EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-03646 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr14:32472500-32475250 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr14:32474437-32474449GTTTGTTTGTTT+6.32
Gfi1bMA0483.1chr14:32475181-32475192AAATCACAGCT+6.14
Nr5a2MA0505.1chr14:32472552-32472567AATGGCCTTGAACTA-6.01
Nr5a2MA0505.1chr14:32474514-32474529GTTGGCCTTGAACTC-7.29
ZNF740MA0753.2chr14:32474265-32474278GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr14:32474263-32474276GTGGGGGGGGGGG-6.92
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02817chr14:32472319-32495739HFSCs
mSE_04134chr14:32472340-32477219Cortex
mSE_04604chr14:32472846-32477005E14.5_Brain
mSE_05011chr14:32472196-32478211E14.5_Heart
mSE_05595chr14:32472260-32477405E14.5_Limb
mSE_06836chr14:32472142-32478517Heart
mSE_09472chr14:32472119-32479566MEF
mSE_11169chr14:32472356-32474236Olfactory_bulb
mSE_11169chr14:32474399-32476750Olfactory_bulb
mSE_12336chr14:32474390-32476805Spleen
Enhancer Sequence
GGGATCAGAA TTTAGGTCTA CTTTACTGCT TACCAAGCTA TCTCCCCAGA CCAATGGCCT 60
TGAACTAATG ATTCTCCCAG ATCACCCGAG GATTGTTAGC TATGCAGTAC CAGACCTGTT 120
TTTTGTTGTT GTTGTTGTGT TGTTTTGTTT TGCAGTGTTA AGGTCAAAGC CAGGGCTCTA 180
TGCACGCTAG GCAAACACTC TGAGCTGAGC GACCTTCCTA GTCCCCGGGC CTGTCACTTT 240
AAGATCGAGC ACCCCTTCTG CTGCTGCTGA GCCCTTCAGT GTCCTTGCTC AGTCTTGTTA 300
AGTTGTTCCT GAGACTGTCT GTGAGACAGA CGCCAAGTGC AGAGGGGAAG CCAGCCTCAC 360
AGCCTTAATG ACATGTCTCC TGCTTCACCG CTGTTTGGGA AGGGCAAACT CGTGCAGCTA 420
TTTTTATTAC AGTTACTCAT TCTCTCCTAC CTCGTTAAGC CTGGATCTTT CAAGCATGAA 480
TATCTGGTTA AATATGCAGT GTCTAATTAT TGATGCACAC ACACGCATAC ACACACACAC 540
ACACACACAC ACACACACAC ACACACAGAT GATTGCCACT TAGAGCTTTC CTACTGGACT 600
CCTTCCACAA ATAATACAAA TTTTATTTTT CTGAAAATAG AAAGGAATGT GGTTTCTTGC 660
TGGCTCTGCA GTTTCCTTGT TTGGCTGGAT TACATGTTCT TAGAGTTAGG TGTTCTGTAT 720
CCCAGGGCGG GGCTAAGGCT CTGTGGTAGT GGCTGGTCCA TGTGAGACCC TGAGTCTTAT 780
CCCATCCCTG GTGTACATGC AGAGCCCCAT GTCCCCACAT CTGTTATGCA GATACCACGA 840
ATGCCCTTCC TAGCCCAAGA GTTCTGACTT GCTCCCACCA AGGCCTGCCT CGTGTGTCTC 900
TACCTCAGCT CTTCAAGAGG CCATCGACCT GGGCTTTAAA AGTGTTATCA CTGTGACCGT 960
GATGTCACTC AAACTACCCC ATTATCATCC TTTCAAAATG GGATATAAAG TAGATTATTT 1020
GAGTCATTTA AAATTATTCC TTGGTATCTT TAGAGACAAA GTTCCAATAA GAAAGCTTAT 1080
CAATTATACT TTTGTTTCCA GTCCAAAACT CATGACTGCT GGCTCAAAGG CCCCTTGTTC 1140
TTACCACAGA ACATTGCTTA CAGTGTAGAT GAGTGGCACC AAGCCCTGGC CTTTGTGTGG 1200
TACATTTATC CCCTAGGGAA ACAAGAAGCA GTTTGAGATG AGGGGTGGGA GGGAGCCCCT 1260
GCCCCCGGAG GCGCATTTGC TGTTGACTGG TTCTGAATGA GGAGCTCTAG GTCTCTTCTG 1320
TCGCTGAAAT AATTACGGGT TGTTTCTGGG ACTTTTTAGC TAAATAATGC ACAGAACTAG 1380
TGGCCTGTGG TGTTTATTTG GGAATGCAAA CTCTAAGAGT CCCGGCTTGA GGTTTGGACA 1440
GATGTTATTT TTGGGTAGGG TGCTAGTTTC TTCTTCAAGA ACAGCAGTGG GATTCCTTGG 1500
TTTGTCAGTT ACCTTAGTAT TGAACCGGGA TTCTTGGGCA GTTGTCAGCC CCTGTCTGTC 1560
TCCACAGGGC AGCTGTCTGG CTGAGGTAAA CTGCCTGATC AGTTTCTGTG CCAGGGGAGG 1620
GGCTTTAGTC AGGAGGCCAG GGTGACTTTC AGAATGGCTT TGATTCTAGC CCTGCAAAAA 1680
CCAGGCATGG TGGTGCAGAG CTGTAATCCC AGTTAGTAAC ACACACACAA TTATGCCGAG 1740
CAAATGTTCT ATTTTCCAGA GGTGTGGGGG GGGGGGGGTA CAGAAATGTA ATACAGAAGT 1800
CTAATTTACT TGTGTCCACT TTGTCATGGT AAGTAGAGAC TACTCACTAC AAAATTCCAA 1860
TGTATTTTCT AGAAAATCAC ATGTTATGAC TGTGAGAAGG ATTTTCTTTC CAACCCGGTG 1920
TGATTTTTTT GTTTTTTGTT TGTTTGTTTT TGTTTTTTGA GACAGGGTTT CTCTGTGTAG 1980
TCTTGGCTGT CCTGGAACTC ACTTTGTAGA CCAGGTTGGC CTTGAACTCA GAAATCTGCC 2040
TGCCTCTGCC TCCCAAGTGC TGGGATTAAA GGCGTGCACC ACTACGCCCC GCTTGAATCT 2100
GGTGTGTTCT TAAGCAAGTG ATTTGGAGTA GCAGACAAAA CAGAAAACAG TGGAGGCTCA 2160
CTCGGATTCC AGGTGAAAGC CACACGGGAC TCTGACAGGG AGAGAGTCCT TTATGGCTGC 2220
CCTATGGGTG ACACAGCAGA AGCTAGGACT CCAGACCGTC CCCAAATAAA GACTGAAGAA 2280
TATCAGCTAC GAAGCTGCCC TGTGTTCGGG AACTTCGGGA CCATCACGGC TGTCCTAGAG 2340
GGCTGACCTG CCATGCTGAG TAAGAAGTCT CAGCGTCAAA TATATCGCAG AATTGTGTCC 2400
AAAATTCAGC CGCGCTCCTG CAGTGCGCTG TGTAGCAAGG CTACTGCGTG GCTAGCAAGG 2460
CAGCGGCGCA CTGCAGGCTT CCTGCCCGCC GCGTTAGAAA ACCGAGGCAA ACACCGAGTC 2520
TGTTTTGGAA ATGTTCTGAA GCTCAGTCTA TTAACACAGC GAGCCGTTTG AAACGCAGCT 2580
CTACGTGTTT GGAGAGAAAC ACACGGGCTT TTATTAGGGA CATGAAACAA ACTCTTTGAG 2640
CCCCGGCCTC GCTGCGGGCG AGTGTAATTG CCAGGATTAA TAAATCACAG CTGCGAAAGT 2700
TCAGTCCTTG GCAGCTTTCC TTATTCAGCT CTTCTCTCCT GCCGGTTCGT 2750