EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM060-00074 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E12.5 
Coordinate
chr1:71661010-71661930 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:71661389-71661407CTTTACTTCTTTCCTTTC-6.04
PHOX2AMA0713.1chr1:71661218-71661229TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr1:71661218-71661229TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr1:71661218-71661229TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr1:71661218-71661229TAATTTAATTA+6.62
RFX2MA0600.2chr1:71661698-71661714GGTACCCATGGCAACA+6.04
RFX2MA0600.2chr1:71661698-71661714GGTACCCATGGCAACA-6.04
RFX3MA0798.1chr1:71661698-71661714GGTACCCATGGCAACA+6.14
RFX3MA0798.1chr1:71661698-71661714GGTACCCATGGCAACA-6.2
RUNX1MA0002.2chr1:71661404-71661415TTCTGTGGTTT+6.32
Enhancer Sequence
CCTTTAGTAA GAAAATAAAA TCTTCCAAAG GTTTTTTAAA AAAAAATTGG CTGGCTAATT 60
GACTTATTTT CCATGTTCAA AAGCCATGAT GGCATCATGA CCATGGTATT AATCTATGTT 120
GTGAATGTGC CACTCAAATG CACAGTCAGG CCAAGGCCAG CCAGCACAGA GCCCTGAGCC 180
CACTCCACTG CCAACATTTT AATTCATGTA ATTTAATTAG TATTCATAAA TGCATAGCAA 240
AATACTGCAG AGGGTAAGAG AGTCTGACCA GGGCTTTCAA TCTACAGAAG ACTGGGGACA 300
AACAATGAAC CTATCCCTAG ACAGGCCTTT GTGACGCTGT CTTTCAATTC AGAAGAAAGC 360
AAGCCATGGG GGGCCTGGCC TTTACTTCTT TCCTTTCTGT GGTTTTTCAC CCCACTTGCA 420
ATTTTAAAAA GGATTTGAAG CTGCAAGATA AAGATTTGGA TTGTCAACCA AGTGTGTTTC 480
AGTGCTCACA TATGGAGACA AAGGCTGTTT TCTAGATAAC AGTTGGAGGT GGAGATGGAC 540
TGTAAAACCC GGGCACAAAA GCCCCAAAGG GATGCATTTA CCACATTACT TTTAGCCTGT 600
CAGCACTGGG TACAGACACG CGACACTGTT TAGTAATCTT TCCGTGTGAG CAAACAGTAC 660
AGAGTTAATG CCGTGGCCGC ACTCATCAGG TACCCATGGC AACAAACAGC ATCCCAGGGA 720
AGCACAGATA GTGAAGCAGA GGAAACAGGA AAGCCTTCAT CCAAACAGTT GCTTTTTGGC 780
TTTGTGGTTT TGGAGAGCGC CCTGGGAGGT TGGCATTAAA TCCCAACTGT ATCTGACACA 840
CTCAGCTATC TCGGATTAAG ATGCTTATCC CCATCGCTAC TCAAAACTGC CACTCTAAGG 900
ATAACAGCTT ATTTTTCTAT 920