EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-06586 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr2:26348200-26352150 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESR2MA0258.2chr2:26350458-26350473GGGTCAGGCTGGCCT+6.11
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:26348959-26348977GGAAGGAAGGAAGGAAAG+10.53
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:26349965-26349983CCTTGCTTCCTCCCCTTC-6.25
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:26348955-26348973AGGAGGAAGGAAGGAAGG+7.85
Gfi1bMA0483.1chr2:26351420-26351431AAATCACAGCA+6.62
HNF4GMA0484.1chr2:26349647-26349662TGACCTTTGGCCTCC-6.55
Nr2f6MA0677.1chr2:26349647-26349661TGACCTTTGGCCTC-6.76
RXRBMA0855.1chr2:26349647-26349661TGACCTTTGGCCTC-6.21
RXRGMA0856.1chr2:26349647-26349661TGACCTTTGGCCTC-6.09
RxraMA0512.2chr2:26349647-26349661TGACCTTTGGCCTC-6.36
ZEB1MA0103.3chr2:26348771-26348782CCCACCTGCCC+6.14
ZNF263MA0528.1chr2:26348956-26348977GGAGGAAGGAAGGAAGGAAAG+6.92
ZNF263MA0528.1chr2:26350767-26350788GGGGGAGGGGCGGGCAGGAGG+6
ZNF263MA0528.1chr2:26348953-26348974AGAGGAGGAAGGAAGGAAGGA+7.47
Number of super-enhancer constituents: 12             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02936chr2:26327248-26413177TACs
mSE_03482chr2:26347859-26349709Bone_Marrow
mSE_04418chr2:26347880-26349978E14.5_Brain
mSE_04992chr2:26347679-26350908E14.5_Heart
mSE_04992chr2:26351345-26353427E14.5_Heart
mSE_05919chr2:26348342-26350928E14.5_Limb
mSE_06676chr2:26347419-26356296Heart
mSE_07765chr2:26348080-26350926Intestine
mSE_08188chr2:26347799-26350605Kidney
mSE_08507chr2:26347515-26350723Liver
mSE_08970chr2:26347610-26356343Lung
mSE_11123chr2:26348553-26350209Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GGACCCAGGG TGTCCCAGGC CAGTGGGTCT AGGACAAGCT CAAAGCTTGC AGGTCCTGGC 60
CCCTCTGCCC CGTGGACACT GATGTCCCAC GCTTGGCCTC TTTTCAAGTA TCACTTCACT 120
GGCATCCTGG TGCCCTCTCC AGTCCTTAGC TGAGACTGAG CACAATGAAA AGGACACGCC 180
CCATCAGGTC TGAGCTGCCC AAGTCAGTCG GGCACCTTCT GCAGCCTCAT GGTAACACAC 240
ATGGCTCTCA AAGTGAGACC CCCCCCCCCA AAGACAAATG AAGCCCATAT ACCAGCAGTA 300
AGGCCAGCCA GCACCTTTAG CTACAGTGGC CCCATGGGAT CCTCCATTCA CCCCAAGGAT 360
ATGGGTCCTG TCGTAGGAAG AGGAAGTGTG AGACTAGTTG CAGCCCCAGC TCTGGAGGAA 420
GGAAGTATCC TTTATCTGAG CTTTGACTAG GCACAGCCTA CTGGAACAGG GGGTTAGAGG 480
GGAAACAAGC CTGGCTCAGA GGCCAGGCAT GAGTATACTG TGAGGAAGGG GGATCCTGCC 540
TTCACTGTGG CTTCTTAGAA ACCTGGGGCT ACCCACCTGC CCCCACACCT GTTCCAGTCC 600
ATCTCACCAG ACCAGTAGGC CAGACTCTGA GCCATGAAGT TAGGATGCAG TCACGGCCTG 660
ACCTGTCACA ACACTGTTCC ACAAATCAGT GCCCCACCTG GTTTCCACTA TCGGGCCCTG 720
AGACAGAGCT GAGGTCATCC TCGTCTGACC CTCAGAGGAG GAAGGAAGGA AGGAAAGCCC 780
CACCTCGAAG GATCAACCTC TAGAAGCCAT GAGCAAGCAG AGCCGAGAAG AACCAGAGGG 840
CCAGGCACAA AGGCAGCATC TGCCCCTACG CCAGCCACCA GGCACATACA CTGGAAGCCC 900
CATTCCCCCC AACCCCCCAA CCTCTCATTT CCAGTAACTG TGCTGTTTCC GCTCACTCAG 960
AACTGAAACA GAGAGGAAAT GGTGGGAGGC GGAGCTGCTG CCACTCAGAC CTGAGCAATC 1020
TTTCCAGCCT TTACCACCCA CATTCCTCCC CATGCAGAGC AATAGCCCTG GGAGCCTGGA 1080
GAGAGCAAGT CAGATCCCAG TGTGAGCTGC TTCCTCCCCG GGTCTCTCTG GGATCTGGTC 1140
TACAGTAGGG GATGCTGTGC ACCAAGAACT CCATCTGCAA ATCTACTTTT AAAGTAAGGA 1200
CACTGGCACA CTGGCTCCGC TGGTAAAATG ACTGCTGAGC AAGCTAGAGG ACCTAGAGTC 1260
AGTCCTCAGC ACCCACGTGA GCCAGGAATG GCAGCACACA CATTTGTCAT CGTAGTGCCG 1320
GAGGTGGACA TAGGAGGACC CTTGGAACTC GCTAGCCAGC CACTCTAGCT GAAGCAGTGA 1380
GTGCCAGGTT CTGTGAGCCA CCCTGTTATA AAATATAAGA TGGGGTGCAA AAGAAGACAC 1440
CCAGTGTTGA CCTTTGGCCT CCACACACAC CCCAGTATAC AAGTATACAG ACATGAACAC 1500
ACCTACACAA ACACACACAA AATATTGACT CAATAGGCAA AGTAGCTGCT GTGTAAGTAC 1560
AAGGACCTGA GTTCAAACCT CTGGAAGGAA CCCAGGTAAA ACTCTGACAT GTTGGCATGT 1620
AGCCCAGCCT TCCAGAAGAG AAGACAGGAG AAGGATCTCT GAAGCCCAAT GGCTGGCTGG 1680
CTAGCTGAAT TGGCAGCTTG AGGGTCAGTG AGAGACTCTA CCACAAAAGA TGAAGGTGGA 1740
GCATGTGGAG GAAAGCCACT GTCAACCTTG CTTCCTCCCC TTCCCACGCA CCTTCCATGC 1800
ATGTACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACTTCTAGGC 1860
CGTGGGAAAA CCTGCTTCAG GGAGCAGGCT GCCGCCCAGC TTTCTTCCTG AACTTGATTA 1920
AACACAGATG TTTCTCTAGG AAAGTCAGTG GCTTCCATGC AGCCTGCGGC TCCCCGGCCT 1980
CCCTGTGGCT GTGGCTGGGC TGTGATTCAT ACGGGGTGAC CCACATGTGG TGTTAAGGCA 2040
ACAGGGTGAC CCAGAGCCAA GCTATGGCCT CGGTGCCTGG GTATCATCTT AAGAGAAGGA 2100
CAGTCCTTTG TCCTCCAGCT CAGGTCTAAG AACTCTCAAG AAGTGGGTAG ACATAGCCAC 2160
TTTTCAAAAT CCTCAACTGA CGGCACAGAG CAAATTGCTC ACACAAGACT GACAGTCCAT 2220
GTGGCAGGAC CTGCCTCCCC AGGCCTGTGC TGGAGCTTGG GTCAGGCTGG CCTCTGGCAC 2280
TACCTGTGGG AGAATTTGTT CAGCAAATTA GCAGCATCAA CAGATGACAG GGGGCTCGTT 2340
TACCTAGTTC AGAATGGTAG GTCTCCAAGC ATGTCAGTTG CATAGGGACA CCAAGCCAGG 2400
TGATAGGATA AACCAACACA AGCCCAATGA CAACTCCTCT TATCTGCCTG TTAGAGCAAG 2460
GCTGGAACCA GCATTTGGCC GTATTCCATA ACTGGAGACA GTCATTCCTC CCCGTGCCTC 2520
AGCATTGGAC ATAACTCACC AGGTGAGTAC CAATCAAAGA AACTAAAGGG GGAGGGGCGG 2580
GCAGGAGGAG GAGAATTAGT CTGGCTAATT CACTCTGGAG TGTAAATGAC AGGAGCACAG 2640
GGTAAAGTTG GGAGGCCTTC TACCCAGAGC ACTTCAGTCC AGGGTAGTGC ACAGTCTACG 2700
GACTGGAAAG ATGACTCAGT GGTTAAGAGC TCTTCCAGAG GACCCAGGTT CAATTCCCAG 2760
CACCCACATG GCGGTTCACC ACTGTCTGTA ACTCCAGCTC CAGAAAACCC AACACCCTCA 2820
CACAGACACA CACATGCAGA CAACATCGAT CCTCACAAAA CGAAAAAGAG AGCAATAATC 2880
AAGGAAATAA AAGGCCTGGG CTAGAGGTGA GGTCCCTGGA AAAGGGGCTA GCCCTAGAAT 2940
CTTGTAGATC TCAGGAACAC TGAGAAAGCA GCCCCTTCAG ACCAAGTCCA TCCAGCCATC 3000
CCTACCTCTT CCGCTAGGGA CACCTGTGCT GGCTAGGGAG ACAGTTCTGC AAGAGACAGT 3060
ACATCCCTCT GAGCATCAGA GGCAACTGAA GGATACTCTA TACCTCTAAG GTAAGGGCTG 3120
GGTTCTCTCA TCTCCCAGAG CTTGGTGCCC CTCCCAAAGA ACAGCCTGTG GCTATTCATA 3180
GACTGGCACA CCTGTTCAAA TCTCCTAGTC TGTGGCGGGA AAATCACAGC ACAAGCCTAT 3240
GGAAGACAGG GCCAAAGCTT CCCTCCCTAC TGCCCCTATC CATTGCTCCT GCTGGCTAAG 3300
GCTCCCTGCC TGTCCTCATC CAGGCTGCTG TAGATGCCAC CCTGTAGTGG GCCTCATGCC 3360
AAGCTGTGGA AGGCCCAGGG CACTCAGACA CACGGTTCCT CAAGCTTCAC TCTGTGGAGA 3420
CTAAGGCTGA CTCCCATCTT CCCTAGTTTC CCATCTCCTC ATAGCTGGGT GCCTAGGTGG 3480
GTTGGCTGCC TTGCCTGCCC TAGATCCTAG GCTTCAAAGC ATACGAAGCT CTCAGCAAAA 3540
ATCCTCTGCT TCCATTGTCC TGTACCGGGC ACAAAGACTC CACTAGCTCT TCCTTCAGGT 3600
TGTAAAAGGC CAAGAGGCAA GATGGCCGTT GGAAGGCAAG ACAAGGATAG CTGGCTATGA 3660
GTCTGCCATG GGCACTGAGC ACTGTAAAGG CCTTGGGCAC ATTATCAGTG ACCAACAGGA 3720
GAGCACATCA GGTCCCAATT AAGGAGCATT CTCAGGGGGC AGCACGAGAC CAGAGATGTA 3780
CATTCTGGCC ACTTGGTGCT GTTGTCAGGA CTCAGAACAG GGCTCATCCT GAAGGCGCCA 3840
CAAGTTGGAA ATGATCCTAA CAGGAGTGCA GAGCTGGCAC CCACAGTGGC ACTGCGAGAC 3900
CCTGACATCA TCCGTGCTCA GAAAGCAGCA CTCAATGGCC ACAGACTGGG 3950