EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM061-00223 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forelimb_bud_embryo 
Coordinate
chr1:74073290-74080160 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EN2MA0642.1chr1:74074169-74074179CCCAATTAGC+6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:74074332-74074350GGAAGGAAGGCAGCAACA+6.38
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:74077828-74077846GGCAGGAGGGAAGCAAGG+7.12
Foxd3MA0041.1chr1:74079224-74079236GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:74079228-74079240GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:74079244-74079256GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:74079248-74079260GTTTGTTTGTTT+6.32
KLF16MA0741.1chr1:74077820-74077831GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:74077821-74077831GGGGCGGGGC-6.02
Nr5a2MA0505.1chr1:74079286-74079301GCTAACCTTGAACTT-6.41
RARA(var.2)MA0730.1chr1:74077843-74077860AGGTCAACCCAAGGTGA+6.37
Rarb(var.2)MA0858.1chr1:74077843-74077860AGGTCAACCCAAGGTGA+6.33
TFAP2AMA0003.3chr1:74074764-74074775TGCCTGAGGCA-6.02
Number of super-enhancer constituents: 13             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04782chr1:74072810-74075319E14.5_Heart
mSE_04782chr1:74075350-74079221E14.5_Heart
mSE_06599chr1:74072267-74084210Heart
mSE_07441chr1:74072807-74075058Intestine
mSE_07441chr1:74075421-74076551Intestine
mSE_07441chr1:74076673-74078422Intestine
mSE_07953chr1:74072239-74084330Kidney
mSE_08338chr1:74068365-74079251Liver
mSE_08338chr1:74079256-74084202Liver
mSE_08946chr1:74072260-74079304Lung
mSE_08946chr1:74079381-74084303Lung
mSE_09385chr1:74072286-74081059MEF
mSE_12598chr1:74073647-74075086Testis
Enhancer Sequence
GGGCTCAGAC ATGCTGTAAC TCCCTCACCC TCAGCATCCT CACAGGGAAA GGGGACTGAT 60
GGGAACCACT CTGCAGACTG GCTGGGAATC GTTATCGAGA TTGTGATCAG GCTGAGGGTG 120
TAGCTCAGCT GTGGAGCACA TGCCTTACCC ACCCCGGAAA GCGTCAAGAT GAAGTCGGCT 180
GAGCTTCTCA TCTGTAGGAA TGCCGGGTAC ACAAAGCAAC AGCGCTCTGT GTGCCTCAAA 240
GCTCTCCACT GACTCCTCTC TACCCACTGA TCCCCAGCCC CACCCTGTGA TGTAAGCCCC 300
ATGGCCAGCC CCCTTTTATG GAAGAAACTG AGAACCTGCA GGACAGAGAA AGGAACACAC 360
TGTGAAGAGT CTCATCCAGG CTGGAAGGAT GGCTCAGTGG TCAGACATAC CTGCTGCTCT 420
TGCAGAAAAC CTGAATCCAA TTCCCAGCAC TCGTGTGATG GCTCACAACC ATTTATAACT 480
CCGGTCGTAA GATATCTAAT ACCCTCTTCT GGCCTCCTGG GGCACCAGGC ACGTACACGT 540
GCACAAGTAC ACATGTAGGG AAAACAGTCA TACGCATAAA ATCAAAATAA ATAAGCATCC 600
AAAGATCCCA TCTACCTGTC AGTCAAAAAC AACTGTGCAA TGGCACTCCC CATCAACACC 660
CTGACCTCTC TTAAGATTTC CACTCTCGGT GTAGCATAAG CTTCAGTTAT CTGAAAATCA 720
TTTCTGCAGA AATTTCTGAC CCACGGATGG CAGGGACACA GAGGTAAACA ATGGATGGCC 780
CAGAGCCCCG GAAGCAGGAG GTCCCTAGGG CAGGGCAGCC CAACCTCACG AATCGCCTCT 840
AAGACCATCT GTGGCAAGAG GCAGGAAACC CTTCTTGCTC CCAATTAGCC AGCAACAGAG 900
ACTTGAAGCA GGGCCAGCCT CAAGGCCGGA GCAAGCCTGG CTGGAACTAG CATTGTTTGA 960
CTCCGCGTGA CGCATATCCA CTCCAGTCAT GTTTCCTTGT TCCCGGGAAA AGCTCAGGGC 1020
TGCACACAGA CAGGGAGTCA AGGGAAGGAA GGCAGCAACA GACCTGGCTC TCGCTGGCTC 1080
AGACAGCAGG CAGGTTAGAG AGGAGGAGAG AAAGTGCCTA TCAGATAGAG ACACCCACAG 1140
ACAGCACAGC AGTGACCACA CACAGCTCCC GATGCCCCAG GCGGTACATA CTCCACACCC 1200
AGCACACGCA CCACACCACT TTGCCAGATG CAAAATCACT CCCTAGCCCT CTGGCTTCAC 1260
CCCAGAACAG ACCCATGAAG GCACGGCCAA CACATCCAGC TGCCTGTATG ACCTAGAGCA 1320
CTGAAGGGGC CAGAGCCAAG TGTGGCGGGA AGCCAGATGT GGGAAAGAAG TAGATGAAAG 1380
CGAACTGGAA TCTGAGGGTC CTTGAAGCAC CATTAGGTCT CTGCACCCCT ACCCCCCACC 1440
CCCTAAGATG TATAGGAACC AGGCCCTGTA TTGGTGCCTG AGGCAGTAGC AAATTACCCT 1500
TGAACTTGAA CTTGATGGTT GCCTGAGCCC TGCCTATCCT AGAAGCACAG AAGGGTGAAT 1560
GTTCACACGA ATGCACTCTC AAGTGAGCAC ACGTGCACAC ACATACACAT ACACGCACGC 1620
GCACGCACCG AGGGCTGAAA GTGTCAGAAC CAGCAGGGTG GGGCTAACTG GAAGGTAAAC 1680
AGTCTCTAAA GTATGGAGGC ACCAAAACAA CTATTTTAGT ATCTGGATCT ACTGGACATG 1740
TGATTCTTTT TTAAGTCAAC CGAGATTCAA GTGATTCCCC CTTTTCCACA GGAAGTCACT 1800
CAAACTGAAT TAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAGAGTG TGTTGTCCAA GGTCGCACAT 1860
CTGGGAGGGG CTGAGGGAGA CACAAATCCA GAAGTGCCCT CGAGCAAATC CACTGCAAGT 1920
TAGATGCAGC TAGCTGCTAA ACCAGGGAAG GGGTGATAGC CCTGATGGTG GGTGGGACCA 1980
ATACAGATGG AATCAGAGGG AATAAGGAGG GGGTGTGGCC GAGACATGCA CACAGACAGG 2040
ACACTCTACT CAAAAGGAGG GGTTGGGAGG GTGGGTTCAG CGACTGTGAT TCAGCAACCT 2100
CTGGGAAGCA TGTCCCATGT CTAGGGGCCA CCTGCCCTAG AGACATCAAA CCGTTACTCA 2160
CAAGTTACTC ACTTTGCCTT GGCATTCACC CTGGCAAGCC AGCCGAGCCT CCCACTCTTC 2220
CCCTGAGAGT GACCATGGAG AAGCCAGAAG ATCCATGGCT CCCCTCCCTC TAGCCAGAGC 2280
ATCCCCACCT GAGTCACAGG GACACGCCAG ACTTTGGCCT GCTCCCACTA ACAGCTGCTT 2340
CCCTCTGCTC TGTTCCAAGA AACAGATGCC TTAGAGGAAT GGTCACTGTC CCCAGACACA 2400
GAGCAGCCCA ACCCAGAAGG GAGCTTCCCA GCACCTCTGC CAACATCCCA GCGGATGCTG 2460
GACGATCCTT GAAAGCCTGA GCTCAACAAG ACAGATCTTC CCAGGCACAA GAACGGGAGC 2520
CTACATGCAG GAAGCTCCAT GGCTAAAAGA GAGAACTCTG CTAAACCCAG TCTCTCATTC 2580
CACGGGTAAG GCTGATGATG CCCAGGAAAG GACAGACAGA CAACTGCCCA AAGCTACAAT 2640
GTCAAAGAAG GCAACCGCCT CCCAACACCC TGAGCTGTTC CACATCACTC AGCAACATCA 2700
CCTCCCCTGA CTCAGATAGG GACAATCTCC CTAAATCTAC TCTCTCCTCA TCACAGAGCT 2760
GCCGTAGTCT CCACAGTGAG CAGGGTAGCA ACTCAGAAGG AGAAGAGGCA GGTTAGAGAT 2820
GCTGTAGCCA GGCCAGTCAC TAAGAGAATT GGTGCTCAAG CTAGTACCAG AGGTAGGAGA 2880
CAGAGACAGG ACCTCTGGTT ATCAGACCAG CCCCACTTTT CTAGTCCCAA GTTCATAGCA 2940
CAGATAACAC AAGGAAAGCG CTGGCTGGTG TGTTGAGTAA GCTGTTGTCC AGAGGTTGCC 3000
TCTGCCTGTC AGAGGTAGAG TCGGGATTCA AACCTGCACA GTGGGGCTGC AAAGCCTGTG 3060
ACTTAACCTC AAGGCCACAC CACCTTATTA TAACCCTCAG TCCAAGAATC GAGGGTTCCT 3120
GAGATGTCCT CTCCTCCCTC AACATACAGT AACCTGAGCA CTTGTGATGT GCTGGCACCA 3180
AGCCTTTGAG ACTCTCAACA TTCCTCCTGG CTTTAAACAG ATGGCCCCTG TCCCCACACT 3240
CACCAGCCAC CTAAAGTCAG GCTGGGCACT GCTGACTTCC AGTGGACAGG CTCCTCCAGA 3300
CTAAGGGATA CCTTTGACCA TTTATTCAAC CAACACACAG TGGGTCTACA GTATTCTGGG 3360
ACCCACAGTA AAAGATACTC CCTTAAAGAG CCTCTTGGCA CCTTCGATAT GTGAGCTGCC 3420
TGCCCCCTCA CTCCACCTCC ACCATCACGG CTTATTAAGA AGCCTTGTGT GGGGAGGGAT 3480
CCCACAGTCA GCAGGCTCTG GTCTCAGAGC ACAGGAAGAA AGTTCGGTGG GTGGGAGAGG 3540
GCACATTAAC ACCAAGAAGG TTTCCCAGTC CCAGGGGTTA AGGGCACAGG TGCCAGACTC 3600
CAGGAACACA GGTCCTGGAT GGAGTTTATC CCCAGAAGTC CCCTGTCCAA CCCCTTCCTA 3660
TACCAAAACC TCATCCTGTC TCTCCTAGGT AAAAATCCCT CTGCTACTCC CAACTTTGAC 3720
TTGGCCCAGG AGATCTCTCA CCCTTGACAC CCAAGCAAGG CCTCTGGGCT CTCTCCAAAA 3780
CCACTCTTTG TCACAGGTTT CCTCGCTAAG CCTCATTTAC TGTACCAAGC ACTTTGCACA 3840
CAGAATTTGT TTTAACTCCC CCACAGCACA CAAGGCTATG CTGGAATGTG GACCTCATCT 3900
TACAGACTCA GTGGGACACT GAGGCCAGGC CAATGTCACA TGGGGTGTAA GTAGCAGAAA 3960
GACAGAGTCC CTACATTACC CATCCTTACA TGCACGCCTG TCCCATACCT GAACAAATGC 4020
CTCTGTAAAA CTCCTCCTCA ACCTTCAAAG CCCATCTCAA AAGGTTCTTC CTCCCGGAGG 4080
TCTCAACTCC TCCACCAGCT CACGGAACAG GCTTCCTGCA TCCCATCCCA TCCCTCCCTT 4140
GTTTTTTGTA GAACTGTCTA CTCCCCTTTG TCTCCAACTA GAAGGTGTCT CACTGGCCTT 4200
TCCAGCCCCA TATCTGGCAC CCTGCCTGGC ACAGAGTGGA TGCCCTAAAA GGCTGTTAAT 4260
GTGAAATCAG AATGGCCCCC AGGCCCAGCT GGATTGGCCC TGGCTCCCGG CCTCCTCAGC 4320
AGGCTCACAG GCATCACTGG ACCCAGAGAG CCAAAGCCAG AAGCCCATCT CCTCCAGACC 4380
CAGATGGCAG GCAGGCCGCC AGGGCCCTGG TCTCATACTC CCCCTCCTAA GCCCAGCCCC 4440
TCTCTGCTTC ACCAGCTCTG AATCTGGGAG TCTCAGCCAG TGATTAGGGC CCTAATCAGG 4500
CAGGACTTCC TGCCAGCCAC TGCCAAAGGT GGGGGCGGGG CAGGAGGGAA GCAAGGTCAA 4560
CCCAAGGTGA AGTTTCACAG CCAGGGACCC AAGGAGCTCC ACACCCCCAC TGGTAGATTC 4620
ACTTTAGCAG CCTCCAGCAC TACTCCAGCA CTACTACACT GCTCCAAACC TTTGACTGCT 4680
AAGAAAGGAT ACTGAGACCC AGAGAGGGAA GGGACTCAGC TGTGCGGGAG AGAGAACCAG 4740
GCCAGCCTGA GATCTGTTGG TAAGAAGAAT ACCATTCCTG CACAGCCTTG GGTCAGAGGG 4800
CCCCAGGGTG GAGACCCCTT TGTACTTCCC CTAGAGCCTC AGACATAGCT CTGTCCCCTG 4860
CTAGCACCAA CCCTGGCACT GAACCTCAGC TCACTCCCTG AAGAGCGGTT ATGGGCCAGC 4920
TGATTGCCTG GCCTCCTGGA GGATGTGTTC AAGGTAAGGC CACTTCTCAT CTCTCAAGGA 4980
TCAACAGTCT AGAAGGGCAG AGGGGAGCCA GGCTGAGGAG GGAAGCCAGT GAGAGTCCTC 5040
CCAGTAGTCA TCATGATCAG CCTACAGCAT ACTTCCTTCA AAAGAATCTT TAATGCTTTC 5100
TGCAGCTGCA ACTGGGCGGG CCAGGGGTCC GGAAACGGTG GTCACCCCTG ACCCAGAACA 5160
ACCTCAGCCT CCTGGGTGGG GATCTCTGGG TAAAAGAGCA GGCCAAGAGG CTGGTCCTTG 5220
GTGGAGGAAT GTCAGAGTCA CTAGAAAGCC ATGGACCCCA AAGAGGGTAG AGGCCTGAGA 5280
GGGAATGGAG TGTGGCCAGG AGACCTACTG ACCAATCTTC AAAGCTCTCG GCTCTTATGT 5340
ATACACAGAA AGGGCTTGGG TGGTTATCCC CACCCCTTAC CAACAAGGGA CTGAATTAGA 5400
TTGTAGAGAG AAATGCCAGG TAGACTTCAA GGAGCCCTGG AGGGTCTAAG CCAGCTCAGT 5460
GTTTACTTGG GAATGTCACT CTAAAACATA AATGCCATTC CTATGGCTAC AGTCAAGGAT 5520
AGCCTGTTTG GAGGGAGGCT GACCAGGCCC TTGCCAGGCC TGGAAGGTCC TAACGCAGGC 5580
AGTGGCTGTC TGAAGGGTGG GAAGGGATCC CAGAGGGACT TGCGATGGCA ACTTTCTCAG 5640
AGTCCGACAT AAACACATAT CTGCTCCAGC TCCCTGGGGA GACAAGTCTG AGGTCCCCTC 5700
AACTCCAGGC CTGCCTCCTA ACTGCAGACA GAAGCAAAGT TGGGAAAGGA AAACACTGAT 5760
ATTAGCAGCC CCTAAAGGAA GCCTGTGGAA GCCTGACCTA CACTCTCGAT CCAGGATAGG 5820
GAAGTCACAA CTGTGATGAA AGAGAACAGG ACCAGTAAGA GGCAGCAGGC TCCGGAATGA 5880
ATGACACCCA CTGACAAGGA TTACCTTTGG CTTCTCTGCT TTGGATGCTT GCTTGTTTGT 5940
TTGTTTGTTT TTTTGTTTGT TTGTTTGTTT TTGAGACAGG CTTTTGTGTA TCCCAAGCTA 6000
ACCTTGAACT TACTTTATAG TCATAGATGA TCTCGAACCA CTGATCTGTA GCCTCACGAG 6060
TGTTGGGATT AAAGGTTTCT ACCACCATGC CCAATTTACA CAGTGCTGGG GAAAGAACCC 6120
AGAGTTGTGT GCATGCCATG CAAGCCTGCT CCAGCTGATC TACATCCTAT ACATCAAAGC 6180
ACTTTAAATC AATGAATTCA TTTAAACTCT ATGTCCGTGC CATGAGGCCT ACTGTTCCAT 6240
TCTAGAGGGG AAACTGAGGC GAAACCTAAT CACTTGCTGA GAGCACACAG CTAGTAGATA 6300
GGAATGGCTG CCATGGTAGG TCTCCAGCAG GCTGGCTCCG GCTTCATGCC CTCCCTCTGC 6360
CTTGCTCCAC ACTGCGGAGG AAAAGCAGCA TTGTGTGTAG GCTAACAGCT CTTCAGCAGG 6420
CCTGTCCCAA ACCCTCAGTC CTCCAGCCTC AGTTGGCACC AAAAGCCTCA CACTGAACAG 6480
TCAGGGAGTG CCAGTGCAGC CAGATGACAG CAGACACGGG GGAGCGAGAA ACATTTGCAG 6540
CCAATGAGGC CCACATTCAT TCCAAGAGAA GGCAAAGAAG GTCCCTGGAG GAAGCTTCCA 6600
ATGGCAGAGA GTGGTGAGCT CACAGAAGGC CTCCTGTGGC CCTCATCTGG TCGGATCCCT 6660
GGATCCACCC TTCTGCACCA GTCCCTGGCC TGAGCTGGAA CTCAAAGCCC TAAAAAGGCA 6720
GGGAACACAC AGCTTAGCAA GCCCTGCAGG AGGAAAGACC GGGGACTGTC CCTGTCCCCT 6780
CTCCTCACAG TTCCAACTCC TCTAGGGAAA CAAAGGTGAG GACAAGAAGG CAGATGGCCA 6840
AGGGCCACAG CCTAAGCAGA GAACCAGCTA 6870