EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM060-03739 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E12.5 
Coordinate
chr6:88873750-88877400 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr6:88873892-88873909GTCTTTGTTTATTTGCA-6.19
KLF4MA0039.3chr6:88874613-88874624CCACACCCTGC+6.62
MYCMA0147.3chr6:88875007-88875019GGGCACGTGGCC-7.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:88876061-88876076TGACCTCTTGGCCTC-6.81
RARAMA0729.1chr6:88876058-88876076CCATGACCTCTTGGCCTC-6.64
RarbMA0857.1chr6:88876061-88876077TGACCTCTTGGCCTCT-6.52
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04779chr6:88874060-88876671E14.5_Brain
mSE_09716chr6:88873744-88876119MEF
mSE_09716chr6:88876326-88879400MEF
Enhancer Sequence
TAGCAATCAG CTGCAATTGT GTAGTTTCCT CTAGGCATAA GAGTAATCTG GTTGACTATC 60
TGATAGTCGT TTTGCTCAGA GAAACTAGGG AGGATCTAAT AGCTGCTAAT TAGGGAGTCA 120
AATTGCTCTT CTCCCCCCTA GTGTCTTTGT TTATTTGCAG GAACATGAAC ATCAGAGGGG 180
TGTGCTTACA GTAAGAACCT AGAGAATTTA TAATTAACAA TAATAGTGAT TTTTAACAGT 240
GCCCAGCACC ATCCCAGCAC TCGAGGGTTA GTGGGGTCTC CTCCTCTGTC TCAGGCTTCT 300
CAGAACCATT GTAGCTGTCC ACCTGGTGGC TAGGGAGTTG CCACAGTGTC ATTGGCCCAA 360
CCATTTCAGT CTTATCCTGC CTTTGGCCAA AGGGAATCTG TGTTTGAGCA TAGAACACCC 420
AAGCAGGCTG GAAGGCCAGA GAGTGCAGGG AGAAGGTGAA CCTTTTCTTC CAATGGCTCC 480
AACACTTCCA GCCCATGGCA GGCAGTGACA CTGATAGGGG ACACCCAATC CTCAGGCCCT 540
GCCTGGCCAG TGGGCCTAGT AATGTTCCTG ATGGCCAAGG TATCAAGTCA GGCCCATTGG 600
TGAAGAGTTG GCTCATCTTC AGCATCTTCA GTCTTTACTG CCCTGATGCC TTGATCACTG 660
AGCTCTGGAT TTTGTTTTTG TTCATTTCTT TGCTCACTAT GTTGCACTGG CTTGCCAGGA 720
GTTCCCTTTG TAGACCAGGC TGGCCTGGAA CTCAGGCTCC TCTGCTTGAG TCTGGGTAAT 780
GCTTCCTAGT GGTGAGATGT TTGTCCCAGG TCTCAGGCCA ACTCAACCTC AGAGCAGGAG 840
CAGCTGTGGC TATGGACACA CCACCACACC CTGCTTTCCC TGGCTGCCCA GGTCACACAG 900
GAACTCCAGT GAGCTACAGC TCCTCCCACA TTTTGCTCAG GGGAAAAAGC TTCCAGGCTG 960
GGGAAAGACT TAGTCTGCTC CCACCCATGA GGCAGGCGCA GACGATGGCT GAGCAATTTT 1020
AGAGGGAGGG AGAGAAAGCA TACAGAGCCC ATTATGCAAA ACCACAGGAA AGCTTTGAGG 1080
GCACCTCCAG GAACCTCTAG CCTAAAAGAA AATACAAAAC ACTCAGACAC ACAGACACAG 1140
ACACACACAG ACACACACAG ACACACACAC ACACACTTCA AAGGATTTTA AAATGTGGCA 1200
CCAAAAAAAG ATAAAAGAAA AAAAAACCAC ACCCTTTGAC CTATAAATTC CATCTCTGGG 1260
CACGTGGCCG AGGAGAGAAT TAAGGACATG TGCCAAGGCT TAGCTTGAAG GAATGTCCCT 1320
GCAGAGCAGC CTGTAATAAC AAAATGCTGG CAACAGTCTA GACTCCAGTG AGGGAGTGGT 1380
TACATCTGCT TTGGCTAGAA AGCACAATGG CATGCTATTC AGCTCTCAAA GGACTGGCAG 1440
GGCTGTTTAC CCGGGAAGAT AAGCATCATT TATTATTGAG CAAAAAAGAA AAGCAGCTTG 1500
CAGAGGGAGG AATGTGTAAA GATTGGCATA TCAAGATATC ATCTGCTAAA GCAGAGAGCT 1560
GGAAGTACCC TTAATGTCCA ACAAGAGGGG ATTCACTGTG AAGTGACACA CAGGCTTTCA 1620
GGAGAGCCAC AGGGGTTCAA GATACATTCT GATGAAGAAG AGACTCCAGA CGGAGTGTAA 1680
TGGAGAGGTA TAACAGGCAG AGCCAAGCTT AGAGTGCATG TGTGTGTGTG TGTCCATCTG 1740
TCCTTATGTC CACATCTCTC TATATGCATA AAGAAATCTT GCAAGGATTC AGTGGGCGTG 1800
CTTATCTTGG GGGCAGGGTG GGAGCCAGGT GTGGAAAGGG ATCCTTTCTA CTACAGACCC 1860
ATTATTCCAA GTTCTGTGTG TCCTCTCTTG CAAAGTCTAC ATTAAAAACA AAAGACCAGA 1920
CAGCACAGGC ATGCGCAGGA GAGCTCCATA CAGAGGGGCC CATCCACAGG GCTGCTGAGC 1980
ACCTGCTCAT TTCCTCCACG CGTTTGTCAG AGCACCTGCA TCTGTGAGAG TTCTCAGGGC 2040
CTCCTCTGTC TAAGGCCTGT GAGAGGCTAG GCTTAAAGGG CTGGGATACT GTGAGGGAGA 2100
GCTTGGCTGT GAGCAGGGCC CCCTGGGGGG GGGGAGGGAT CTGCCTCTTT GTTCTTGCTG 2160
GCTGCCATGC TAATTTTCTG TTAGGCTACT GAGGCTACTG AGAATCACCC CTGTGACACC 2220
CTCCACCAGG AACAGAGTGA TTAGGTGTCA CAATGCTTCC TATTGAATAG AGACCCTCCC 2280
CCTGCCCCCC AGTGTGTCTC TAGGAGACCC ATGACCTCTT GGCCTCTTCC CTGCCTGAGG 2340
AGACTGATGG GAGGGGAAGG GGCACAAAGG CAGGGGCTTG ACAGTGCATG GGACCTGCCT 2400
GACTGGATGC CGCTCAAAGC AGGGCTCATG GCCAGACCCT GACTTTGGCC CTGTGTGCAG 2460
CAGCCCTCTT CCAGCCTGCT GCTCCCAATC TGCAGTTGCT CATTCATGCA GACATTTACT 2520
AAATACCTAC TATGTGCCAG TCAGTGCTCT AGGCTCTGGT GGTGTATAGA ATAGACAGGG 2580
CCCCTGTCCT CTGGGCTGTG TTCTACTAGA AATCACAGAT AACAGGCAAA TAAATAGCCT 2640
GGATGAGAAG GGGGGGGGGT GATGTAAAGA GGCTATTGTT AGCTGGGGAG GCAGTGGAGA 2700
CTAAGGCCAT AAAGGAGAGA AGATACAGGC AGAGTTGCTT CCCAACATAC CCAGAATGCC 2760
AGTTTAGGCA AAACCAAATG TTAGGACTAA ACTACGGAGT CCAGGAAGAG TTAGAGGAGG 2820
CTGGTCTTGT CTGTGTGTGC TGGGATAGTC CTCTTTGAAG GAGGACAGGT TACCTGCATT 2880
GACTCAGAGT GGAAAGGGAA CTGCCAGTGT TATTCAGCAC AGTAGTGGAC ATCCCCAGAC 2940
TCCTGGCCAT GGGTCTTCAT GGCGTTTGCT GAAGGCTAGG GTGGCTGGAC TCCCAGGATA 3000
CTGTGGAGCA GGGAGGTGGG TCTACTCCCT GGGTGTGAGT CCTGACCTCC AGCTCTAGCT 3060
TCCCCTCCCT GTAACAGGGT GAGTCTCCTG TTCTTAGAGG TAGTCCAGTG AAGGTTGGAC 3120
AGCCAGCCCA GAGGCTTCCC AGTGCAGTCT GGGGCATACT GCTGCACTGG GTACTCACAG 3180
CCCTCCCCAG CCAGAGGCCC TCTTCCTGTG ACATAGCAGA GCTTATGTAA CACCAGCTCC 3240
TGGGCAGGGT GTTGTCAGCA GTTCCAAGGA GACAATGCCC TAGCTCCCAG GGTGTAACTG 3300
TAGAGACACC CTGTGTCTGT AGGACCCGTC ATTGTGTGCT GGGTCCGTCC TTGGTGGTGT 3360
TGGCAGCTCA GGAGGGTTGT TTCCACAATG CTGCAGGCAC ACCCGAGGGC ACACTGCATT 3420
TCTGATGGTG ACTAATGGTG CCTGCAGCCT GCAGATCTCT GGTTCACTCA TCATTTGTAG 3480
AGACAGCCTT GTCCAGCTCA GGGCCATTTG GGCTTTTTTT TTTCGTTCCC CTGCAGACCT 3540
TCTGCTCCGA GTCTCCACTG TTTTTCTCCT GTGAGGCTGT TCTCTGTGCT GACCTCTCAT 3600
TCGGCTTGTG AAGGGCTGCA ATTTCCCATT TGTCATGTGA CTTTGTTTTT 3650