EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-06430 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr19:47402190-47406280 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR4MA0733.1chr19:47402569-47402585AAGTGGGTGGGCGGGG-6.67
Foxd3MA0041.1chr19:47404127-47404139GTTTGTTTGTTT+6.32
Klf1MA0493.1chr19:47402631-47402642TGGGTGTGGCC-6.62
RELMA0101.1chr19:47405367-47405377GGAAATCCCC-6.02
SP1MA0079.4chr19:47402574-47402589GGTGGGCGGGGCTAA-6.86
SP2MA0516.2chr19:47402573-47402590GGGTGGGCGGGGCTAAG-7.82
SP4MA0685.1chr19:47402572-47402589TGGGTGGGCGGGGCTAA-6.74
ZNF143MA0088.2chr19:47403767-47403783TTCCCATAATGCACCC+6.73
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02644chr19:47385209-47410291HFSCs
mSE_03225chr19:47388246-47417935TACs
mSE_05430chr19:47404573-47406093E14.5_Heart
mSE_05639chr19:47404501-47406122E14.5_Limb
mSE_09667chr19:47404603-47406705MEF
mSE_10627chr19:47401747-47404235Embryonic_stem_cells
mSE_10627chr19:47404296-47406572Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
ACATTTTGCC TGCAGCTACA AAGGTCTTCT TCCCCCAGAG TCTTGCCTTT CCCAGAATCC 60
AGGGTACACA TGGGACAGCC CAACCTAAGG CAGGAATGTA CTGAACCCTG TAGCCTGAGC 120
GGCTGAAAGA AAAACAGGCG GATTGTCTGC TCAGGTGGGG AGATGGGGGA ATCCACAGCT 180
TTTAAAGGAC CAAGAAAAGG ATGCCTTCCC AAGCCAGGGC TTGGACCAGG ACAGTTCAGC 240
CTAGGGGATT CAAGGAAAGC AACCATCGGG ACCACTCAGC TGTCCCGGGA AAGGGAGGGG 300
CCTCAGCACA CCAGAAGCGT TTAAAGACAG GTGGCCACAT TGGGAGATGT GTGGGCAGAC 360
AGAGGAGCAC TTAGTGGGGA AGTGGGTGGG CGGGGCTAAG CATCTGCTCC CAGCAGCTGC 420
AGCTTGACCC CCACAGCCCC TTGGGTGTGG CCTCCCCCTC AGCTCTCAAG TCCTCACCTT 480
TCCTGGAGCT CGGTTGTTTG TGTGCAGCAG AGAAGAAATA AACTCAAGGC TGAGAATCCC 540
AGCATCCCAG CCCCTCCCTC CACCGGGTGG TCTGCCTTGG TGGTCCACCC CACTCACTGA 600
GAGGTCTCCC TGAGGCTATC TACCCACATC TCTGAGCAGT CCCCACCTAG GGCACTGTGT 660
GTGCTCACAC ACAGAGAGAA GCAGCCATCC CTGAGCAGCC CCCACCTAGG GCATTGTGTG 720
TGCTCACACA CAGAGAGAAG CAGCCATCCC TGAGCAGCCC TCACCTAGGG CATTGTGTGT 780
GCTCACACAC ACACAGAAGC AGCCATCTCT GAGCAGCCCC CACCTAGGGC ACTGTGTGTG 840
CTCACACACA GAGAGAAGCA GCCATCCCTG AGCAGCCCTC ACCTAGGGCA TTGTGTGTGC 900
TCACACACAC AGAGGCAGCA CAGAAACAGG CCAGTGACTT CAATAAATCA GTCATCCAGC 960
CACTGCAGGC CTATAGTCCT GGATCCACCC ACCCCTTGGC TACTCCTTCA GAAGCCAAAA 1020
GGGAGGAGGG AAGGGCTGTA GGGAGGAGTC AAGGGCAGCA TGCTCACTCA GGACGGACGT 1080
TCCCATCCAG GACAATCCAG AGTAGAACAT CCCGTCTCTC ACTCAGGACT CTGGCTATCA 1140
GATCATCAAA GAATCAACGG CCAGCTATTT AGTGAGCACG GTCCACATGC ACTGCCGGGG 1200
CCCTTCTGCT GATCCAGCTC CACTGGGTAT CCTCAGCACA GGAGGACACA CACACACACA 1260
GTATGTCCAC AGGAGGACAC ACACACAGTA TGTATACCCC ACTGAGTGAT ACTGTCTGCC 1320
CTGGAAGCCC CCGGCTTGAG GCAGTCTGGC ACCCTTGGCT ACCTCCCTGA TTCCGTCCAG 1380
GCCACCTCTA CAGGGTGTCC TTCTTCTACT CTCAGGCTCA CTGAGGTAGC CTGGGAGAGG 1440
TCAGTCAGGG AGTTCCCCAA AGACCTTACG GTAACAGGGC TCACAGGCTG CAGGGGCCAG 1500
GTAAGGGCTC TTCTCTGCAC TGAAATTGGG GATACCCATT TCTTAACCCA ATATTTTTTA 1560
ATTGCTTATT TGGAAATTTC CCATAATGCA CCCCAATCAC ATGATCACAC TCATTTCCTA 1620
CTCCTCCCAG GTCCATCCCC TCCACTCTTG TGACCTCCCC AAAACAAAAG AAGAAGAAAA 1680
AGTACACTGA GTACTACCCA TATTCTTGCA GGAGCATGGT CAAACTCCCA GTGGCCAGCC 1740
CCTTAAAGAA AACTGGGTTC CTCCTACCCC TGCCAGAAGG TCCCAACTGT GAAGAGCTAC 1800
ATTTCAGCAC CCCACACAAT TTTTAAGACT TCTCTTCAAT GGCTTCCTGT CTAGACCTTT 1860
TTTTTTTTTG GGTGGAGGGA GAAGGGTTGT CACAAAAACC TTTGGTGGAG GACTAGCAGC 1920
AGAATATCCA TTTTTTTGTT TGTTTGTTTT GTTTTGTTTT TTTGTTTTTT GAGACAGGGT 1980
TTCTCTGTGT AGCCCTGGCT GTCCTGGAAC TCACTTTGTA GACCAGGCTG GCCTCAAACT 2040
CAGAAATCCG CCTGCCTCTG CCTCCCGAGT GCTGGGATTA AAGGCGTGCG CCACCACGCC 2100
CGGCTTGCAT TTTTTAAAGG TTGGTCTATC TCACCTACCT TTGCCCTGTA CTGTTCACTG 2160
TTTTAACCAC CTCCAGAACA CCCGCTAGGA TTATAATCTT AGCAAATATT TGGCACATAA 2220
TAGATGTTGA ATAAAAACAT GCTAAGCTAG GCTAGATACA TATCCTAGTG TTAGAACACT 2280
TGTCTAGAAT GTATAAAGGC CCTGGGTTCC AATCTTAGCA TACACACTCA AAGTGTTGTG 2340
TGTCTCCAGT TAGTCTTGAA TTTCCTTTTG TCTTAACCCT GACTACGATT CTATCACACT 2400
GGAAACACTC AAGTGTCCAG TTTAACCTCA GTGGATGAAA GGGGCAGGAG CCTTCTTTGG 2460
TCTTCACTCC ATTGGTTTCA AGGGAACCAA GGCTCATTTG ATGCCTGTGG CCCTAATCTT 2520
AATCTAGCCT AGGGATTATC AACTTGTGGG TTGAGACCCC TTTGGGGGTG TGTGTCACAT 2580
ATCAGAAGTT TATATTACAG TTCATAACAG TAAACAGTAG AAAAATTGCA GCTATGAAGT 2640
AGCAATGAAA ATAATTTTAT GGCTGGGGGG GGGGTCACCA CATCATGAGG AACTAAAGGG 2700
TCACAGCATA AGGAAGGTTG AGACCGCTGA TCTAATCCAA AATTGCCCTC CTGAGCCACG 2760
TGCAGGCCTT CTGAGGCTGA GGAAAGTCCT TCACCTTCCT GGGCACCAAA GTACAAAGAC 2820
GGACCCTCAG GCCCAGCAGA AAATCCCAGA AGACTGCATG GCAAAGCCTT CCAAGGGCTC 2880
AAAACAACAG CAACAACAAT AACAACAAAG CACCCATAAG CAATATAGCT TTGTGGCATG 2940
GTGGATGTTA CAGGAGACAG TAGTCTATGA AGGTGCAAAG TGCTCTTGTA CAGAGACTGG 3000
TGGGATCCAG GCCCAGTCAA TCCCCTCCTC CACAGTGTCT GCTAGAGGCC CTGGGCCTCT 3060
CCTGACTTGG CCCACCCCTG ATCTGCAAGT GTTTAGACAG GTCCCCTGAG CTCACAGACT 3120
GCCACGTAAA CGGTTGTGCA TGCATGCACT TAAGACGCAT GCACACATCA CGGCTGGGGA 3180
AATCCCCACA GCTGGCTCTC TCACGTGACA AAGCTTTATC CAGAAAGCAG CAGCCTAGTT 3240
GCCTGCAGGA CAGGGGTGGG GTGGGGCTCG AGTTAACCCT TCCATACCAC AGCGCAGGCT 3300
GAACTTCCCA CAGGGAGAAT GGAGTGAAGT CCAGGTCTCC GGGATTCTCT CTCAGGCACT 3360
GTGATCCTCG CTCACTGGGG ACAGACTACT TCTCAGGGCC CCGCCCAGGC TTCCCTGTGC 3420
TAGCACAAGG CTGTTCTCTA TCCTGTTAGT GTGCTCCCTC ATCAACTCTG AGAAGTTCTG 3480
CTTCCTGGAG CCTCATCCCC AGAGGGGGGT CACAGGCACA GCCCTAGGGA GCATGTCCCG 3540
ATGCCAGATG CCTAGGTGGG GTCCTACAGC CAGGAATTCA GCCAGAATTC TTGCCCTCCT 3600
TCCATGGGTG TGAACAAATG CCTCTGAGAA ACTGCTCCAG GGCCCTCCCG GGTCCTCCTC 3660
TAACAAGAAG GCTGGAGGAG GCCCCTGGAA CACGTTTTCT CCTGTTCAGA CACACTGTAT 3720
CTATTAGCCG GTGTGATCTG TATCATGTCT CTCACACAGT ACTCCCAGAT ATGGAGAAGC 3780
CAGATGCCCA GTTTACTTTC TATGTTTCCT TACTGAGATA CCATGTAGCC CAGGCTGGCC 3840
TCAAACTCAT GACCCAGGCA TCCCAGTCCC CCAGATGATA GGATTTTTTT TTAATAGCCC 3900
CACCCCTGAA GCCTAGAAAC ACTATCTCAG TGTAGTCCAG ACTAGCCTGA AACTCCCTAA 3960
GTAGCCGAGC ATGACCCAAA CTCCTGATCC TCAAATGCTC AAACTCATGG CCAGTGTGTT 4020
GACAAGTTTT TATATCAACT TGACATGAGC TGGGGTCATC TGGGAAAGAG TCTTAATCGA 4080
GAAAATATTT 4090