTCCAGT TTTTAGTTTT AGTTTTTAGT AAGCCTGGAA TTTTATATGC 5580
ACGTGACTGA GATACTCTCT GGGTCTGCAC TGGGAACAGC AATTAGCAAA TTTATGAATC 5640
AGGCCTGTTT ACACTTCTTT GGGGGAAGGA TAATCATTAC TTAATTTAAG TGAGGCCCTT 5700
GCTCCAAGTG TCCGGGTAGA AAACGAGACT TGGTAGGGAG GACCTGCTGT GAAATGGAAG 5760
ATGTGGGGAA TTTAAGCAAC TGGAGAGGGT TAATCACTGA GTATTCAGCA CCATTAATGG 5820
CATCGAGTAG AGTAGAGGCT GGGTGTTTTG TTTCATACAA ACTGCTAAGG AGCTTTTCAT 5880
ATCAGAAGTG AAAACAGGCA ATTTCGACAT GGACTCCGTA TTTAAAACAA ATGAACAAAC 5940
AAACTACTGT CCAGCTTGCC CATTACAAAG GTGTAAGAAA GGACACACTT ATGCATGTGA 6000
ACACCACAGC CATGTGTGAA CACTATATCC AGAGGAAAGC TCAGAACCAT TTTCGAAAGA 6060
AGTTGATGCC TCAACATCCC CCAAACCTCC TTGTGTGCAG GGTGTAGCCA GTTTAACAGA 6120
TTAGGAACAC ACAACATTAG GAAAGGCAAA GCTCTGTGAG GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 6180
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGC GCGTGTGTTT CAAGATAGTT TCTCTATGTA GCCCTAGCTG 6240
TCCTGGAACT GGCTTTGTAG AACAGGCTGG CTTCAATCTC AGAAATCTGC TGCTTCTGCT 6300
TCCTGAGTGC TGGAACTAAA GGCATGGATC ACAATCACCC TGCTTGTGAA TTTTTATGTG 6360
TACTTTAAAT TCTATAGAAT TTAAGATTTG AAACTTCTAG ATACTGAGTG TTTGTACTTA 6420
CCTCTTAGAC CCACCCAACG ATTTTGAACA AATTCTAAGA GAAATATCAG CAAATGAAAT 6480
TGTACAATTG TGATTCAAAA CAACACTAGA CACTGACAGC AAGGTTTCTC CCTTAGTTAC 6540
TTAATTTTGT GAATAATGCC ACTTTTAGTT TGTATGATCA GAATGTTACT TTTAATTCTA 6600
GGAAATAATT TCATGCCTCC CACAGGAAGT AAGTGGAATC AGAGAAATTT GGATACTAAT 6660
TATATATTAT AGAGTTGAGA TAAGCATCGC AAATTAGAAA AAAAATTAAT TTAGGAACAT 6720
ATAAAACAAT GTAGAAATGT ATCCCCTAAT TGTCTTCTAT TTCTTTTCTT TCTTTTCCCC 6780
CCTTACATTT GTTGTCAAAG TTTAGATGAG ATGTGTGCAG AAAATTGCCA CATGCTTTAT 6840
AGGATGAGAC CTAAAGGAAA TCAACAAGCA AACTAACTCC TTGGAGATAT TGGCAGTGTG 6900
GAGGCTCTCA CTTTTAGTTC CAGTAATCAA TAGGCAGAGA GAGGCTCCTT TAAGAGTTCT 6960
GGGCCAGCCA CGGCTACAAA GTATCTCAAA AAAAAAAAAA AACCAACAAA AACAAACAAA 7020
CAAAAAACCA AACCAACAAT AAACACACAA AAAAGAAACA AAAACCCAAA GACACACTTG 7080
TCGCATTGCT GGTAAAGTTC CCTTTTATTA GACATCCTTA TACCTCTAGT GGGGGCCTGG 7140
AAACTTTGTG TACTTCCAAC TAGATGAATG ATTTCCTAAA TCCCGGGCCG CGGGCCTTCT 7200
CTGATGTTCT CTGTTCCCTG TCCCCACCAG CACAAAAGTA AGGTCTCCTA AGGATCCGGA 7260
GACAGTTAAC CTTGCTCTCT GCTCCTCGCG CCTCACTTCG GCTGCCTTTT CGCGGGGGAA 7320
ACGGTAGCTT TTTAGGCGTC TCTCAAGAAA TTTCAGCTGA CATTTCACCA GCGAAGGAAC 7380
TAGAGTGGAT CCTTCCCTGT GAACCCATAA CTGGGGAAAT TCGGGTGATC TTCACAAGGG 7440
GCTATGCCAG TCGCTTGCTT GGGCCTCCGC AGCGCAGAGA GGTGGAGATC ACACTGTCCT 7500
CTGAACAAGT TTGGGTCCAG CTCTGTGGAG CACGGATGCT GGCCGGTGGG GCCGGGGCTG 7560
CAGGCGCGGC GGTGGGGTGG GGCAGACAGG AGAAGGGAGC AGCTGAGCCC TTTTTGGTTG 7620
AGTTTCTAAT CTTGAGGGAT GGGCCTTGCG CTGTCGCTCT AATTACATAT TGGAAGAGTG 7680
AGAGGGCTCC TGACTAACTG GGAGAAGGCA TTCCTCAAAA CAATCAGACT CCCCCCAAAC 7740
AACGAAAGAA AAACAACGGA ACCCAAAGAT CTTACACCTC TCGCCCTGAG GGGAGTTTGG 7800
GTTTTGCTTT CATCAGGCTG AACAAATTTC CGAGGAATCA AACTGACTTC AAACATTAGC 7860
AATTAGAAAG CAAGAATCCC TGGGCCTGCA GAACTTTTAA TCCTTAACCA TTTCCAAATG 7920
GGTAATTCTA GGGTCAGTAA ATATTGTAGC CAGTCTGTTA AGAAGAAAGA AAATCATACT 7980
GTTGGTTACC TTGCCTAAGG TAGACTCCTT TCAGAACTCT GCATTGCCCC CTGCGGACAG 8040
AGACTGTACT TTAGCTGTTC TTGGGGAGAC TGTGGACAGA CAAGTAGTGA CTCTCTTAAA 8100
AGGGAACCCA CTCAACTCTT CAGAGTAGGC TGGGGATTGA CTAGTGGAAA TCACCAAATT 8160
CAGCTGGAAG GCCTCTCTCT CTCAGTCTTA GCAGGTACAG GGAACTACTG CCTCAGGCCA 8220
CCCACTGTGC 8230