EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-07635 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr3:8985610-8989960 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 33             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr3:8989396-8989413TTGTATTAATTAATTCT-6.07
FOXA1MA0148.4chr3:8989173-8989189GCCTAAGTAAATAAAC+7.18
GabpaMA0062.2chr3:8987511-8987522CCGGAAGTGAC+6.14
GabpaMA0062.2chr3:8987530-8987541CCGGAAGTGAC+6.14
MITFMA0620.2chr3:8988303-8988321CAAGGTCACGTGAGCAGA+6.07
MITFMA0620.2chr3:8988303-8988321CAAGGTCACGTGAGCAGA-6.07
Myod1MA0499.1chr3:8986990-8987003AGGAACAGCTGCG-6.71
NR2C2MA0504.1chr3:8986069-8986084GCAGGGCAAAGGTCA+6.4
NR2F1MA0017.2chr3:8986075-8986088CAAAGGTCACAAG+6.29
Nr2f6MA0677.1chr3:8986070-8986084CAGGGCAAAGGTCA+6.45
POU2F1MA0785.1chr3:8989442-8989454AATTTGCATAAA-6.11
POU3F1MA0786.1chr3:8989441-8989453AAATTTGCATAA-6.62
POU3F2MA0787.1chr3:8989441-8989453AAATTTGCATAA-6.32
POU3F3MA0788.1chr3:8989441-8989454AAATTTGCATAAA-6.78
POU6F1MA0628.1chr3:8989400-8989410ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:8989400-8989410ATTAATTAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr3:8986217-8986237ACACACCACACCCCCCACAC+6.07
RREB1MA0073.1chr3:8986186-8986206CACCACACCACACACACACA+6.11
RREB1MA0073.1chr3:8986265-8986285CACCACACCACACACACACA+6.11
RxraMA0512.2chr3:8986070-8986084CAGGGCAAAGGTCA+6.09
SOX10MA0442.2chr3:8987200-8987211GTCTTTGTTTT-6.14
USF2MA0526.2chr3:8988303-8988319CAAGGTCACGTGAGCA+6.12
ZNF263MA0528.1chr3:8988163-8988184GGAGAAAGGGGAGAGAGAGAA+6.01
ZNF263MA0528.1chr3:8988209-8988230AAGGGAAGGAGGGGAAGGGGA+6.14
ZNF263MA0528.1chr3:8988136-8988157GAAGAAAGGGGAGAAAGGGGA+6.1
ZNF263MA0528.1chr3:8988210-8988231AGGGAAGGAGGGGAAGGGGAA+6.28
ZNF263MA0528.1chr3:8988142-8988163AGGGGAGAAAGGGGAGAAAGG+6.38
ZNF263MA0528.1chr3:8988151-8988172AGGGGAGAAAGGGGAGAAAGG+6.38
ZNF263MA0528.1chr3:8988160-8988181AGGGGAGAAAGGGGAGAGAGA+6.3
ZNF263MA0528.1chr3:8988145-8988166GGAGAAAGGGGAGAAAGGGGA+6.52
ZNF263MA0528.1chr3:8988154-8988175GGAGAAAGGGGAGAAAGGGGA+6.52
ZNF263MA0528.1chr3:8988213-8988234GAAGGAGGGGAAGGGGAAAGG+7.68
ZNF740MA0753.2chr3:8986222-8986235CCACACCCCCCAC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_07318chr3:8987498-8989299Intestine
mSE_07318chr3:8989431-8991146Intestine
mSE_10456chr3:8987662-8989294Embryonic_stem_cells
mSE_10456chr3:8989519-8991142Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
TGGGTCCTCC ATGCATGGGT CCTCTATGCA TGGGTCCTCT CTCTATGCAT GGGTCCTCTA 60
AGTTAGATGA TGCTGCAGAT GCCAGCAAGG GACAGGTAAA TGGTTGGCTG CTCCTGTAAC 120
ACATGGAAAG CTCTGGATGG GAGATTAACA TTCCCTAGTG GCTACTGAGT CGGGAAGGAT 180
TCCCCTCCTA ACTGACAACA GTTCAACTGG TCCTCCTGAT GTCTTCTGAA GAGCAAGCAC 240
ATGACAAATG GCTAACTGTA ACAGGAAGAA GGGCCAGCAA CCATGGCGAG GGGAGGCTGA 300
ACAGTACAGG CCTTGTTTAA GAACAGCTAT TTAGAATGTC TTTTGTTGTT CTGTTTGTTG 360
AAGCTTTGAA TTACAGGCAG CAGCAAGCAG CTGGCTCCCA GTCCCCGCTG CCAGTCCCAG 420
CTGCCGTCCT TGCACTTTCT GGAGCTGTGT TGTGGGGCCG CAGGGCAAAG GTCACAAGAG 480
CAGGAGACTT GAGGGAGAAG TAATGAGCCT TACAGAGGTA CCCGAAAATC CTGAGCAAGC 540
AGGTTCAGCA CAGCAGAGCC TAAGACCACA CACACACACC ACACCACACA CACACACACA 600
CACACACACA CACCACACCC CCCACACACA CACATCACAC ACACATACAC ACACACACCA 660
CACCACACAC ACACATCACA TACCACACAC ACACACACAC ACACACCACA CCACACACAC 720
ATCACACACA CAAGTACACA CACCACACCC CACACACACA TCACACACAC AAGTACACAC 780
ACACACCACA CACACAAATA CACACACACC ACATGCCACA CACACACACA CACACCCCAC 840
ATACCACACA CACACACACA ACAAAACACC ATACACACAC ACACAGTTTC CTCCATTAAC 900
TTCACAGCCA GAAATGGGAG AGGGGAAAAA AAAGAAATCA AACTTGGGCC CCTCCCACTG 960
CCTGCACCAC CATGCCAGGT TTATATGGTG CTAGGGATCG AACTTGGGTT CTCATGCATG 1020
CTAGCATCTG AGCTACATCC CCAGCCCTGA AGCATTTAAA AAGTGAAAAC CGAATTGATC 1080
TAGACCTCAG GGGTGCATGG CATTACCACC GACACCACAG GCAAGGACTT TAAAAGCTGG 1140
TTTCTAGAAC AACCTGGATA CCCTGCTTCA CTCTCTGATA AAGAACAAGC AAAGTTTCTC 1200
TCGAAAAAGA ACTCTGCAGA TTCCACTGGG AAAAAGCTAA AACCATTTTC ATGTCTGGCT 1260
TTGGCCATAT CAGTGGTTGG CGTTCAACCT TTTCTTCTCG TGGGTACGGG AGGCCATCGC 1320
CGCCCACTTG TACTCTGACA CAGCAAAGGA GCCCTGCTTG AAGCCACAGT CAAACTGTAG 1380
AGGAACAGCT GCGAGTCACT TTCCAAGCCT CGAGTCTTCA CTCTACAGAA ATATATATAA 1440
TTCTCTTACA GCCTAAGAGC AAACACAGAG CTCAACTCTC AACAACAGCA GTAGAAGGAT 1500
TATTCTTTGT CTCTACAGAC TAGATCTAAA ACTTAAGAAA AACAGTGCAA GTGATATTTT 1560
TTAAGGCATG ACAAAGAAAA ATTCCAGGAA GTCTTTGTTT TAGACCCAGC TATTGCATAA 1620
GGCCAGATCA AACAGAAATG GAGTCACTGG CCTTAAGTGC CATGCAGTCA AACTGAAAAA 1680
TTAAGGGGGC TGGGTGTCCA AACAGTGCCC ATTGGAATGT CTGTTCCATT TTGTTTTTGG 1740
GAAATCAAAG TCAATTAGAG TTATGTTTGC TGCTATTTTG TCTTCTGAAA GGTGCACACA 1800
CCAAATGATC TTTATATGAT TTATCCATCC TTACGGAGTT AACGGCAAGT AAAAAGCATG 1860
GCACCTAGCA TGATGTCAGA CGCCAGACAT GATGCCAGAC GCCGGAAGTG ACGGCAGACG 1920
CCGGAAGTGA CATCCTTGTA TCAGTACTTT GAGGTGATGC CAAGTCTCCA GGCAAGCAGC 1980
TTTCTGTATA AACAAGAACC CTGTGTCTCA GTTACTTCAA AGCAGAATGC TGCAACTCTG 2040
GGGTTTCTGG GGCACCTTCT GAAACATATC TGATTAGCAT TAATAGTTTA AAGAAGGAAA 2100
AAACAAAATC TTCCCTGTCA ACCTGACACA CACAAATCTG GACGTATCTG GGAAGTAGGA 2160
TTGTGAGTTG AGTTGTGGCT ATCAAACTTG CCTATAGTCA AGTCTGTGGG TCATTTTCTT 2220
AGTGACTGAT AGGGGAGATC TCCTAGGTAG GCGGGCTTGG GTGCATAGAG CATGCTGAGT 2280
GAGATGATAA ACATCACTCC TCCCCCAGTC TCTGCTTCAG TTCCTGCTTC CAGGTTCCTG 2340
CCTCGACTTT CCTCAGTGAT AAACGTGGAA ATGTAAGATA AAATAAACTG TCAGGTGTGG 2400
AGGACCACAT CTTTAATCCC AGCATTTAGG AGGCAGACAC AGAATGTCTG GGAATTCAAG 2460
AACCAGCCTG GTCTATAGAA TTCCAGGACA GCCAGGACTA TGTAGCGACC CTGTCTCGAG 2520
AAAAAGGAAG AAAGGGGAGA AAGGGGAGAA AGGGGAGAAA GGGGAGAGAG AGAAAGAGAG 2580
AGAGAGTGAG AGAGAGAGAA AGGGAAGGAG GGGAAGGGGA AAGGAAAACC TTTTGTTAGA 2640
GAAGCAGGGA AGAGAACAGC CTACCGAAGT TGGATGCACC CTAACATAAC TGACAAGGTC 2700
ACGTGAGCAG AAATAAGCCA CAGAAGCACC AAGGCAGGAA TACAAACCTT TTATGAAAAT 2760
AGCCGGGCTG GCAAGATGGC TTAGTGGTTA AGACTGCTCT TCCGAAGGTC CCGAGTTCAA 2820
ATCCCAGCAA CCACATGGTG GCTCACAACC ATCCGTAACG AAATCTGATG CCCTCTCCTG 2880
GAGTGTCTAA AGACAGCTAC AGTGTACTTA CATATAATAA ATAAATAAAT AAATCTTTAA 2940
AAAAAAAAGA AAGAAAGAAA ATAGCCTTCC TCAACACCAT TCTTCAAAAG AATGTTCATC 3000
ATACTGCAGA CCTCAGAGGA TGTCAGAGGG TGTCTTAGGA GACAAAAGGC AAGCACAAGC 3060
AGGTTCCAGG TTCCCTTTGA ACGCAGGAAA TCTGATCCTT GAAGGACGGC CAAACAAAGC 3120
ACCCAGTGTT TCAGGGAAAG GCCTGTGATT AAGAACTTGA ACATTGACCT GACAGGGTGT 3180
GTGCAGGAGA GGGAGAGAAA TGTAGTGAGT GGAGAAAATG ACTTTTATTA GCATGGTCTG 3240
AAGCTTCTGT TAGCACCTCT ACCCCTTGCT GTACACGTAC AGCCAACCCA AGAGTAGGAG 3300
AAGTGTTTAA GCATGCTGAG GTTTCAGTAA GACACTTAAG GCTGTGAGTT GAAGCAGGAA 3360
GGTCCCCCAC CAGCTTCGTT TTAAATGCCT GCTCCCAGTC TGTGACTCTA TTTTAAAGGG 3420
CTGTAGAAAC CTTAGAAGGT GACCTTGCTG GCAGAAGTAG GCCATCTGGT TCCTGCCTCA 3480
CTTCCTCCTC CTGATAGAGG AGCCTGCCTG CCCCTGTCCC TCGGCTCCCC TACAGGAAGG 3540
ATCAAAATGC TCTGAAACTG TGAGCCTAAG TAAATAAACA AACTTTCTTC ATGTAAGTTG 3600
ACTCTGCCAA GCATTTTGGC CACAGTGGCA GAAAAGTAAA CTGATATGCT TAATTAATTG 3660
ATAAAATATG AAATTTTTAA TTTTATTCAC TTATATATAA ACATAAGACT ATATTGTAAA 3720
TTACATATAA ATATATAAAT TTTATATATT GCATATAATA AAATACAATG TTATACATAA 3780
AATATATTGT ATTAATTAAT TCTAAAATTA ATATTCTTGA TTTATTTAAA TAAATTTGCA 3840
TAAATAAAGG TTTTAAAATA TGATTTCCTA TTAAATGCAT TATTGCTATG CTTTCCTATC 3900
TGTTTCTATA CAACAGATAC AGATAACTCA TGGTGAAAAC GGAAAAGAGG TGAAGAGTAA 3960
CTTCCTAGAA GCAAGCAGAT CAGGAGTTCA AGTCCAGCCA GAGCTATATA ATGAATCTGA 4020
GGCCAGATTT GACTCTATAA GACATCACCA CCTCCACCAC CACCGTAACC AGCACTAACA 4080
CACAAAAAAA TACATGAAAT GCAACTGCTT TGATTTTCTA ATGCCCACAA GGTCAGCCAT 4140
CCTAACATGG AAGGTGAAAA CTGCTCAATG GTAGAACCAG CAGCAAGTTT GCTGTCTCCC 4200
TAGGGAAAAT CCTTCCTCAG CAGCTGGAGA GACGCACAGA GCCTCCTCTG CACTGGCCCA 4260
TCCTTTTTGC CCTTTCCCCA CTCCTAGGCC TCAGAACTTC TCTCTCCAAA ACAGCACCAG 4320
CAAAATTTGC TCCACTGGTA ACATTAATAG 4350