EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-04262 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr15:77668090-77672380 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PKNOX2MA0783.1chr15:77671932-77671944TGACAGCTGCCA+6.02
RREB1MA0073.1chr15:77668468-77668488CCCTCAACCAACCACACCAC+6.15
RREB1MA0073.1chr15:77670548-77670568ACCCACCCCACCCCGCCCCC+6.28
RREB1MA0073.1chr15:77670553-77670573CCCCACCCCGCCCCCACACA+6.35
SPICMA0687.1chr15:77671842-77671856CAAATGAGGAAGTC+6.28
TGIF1MA0796.1chr15:77671932-77671944TGACAGCTGCCA+6.04
TGIF1MA0796.1chr15:77671932-77671944TGACAGCTGCCA-6.18
TGIF2MA0797.1chr15:77671932-77671944TGACAGCTGCCA-6.07
TGIF2MA0797.1chr15:77671932-77671944TGACAGCTGCCA+6.44
ZNF263MA0528.1chr15:77669802-77669823TCCCCCCTCTTCTCCTGCCCT-6.17
ZNF263MA0528.1chr15:77669745-77669766TCCTCTCCCCTCTCCTGCCCT-6.28
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02632chr15:77630059-77689248HFSCs
mSE_02954chr15:77627545-77689321TACs
mSE_03344chr15:77669687-77670540Bone_Marrow
mSE_03344chr15:77670612-77673324Bone_Marrow
mSE_04812chr15:77665969-77668990E14.5_Heart
mSE_04812chr15:77669728-77670548E14.5_Heart
mSE_06719chr15:77667200-77669700Heart
mSE_07135chr15:77660531-77670840Intestine
mSE_07135chr15:77670866-77672750Intestine
mSE_08002chr15:77667277-77670736Kidney
mSE_08949chr15:77663549-77670819Lung
mSE_09356chr15:77663552-77672603MEF
mSE_11192chr15:77663523-77672587Placenta
mSE_11927chr15:77659910-77670785Spleen
mSE_11927chr15:77670837-77673336Spleen
mSE_12977chr15:77662512-77670800Thymus
mSE_12977chr15:77670858-77672624Thymus
Enhancer Sequence
CTACCCATAA AAAGAACTCA AGTGGGGAAG CAGAGGTATT TGGAAGAAAG TCTCTCACTT 60
GTAGAGTTTC CCAGGCACCC TTGTGGGCCA ATAGGCACAG GAACTGCTAC TGTCTTCCAG 120
GGGATATGGT CCTCGCTAAC ACAATCAAAC CTACCTTCTA CCAGCATACA CAAGTTGTTC 180
TTCCCACACT ACCCTTGCCT GTCATCTAGA ACACGAGGAA ACCATGTTTT AGGGGAAAAA 240
CAGAAACCAC AGGCAGTAAG AGCAACTTCT GCCTAGGCCA GCACCTCTCA GCAGGGCTGA 300
GCCCACATCT TAAGCAAGTG CACCCAAAAT CATCAGCAGA GGGGACTTAA GGCCATTGTG 360
TTATCACCAT TTTGACCCCC CTCAACCAAC CACACCACCG CATGGTATAT GCGCCCCTTG 420
TTAGAAATGG AAAAAAAACA CTGAGTTTGG AACCAAGGAA GGAGTCTACC CCCCACCCTC 480
ACACAGTCAC CTAGGGAGGC AACACTGGTA GAAATCTATG TTTACAACAA TAAGAAACAT 540
GTAGACAGCC GCTGCGTATC AGGCCTTGTG CACTGACCGC TCTTCTGGTT CTTGCAGCCA 600
GCTCTGCAGA GTAGACCCAA CTGATTCCCA TGTTCCAGAT GGGAAAACTA AGGCTCCGGG 660
TGTTATATAA AGTGTGTAAT GTCACAAAGC TGGTGGGAGA GTTAAGATTT CAACTCTGCC 720
CAGCACCACA GTTTACGTTC CTTCCCTAAC CGACTCTTCC CAACTTTAAA AATGAGATTC 780
TGGAGCCAAC TCGGTGGATT AAAGGCCCTT GCCACCAAGT CTGAGTTGTA TCCCAAGGGC 840
CCATATGCTG GGAGAGAGCC AATTCCCTTA AGTTAGACTC TGACTTTATT TGCTTCTTTA 900
TTGAGAGTTT ATTAGGAAAA AAAAAAAAAA AAAGAGCTCT ATGAGCCCGT TGCCTAGGCA 960
GCCAGGGCAG TGTTCTGCTG TCACCACAGG ACCTGACCCA GGCAGGGGCT CAGAGCACCA 1020
GGGGTTAAGG CTGAGAGAGC AACACAAAAG GAAAATGTAC TTCCTGCCCT TGTGGCAGAG 1080
ATGCTGTTTT ATGCTCAGTA AATTAGGACG TTTGTTTAAT GAAGAGAACA CACAGATTCT 1140
GTTATTCTAA ATATTTCTGG AACATGATGC TTAGAGGAAG CTGTCAAGGC AAGGGGTTTT 1200
TTGTTTTGTT TTGTTTTTTT GGGTTTTTTG GTTTTTGGTT TTTTTCTTCC TGGCTTTAGC 1260
TTTCTCCCCC CTCCAAAAGA AGGAAAACAA CAGCTAAACC CCTCCTCTCC TTTTGAAATA 1320
AAGATGTCAA GCTGGTAGGG GCTGTCTTAA GTACTTTATT GAAGGATTAG TGAGAAGAGG 1380
AAGTGAGAGG GGAAACTCCA GCCAACCCCG TTTCTACCAG ACTAGGGACA AAGCTGCATT 1440
TCCTAGTGGG CTTCTCTTCC TTTCAAGGGC TAAGAGATCC TTGTTTTGTT TTGTTTTGTT 1500
TTCTAGAGCA AAACCAGGCA AAAGGCAGGC TGTGATTAAC ATGCACCCTT CCTTCCACAA 1560
GAGCGTAGTT GCCTCATCTC CAAACCCTTT GGTTAAAAAG TTCAAAAAAC TTAAAAAATA 1620
ATAAAATAGA AAAACAAGAA AACCAGGCCT TTCTTTCCTC TCCCCTCTCC TGCCCTTCAG 1680
ACCAGCAGCC CCACTGTGAG TCCCTGACTC TCTCCCCCCT CTTCTCCTGC CCTTCAGACC 1740
AGCAGCCCCA GCCTGGTCTA CAAAGTTCCA GGACAGCCAG GGCTATACAG AGAAACCCTG 1800
TCTCAAAAAA AAAACAAAAA ACAAAAAACA GACCAGCGGC CCCATTATGA GTCCCTTACT 1860
CTCTGCTTCC CTTCCCCACC CAGGGCTAGA TGATACTTCC CAACCCAAGT TGCTAATGCT 1920
AGTTTGAGGG GAACCTGGCT CTGCCCACCT CCCCGGCCGT CTAAAACCTG CTGAGTGCAG 1980
TAGGAGCAAA GCTCTGGGGT GTCACCCACA CAGCAAGCAC ACTGCCTCTC AAACTACACT 2040
CAGCAATCCC TCGATGCTTT TAACTACTCC CCAATTATCC ACTAAATGAC TCCCCACTTT 2100
CCTTCACCAC GCGTTTGCCT CGGTTTGCCA AGCCTGAAAT GTCTTCCTTC CTCATGGTGG 2160
TTTCCCTGCT TGCCCTGGAC AGCAGTGGCC CCCTGAGCCT AGGAATTCCT TGAGTCCTTT 2220
GTCTGTGGCT AGTTTGGGAC ACAGCACAAG CTGTCTTTGT ATCTTAGTCT ACCACTCCAC 2280
TCTTTAATGC CTTCAAATTT CCCCAGAACA CAAGTCTCTT CAGGAGGCCA GCAGGCTCTC 2340
CCAGGGTAGC CCAATGCCTC ACAGTACCTT TCTGGGGTTC CTGATATCTC CCCTTCACAC 2400
TAGTCACTGG TTTGTCTCAG AGTGCCGGTG AGCAGGGGCC AGGTCTTACT CAATTCACAC 2460
CCACCCCACC CCGCCCCCAC ACACACCACC TGGCAAAGTC CCTGGCAGAA GCCCGGTTAA 2520
ATATTTGCTC AATTACACAT CTATAGGCCC TTCCCCCCTA CCCCCACCTA TAACAACCTG 2580
GTATATAAAT TGACTGATAT TGAGTGATTG TCTACACGGG GCTTCAAGCA AATTGCCTCC 2640
TTAATAGAAA GGGAGGGAGG CCTCCAGGTG AAGTTATCAG CTTGGACTCT AGACAGTGGA 2700
GTCAGAAATG GCTACAATGT TTCTGTGAAC AAGTTACCTT TTATTTATTT ATTTATTTAT 2760
TTATTTATTT ATTTTTGCTG TTTCAAAAAG CTTTATTTTC ACTTGGTCAA GGCTTAGGAG 2820
GGGCTCCGGG GCGGGTTACA GATCTGCCTA GTGGCTTGAG AGTTCTAGAT GGAGGTCCTG 2880
AGATTGACTG GCTGGCATAC AGCAGAGGAG GGAGTCCTTT GGGAGGCAGA AACCTCCTAA 2940
GTCGTGCTTG AGAGTGAGCC ACTCTTAGAG ATACTTGGGC CAGTCTGCGT TGGCTAAAAA 3000
ATACGGAACT CAATGCATTT GCGTGTCATC CTTACGCAGA GGCCATGCTA ATCTGTATCG 3060
TTCCAATTTT GGTATAGGTG CTGCTGTAGG AAGCACGCAA GTTACTTTGA AATCTTGCTA 3120
ATCCAGAAAA CCGCTCAGAG AACTGAGAAC TCGATGGACC TCCCTGTAGC CCAGCCGAGG 3180
CAGCCTCCGG GTCTCCAAGA CCTGGGACTT CCCAGGGACC TTTTCCCTAA CACCGCTGGG 3240
TGGGGCCTTA GGCACCCGCC CGAGCCCACC CAGCCTTCAG TTTCACTACA GCCCGCAAGC 3300
AAGTCATAGA GGGTACTTGA CTCAGTTTGC CTGGGAGAGA TGGGGACCCG GAGGAGCGGG 3360
GTGCAGCTCC TGCCTTAGGC GTGGCTCCAG AACAGGATGA GGTGAAGACC CTAGTGCAAG 3420
GAAGTGGGGG ATGTCTTCAA AACTCCGCCT CTCATCAAAC ATAAAAGATG CGGCTGCCCG 3480
GCCTGGTCTT AAAGTCAGGG CCAGCTCCCA GAGACTGGCC CGGGCGTGGC GTCCCAAGGT 3540
GCGGTGGAAA TCAGGTGCAC GCCTGCCCGG GCGACGGGGC AGCTGCCGGC AGACCCAGGC 3600
CTTCTGACCT CGGGCAATAG AAATCCAAGG TTGAATGAGG TCAGACGGGG GGGTTCTTTT 3660
CCTGCGCCCT GAGCCCCTCG GCAGCTGGGA CCCCTTTTCC CACGCACTCT GAGTACCTCT 3720
CCCCGCCCCC TCCCGGCCCA AGGGCTGACG GACAAATGAG GAAGTCCGCA GCGGACGGCG 3780
GAAACCGTGC CGGGCGCAAT GTCTGCGGCG GGACCGACCG ATCCTGACTC AGGAGGACGC 3840
CCTGACAGCT GCCAAGCGGT CCTCGCCTGC CCGTTACCTC CCTTTGCCAA ACTTACAAAG 3900
GAGCTGCTGC CCCGTGCCCA CGAACGCATC CGGCCGGCTC GGCCGAGATC TCCGGGACTG 3960
CTGCGTCCCG GAAGGGGTTA AAAAGTTTGC CGGAGCTGGC CGTCGGGGAG GCGGGAGTGC 4020
AGAGGCGACA GGAGCAGGCC GAGCTCCCAG TGCCCCGACC GGGAAGGGCA TCCTGTAGGG 4080
CCGGGGACTG CGTCCCCCGG TTCCCTAACC CCGAGGCCTC GCTGCCTATC ACCCCTCGGG 4140
TGAGGATGCG GAGTCCGGTC GCACCCGACC GCGCTGAAAC CCGCCACGCG GAGGCCGAGA 4200
ACCACAGGGC CGTCCGCCCC AAAGGACTCG AGTCTTGTCG CCGCGCGCGC GCGCTCGGCA 4260
GCTCCGGGGC GGGACATACC GGCAAAGCTC 4290