EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-00455 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr1:138032920-138037390 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr1:138035641-138035652AATGACCTTGA-6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:138034857-138034875GGCAGGAAGGAGGGCAGG+6.76
EsrraMA0592.2chr1:138035642-138035653ATGACCTTGAG-6.02
EsrrgMA0643.1chr1:138035642-138035652ATGACCTTGA-6.02
LEF1MA0768.1chr1:138035003-138035018TCCCCTTTGATCTTG-6.63
NR2C2MA0504.1chr1:138033942-138033957TGCCCTTTGACCCCA-6.87
Nr2f6MA0677.1chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.46
Nr5a2MA0505.1chr1:138035641-138035656AATGACCTTGAGCTT-6.53
RXRBMA0855.1chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.8
RXRGMA0856.1chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.46
RxraMA0512.2chr1:138033942-138033956TGCCCTTTGACCCC-6.73
Sox6MA0515.1chr1:138037335-138037345CCATTGTTTT+6.02
Tcf7MA0769.1chr1:138035006-138035018CCTTTGATCTTG-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036000-138036021CCTTCCTTTGGTCCCTCCTCC-6.22
ZNF263MA0528.1chr1:138036013-138036034CCTCCTCCCTCCCTCTCCCTC-6.43
ZNF263MA0528.1chr1:138036045-138036066TTCTCTTGCCCCTCCTCCACT-6.4
ZNF263MA0528.1chr1:138035988-138036009CCCTCCCTCTCTCCTTCCTTT-6.72
ZNF263MA0528.1chr1:138035984-138036005TCTCCCCTCCCTCTCTCCTTC-7.16
ZNF263MA0528.1chr1:138036042-138036063CCCTTCTCTTGCCCCTCCTCC-7.73
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02721chr1:138030318-138061695HFSCs
mSE_03461chr1:138027478-138034626Bone_Marrow
mSE_03461chr1:138034684-138035542Bone_Marrow
mSE_03461chr1:138036579-138037416Bone_Marrow
mSE_04183chr1:138032756-138034579Cortex
mSE_04183chr1:138034617-138037628Cortex
mSE_07308chr1:138029879-138035516Intestine
mSE_07308chr1:138036408-138037452Intestine
mSE_10895chr1:138031105-138034623Olfactory_bulb
mSE_10895chr1:138034628-138037668Olfactory_bulb
mSE_12032chr1:138027259-138035645Spleen
mSE_12032chr1:138036436-138037602Spleen
mSE_12949chr1:138027947-138035722Thymus
mSE_12949chr1:138036419-138037578Thymus
Enhancer Sequence
GACCTATTGG ATGCATTGTC CCCATCTCTG GTGGGCTCCT TCATTTACCT CCAGCTTTTC 60
TCGGATATGG GAAAGAGAGT GTACTATGGT CCCTATCCCC AAATGCAAGC TACCTGTCCT 120
CTCTCTATGC TAAGCTGTCC TATTTCAGGG AGGTGCACTT CACCAGAGAG CCAGCTGCCT 180
GAAAACTTGC AATAGGGAAA GGCAGCAGGA CCAGTGTGGT GGAGGGAGGC TGGCTGCCCT 240
CCATCCCAGC CAGCCAGCCA GCCAGCTGCC TGTTGCTTGA CATTCCTCAG CTGGGGAGTG 300
TCCCCTGGGC CCAGCCCCTA CTGAGCTACC CCCTACCAGA TGCAGATGCC GGCACAGCTC 360
TGGGATCTGG GTTACGCCTG ATGCTTCAGT GTCTCCCGTC TCTTGGGAGG TCATGGAAAA 420
CCCCTACCAG ATGCCCTGAG ATGGGGGGTG GAGGGGCAGA GAAAGCATGG CTGAGTGGCA 480
GTTCCCTGAG ATGGACTTGC CCTTTTTCAC AGGCTCCAAA GACAGAGGGG TCAGACCCAA 540
CTCCATCTCA GGAAGCGCCT GGTGCTGCTC ACAGCATGGC CACTGGGCTG GCCAATCACA 600
GGCTGGGGTA TCTCCCTCAG ACAGGGGCTA GCCTTCTCCA AGCCTCCTCC TGCTCTCTGG 660
CTTCTGACAT CTCATTCGTC TGCTTGCTGC TTCAACCCCA GCCTGCTGTC GGTTCTGTTC 720
TGGATTGTGG CCTTGACACC GAGGCCACAG AAAACGAGGT TCGCCTGGTG AAGGTGCCTC 780
AGAGAAGGTG TCCTCTCTGT TTCTGCTTCT GAGTATGACT CAGAGCTCAG TGGCCAGGAC 840
TCTAGGATGA ACTGAAAGTA AAGTTGAGGA CATTCCCTTT GGAGGGGGTG GAGTTAGAAC 900
CCGAGACACC CCAGAGGTTG TTGTGGAGTG TTATGTCCCT CCCCATGATC TCAGAGGCAG 960
AAGTCAGGCA GAGAGTGTTG ACCGGCCCTT TTCACCAGGT CTGCCAGAGC CTCGTAAATC 1020
CATGCCCTTT GACCCCACAA TATAAAGCCT TCTTGTTTGG GGGTGCAGCC CCATCGTTTC 1080
CCTGGGGGCA ACCACAGGAG GGCTGGGCTC CAGATGCCTA TGGGAAGCCA GGGGAGGTTC 1140
CAATAGGCAA ATAGTGATAG GGTCCTGGTG GCTCTGCTCC TAGTATACCT GGGATTTCCC 1200
TCACTCTACC GAAGAGTTAG CACCCTGAAT TAGATCTTGC CGCCCTGATG GAGAGAACAC 1260
CAACCCTGTG GGAAGATGCC TTGTCTCAGC AAAGTCAGTT AAAAGCCAGA CTCCCCTGAG 1320
GGAGCAAGGA TTTCGCTTCT AGCAGCCTTC CCCAGAGTTG GCAGGTTGCC AGGCTGCCTA 1380
GGAGAAGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT TTGCACGCAC ACACAAGCAC 1440
GTGTGTTTGG GGGGGTGAGG GGGTGCTACA GAGGGCAAAG GAAGCCTGCT TTCTACAAAT 1500
GGCCCAGCTC AGCCTCCTTA GCTACAAAGC TTGGAAAATG CTTTCCCTCC AGGCAGGCAG 1560
CAGGCAGCAG GCAGCAGGCA GCAGGCAGCA GGCAGCAGGC AGCAGGCAGC AGGCAGCTGT 1620
TGGTGGGATC AGCAGGGATT CTAAAGGGAT TGGTTTCCTC CAGCCTGACC CCTATGGCCC 1680
TGTTTAGGGG TGCCCCCCCC CCGCCGCACC CCCCCCCCCC GTGACTGGGC ACACTCTTGA 1740
GGAGGCTGCT TCAAATTCCG TCTGCATCAT TGTAAATTGT GGGGACTCTG GGCTTGTGCA 1800
ATGTCCCCTT TGGGATTTCA GTAAAATGGG GCATGCATCC CTCACCCCAT AGTGTTGTGA 1860
TAACCCAAGA GTGCATGTGG CACCCAGGTT CTCAGATGCT CTGTTATGTC GTCAGATGAA 1920
GCTAGGGAGT GAGAGGAGGC AGGAAGGAGG GCAGGCCTGC TACTGCTACC CCCAAGGAAT 1980
GATTTCCTCC GCTCTCAGGC TTGCCCTTCC AGGATCCAAC AATCTTTACA GGCAGGAAGT 2040
TCTTTTTGCT AGCTTATCTA AATCCCTGTG GCTGTGGCTA AGTTCCCCTT TGATCTTGCC 2100
CAGTCTCTGC TGAGGAAGAG CGGTGTCCTT GGCAGGTCAC ATAGCTTAGC GAAGTGACTG 2160
TATGAAAGGC AGTCTGGAGA CCACGAGGGT CCTCTGGGTC CCTTCTGTGT CTCTTGCATC 2220
CGTGAGCCAA ACACGCACCA CGAAGAAGAC AGCAGCTGGC CTTTCCCTCT GCCCCACCAC 2280
CTGTGGTTGG AGCTAGGCAT GGGGATTCAG GCTGGGCACG AGGAGGAGCC AGCGGGTCTA 2340
AGCTGCCTTT GGTTTCTATC AAGCTTGGAT ACAGTACAGC CAGATGCTGG GTGATAGGAG 2400
TCCTTTATGG TCCCTCTGGA GCTCTCCCAC CAGCCCCCAA GGGCTCATTC TCAACATCCC 2460
AAGGGACTCC TTACAACAAG ACAGACATGC TTTTAGCCCC ATGAAACTCC TTCCGAAGTG 2520
TCTATGTTGA TTATTGTGGC CATCTGAGGG GTAACTCTAG ATCAGGCCTC TGGTTCCTGA 2580
AAGCCTGGGG GTAGAACTGG GGAGAGAGTG TCTCTCGGTC TAGAATCCCT CTAGTGCAAA 2640
TCTTACACCA GCTAGTGTTT GTGTGCATGC TAATTTTGTG CAAATCTCAG GAAAAGGCAG 2700
CCTCTGGTTC CTTATCAGTC AAATGACCTT GAGCTTGGGA CAGGATAGAG ACAAATTGCT 2760
CCTCACTGGC TATGTGATAT ACTATACTGT GGTGGCCCAC CGTGGGCAAA GTGATGGATG 2820
GTATCTATCA AGAAGTTGTC TCACCCCTAA GTACTGATGT CTACTGTACT GGGTGAAATG 2880
AGTTCCAGGT AAAGCCTCAG GTGCATATTT TACATATCAA AGCAGACCTG GCCTCCAAGT 2940
TCTCCCAGCA TCCCTCAGTC CCTACCTGGC ACACCCTTCC CCCAACCCTG GTCTTTCCAG 3000
ACCCTTCCCT CAGGAGGCTC TTTCTTATAT AATCCAGACA TTTTGCGCAC ATGCTCTCTC 3060
CCTATCTCCC CTCCCTCTCT CCTTCCTTTG GTCCCTCCTC CCTCCCTCTC CCTCTCTCCT 3120
TTCCCTTCTC TTGCCCCTCC TCCACTTCCC ATGGTGACTT CCCTCCCTGG CCTTGGTCCT 3180
TGGGGCCAGT GAACTCATCT GAGAGTAGCT TCCAAATAAA CCTGCCTTTA TTATATTCTA 3240
ATCCGGCTTG AACGGTCTCA TTTCACTGGC AGAGAAATAA CCTATCACTA AGGACCAGAG 3300
AGATGGCTCA GCCTGTAAAA GTACTTGATG CTAAATCTGA TAACATAAAT TAAATTCCCA 3360
GGACCCAAAT AGTGGAAGAA GTAGATTCCA GTGGTTGTCC TCTGGCCTCC ACATGTGCAT 3420
CCTGCCATAC ACACACCTTC ACAGGTTTAT TACATGCATG CATCCATACA CACATACAAA 3480
CATAAAATGC TTTGAAAAAA AAGTTTCTGG CTCTGGAACA GCTCTTGGTT ATTTTAATGT 3540
CACCGCCTGT TACTTTTCAT TAGCAGAAAG TCTTTAAGTG TAAAAAGCTG CAGCCTTGGA 3600
GGTCTTGAGT GAGGAATAGG GGAGAGTCCG TTAGGAACTC TGGGAGATAC CTAGCCGCTA 3660
GCTAAGTAGG TAAGACTAGT TTTACCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAACCAC AGCCAACCCC 3720
CTAGGAGCCC AAAGTCACTG GGCGGAGCTT CTGGGAGGGG TGATTGGCTG CCTTTGTGTG 3780
ATGTCACTTG AGGCCCTAAG GTGAAGCTCC GCCTAAACTT TGGTGGCGAC TGTTGGGTCT 3840
CTGGCACGTA CCATGGCTCA CCTAGCCATT ATGCTCTGCA GAAAGCGAGT TTTGCCCTTG 3900
GCAGTCTCTC AGCAGCCCCT GGCCTGCCTC CTCGCTGTGT CCTCTGCCCT TCACTTTGCT 3960
ACGGCTCAGT CCGGCTCCTG ATGAGCCAAA GAACCGCTGA GCTCAGCTCT TCCCGTGGCC 4020
CTAGGCTCCG GCTGGCTGCC TTTGTGCCCG CCTCGCCCGC CTTTAAGTCT CTCGGCTGTG 4080
GCTCATCGCT GCGGGGGTGG AGGCGGCCGC CCACATCACG CCAGCCACTG TTCGCTTGTG 4140
AGCGGAGGAA GCGTGGTGAC CTCAGCCACG GTGCCAGATC CTGCCTCTGA AAAGCCTTGG 4200
CTGCGCCACC CTGCCTGCCG TTTGCCAAAT GGCGAATAGT CCGGCTCTGT TCAGCGAGAT 4260
TCCGGGGGTG GGGGGTAGGG GCTTTCGGAG AGAGGCCCTA GGTCCTCCCA ACAGGGTGGA 4320
GAGAAAGGAT AGAGGGTCTT CAGTGAGAGT CACAGTTAGG CTACCAGCCT TCATTGATAA 4380
TAGGCAACAG GCTTGCCGGC CATAGTGTGC CAATTCCATT GTTTTAAATG TTGCATCTTT 4440
CCGCTTGCAG ATTTTCTATT TTAGGGTATA 4470