EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-06663 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr2:30400700-30403270 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr2:30401030-30401042AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr2:30401034-30401046AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr2:30401038-30401050AAACAAACAAAC-6.32
Foxq1MA0040.1chr2:30402914-30402925TATTGTTTATT+6.62
NR2C2MA0504.1chr2:30401525-30401540ACAGGTCAGAGGTCA+7.58
Nr2f6MA0677.1chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.67
RFX1MA0509.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.43
RFX1MA0509.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.45
RFX2MA0600.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.38
RFX2MA0600.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.45
RFX3MA0798.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.35
RFX3MA0798.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.69
RFX4MA0799.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.65
RFX4MA0799.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.67
RXRBMA0855.1chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.38
RxraMA0512.2chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.27
Enhancer Sequence
CTCCTGCTTA TTAGTCCTCC TGGCCACGCC TAAGTCCAAC CCCCGCGCTG TAGGTTCCGC 60
CCCCCGCGGG CAGCGCTGGC CTCCCATTGG CCTCCGTTTC CATGGTTACA CGAGACCTGC 120
GGCGCTGCTG GCTTCCCGAC ACGTGTCCCA CGGAGCCGCC CGGAATTTGA CAGGGGACCA 180
TGTGCGCGGC AGCGCGGGAG CCAGACAAAG ACGGGGAGGC GGTGGGGGAC GAAGCCCGGT 240
GGAGAGACGA AGCCAGGCGG AGAGGCTGGG AGCCGCGCCT CCCGCCTGCT GGACACCTCG 300
CTTTCCTCAT TATTGCTTGA AGAGTGGATT AAACAAACAA ACAAACAAAC AAAAATTAAT 360
GGGAGAGAGG TGGGAAAGGA TCAGAACCAG CCCCACCTAC TGTCTCTTCT ACAGGAAAAA 420
CCCACAGGCG AACATCTTTT ATGACTGTGA ACGCGCAGGC TCCCTGCTTA CACCTCCTGG 480
CCCTGGGCAT CTCAGCCCAC CTTAACTTCA ACCAGTGAGG TTCAAATTCA GTTGATTTTG 540
CCTGGCTAGT TCTAGTAAGG AAAGCTTTTC TGGCGTGGTT GTTTCGATGC TTGAAATAAA 600
TGAGATCCAA GCAATTGTGG GGAACCTCTC TGGCCCAAGC ATCCTCTGCC TCTCTTACTG 660
CCTTCAGGCA ACCTCTCCCA TGAGGCCCTC CTGGGCTCTG GCCCCAGCGC TGTGGGGCAC 720
GGACTTTGTC CTCTCGCACC CCCATTTCTC CTCTTGCAGC CCTTTGTGAT GGCTACCATA 780
ACAAATCACT CCAGATTTAG TGTCATAAAA CAACAGCGGA GTTCTACAGG TCAGAGGTCA 840
AATCTGGATG AATTCAAGGT GTGCAGCAAC ATTGGGTTCC TTCTGCAGAT TCTCGTGTGT 900
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTGC ACTGGGTTCC 960
TTCTGCAATC TCTATGTCTC TGTCTCTGCT TCTCTCTCTT GTGTGTATGT GTTTGTGTGT 1020
GTATGTGTGT GTGTTAGCAC TGGGTTCCTT CTGTAGTCTC TATTTCTGTC TCTGCTTCTC 1080
TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC ACACACACAT ACACACACGA GAAAGAGAGA GAGAGAGAGA 1140
GAGAGAGAGA GAGAGAGGAC TGGGTTCCTT TTGCAGGCTC TCTCTTGTGC ATGCATGTGT 1200
GTGTGTGTGT GTGTGTTAGC ACTGTGTTCT TTCTGCAGTC ACTCTGTCTG TTTCTCCCTC 1260
TCTCTCGTGT GTGTCTGTGT GTGTGTGTTA GCAGTGGGTT CTTTCTGCAG TCTCTGTTTC 1320
TGTCTCTTCC ACCCCCCCAC CTATCTCCCC CCCCCTCTCT CTCTCTCTTT CTCTCGTGTG 1380
TGTGTCTGTG TGTGTCTCTG TGTGTGTATG TGTGTGTGTG TTAGCAGTGG GTTCTTTCTG 1440
CAGTCTCTTT CTGTTTCTGT CCCCCCCCCT TGTATGTGTG TGTTAGCAGT GGGTTCTTTC 1500
TGCAGTCTCT TTCTATTTCT GTTCCCCCCC CCCCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 1560
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT AAGGGTCAGC CTCCTTACCT TTCTCCAAGC AGAGAGCCCA 1620
CCCCCTGACT ACCTTCCTGA TCTTTGGCCC TGCTTGCTCT TCAGTTACCT GCTTTCCCAT 1680
CTCAGAGTCC CTCAGTCACT CGGATGAACT AGAAGAAACC CCCGGCTCAA AGGCTGGTGA 1740
GCTGCCTCTG TTCCTCTCTG CTGTGAAACA AGCCATCTGT GTGCCCCAGG GGTTACGCTT 1800
GGGACATTGT TCTGCTAACC AGTTCACCTC TCCAGCTCCC CCCACCCACT TAGAAGCCTC 1860
TTTCTCTTCC AAGTCTTTCT CCCACGATGC CTGCCTGAGG TGGTGCCTGC ACACTTCAGG 1920
TCTCCTCTGA CCATAGGCCA GCACTCTAAA GTATTCCTGC AGCCTCTTCT ACCTACAAGG 1980
AAAGCCAAAA TGGCGCTGGG CCACACACAA ACCCTGATCT GCCCACCCGC TGGTCTCCCC 2040
CAGACCCTTC CCTCTCCTAC CCTTTCCCTT TGCGTCCTGT TTCCTGTATA TTCCACGGTG 2100
TTTGTCACCT CCTGGCCTTT GCCCGGTGGT TCCACTCTGG ATCTTTCTGT CTGTCCGCCT 2160
TCATTCATGT CCCCAGGAAG CTTGACTGAC CCTTCCCAAG CACCTGAATG TACTTATTGT 2220
TTATTAGTCT GGCAGAGCAC AGAGGCCTTG CCTGTCCCCT CTTGTCCCTC ACAGTCTTGT 2280
GTCTTGTTTG GCCACAGAGC TAGCCATGAG CTGGTCCCAG AGTCATGGTG AACCCTGTGA 2340
ATTTCTACTG AAGCTCAAGG ACTTGGTCTA GGGATGCTGA CGAGACCCAC GGCCAGGACA 2400
CACAAGATGC CAGAATGACA GCCGTGACGT GACATCGCTA GCAGCCGCTG ACACCGGAAG 2460
CTGTTGACAC GGGATGCCGC TGGCACCGGA AGCTGCTTGG TAGCATCTCC AAGCTTGCTT 2520
TACATAAGCT CTCAGAATGG CTGGGGAATC CAGCTCTCAC CTGCTCCCCA 2570