EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-00541 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr1:164001310-164005900 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:164005764-164005783TGGCCAGCAGAGGGTGGCT+6.15
Foxd3MA0041.1chr1:164002312-164002324AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:164002316-164002328AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr1:164002320-164002332AAACAAACAAAC-6.32
Nkx3-2MA0122.3chr1:164004237-164004250ATAAACACTTAAC+6.08
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05676chr1:164002464-164006437E14.5_Limb
mSE_09388chr1:164002671-164004812MEF
mSE_09388chr1:164004843-164009426MEF
Enhancer Sequence
TCTGTGCTCT TCAATATGAA TCCTGGCAGC ATTCAGTTGG AGAATTCTAT TATGAAAAAT 60
GGTCAGTAGA AAGCAGAGCT TCACCAAATA GGAAACCTGA TGGATAACTA CCTTCCCCAT 120
TGACAGGAGG TGGCCAAGTC CATCAGCCTT GCTGAAAGCA TCCAGGAATG GCTGGGCAAG 180
GTATTGTTAA ATGGTGGAAA AAGCAGGTCC TTGGATAGGA CTCTCCCTCC TGCCTTTTCT 240
TGTAGCACAA GGCTCTTTAG TATGTAGGAG GTTACTGAAT TTCACTGTGT TATAGCTCAA 300
TACAGATACT ACAAACATAG AATTCTGATA TTGAAATATA TTATTCAATT TCTCCTTTTC 360
AAATGAGATG TAGTCAGTCC TATACGACTC CTGGGGAAGT ATAAGACACC TTTATTTAAA 420
AAGACTGAAG TTAAAATAAA AGCAAAGTTA ATGTTTTTCT TTCAAAGGGT AAAAAACTTT 480
TTTCTATAAT GTAAAACTTT TAGAAGAACT AATATTGGGT CTAGATTTCT CTATATTTCC 540
ATTTGATTTT TTGCACAAAA TCATGCCGGG CGGTGGTGAC ACATGCCTTT AATCCCAGCA 600
CTTGGGAGGC AGAGGCAGGT GGATCTGAGT TCGAGGCCAG CCTGGTGTAC AGAGTGAGGT 660
CCAGGACAGC CAGGGCTACA CAGAGAAACT GTCTCGAAAA ACCAAAAAAG TAAAAAATAA 720
ATAAATAAAT AAAATCACTC ACCATTTGTT ATAATGTCTT ATTTCTTACA TTTAAATTTT 780
TTCTATCTTG AATTCTCTAA CTTTAACAAA GATACTTAAC CAAACTCTTT GATAAAGAAA 840
TAATATTTAA AGTTTACTAA ATCTCTAGAA ATGTCCTTTC AGAGAGAAAC TAAATTATGT 900
AGGGAAATGA AATGTCTTTT CTTTAGGACT GAGCATGGAA ATTAATTGTT ACCTGAAGAC 960
CTCAGGTTTG CAGATGGTTT CTGGTTGGTG TTTGTATCCA ACAAACAAAC AAACAAACAA 1020
ACGTAACAAA CACCAATCAA GCGCTTTCAT CCTTTATCAT ATATGGCCTG CTGTTTGTCC 1080
ACATTCCCCG TGCTGATGCA TGGCCTGGAT TCTTGCCTTC TTAATGAAGA CATGAACTTC 1140
TATAGTCAAG AGCAACTTGT CTAAGGGGGA GAGAGACTCT ACTGTGAGCA ATTTAGAATA 1200
TCACAGTGCC AGAGATGAAT ATTTTCCAAA GGAAAAATAA GTAATATTCA AAAGAGGATT 1260
TTCCCCCAAG TAACTATGAC TTTCTGATAA AGGGAAAATA CTCCATTTTC CAGGAGAAAT 1320
AGCACTAACT ATCCAATGAG GAATGTAAGT ATTATTGTTT TGTTCTATCA TGTGCCCGTA 1380
ATGTAAGGCT CTATGTGTTT CTCTAATAGG AACTGGTGCT CTACATATGG ATACAGTATG 1440
GAGGATGAGC TCCAAACTGT AAGCATAAAT TAAAGATGGA TGAGGCAAAT CTGTCACTGA 1500
GAAAATGAGC ATCAGGGTTG TTCCAAATAC CCTGGGTTCT ATGTGAGCAT GAGGGGGGAT 1560
TCTATGTGGG CATGAGGGGG GATTCTATGT GGGCATGTGG GGAGATTATG TGTAGGCATG 1620
GGGGGGGAAT TCTATGTGGT CATGGAGGTG GGTATGTGCT AGACTTGCTG TGTGTAGGGA 1680
GAGGAGTTTG TTGTGCTCAT AAAGAGAGTT AATTAAACAG AGTTTACTTT CTTAGGATCT 1740
GGTTAACATC CCGAATGCTA AAATGTCATG CACTCAGTAA ACAATGAGCC TTCTCAAATC 1800
TGAAATGAGC CATACTTTAC AGCTGGCTCT CCTATATGGC AGGTATGTTG CCTTAGGGAC 1860
AACTCAGAGC AGTCATTCCA ACATGAGAAG GGGAAAGACG AATCTCACAT TCTCCTTCGA 1920
AAGAAGCCAG ATCTATACTC TGGAGACAGC ACAGCTTGGC TTGCAGTGTT TTCCATTTAC 1980
ACTGAAATTC TAAGCTACAG GAAAATAGCA TACAGATGTG GCGCTTTTGA TTCGAGGGGA 2040
CTCTCTCGTG CCAGAATCTC TGGTCAGGAG TATGACCACA TTTAAAAAGT ATTAGCATAT 2100
TTTTCACAAA CTATCACTTA TGCATAGTAT AAGCAATTAA AAAAATAAGG CATGGGGTAA 2160
TAAAGACCAA TACCACTGAA GTCTCCACCC TTCAATTACA AGTCAAAGCA GTGAGCACTT 2220
GTATTTTTGA GAGCCTTACT TTCAACCAGC TTCTTCCGCA CTACAATACC AGATATTCAT 2280
GCTGTACAGG GCAGGCTGTG GAGGCCCTGA GGGCCTGAGG TCCTGCAGGG ACTTCAGCCC 2340
TATTCCAAAA GGTTTAATGA ACAATAGTTT ACAATTTTTG AGGTGTGTGT GTGTGTGTGT 2400
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTAGGTAT TGAACTACAC ATGTGCATGT GTGTATGGGC 2460
ATGTGTGTAT GTGTGTAGGC AGTATATGTA CATGCATACA TGCATAAGTA AGTATGTACA 2520
TGGAAGTCAA AGGACAACTT TGGATGTAAT TCCTCACGTG CTATCCGTAT TAGTTTTTGA 2580
GACAGAGCCT CTCATTGGCC TTTTCTCAAC AGGTAAACTA GGCTCCTGGC CAAAGAGCCA 2640
AGGGATCTGC CTGTGTCTAT GTCCCTAGTG CTGGAATTAC AAATATACCA CCATGCCAAC 2700
TTTTCACACA GCTGCTAAAG ATTGAACTCA GGTCTTTGTG CCCACAAGGC AAGCATTTTA 2760
AGGCTGAACT ACCCCACTCC AGCCCCAATA GTTTATATTT TCTCATTCCC TTCATCTAGT 2820
GAGCTGAAAA AAAAAAACAC AGCAAACTGT ATCCACCATA GCATCCATGA GCTGTGTGTG 2880
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGCATGTGTG TGATTTTATA AACACTTAAC 2940
CATCCATGAA CTTCTTGAGA AAGGAACAAA TCATGGTGCT CCTCTCGTGA GCAGAGTAGC 3000
ATCTCCCCAA ATGTCAGCAG CTGGCTCCCT ATCAGTGTAC CCACAATTAA CCCAGGGCAT 3060
GCATGGCTGC TTGGATGGAT GGTTGGCTGT TTTGTTTTCA AGTAACATGA ATGCATGAAC 3120
AATGCAAAAA GTTTCAGACA AGAGATCTAC TGTGGTGCAA ATGATCAGGA TAAAATGCTT 3180
ATAATTCAAG AACTGAAATA CTATAAGAAT TAAAACATGA GTTTCACATT TTGTTCAAAT 3240
ATTTGTCCCT AAGAGTTGTT GTATTATTTA GAAATACTAC CCTTTCCTTT GTGGAAGAAG 3300
CCTTGAGTTT ATTATTTTAA GTGACCTGCT ATTCTCCTTT AGAAGTGTGC TCTAAATGAT 3360
GTGAGTTCAC CTCCTTCCTT CTCCATAGAT GTACATTTCT GGCATTATTT TAACTTTATT 3420
AAATAGCATT GCCTGGGTTG TGAGCAGCTC TATCAGAGTA TAAATTTATG AAGTGACACA 3480
TTTTTTAGGA CCAGCCATCT CTGTCAATTT ACTCCATAAT AACACATTCC ACCAAATTAA 3540
ACTGCAAAAT ATTTCCCACA TTTGTTTTAC ATTCTATACA TATGGCTTAT GAATAGCAAG 3600
CTTGATGAAT TCCAGCTGCT TTAGCTATGC AGGCCAACTC TTATATAACA GATTCCTTTC 3660
CATTCCTATT GTATCCACCG AGGCCCATTT TAAGCGGGCC ACCTGGTAGG ATAAACGACC 3720
GTTACAAGAA GGAAAAACAA AACACAACAA GAAACCCCCA AACAACAATA AAGAAAACCA 3780
GCCTGCCGAA TGCAAGACTA CTTTCCCCAG CTATACGACT CTTATATTTC TAAGAAAATG 3840
GGAAGTAGCA CGAAGCTTTT GGGAAAGTTA CATGAAAATT TAACCAAACG AGTAACGCCA 3900
CGAAGCAGCA TTTTCTCATT TATCTGTTGT AACGAGAACA TTAAAACTGC TCGCACCATT 3960
CATGTGTGTT GCCCTGCCCG TTATACAGAC GGTTCAGCCT CCCCTCAACC TCCCCACACT 4020
CTCCTGCTTC CACGCAGCTG GAATTCATCA AGGATGTAGG AGCCAAGTCA AATGTTGACC 4080
CCACCCTCCT CCTCCATTTT AAGGCCCCTT CAAAGCCAGT GAACGGATCG AGTTCAGTTT 4140
TGCCAACAAA GCCTGCCATA CTGCCCTTTA AGGCTCCAGT TTGGAGGTTT TATAACTGCA 4200
CAAGCTTTGA TTTGGGGTCA GTTCTTCAGC TACACTGAGT TCCATCAGTT TGAGGAACCC 4260
TTCTGTGACA AATCCTTACC ATTCCTTTGC TCAGAGTTGG TCTTTTTCTT TTGCGTGACC 4320
CCTCTGACAT GTCCCATAAC CAGCTCTGAA AACATAACTT ATTTCCCTTC CAAGAAGGCC 4380
AAAACAGAGC AGCCACTGTG GCCATCCACA CACATTTCCC CTGACATTTG CATTGCCCCA 4440
TAGACTCCTT GGAATGGCCA GCAGAGGGTG GCTATCCCAA GATACATAGA ATCACGTTTG 4500
TCAAGACAGC ATGCAGGAGC AGAGGCTGGG CATGCAGGAG CAGGGGCCGG GGAGACAGGA 4560
AACACAGAAG AGCCGCACTA GGGCAGAGAA 4590