EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-04260 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr15:77627730-77632070 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA5MA0766.2chr15:77630120-77630130CAGATAAGGA+6.02
Gata1MA0035.3chr15:77630119-77630130ACAGATAAGGA-6.14
HSF1MA0486.2chr15:77630789-77630802GAACCTTCCAGAA-6.19
HSF2MA0770.1chr15:77630789-77630802GAACCTTCCAGAA-6.41
HSF4MA0771.1chr15:77630789-77630802GAACCTTCCAGAA-6.37
NR2F1MA0017.2chr15:77630672-77630685CCCTTGACCTCTG-7.34
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00796chr15:77618732-77628929Myotubes
mSE_02632chr15:77630059-77689248HFSCs
mSE_02954chr15:77627545-77689321TACs
mSE_03344chr15:77628318-77629655Bone_Marrow
mSE_03344chr15:77630584-77632654Bone_Marrow
mSE_03721chr15:77627528-77630417Cerebellum
mSE_03721chr15:77630424-77631988Cerebellum
mSE_04101chr15:77627519-77630663Cortex
mSE_04812chr15:77626822-77632652E14.5_Heart
mSE_05777chr15:77627670-77630830E14.5_Limb
mSE_05777chr15:77630890-77631875E14.5_Limb
mSE_06719chr15:77628146-77632506Heart
mSE_07135chr15:77626497-77633092Intestine
mSE_08002chr15:77625216-77632540Kidney
mSE_08949chr15:77627586-77632557Lung
mSE_09356chr15:77623714-77657210MEF
mSE_10165chr15:77626886-77630810Embryonic_stem_cells
mSE_10165chr15:77630861-77631917Embryonic_stem_cells
mSE_11015chr15:77627546-77631977Olfactory_bulb
mSE_11192chr15:77626464-77635380Placenta
mSE_11927chr15:77627538-77638511Spleen
Enhancer Sequence
GGCACCTGCA ACACTGACCA CATTTACGCA AGGAATACTG TTTAAGGGGC CAGAAATCAG 60
AGCAGGCAGC ATGGCAGGCC TAGCTTGCAA TGGGACAGTC CCAGTGTGGG CCACTGCCTC 120
GCAGAGTCTA AGACCAGAGA TGGTGGCCTT CTCTGAGCCC CATGCACTTC TCTGTGTTGT 180
GAGGCAGCAC GTGTAAAGGG ACACATGTGA ATCCACATAC ATGGTGCTTG GCTCATGTAA 240
GGCACGGTGA TGACAGGACA GAGGGAGCCA CGGAGGAATG GCAGCTTCCG GCATGCACCT 300
GGGACAGCCT GCTCTCTGCA CCAGTGGCGG GGACTTCCAA CAGCCACCCT AGCTTCACAA 360
ATCCAGCAAG AAGAAATAGG AATGTTCTCC TTTGCATGGA GGGACAACCA CAGTTCCCTG 420
CACTCTGAAA GCTAAGCTAA GATGGTCAAG CTCCAGGAAA TACGCCAACC TCAAACCGTA 480
CAGTTAATTA AAGCAGTTGG ACCCAGCCCC CGGCAGTTTG GCAACATCAG AACCGCAGTG 540
AGGTACCTGA TGGTGACGCT TCACAGCACA GCATACACTG GCTATCCACC CTACTTCATG 600
ATTATTTTGA TAAATATAAC ACACAAAACA AACCTGGTGC TGACCCTGTG AGTACAGTAA 660
ACTAGGAGGC CACTGTCATC TCGATGACAG AGCAGCCGTG ACCCAAGGAG GAGATGAGGG 720
AGCAGGAGAA CCGGTCAGGG GCACTGGTGG CCACTGGCCA TCATGCTGGC ACTCCTGCTC 780
TCTCACAGGC TCAGGACCCC ATGTGACAAG GGTGAATGAC TCATAGCTTT CTGTGTGCAT 840
GGCCTTGGGA CATAGACTTA GTCGTCCAAT GGCAGACTGA CCGGGCAGAT CACCCGCCCT 900
CCTGTAGGTG AGCTTTCTAG CCGGCCCAAT CTCAGCAGCA CACAGTGCTG AGGACACACA 960
GCCATCCCTA TTCTATCAGG ACTCATGCAG GAAGCAGGAA CAGGAAGCCT TACTTCCCAC 1020
ACAGGCAGCA GCTGCCTCTG CCCCCAGCTG CAGCCTTCAT TCTAATCTCC CAAGAAATAG 1080
CCACCAAGCC AGGCACTTGG GAGCCGCAGC AGAACCATTT GCTGTGGACT AAGGCCAGGC 1140
AGGGTGAACC ATAAAGCTGA CAAACCAAAA CCAAAAAAAA AAACAAGAAA AAAGGAAACC 1200
ATCTTGGAAT GGGAGCCCCA TCATCCCACT CACACCAATA CCACCCCACC TCCCTGAGAA 1260
CTACTCAGAC AGAAGTCGAG AAGGGGGCAC TCAACCTTCC TTCCCCTCAC CCTGTCCCCC 1320
CACTCCCCAA AATGCATTCT TCAAGGCTGC CAGACAAGGA CTGAGCCAGA GTGGAGCAGA 1380
GCCTGGGTGA GATGGCAGGA GGGGCTGGGG CCAGGCTAGA GGAGAGCTGG TTCCACCCCT 1440
TCTTCCCCAA CAGCAGTGTG GCCCGCGAAG CTGAAGCAAG CATCTCTGTC ATCCCAGGCC 1500
CTGCCCTCCC CCAGCAGCTC CCTGTGGTCG GCCCCAGCTG TGGCTGCAGG CGGGCATGTT 1560
TAGTCACCGC TCCGGAGCAG GCAAGAATGT ACCTGCCTGT GCTGGCGAGG CACGAGCAGA 1620
AAGTGCCTGG TGCTACCATA AAAGGAAACA TTCTCCATTC CTTTCAGAAG GCACTGTTTC 1680
CCAGGGCTGT CCAGGCCCAG GCCCTGGATG ACTGGAATTC CTTTACGTGA GGAGGAGTCA 1740
GAGAATTATT CACTACTGAA CAGGAAGCAG GGTAGCCAAC CCACACGGAC ACACATGCAC 1800
AAAAGCAGAG ACATGTAGGC AGACGCACAG AGTGTGTGCC CTGGTGCACA AGAATATGTG 1860
CACAGACATC AAGCAGGAAC TCAGTGCACA AAGCAGCACC TACACAGACT CCTGTGTGTA 1920
AATAGATCCA CAGCATGCTA TATACTTATG TACACACACA TACAGGCCTG CATGTGCTCC 1980
AAAAGCTTAA AGCTCGGAGC CAGACTCATG AGACCTCTGC CTACCTAGGA CCCTTAGCTC 2040
TGCCCCTTGA CCTGACCTCT CCGCTGCCAT TGCAGCCCAA ACACAGGCTC GGAGGAATCC 2100
CAACCTGCTT CCTCAGACCC TGCTGAGCCA CTGCTTTCAG AGATGCCCTA CCAAGAGGCC 2160
TCCTCCTCCA CCTGAGTAAG GCCCCCAACA CTGAGCACGG AGAAGCCACC TGCTTAGAGT 2220
GACTCACACA GCCTCTAAAG CCTCAAGAGC CTTCCAACAC TTTCTGGAAG TTGCAGTCTG 2280
ACACCTGACC TCCTGGGTGG CCAAAGGACA CCCTCAGCAC TCAGGAAAGG CGGGTGACTC 2340
TTTCACAGCA CTATGTTTGA AATCTGCTCC TGAGCTCAGG GCATCCCTTA CAGATAAGGA 2400
AGTCCCAGCA AGTGGTAGGC CTAAGCCAGC TCATTCTGCT GCCTGCCATC CTATGTGTTC 2460
AGTTAGGGAC ATGGACACAC ACATGGGGAC AAACACACAC ACATATACAA ACACGCACAT 2520
GCGTGCGCAC CCAGCACTCA ATAACCTTGC CTCACACTGT CATCTCTGTG GCTGAGTACA 2580
CTCACAGGCC TCCGGAAGCC ATTTATTTCT GCCCAAGTCC ATACTTGGTC CTATGCGGTC 2640
TAACAGTTTA TCTGAAATGC CCTTTTGTCT TTTTTCTACC CTGGGACCTG GAAGGTAACA 2700
GCCACCAGCA TAACCTTATT CAGACACAGG CTCTGAACCA CCAGGACCCC ATCTCAGAGG 2760
ATGTGGGCTG AGATAGGGCT GTGAGTCTCA GCCATGGTCT CTAGAACTCT CAACAGCCAC 2820
AGCCTTTCCT CAGTCAGAAT CTTGACAAAG CCCTGGAGCA GGGGACATTG GCTGGCAGAG 2880
AGCAGTTTGA CTACTATTGG TCCATACACC CAGAGCAGTT AGAAAGGAAG TCATTAGCCC 2940
TGCCCTTGAC CTCTGGAATG AGCAGGGTCT GTTCTGAAGA CCTGTGGCAA TAAATGCCTG 3000
AGGCCTACTC AGAACTCTTT CCTTAGCCAC CCCCACACTA CATCACCAAG CTCCTAGCAG 3060
AACCTTCCAG AACCGCAAAA TAAATAAATA AATAAATAAA TAAGGCTTGC ATGAGTTAAA 3120
CACTCAGCAG TCAAGCTCTT GCTGCCCCTG ACTATATATA TTTAAACCCA GAAGCCCCAA 3180
GGCTGGGTCC ACAGAATGAC ATCAGAGCTG ATGTGGCCAC CCTGAGTGGA CAGGTTTCTA 3240
GCCAACTCAG AAGACCACCT GAGGCCTGGG CAGGTGTTTC ATCCCAGGCA TTTGGAGTCC 3300
TACACACTGG GGGAGGGGAG CAGACACACT ATGGCTCACT TCCTGTCAGA GGAGCAATGG 3360
CTGATTCTTG TCCATAAAAG GCTGTGAGGC TTGAGACTAC TAGCACAGTG GTGACATCAG 3420
CCAGACAGGA AGTACAGGAG GAAGGGTGCA GGCAGCTACT ACAACTGACT CATGGCTGGG 3480
CTCAGAGAGT GTACCTCCCT GGAGGAACTG TCACAAGGCC ATAACTGGCT GAGTGCCTCC 3540
CTGAGGGAGC TCATCTCCAG GTCCACTGGG TTCTCTGGAG CTGAGAAGCA AATGTCAAGG 3600
CAGGCAAACA TGCCTACCCA AGTCAGCACT CTGACAGGCA GCCCCCTGCG AATGTGCTCT 3660
GGAGAAAATT GCACAGCAGA CCTGAGGACG GCTTACTGTG TAGGCAAGGC GACTGGCTCA 3720
CCCTGAGCAG ACACTGAAAC TCCAGCGTCA CCTCTCAACC CCATCTAGAC TTCAGGAAGC 3780
CACGGCACAA AGGATTTTGC AAAGCATGTG AAATATGGGG CTCCAGTTCA AAGCTAGAGG 3840
TGGGAAGGCC TTAGAGTGGC CTGGGGATAA GGCCACAGAT CCTGAGGGAC CTGATGATTT 3900
GACTGAGAGA ACTCAGGCCT TTGTCCCAGT AAAAGCACCA ACAGGCTGGG TCCAACCAAC 3960
CTCTATGCAA AGGCCACGGC CACTCACGAT GAGAGCCTCT GATGCCATCT CCACAGCCTG 4020
ATCACAGCTT GGGTGACAGG CTTGGGAAGC AGACAGAAAG GCGAGAAGAG AGGGTGTGAA 4080
ATACCACTTC CTACTGATTA GCAGAGGTTG TAGACAGGCT GCAGAGGTCT TCTAGCAGAC 4140
TCCAACGGAC AACCCTTTAG GAAGGAAGCC CCTTGGGGGA TGGAGAGTGA CTCAGTGGTT 4200
AAGAGCACTG ACTGCTCTTC CAGAGGTCCT GAGTTCAATT CCCAGCAACC ACATGGTGGC 4260
TCACAACCAT CTGTAATGGA ACTTGATGTC CTCTTCTGGT ATGTCTGAAA ATAGCTACAG 4320
TGTACTCATA TACATGAAAT 4340