EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-05827 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr18:37993420-37997000 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr18:37995416-37995429CTTAAATAAACAT+6.14
Myod1MA0499.1chr18:37996200-37996213GGCAGCTGTTCCC+6.24
Nr5a2MA0505.1chr18:37993866-37993881GCTGTCCTTGAACTC-7.06
PHOX2AMA0713.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA-6.62
PRDM1MA0508.2chr18:37995316-37995326TCACTTTCAC+6.02
PROP1MA0715.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA-6.62
STAT3MA0144.2chr18:37995156-37995167CTTCCCAGAAG-6.14
TBR1MA0802.1chr18:37995320-37995330TTTCACACCT-6.02
TBX20MA0689.1chr18:37995320-37995331TTTCACACCTA-6.14
TBX2MA0688.1chr18:37995320-37995331TTTCACACCTA-6.32
ZNF740MA0753.2chr18:37995996-37996009CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr18:37995997-37996010CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04059chr18:37994789-37996075Cortex
mSE_04454chr18:37994825-37996113E14.5_Brain
mSE_04922chr18:37994544-37996145E14.5_Heart
mSE_05544chr18:37994499-37996840E14.5_Limb
mSE_09499chr18:37994107-37997052MEF
mSE_10743chr18:37994532-37996143Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CACTTGTTGA CCCTGGGACA TGGAGCAGTT TGTTTGTTCT CTTTAAAGTT CAGCTTCCTC 60
CACCAAGAAA ATGGTAGGAT GGCTCTACCA GGTTACAGTG AGAACTGAAG AAAGGGCACA 120
GAGTGTGGTA CTGGGCCTGG CACATTCGAG ATCCTGTTAG CGGATGCTCC CAACAGAGTA 180
TAACATGGCC ATTCATTTCT GCTCCCCGGC CTCCACCCCA GGACCAGTGC AGTTTCCCCA 240
CTAAGCTTAG AAAGAACCTC TGTCACAGCT GTACCATCAA CCCTGCCAGT GGTTTAGGTG 300
AGAAGTCACC GAGGTTGCTC TGCGGGGCAA ACAGATTCAG CTCCCTAACA TGCGAGAGCA 360
TAGGCTTTGA AAGCAGGCCA GTCTGGGGGC ATAGCCTTGG GGGCATAGCC TTGGCTGTCT 420
GGGAACCCAC TCCATATATG GACCAGGCTG TCCTTGAACT CAAGAGATCT ACCTGCCTCT 480
GCCTCTGCCT CCTGAGTGCT GAGGTCATAG TTGTGTGATA CTCTTGCTTT ATAAGGTGCC 540
GGAGAGCAAG CCCCAGGGCT TTGTGCACGC TGGGCAAGCA CACCCCCCCC CAGAACCAGA 600
ATCTAACTTG TAGTACCCCC ATGAAGGAGC CTCAGTGAAA CACATTCCCT TGTATTCTAA 660
TCCAAATAAT TAAATTAAAA TAGAATAAAT TGTAAGAAAG AGAATCTTAA AACCTGTTGA 720
TAAGGACTAA CTTCTGGCCC AGGAGACTGG AGTCTATGGG AAACTTACAG AAGATTAAGC 780
CCTGCTGGGC CTCAGGCATG AATGCACGCT TTCTTCTTGA GTATAGCTGG GGGACTGGTA 840
GGTAGAAAGC CAAGCTAGGA AAAGCATCCC TACCTACTAT CAAGTAGGAT GTGTGCCAAC 900
CAAACTTTAG GGCTTTGTTT AACCAGTCAT CTCTAAGTTC TGATCATGCT TGGTAGAAAG 960
GGGCCGTGAA ATCCCACTGA CCTGGAGCTG TGTCCCAGGG CCATGTACCT TCATCGTCCA 1020
CAGTCACCTT TAGATCTAGT CTTGTTTCCC TCTTGGACCT AGAGGCTAAA TTCCTCCGAG 1080
TGCCCCCTGC ATTGTTCTCC CTGATTCGAG TTGCCTGATA AAATCTAGGG TTCCCAGTTG 1140
AATATAAATC TCAGATGAAT ATATGCTTTT TGTTTGTTTT CGAGACAGGG TTTCTCTTGG 1200
TAGTCCTGGC TGTCCTAGAA CTCACTCTGA CCAGGCTGGC CTTAACGTCA GTGATTCACC 1260
GACCTCTGCC TCCTGAATCC TGGGATTAAA GTTGTGCCCC ACCACTGCTT GGTTATATTG 1320
GCTATATACC GTTTTAGTAT AAATCCTTCT TAAACTGTTT ACATGAGGCC AACTATGTAA 1380
AAAAGAAAAT TTCCAAAATT CAGAGATAGC TGAAAACCAT GTATTTTCAC TTACTATGAT 1440
TTAGTAATCT CACCCTTGAT GTCTGAGAGA CTGGATGAGC CTGGCTTATG GCTGACCAAA 1500
GGGTAGAGGA AGGGGACAGA TGATAGGAGC TCTCAACTTC TGGGGGCCAG GGCTGAGATC 1560
CCTGAGAGGC CAGCTGTACA CACTGGGCCT GGGGAGATGC CAGGTTCAGC TCTTGAGGGA 1620
AGTAAACAGG TCTCTTTAGC TGTCATGGCC TTGAGCCCTA AGGCCAGAAG GCAGCCTTTT 1680
CAGCCCAAAT CGAAATGCTA AAAACAGACA TGGAAACAGT ATTTATGGCC CAAAACCTTC 1740
CCAGAAGGTC TCTCTGGAGT AGGGCCATGG CCGCGTGCAT GCTCCCCTGT CAGGGCTCCA 1800
CCCCTCCAGC CCACACAGGA CCTGACCCAA GGCCCCGGCC TTGGGCTCTG TGGGGAATAG 1860
ACTCCAGGAC TGAGGTGGCA GGGTCAGGCC GGGCTCTCAC TTTCACACCT ACTTCCAAAC 1920
CCCAGAGCTT GAGAGACTCT GGAGCCCAGC CCAGCCAGCC TAGAGTGGAG AGAAGGGAGG 1980
GACCCCTGAG AGAGTGCTTA AATAAACATG TGGGGGAGGG GCACCCAAAA GAAGGCTGCG 2040
GTTTGCAGCT GTGCCAGTTT TGGGCTCACT TCCTTGGCTA ACTCTGGTTA TTGTTATTGT 2100
GGGGTCTTTG TCTGCCTTGG ACTGGCAAGA TTAAAAGGAC CAGGGGAAGG TGGTAATGCG 2160
TTTGGAGCTG GAGGGAGGCC AGTACCCTTC CTCTACTGGA AAAGATCCCA TCTCTTTGCA 2220
TTTCTAAGTG TGTTTTCTTC TGAGACAGGA GCCACCCCTG GTCCTTGTCT AGGCCAAGTC 2280
TTGGGGGTTA GAATATAACC AGAAAGGCCT CTGGAGTCTC TGAACTGACA GGGCAGGAGT 2340
CCAGGGTCCT TTCTGCATCT TCAGTGTCTC TCCCTCCTGA TCTCCTCACG TTCTCTCCCA 2400
CCAAGTGGCC ATTTTGAAGG ATTCTCAGAG ATCTCCAGTG TATGCAGCAT GTGGGTCGGC 2460
CTGCTTTGTT GTCATTCAAT GAAGCACTTC CTGCCTTTTT GCTCATAGTA CTTTCTCAGT 2520
TCTTCCACAT TCCTTCCTAA TTGAGTGCTT AGGGGGCGGG CAGACGAAGC TCTATACCCC 2580
CCCCCCCCCC AACACACACC TATCTTCTCT ATCCCCTAAA TCACTTTGGA ATCCTGGCTC 2640
TTTGAAACTA GATCTGGGCC CTTCCCCCTT CCATTGGAGG AGGCTGTCGG TTTGAGGGGA 2700
AGGGTGACTG AGCTTAGAGG GCTGCTACCT CCTGGAGTTA ATTAAGGAAA TGTCAGCCAA 2760
TGAAAGGGGT GGGAGGGGTG GGCAGCTGTT CCCTCCTACC AGGCCTGTTC CCAGAAGGCC 2820
TTCAGCTCCA GGACCTTAGG GACTGGATGT AGTGGGTTGT GAAAACCCAG ACTCCACATT 2880
GCCAAGGTGG AGAAACCCTG GCACATCTCT TGCTTTCCCC TTATACCCAA ACTGGAAATA 2940
TTTCCTGTCT CCATTTCTCA ATCCCTGGTT GATGTCCCAG AATTACTCAA CCTCTCCAGT 3000
CTACCTCTCT GTTAGCTCCA AGGCCAAGGG TGGAGGCACA GGCGAGGGAA AAATGCTCCA 3060
GCTTTTGGCT AGGCTGAGCA AGGCCTTCAA CTCTCTCCGG GTCATAGAGG GTTGCAGAGT 3120
CTCCAGCTGG GAATCTGAGA GCCCAGTGCC CACCTCCCTC CCCGCCACCA GCTCCATTCA 3180
GAAGGAATAG TAGACAGGAT AACGTCACAC TGGATGACGA GGATGGTTAT GAGGGGGAGT 3240
GGGGTAGGTA TTTATTGAGC ACTTGTCAAG TGCCAGGGCA CTGCGTGTCT GTTTTCTTTC 3300
ATCCTCACGG AAGCCCCGAT AGATTATTTC TGTGCTTTGG CTGCGCAGGT AGACTTAGTC 3360
ATCTGGGTCT CATTCTCATG CAGAACCTGC TTTTTAAGCA AGAACACCAC TGTGGCCGGG 3420
CGGTGGTGGC GCACGCCTGT AATCCCAGCG CTTGGGAGGC AGAGGCAGGT GGATTTCTGA 3480
GTTCGAGGCC AGCCTGGTCT GCAGAGTGAG TTCCAGGGCA GCCAGGGCTA CACAGAGAAA 3540
CCCTGTCTCG AAAAACTGAA GGGGAAAAAA AAAGTTAAAA 3580