EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-06511 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr2:13292810-13294690 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CUX1MA0754.1chr2:13293495-13293505TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr2:13293495-13293505TTATCGATTA-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:13292913-13292931GGGAGAGAGGAAGGAAGC+6.35
Foxd3MA0041.1chr2:13293298-13293310AAACAAACATTT-6.27
ZNF263MA0528.1chr2:13293819-13293840TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293822-13293843TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293825-13293846TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293828-13293849TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293831-13293852TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293834-13293855TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293837-13293858TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293840-13293861TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293843-13293864TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293846-13293867TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293849-13293870TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293852-13293873TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293855-13293876TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293858-13293879TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293861-13293882TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293864-13293885TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293867-13293888TCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-12.34
ZNF263MA0528.1chr2:13293400-13293421AAAGGAGGGGAGAAGGAAGGA+6.37
ZNF263MA0528.1chr2:13293813-13293834CTTGCCTCCTCCTCCTCCTCC-6.37
ZNF263MA0528.1chr2:13293870-13293891TCCTCCTCCTCCTCCTCCTGC-7.07
ZNF263MA0528.1chr2:13294048-13294069CTTCCTTCTCCCCCCTCCCCC-7.37
ZNF263MA0528.1chr2:13293816-13293837GCCTCCTCCTCCTCCTCCTCC-9.74
ZNF263MA0528.1chr2:13293873-13293894TCCTCCTCCTCCTCCTGCTCC-9.83
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05165chr2:13292057-13295243E14.5_Heart
mSE_06916chr2:13292108-13293836Heart
mSE_06916chr2:13294064-13294669Heart
mSE_09135chr2:13292753-13294656Lung
mSE_09631chr2:13291660-13295424MEF
Enhancer Sequence
ACAAAGAAGG GAGGCTCTCG GGATATGGTC CATGCTGTTA GAGTCATAGA TGTAATCAGG 60
GAAGGATACA GAAACCTGAC TCCTTGCAAT GGCTTTTTTT GAGGGGAGAG AGGAAGGAAG 120
CTGGGCTTCC GCATTAATGA TATTTCCCAG TACGCTGGTC TGAAATGGAA AACCAAGTTA 180
AATTGACAAA CTTCCATCTC AGTTCAGGAC TCCTACTTTT AAGCTGTTAT TGTACACTAT 240
GCCATTCGGC CTTCACATTT TTCAAAAGAC TAGGAGATGT GACCAGGCCT AGGAGCAGGG 300
CCGTAAAGAT CCCTCAAGAA GGAAACGTTT AAAAAGACGG AGCCAACATG AACATCAAAC 360
ATGATAAATA CCCTGGCCCA TGAGCTGTGG CTTCAGCTCA GTTCCTTGCT TTGCTTTGGC 420
ATAGCTACCG GAGATTCATT TGACATAGGC ATGGGAATGG CTAAGCAGAT TATCACAAGT 480
GAATCACAAA ACAAACATTT CAAAGCCCTT GCTCAAGCAA CCTAAAACGT CTGATGGGGA 540
TCAAGAAAGA AGGGAAGAAG GGAGAGAAAA GGAGAATGGG GAGGACCTAA AAAGGAGGGG 600
AGAAGGAAGG AGGGTGACTG TCCTGAACTC ATTGTAAAAC AGTAAATATT TAAAGAAGGC 660
TGTTTCCCTT TCTCTGAAAC TCTAGTTATC GATTACTCCT GACTCCCTTC AGTCCCCTCT 720
GGGAAGTGAC TGTGTTTTAA ATGCAAGCAT ATCATGGGCT GCATCGAAGG GGGGTTGGGG 780
GGAGACAAAT TATGGACCCT GCCTTAGGCG CCTGTCCTGT TGAGCTCTGG GTGTTGTGGG 840
CAGATAATGT GAGAACAACA GGCTCTGGTG CCTCAGAGTG AGGCTTGTGG GTCTGGATTG 900
TTTCAGTTCA GATCAGACAC TTGGCTTCCT TTCTTTTTCC CTTAGACAGT CACCAAAAGC 960
TTCAGGAAAA ACAAACAACC AAAACCGAAC CAGTTAGGGG CTGCTTGCCT CCTCCTCCTC 1020
CTCCTCCTCC TCCTCCTCCT CCTCCTCCTC CTCCTCCTCC TCCTCCTCCT CCTCCTCCTG 1080
CTCCAGCTGT TTGCCTGAGT GCATTTCTCC TTGCAAATAA TAGGCAGGAT GGCCTGTGCT 1140
CTGCTTGCTT TTTTATCTGC ACTGATTCAC ACAAGGCAGA CATTCCATTG CACTGAGCAC 1200
AGAGGCTGCT GGAAACAGAG GTCAGCCTCT CAGCAGCCCT TCCTTCTCCC CCCTCCCCCA 1260
CCGCAGTCTG TCCCTCCCCC TCCTTCTCAC ACAGAGTGCA GCCGTTTTCT CCCAGATCAA 1320
TAAGAACTTA CAGACCCATA GTACCTAAGG CTCAGAAGAG AAATTCTAAC GAAGCAATTA 1380
AACTGGCGGT TGGAGGTCAC TTTAACACTT ACCCTTCAGG AAAGAAAACA TAATGGAGTC 1440
ACTTTTCCCT GATGACTACA CAGAGCCACC CCCCAGCCAG CAAATGCTGT CTAGCATTAA 1500
ACACTCATGA CTTATCATCC CCAAAGTCAG AGGAGAGCTA ACACCAGGCT GGAAAGCAGG 1560
CAAGCAGGAA TCACGGACAT TTTACCAAAT TATATGAAGC CCAGTACAAG TCAGCTGTGT 1620
GTGGGAGCCT CAACATTTTA ATAGAAGTGT TGAAAGAAAT CAGTTTCCCT CCCTTTTCAT 1680
TATAGCAGAA TGAAATTCTA GACAACACAT CTGTACCATG TTTTCTAAGT CCTCATGCAA 1740
CTCAAAATAA TGAGGTCCTA TGTCAATGAC AGTGTCCTCT GCAAATCTTA AAATGCACGG 1800
ATCCCAGCAG GAGTACAGAT GGCAAGGACT CATTCACTCA TATAATTACG GTGTGTCTAT 1860
TAGGAGGAAT CCATGCATCA 1880