EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM060-03651 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E12.5 
Coordinate
chr6:36725420-36729020 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr6:36728888-36728899TCTTATCTCTC+6.32
HNF4GMA0484.1chr6:36726068-36726083TGACCTTTGACCCTG-6.22
MecomMA0029.1chr6:36728883-36728897CCTTATCTTATCTC-6.42
NR2C2MA0504.1chr6:36726068-36726083TGACCTTTGACCCTG-7.66
NR2F1MA0017.2chr6:36726064-36726077CTCTTGACCTTTG-7.52
Nr2f6MA0677.1chr6:36726068-36726082TGACCTTTGACCCT-7.82
RXRBMA0855.1chr6:36726068-36726082TGACCTTTGACCCT-8.12
RXRGMA0856.1chr6:36726068-36726082TGACCTTTGACCCT-7.95
RxraMA0512.2chr6:36726068-36726082TGACCTTTGACCCT-7.95
Stat4MA0518.1chr6:36728201-36728215CTTCTAGGAAATGA+6.69
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04074chr6:36725554-36726452Cortex
mSE_04074chr6:36726499-36727040Cortex
mSE_04074chr6:36727305-36728232Cortex
Enhancer Sequence
GGAGGCCAAG CAGTTAAAGA GTCTTTAGAA AAACTGTATT TTGATCTTAA TACTAATTCA 60
TTCCTTGCCA AAATCGTATT AAAACAGCAC ACACAAGTCA AAAGCAAGTG TGTTTCGCTC 120
TCTGGTTGTT GTGATAGAAT TTCTTGCATC TTAACCAGGA GACATAAAAT CAGTAAGCTT 180
AAATGCGAAT ATATTGTACC CAGGGGACAC ATGACACGGA GTCTTACAAA ATCACTAAGA 240
AGGGACGAAG AATCTCACAC AGCATAAACA CACAGGCAGC TTTAAAACTG AAGAATAGTT 300
GTCCCTGGGC AATGTTTTAA GTGAAGTTGT CTATAATGTG GGAAAGCTTT GCTTGTGTAT 360
ATGGGATGCA CAACGTATGC CAAGTCCGGC CCTTGAGAAG ATCCATAGCG TTTCACACAC 420
AATGCTTCCC ATATAAAGTC ACCAGAGACC ATCTGAAAAC CACTACAGAG ACTGAGACCT 480
GACCCCGGCG TTTGCGTTCC TCCCCTTTTC TCTGATCTTT TTCTCTTTTT CCCCTCCCTT 540
CCTTTGTATT TTGCCTTCGG AGGGACAAGT ATTTGCCCAG TTTCTTTGGG TTACAATATG 600
TTATCCCTAG TGGAAATCAG AGGCTTGAAT TCAAAAGGTG ATCACTCTTG ACCTTTGACC 660
CTGGTGCCTC CCACCCCACA GTTCTGTTTC CATGGAAGTG AATAGCCAAG TGGAAAAATG 720
GGAGCAGGCA GAGTCTATAG CTATTCACAG ACCACCTCAC CCCTCCCCCC CCAAAGAGAG 780
CGAGAAAGAT GAATGAATCT CATTCATCAA TAAGCAGGAG ATGAAGAAGA ATGGTCTATT 840
GGCTGAAAAG CAAGCACAGC GAGGGTGAAG AGAGAAGTCA GGGAAAGACA GGCTGAGGAG 900
TAAGGAGGTT AGTGAGCAGT GAAAGTTGCA AATTCTCAAA AGCAAAATCT CCCCGAGCCA 960
TGTCTCTGTC AGGAGAAGGC AGCTTCAAAC AGGAAGGCTT GTGACTTGGT GTACCCTTTC 1020
TTAATAAATA AATAAATAAA AATAAAATAA AAGCAAGCAA GAAAAAGCAA TACATTTCAA 1080
GGACAGTCTG AAGGCAAAGC CAGGGAACTG GCAGACACTG GTAGAAGTAG CAGAGTCAGG 1140
ACAGAAACCT GAGAAAGCCC AGTATTAGAC TTCTATATAT CTAAAAGCGA GGTACAGTAG 1200
CCAAAGCAAT CTGACTGCCA CCTAGCACGG ATGAACATTT CAGTATGCCT TGAAGCAAAC 1260
AACGAAAGGA CAAAAGTCAC CTGAATCTGG CTGTCCAGAT AAATGACCAG CAGACAGCAT 1320
AGGAACTCAC AAACATACAG AGCAGGTCAT TTCAGTTTAA GAGTATCTGT TATGGGGTAG 1380
AGACTCCAGC ATGAAATCAG TTCAAACTCA AATTTAGGGG AGTCCAATAA TTGTACAGTT 1440
ACAGCTATAG TTCCTCTTCC TCCACATGAT ATAACTATTC CCCAATGTAT TATTCATTAT 1500
GTATCTTTTT TTAAAAAGCC TAGGTTTTGT CTGTTTGTCT TGTTTATCAT ATGAACACCA 1560
GCTTTAAAGT CTTAAATACT CTAAGGAGTT TTCCTTCTAT GGGTGTCAGT GTAACCACCA 1620
CAGGCTTCAG ATAAAATACA CTGCAGCAAG AAGGTATTTT TACCACTTTT CAGTCTATTT 1680
CTCTTACACC AAAAAGACAT CACTTACATC ATGATGTGTG GAGAGGAACT GTGCTTGCAA 1740
AAGACATGTC CTCCTGCCTC CTCACTGACG TCTTCCAGCC ATATTCAAAT AGAATTCTAA 1800
AATTATTTCA CAGGAAATTT GGCAGTGGTC CTAAATGTCT GCTTGCACTT CCCTTTCCCC 1860
CTTCATCTCT CTTGACACTT TTCTGACTAC GTTTTCTAGA ACTGTCAGAT TCTAAGCATA 1920
AGAATATACA TGAAGGAGGT GATGGATTAT GGTTGGAGGA AAAAAAAATA GAGAGGCTGA 1980
CAGTCAACTT TGCAAATTCA CAAAAGCTGG ACTCAAGTAG AGACCTCATT GAATGCCAGG 2040
GTACACATAT ACTTATCTCT GTCAGGGCCA GGGAAATTGA ATACCCCAAA CATTACAAAA 2100
TGGGACAGAG CCATGAGTAT AGGAAAATCC ATGATAGAAG AAGCCATCAG AGAGTGTCCA 2160
TTGTCTTCCA CTCAGGAAAT TGAGATGAAC ATATAGCCAA GACTTGTAAT TACGCCCTCC 2220
TCGCACTGCT TCCTCTGCTC TCTCCTTCTG CTCTACAGAT TCCCATGAAA AACATTAAAA 2280
TGGGGACTCA AATGCACAGC CAAGTAGACT CAATTCTTTT TGGGCCTCCG CCAGATTCTC 2340
ATTAGGTCCT GGACGTGTGA GCCAGTGCTG ATTTCCATAG TTGATCTAGC CTAAATCTGC 2400
CCTTCCCAAA GCACTAGGCT TTGTCCTGCC CTTGCAGTCT TTAAATGGGG CTTTGGGTGA 2460
GAGCACTACA GAGGCACCCT CACTGTTCAT TATTATGAAT TTGATGGGCT CTAAGTCTTC 2520
TTCCCTGAAA GCTCTGCCAG GGTGAGATCC CGCTGGATTT CAGAATCATT GCTCCCCATG 2580
CTAAGTCTGC TTAAGAATGG GAGCTGGGGT TGGGAGGGAG GGTAGGATGC AAAATAAAGG 2640
CAGTGCTTTT CCTCAAATTC ACCTCACTTC ATGTGGGAGT TAGAGGCCAT CCGTACTCAG 2700
GAAAGGCTAA TTACATAAAT CAGATGCCCT GGCTGAGTTT CTAGTCCTCT GGGAGCAGGG 2760
AGAGCTAGGG ATAAATGAGG TCTTCTAGGA AATGAAAGGG CCCCTTTGAA AACAATGCCA 2820
ACACCAATAC AGCGTAGCTT CTCTTTGTAT TTTTTTAATA GAAGCAGAAA AATCTGGACC 2880
AAGGATAACA AAAGTAGCTG ACTTTTTATC TTTCAGAAGA TTTGGAAATC CGTACACCAT 2940
TTATTTACCT CTTCCTTGGT GTATGCTTAA GCTTTTCTTG CTCCACAACT CCTAGATTGT 3000
TCAGACATCT TAATACATCC TCAAAATGAA ATCTGGCTTA TGGTTTTCAG AAACTGTATT 3060
GGTGATCAGA ATGTCCTAAC AGTAAGAGCA GTTATTGGGT AGCCAGAGCT GGACATGATG 3120
GGAAAAATCA CAAAACAGAG AAATGGGAAG ATGTACTTCT CAGTTTGGCC ATTCGCAAGC 3180
ATGATGGCTT GAATGGGTAT CTTGTTTTTT GGAGTCTTAA AGTCCTCATA CAAAAACATA 3240
GGTTTGACAA ACACTAGTAA TGAAAACCCA CAATACCTGA TTCTAGTTTT CCATACATGT 3300
CATGAGCAGT CAGCCCACAG ATGACAACCT GAAATTCAGT CTAAGAATCA ATGGCACAGA 3360
AGCCAGCAAT TTTGAATGTC AGACTTCAAT ATTGAACTTT GATGGAATTT CATGTTTTAA 3420
GTATCTTCCT TGTGGGGAGG CTCAGTTCCT GTGAGAGTTC ATTCCTTATC TTATCTCTCT 3480
GCATTGCCAT GCCTCATACA GATTGCTTTG GAGTAAAGCA CTAAGCCATC TAATTCCTCA 3540
AAATAAAGCT TCTTTGGGGA ACTGGAAAGG CCTTTATTCA TAACGTAGTA GTAAATATAT 3600