EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-03136 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr13:53273120-53280030 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr13:53275835-53275846AAGCAATAAAA+6.32
HSF1MA0486.2chr13:53274570-53274583GAATCTTCTGGAA-6.06
HSF2MA0770.1chr13:53274570-53274583GAATCTTCTGGAA-6.25
HSF4MA0771.1chr13:53274570-53274583GAATCTTCTGGAA-6.14
RARAMA0729.1chr13:53279768-53279786AACTGACCTTTTCACCAC-6.36
RFX1MA0509.2chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA-6.19
RFX1MA0509.2chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA+6.21
RFX2MA0600.2chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA-6.24
RFX2MA0600.2chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA+6.33
RFX3MA0798.1chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA+6.41
RFX3MA0798.1chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA-6.44
RFX4MA0799.1chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA-6.39
RFX4MA0799.1chr13:53273813-53273829GGTATCCATGGTAACA+6.5
RREB1MA0073.1chr13:53279243-53279263TGGGGGGGGGTGGTGGTGGT-6.38
RREB1MA0073.1chr13:53277490-53277510TGTGTGTGTGTGGGGTGGGG-6.68
USF1MA0093.2chr13:53274958-53274969ACCACGTGACC+6.32
USF2MA0526.2chr13:53274956-53274972ATACCACGTGACCAGC-6.05
ZIC1MA0696.1chr13:53276416-53276430CACGGCAGGGGGTA-6.18
ZNF263MA0528.1chr13:53275253-53275274TGTGGAGGGGGAGGGGAGGAA+6.22
ZNF263MA0528.1chr13:53275267-53275288GGAGGAAGGGGACAGGGAGAA+6.39
ZNF263MA0528.1chr13:53275282-53275303GGAGAAGGGAGAGAAGGGGCA+6.46
ZNF263MA0528.1chr13:53275259-53275280GGGGGAGGGGAGGAAGGGGAC+6.51
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05652chr13:53274084-53274815E14.5_Limb
mSE_05652chr13:53277846-53279492E14.5_Limb
mSE_10352chr13:53273101-53274875Embryonic_stem_cells
mSE_10352chr13:53275301-53277063Embryonic_stem_cells
mSE_10352chr13:53277388-53281309Embryonic_stem_cells
Enhancer Sequence
AGTAGGGAGT TCAAGACTAA CCTAGCTTAC CAAGAATTGG GTAAAACACT GGGCTGGGGT 60
TCTGTGGGTC CCCTCCCTCC TGCTGCAGGG CCCTTGGATC AGGCAGTGGG CCATACAGCC 120
ATCTATGCCT TAAAAAAATA ACATGCTACT CCAGGGTCAT GGGACTAGTA AAATGCTCGG 180
GACTAGTAAA ATGCTCGACC TGTTTCTTTT TTTATATAGT GGGTACTTGT GGGAGATGAA 240
GACTACAAAG TAGCCTATTG GGTATCCCTA CCTCAGGCTC AGACTCCAGT AACAGATCTC 300
CACTGTGAAG CCCCCAGAGA GGTTCTGAGG AGCCACCACA GCCTGAATGG CCTACAACAA 360
GCACTATGTC AACCTAACAC AGCTAGGTCC AGCAAGTCAG GACAAGCTTC CCCTCGGATG 420
GATTCATATG TCTTAGAAGA GACTGTTATT ATCACATGGA GCTAGAGAAG GGTCTCTGCT 480
CCCTGTGCCA AGCCTTGGAG AGCCAGTGTT CTGCACATTC CACTCCAGGA GGGCAGGCCT 540
CTTGTGGGCC ACAATAGTTC AGGCAGCGAA CCCCAGAGCC AACCTGCTAT GTTCATGAGC 600
TCGGAAGGCA AACACCTTGT CCACCACCCA CCAACAGGGA TGCCCTTGAC CGAGCAGTTC 660
CAAGGCCATT GCATAAAGAT GAGGCTCTCA TCTGGTATCC ATGGTAACAG AAAGAGAGTC 720
AAAGCTGGGT TTGAAGATCT TGATTAAAAT TTACTTAGAG GGTAGAAGCT AAAGAGCAAT 780
GTCCCAGCGC AGGAGGAAGG GAAGGGGCCA TGGGCTATTT GAGCCTCTCC AGGTTTTGTT 840
TATAGCTGTT CCAGACTAAA ATCCTCAGGT GGGGGTGGGG AGCCTCCTAG CCCTCCCTCC 900
CGCCCCCGGG GTGCAATTGA CAAAGCATTT CCTTTTCTCC AAGGCCAGGG CAGGATCACA 960
AGAGCTTTTG CTGTTCTCAG CCCATGTTTG TTTTTGTAGT TTCTGCCAAG TTAAATCAAT 1020
CCCGCTTGTG GCCGCGTTCA AAACTCGCGA CTCGCTCGAA CAGCCTCAGC CTTTGACTCC 1080
TTTCCAAGAA CAGAGAGCGA TGTTCGTATA GGTTTCACAT GGCTGGAGAT CAAATCCTCT 1140
AATTACTCAA ATCTGTGTCA CAGAAGTGCA CATTAGCCAC TTGCAAGATG ACAGATTGCC 1200
ATTATCTGAT ACGCCTGGCT AAAGCTCTTC CTTCCACTCG GAGGGAGCTT TTGCTTGCAA 1260
CTGCACAACC TTGTCGTATG CCACGCACAC CTCCCAGAGC TACAATCCGA GCCTCTATCC 1320
ACCACTACAA CCTGCCTGTA CACAGCCGAG CCTTTTTCAC AAAGCCCCTG CCGCCTCCTG 1380
GACCCAAGGT GCTGGCTGAA ACCCTTAAGG TCCGATGCCA GGGCTTACAA CGATGGAATC 1440
ATTCTTAACA GAATCTTCTG GAATGCGAAG GGCAAGAGAA GTCCTGTGAC TCTCTGTAGG 1500
AGGGATGAGT GCTGCCTTGA GACAGCCGGC ACAGTAGCTT AATGGTGCAT CTGTAAGGAG 1560
CCAGCTTGTG GGATTGCGGG TCCAGCTATT GGCCAAAAGG GTTAGAAATA CAAATGCAAG 1620
CGGAAAGATC TCTCTGGTGC TACTTTCCTC AATTTGATGG GATGGAGAAC CTGGGATAAA 1680
GACTCTGGAT ATGCCTAATG ATGAATATCT AGATAGGTTA CTAAAGTGGG AGGCCTGTCC 1740
ACTATGGGCA GCACAATTCC GTAGGCTGTG GTCTTAGACT AAGTAAAAAG AAGTGAGCTG 1800
AGAACCTCCC CACCCCTCAC CTGTTCCTGA GTGAAGATAC CACGTGACCA GCAGCCTCCT 1860
CCGGATTCTA CTGTTGTGTT TTATGAAAGA GGGAAAGAGC CACGAATGTG TTTGGTGGAG 1920
GTGCGGTATG GTGAAGTGGA AAGGGGTTCC TCTGCTGGCC CATGCTAAAA CATCCCTTCC 1980
CCCTGAGGTA CCAGCCATAG ACTGATTAGT AGAGAATAGA GTTTATTTAG GGCATGAGAA 2040
AGAGAGTTGG GAAGGAAGGA GAGTCAGAGA GAGAGAGACA AAGAGAGAGA GACAGAGAGA 2100
GAGAGAGAGA CGGGGCGAAG GGCAGCAGGA ACATGTGGAG GGGGAGGGGA GGAAGGGGAC 2160
AGGGAGAAGG GAGAGAAGGG GCAGATAGAT TAAGAGAGTA AGAGATCTAG GAAGGGGCGA 2220
ACAGCCACTT TTATAGTAAG CCAAGCATAC CTGGCTATTG CCAGGTAACT GTGGGGCGGA 2280
GCCTAGAGGG AATACCAACA CCTACTACTA TCCCTTCCTC GCCACAGTGG ACCCTAGGGA 2340
GAGTCCAAAT GATCCCGCCC TTCTTCGAAT TGCACCCGCC AGGTGTTTTG TCCCAGCAAC 2400
AAAACAAATT GCTAGACAGC ACCTAAGTGC TTGCCCTGGT GGCCTCCTGG CTGCACTTAA 2460
GTTTCTCAAG ATGGTGAAAT CGCACACAGA AACACAGAGC CTTGGCCAGA CCTGGTCTGA 2520
GCAGCCCTGC AAAGCCCAGG GCTACCTGTG CCTTTCACAG TTGTCTTCTC CCTCTGTTCT 2580
TCAGTGAGGT AACACCACTG TCTCTGATCC TGAACTATAA CCCCCATCCC AAGCTGGGAG 2640
TGGGGTCCCA AAGCCCAGTG ATGAAGTACT TTTATTGCGT GCAAAAAGCC TTGAGATTGG 2700
TCTCCTGGCT CAGGAAAGCA ATAAAATTAC AAATAATGCC CACTGACTCT TAACACCTCC 2760
TTGGCTGGAT CCCAGTGGGT CAAGGTCGGA GGAAGCCATA GGTAGGACTG GAACTGTGGC 2820
CCAGGAGAAA GGAAGATATA AGGGCCACCA GCAGAGCTGG GGGAAGGATA GGACCTTTGA 2880
TCACACTAGA ACAACAACAA AAAATCCTTC CATGGCAAGA CTGCCCATCC CCCAGATCCT 2940
GACCCTGCGC CTGCAGTGAG CCACTGTGTC CTGGCTCTTC ATGGAACTGT CTCTGCACAG 3000
TGAGGTCCTG CTTCTCAGAA CCAGCCTACA AGGTTCGGCT ACGCCTATAA CTATGTGACT 3060
CTGTGTGTGC GGTTTTTTTT CTGGGTCTTT TGGGTATGTG TGTCTGCATA CCTGTGTCTG 3120
TGTGTGGGCG CAGCTGGCTG TGTGCACACA TCTGTGCCTG TGAGGGAAGG AGGGGCAGGT 3180
ATAGTCATTG GGTGCTCAAG TTGACAACTC AAAGTGCCCC GCTGCGCCCC ACAAGTGTTG 3240
GGGTCACAGG CTTTCACAAT CCAATCTGAA CAAGATCAGA GGTGCAGGTA CAGGACCACG 3300
GCAGGGGGTA GCCAGGCACA CTAGGAGAAC TGAACCTCTA GAGAGATCTG CCTGGAGCCC 3360
TTCAGTTTGT CAGTGCTGAG CTAGGAAGGT GGTTCACCGC CATAGAGTTC TTGCCTTGTA 3420
AGAACCACCT AAACAAGCTG GTGGAGTGGT GTGGGCTTTC GGGCAATCCC AGCACTGCGG 3480
AAGGCGGAGT CAGAAGGATC CCTGGGACTT ACCAGCTACC AGCCTAGCCC ACATGGCCAG 3540
TTCAAACCCT GTCTCAAAGA GGAGGGAGAC AGTCCCTGTT GCCCTCTGGC CTATACACCA 3600
CCATCACCAC CATAATGTTG GGAGGATAAG AACACGAGGA AGCGAGGGTT TCCTTCAGTA 3660
TCTAAGTAGC TGTACAGACC AGGGAGAGTC ACTGAGTGGG TCCTCCTCTG GGGAAGAGAA 3720
GGCCATGCAA ACACATTCAG TGAGGAACTG AAGGAAAATA GCTACTGGGG GCCATAGTGG 3780
GCAGTTGTTC ATTTCCCTCT GTGTAGGAAT GGTTATGCCG CCATGGCGAA TGGAGTTGGT 3840
CTTCTTAGGA GACACTCACA CACTTCTTTG AGGTGAGGGA ACGCCAAGAT GTCAATGTTC 3900
AAGTTGTTCC TCAGAACGTT TTTTATAAAG TGTATGCCGA GAAGGCAGAA AGCCCTGAGA 3960
CCCAGAACCA GAGTGGAGCC ATCGTTAGGT TGGAGTGTGA GCATTGTCTC TCGACGTATT 4020
AGAGTCCTTA AAATTTCCAT ACTCAAAATG CAGAAGAAGC TGAATGTCAA GGTACAAACA 4080
TGTAATCCCA GCATGGGGGG TGGGGACACA GACAGGAGGG CCCAGAATTC AACCTCATCA 4140
TTTGCTATTT TATTTTTCCT TTCTAAAAAG ATATATTTGT TTCATGTATA TGAGTACAGC 4200
GTAGCTGCCT TTAGACACAC CAGAAGAGGG AACTGTATTC ATTACAGATG GTTGTAAGCC 4260
ACCATGTGGT TGCTGGGAGC TGAACTCAGG ACCTCTGGAA GAGCAGTCAG TGTTCAGTCA 4320
GTACCCTCTG AGCCATCTCT CCAGCCCGTT TTGTTTTTCA GATGTGTGCT TGTGTGTGTG 4380
TGGGGTGGGG GTGCACATGT GTGCTTGTGC ATGTGGAGGC CTGCGGTTCA CGGCAAAACC 4440
ATTCACTACC TCTCTTCCAT CTTATTCGCT GAAGCAGGGT CTCTCACTCA AACCCAAAGC 4500
TCTCCACTGT CAGTTATCCC AGGTTGCTCT GGGTATCGCC CATCTCCAGA GTCCAAGGCT 4560
GGATTACAAA TGGCCTCCAC ACCTACCTAG CATCATCCCA TATTGTCAGC TTGACACAGC 4620
TGGGCAGAGA GAGCCTCAGC TGAGGAACGT CTCTATCAGA TTTGCTCCAG GCTGTGTTTA 4680
TGGGGCGTTT TCTTGATTGC TAACTGATGT TAGACCACTG TGGGTGGTAC CATCCATCCC 4740
AGAGCTTGTG GGTTTGGGCT ACATAAGAAA GGCTGCTGAA CAAGAGATGG GGACAAGCCA 4800
GTAAGCAGCA TCCCTCCACA GTCCCTACTT TAAGCTCCGA CTCTATTGAT GTTTCTGCTC 4860
TGATTTTCCT CCATGGTGGA ACCCATAAGA TAAAACAAAC CATTTCCTGC CCAGGTTGTT 4920
TGATCATGGT ATTTTGGAGG GGTGTGTGTG CACGCGTATC TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 4980
TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG CGCGCGCACC ATATGTACCC TTGGAGGCCA GAAGAAGGTG 5040
TGCAATTCCC TGGAAATGGA GATACAGAAA TTTTTAAGAC TCCATGTGAG ACTTGAGAGT 5100
CCTCTGCAAG AACTTGAATT GCTAAACCAC AGCTACAGTC CTGTGCGTGG CACTTATTCC 5160
AGAAACAAAG CAGGGCATGT GGGTTCTGAA GTTCCAGAAT CCTGTCCTCA CACTTCATGG 5220
TTGTCTCTCC AGCACCATCC CTGATTATTA ATATGTAGTG AGTTCAAAGC CAGTGTTTCA 5280
AAACAAAATA AATAAGCCCA GGTGTCTTAG ATAGCAAGCC TCTCACATAT CCTGTCACAC 5340
TCATGCGGAG AGAGAATTTG AATATCTCTC CTGGATATTC AAGGTCCAGA GGGTGGCAAG 5400
ACTCAGGGCA GTCCATCACA GAGAAACAGT TTTCTCTCGG GAGTAGGAAA GAACGCACTG 5460
CACATGCGCA ATGACAAAGT CCTCCCCTAT GCAAGACCGC ACGTTCAGAA GTCTGTAATC 5520
ACAAACACAT TGTCCGGGAA AAGAGGGAAA GGGAGAGAGA TTTCAAAGGC CCTCCCCAGG 5580
AGTGCTGCAG GAAATGGAGG GAGACAAAAT GCAAGCAAAC GCTGTTGTTC CCCACCTGAA 5640
GCAGCTGTCC TCTGACCCTG GTATATGACA CCCCAGCTTC CTTGACGAAA AACAGGACAC 5700
CAGGGGTGGG ATGCACACAG CCCTCATCAG GCATCCTTGG AGGGAGGGAG ACTAGCTCAT 5760
GTGTTTGCAA TTAGGAGGTT GCAGACATCA GGGAGGGGCT TCATGGCCCT GCCAAGCAGG 5820
GTTTTCTTCC CAGCAAAACA AGGCCCCCTT TACCCAACGC TCTGCAGCCC ACAGAATGGC 5880
AGGGCTCACA GAAATGGGAG AAGAGACAGC ACCAGGCTTC AGTTGTGTCC CCAAGTCAAA 5940
CCATACAGCT GGGACCCACT GCAGTTCTGT GTTATTTCTG CCATTGACAA CAGGATAGAT 6000
ACACAGAAGC CCTCCCTACA TGCAAAAGAG GTGTTTGGGA ATAGGGGAAG GTTAGCCCCT 6060
GAGCGATAGA ATGAAATTTC CCCCATAGGA GAGCACTATG TAAGGAGAGG TGGTTTTAGA 6120
AACTGGGGGG GGGTGGTGGT GGTAAGCAGG AATGGGGGTG TTCTTCCACC TGAATTCTAA 6180
AGATCTTGGC TGAAAGTGAG GCTTGCTGGG AGACAGTTCA AGCTTCCCAC AGAGAAAACA 6240
CTGTAAGACT CTGGGGAGCC TTAGCTTACT GGGGACCCCC TGAGTGAACC ACATGGAGCC 6300
TGGATCCATG CAAAAAGCAA GAGGAATTTA TTGTTTCAAT GCAGACCCAG ACCCAAAGGA 6360
GAGGTGGCGA CCCCCAGCAC CAGTTCAGCG AGTTTTTATC CGGTTTCCAG GGGCAGAATA 6420
GAGCATCAGC AACTAGGCAC AATGATTGGT GGGACAGTGC ACCCTTTAAA CTGATTGGTC 6480
TTTAGGGAAT AAGGTGACAA GGACTTCCCT TGTCTTAAGC TGGGTGAGGT CCATCCTGCT 6540
TAATGTGTCC CCACCTGCAG GTCTGTTCCC ACCTGGTGCT CTGAGAAATG GTAATTAGCC 6600
TCTCCCTTCC GGAGGGGCAA GTGTTTCCTG ACCTTCCCAA AGTTTCTTAA CTGACCTTTT 6660
CACCACAAAA CAGCATGTAA CAAACTTGCC TCGCCCTCCA GCTCTGAGAT GCTCGCTCCA 6720
CTGGACTTAA ATGGATAGCT GCTAGACCCA CAAGATAGAC TCTCTTCTTC ATACCTACTC 6780
TGCGGTCCCA GCTGATCTGG AACAGAGATC CACCTGCCTC TGCCTCCTGA ATGCTGGGAT 6840
TTAAGGTGAG CACCACCATG TCTAGCCAGA TTTGCAGAGT TGTTTATTTT ATTTTATTTA 6900
TTTTTAACAA 6910