EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-05649 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr17:87774770-87779180 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr17:87777606-87777624AGAACCTTCCTTCCTTCC-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr17:87777610-87777628CCTTCCTTCCTTCCAGCC-7.73
HNF4GMA0484.1chr17:87777052-87777067TGGCCTTTGTTCTCT-6.23
KLF4MA0039.3chr17:87778352-87778363CCACACCCTGT+6.14
NFYBMA0502.1chr17:87774804-87774819ACCTCAGCCAATCAG+6.59
RFX2MA0600.2chr17:87778048-87778064CGTCTCCATAGCAACC+6.08
RFX2MA0600.2chr17:87778048-87778064CGTCTCCATAGCAACC-6.29
RFX3MA0798.1chr17:87778048-87778064CGTCTCCATAGCAACC+6.2
RFX3MA0798.1chr17:87778048-87778064CGTCTCCATAGCAACC-6.37
RREB1MA0073.1chr17:87777452-87777472CCCACCACCACCCCACACCC+6.03
RREB1MA0073.1chr17:87777449-87777469CGCCCCACCACCACCCCACA+6.23
RREB1MA0073.1chr17:87777459-87777479CCACCCCACACCCCACACCC+6.41
RREB1MA0073.1chr17:87777471-87777491CCACACCCCACACCCACCCC+6.59
ZNF263MA0528.1chr17:87778086-87778107TGGGGAGGAGGAGGAGAATAA+6.07
ZNF263MA0528.1chr17:87776949-87776970CCCCCTCCCCCTCCCTCTCCC-6.28
ZNF263MA0528.1chr17:87778080-87778101GGAGCTTGGGGAGGAGGAGGA+6.35
ZNF263MA0528.1chr17:87775935-87775956CTCTCTCCCCCCCCCTCTTTC-6.44
ZNF263MA0528.1chr17:87775938-87775959TCTCCCCCCCCCTCTTTCTCC-7.1
ZNF263MA0528.1chr17:87776951-87776972CCCTCCCCCTCCCTCTCCCCC-7.94
ZNF263MA0528.1chr17:87776945-87776966CCCTCCCCCTCCCCCTCCCTC-8.74
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02738chr17:87749106-87776827HFSCs
mSE_03133chr17:87751040-87784551TACs
mSE_04325chr17:87776947-87780308Cortex
mSE_10959chr17:87775928-87780505Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CCGCTTACCC TACAGACCCC TCTGAAGACA GATAACCTCA GCCAATCAGG GAAGACAGTT 60
GTGCTGCATC CCAGAGACCC AGGAAGAGAA AGACACAGGC GTGGGTTTGG TCACACAAGA 120
GCGACCAGCC ACCAGTACTC TAGAAGACCC CTCCTAGGCT GGTCTAGTGA CCCTGGGTAC 180
CTACCTTCTC AGCAAGGGCC TTTCAAGAAA CCCAGGGTAG CATATCAACT GGACACTAGG 240
TGCCCTTTGC CTCCGACGGG AAAGTAGAAC TGGCCGGTGA CTCTAGTAGC TGTGTTCTAG 300
AAGGGGTATG GGACTCGACG GCTGTGTCCC CGTCTGGTTG GACAGGTTGA GGGAGCAAAC 360
CTGGAGCCAG CACTGACCTA GAAGCATGTA GTCTCCCCAA GAGTGCCTGA AGAAGACCCC 420
TCCAGTGCAG TGGCTCCTGA ACGCAGTCCC GGTGGCTTCA AGCGGGGCCT CCAGGGCCCT 480
GCCGACTCCC GCAGCCTCCC GGCTGATTCC CAGCTTCCCG GCTGGAAAGG CTGTTAACAG 540
AATCCCAGGA ATGTGCCTGG AGCTCAGAGA GAAAATTCCC AGACTAGCTT CTATAAATAC 600
TTCAGGGCAG GGGTGGGGAG CAGCGCCCAG CTTGGCCCAC AGCTGGCCTA GCACTAAGGA 660
CCACTTCCCG GGTTGGGCTC CCTAGAAGAC GTAAGCCCAC ACCCCCTCGG GACCTTTCTG 720
CTACGCCTCC GTTCTTCTGA CATCATGAGG CACTGAATTA ATGGGGTGAG AGTGTTAGTG 780
GCAAAGCCTA AGAAAGGGCT AAGAAGGCCC TTCCTTCTTT TCCACACCCA GCTATGGCCT 840
CAGTTCTACC CTGAGGCTCA ACAGACAACG AACTCCTAAC AGGAAATGCC CCGCACTCTC 900
AGTCTCCAGA CCTCGGCCAA GTATAGGCCC CTCAGACTAC AGGCCTCCTG AGCTCACTGA 960
AGCAGGAAGT CCAACCCAGG AAGCCCTTAA GGCAAAGCCA GGCATCCTTG GCTGTGGTGT 1020
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGGTGTGTT 1080
GTGTGTGTCC AGGACCCTCC CACCTGGCTT CTGTTGAGAG CTGCTGCCTT GCTTAGAGCA 1140
GAAAGGCTGG CAGGGAAGTC AGTCTCTCTC TCCCCCCCCC TCTTTCTCCC TGGAACACAA 1200
GCCGGGAAGG TCCACAGGAG CCCCACGGTT ACCAACTATG ATGTGGAGGT GGTGTCTGAC 1260
CTCAGGAAAG GCTTCCTGGG AGAACAGAGC CCTCAAAGAG TGGTGTGGGC AGGAGCCCTT 1320
CTGAGAGCTG AGGAAAGAGG CACTAGAGAT GGGAATTTCT GGAGACTTTA ACCATCGTCC 1380
TGTCTGTCCC AGAAGCCCCT GTGATGGCTG TTTGTAGTCC AAGTGCGTCA TGCAAGTACA 1440
GTGTTCCACG GGCATGGGTA ACTTTTACAT GGCTGCCAAC TCCCTGTGAG CGGGCAGCCC 1500
AGTCATGGCT CCACAGTGAA GGGTCAGAAA CTAAGGGCCT CTTCACAGAA CTAGATCCCT 1560
CCCAGCAGAT GAGGGACAAG CGGGGACAGA GGGGGGGACT CTGTGGGGAC AGACTGTGGA 1620
TTGAACTGAG ACACCAGTTC TGTGTTCCCA CCATCTCCCT GGAGACCTGG AGCCAGTGAA 1680
GTGTCAGGAG GGTGCTGATG GGCCCTGGGG GCAGTGCCAG GCTGGGGACA GCAGGTGAGA 1740
CCTTGCATCT TCCTGTGCTT GGGTCCCACC CAGTTGTCAG GCAGCAAACA GCACTGGGTT 1800
GCTACCAAAC ACAAATGCTG CTGGTGTCAG GGGCAGGTGG CCACAGATCC TGTTACAGGC 1860
CCTGGGCCTC CAGGCCTTAG CCTGACCCCA TCCTGGCCTG GTGTCTTCTT TCAGGTTCTA 1920
AGGTCAGCAT GTTGGGGTGG GGGTGGGACA TGAGCCAGTT CCACTGCACA GTCCTTCCTA 1980
ACAGAGGACC CTGCCATCTC CTTCCGTCTA AGGAAGTGGA CAGTACTGGC CTCTCCGTGC 2040
CCCATGCCCG CTGTGGCCTT CCTAAAGAAG TTGCTGTTGT TTGCTACTGC GAGTCTGGCT 2100
GCACCTTCTC CAGATTCATC CTTCCAGAGT TCTCAGCAGC CCTGTGAGGA AGGACTCCCC 2160
CCAACCCCCA ACTGACCCTC CCCCTCCCCC TCCCTCTCCC CCCAGTTTAC AGAGACCCAT 2220
GTCAGTTTGC TGAGGTCACA GTGCATGTCA GTGGCAGAGC TGGCCTTCTG GCTGCTAAGC 2280
CCTGGCCTTT GTTCTCTACT GAGGCGCACG TTCAGCCTGC AGACACATCT GGCTCCTTCC 2340
CAAACACCCA CACCTTCTCT CTGCCAGCCT CCCTACTTGT TAGGCAAGTT AGGCAAGCGG 2400
TGGCAGCGCA GCGTACCACA GAGCTCCTTC CCTGCTCTCT GTTTATTTCC ATTTGGTTTC 2460
CGCTAAGTTC CCCAGGCTAG CCTAGAACTC TCTTGCCTGG TCAGGTCTTC AACTTGTTAT 2520
TCTCCTGCCT CAGCCTCCCA AGTGGCTGGG ACGATGGGTT TGCACCACTA GACCCAGCTA 2580
GAGATTGGGA GGTGAGGGGG GTGGACTCTT CTTACCAATA AAGTTTCCTG TGGAAGGCAG 2640
CTCCAGAAAG AAAGCGCAGA GAAGAGAAGC AAGTAGACCC GCCCCACCAC CACCCCACAC 2700
CCCACACCCC ACACCCACCC CTCTGACAGG CCCCGCTGGC CACCTCTATC CTCAAGCACT 2760
CCCTGTGGGT AGCATTGAGA GGCTTCAGAG CGCTTGGTTT TTGGTACTTC ATTTTGGTGT 2820
CTGATAGCCA TCGGCTAGAA CCTTCCTTCC TTCCAGCCTG TAGGCCCTGT TCCATTGTGA 2880
GTGAGCTACT TAAGGTCCTG CCCTGGCCAT GTGGGCAGAA CTGCGTGGCC TGGGCACTAC 2940
TGGCCGGACA GACGCTGCCT GCCGCTGGTT CTGGTAACCC TGAGTCAGCA CTGCTGTGTG 3000
CATCTGGTCA GCCCTGTGTG CCGCTACTCC CTGCCCCCAC CTGCTGTTCT CCAGCCTCAG 3060
CTGAGGCTAC CGAACTCCTG GGTCCTTGGG TGTGTCTATG CTTAGGGTCA TAGGAGGGTG 3120
CCACTCGACG AGTCGGTTGT GGCCCCAGGA CCTCCAGCCA GCGCCTCTGG AGACAGAGCT 3180
TTCCCCAGTC CTCCTCAGCA CCCTCTCTGC TGCCTAATTG GTCATGTTCC AAGCTCTCTT 3240
AGGATTTATG AAGTCAGCCA TGTACATCTT TCCTGGTGCG TCTCCATAGC AACCAAGGGC 3300
CTAACTCTAG GGAGCTTGGG GAGGAGGAGG AGAATAATCC AGCTAAAAAT GTGCATGGCC 3360
GCCAGTGGGC GGGCTGCAGA GAGGGGGCTT CAGGCACAAA GACAGCTCCC TGCCCCCACT 3420
CTGGTCCCCT GCCTCCCCAG GAGATCAGGG TTGAAGATTT ATACCTCCAC TCTTTGGAAC 3480
AAGAGAAGTG CTCACTTCTC AGCATCCTGG GATACCTTCA CAGTGGCAGG TCAGTAGAAT 3540
GGTACAGAGT AGCCTTTCTG GGACCTGGAG CCTTCCCCGT GCCCACACCC TGTCCCTTGT 3600
CCTTGTCCCT GGGAGGATGG GGGATGTTCA AGACTGCCGG TTTCACTTCC CACCCGCTTT 3660
GTGACAATTC CTGGCACTTC CTCTAGCTTA CTCTCTTCAG TTCTTTGCAG TGGTCCTTTG 3720
AGCTAAAACT GCAAAGCCAT ACTTCCTGCT CTTGACCGAA GGGGCCTTGG ATAGCTGAGT 3780
CCCTTTTCTC TCATTCTCTC AGCAACTGCT CTGTGCCCTG ATCCACTCCC TCCAGCGCCC 3840
GCCCGCCCTG GCACCTGTGA GCGTAGAGTC TGCTGGCTGC TTGGTCTCGG GACCCAGCAG 3900
TCCCCGGGGG AAGATGGGCT GCTGAGGCAG GCAGACAAGC ACCCCCTCTT TGTCACAAAA 3960
CTAGATAACC TTCCTGCTGT GGGTGCCCCC TTGGGGTGAG GGGCAGCGTG GCCTGGGCAC 4020
TACTGAGCAT GCTCCAGTCT TAGACAGCTT TTCGTCCACT GACTCATTCC TGCCACCCGG 4080
CTTAGATGCC CAGGCCCTGA TAAAATGCAT TATTTTATTT TTATTTTTCC ATTTGTTGAA 4140
GAGTGAGTTG GAGGGCTCAG AATTCCCCAC ACGGGGCCAC TCAAAATCAG GTCTAGGCTT 4200
AAAGGCCCAT CTTTTGAAGA CAAGAGGAAC ATAGCTACTA CAGGTTAAAA CAGGGCTTGG 4260
GCAGGGTCGG ATGGGTTTTG CATAAGTAAA GGGCACAGTC ATTTGTCTGT GGCCCAGCCA 4320
GACCTGAGGG CCTCTCTGGC TCGCCCTGGT TGCTAAGCTC TCCCCACCGG CTCTGGAGGC 4380
CCAGGCCTGG TTAACCTCGT CCTCTGCTTC 4410