EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM060-00042 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E12.5 
Coordinate
chr1:42595320-42598740 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr1:42595477-42595488AGCTGTGATTT-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr1:42597226-42597239ATTAAGTGGTAAT-6.07
RFX3MA0798.1chr1:42597262-42597278GGTTTCCACGGCAACC-6.01
RFX5MA0510.2chr1:42597262-42597278GGTTTCCACGGCAACC-6.03
RREB1MA0073.1chr1:42598365-42598385TGGGTGGGGGTGGGGGGGGA-6.45
SP2MA0516.2chr1:42596286-42596303ACAAGCCCCCCCCCCCC+6.33
STAT1MA0137.3chr1:42595700-42595711TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr1:42595700-42595711TTTCTGGGAAA+6.32
ZNF740MA0753.2chr1:42596291-42596304CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
GTTCAAAAGC TATCAAGGCC TGTGCCCAGA TGCTTCGGGT CCAGGGCACT GGGAAGGAAT 60
AATTTGACTA GGTCCACACC AGGGTAATGG AAAGCCCAGA ATTTTACCTC TGGAATTTAC 120
TCATACTTTG TCCCTAAAGT CACATGTTCC TAAAGACAGC TGTGATTTTC GTGTGTCAAA 180
TGCAGTGACA ACATGATCCT GCCACTCCGT ACTGCCACAC CTACTGCAGT GGCCTTGCTG 240
TCCCTGATGG AAACTGAGCG CCAAGCAGCA GGTTTCTCCT GCTCCCGTTG ACTTGTTAGA 300
GTCTACCTTG GCTCAGCTTG TCTAGGCCTG GGGTTTGCAC TCAAGCATCT GTCCTTTGTC 360
CCATGACTTC CTGGAGTGGC TTTCTGGGAA AATGTCATCA GCGATGTTGA TTTCCTGTCT 420
TCTCATCACT GGATCTGGGA GGTGGATTCT CTTCACACTG GGTTTTGTTT TTTTGGTTTT 480
TGGTTTTGTT TTTTTTTTTT AATCTGAAGA ATGCACAGGA GCCTCTTGCC TTGTAATACA 540
CAGTCTGTCT CATTCATAAA ATCTTGTCCT GGAAAAAGCC TCATTCATTC CCACAGAAGA 600
GCCGCAGTTG GGAGGGCAAG GGCATTCAAA ACCTTGGGAG ATAGGAGACA ATAGCGGAGC 660
GCTTGGCAGC CGCTCCTGGG CGGCGTTAGC AACGTGTACC GACGCCAGGG AGAGGATAAA 720
ACGCTGTAGT TATTTACTTG TCTCTTAGGA GCAAAAGAGT CTCTTTGCCT CTAATATAGA 780
TGCCAAATCC TCAGGACCCA AGCGAGGAAA TGATGAGCTG TGCGGAGGAT TGGCACGAAG 840
TCCTGTGCTC CGAGATAGTG AGGCATTTTG CTTGAAAGCA TCCGTTGTTT AAAGAGAAAA 900
CGAGAATTGT GGGATTTTGT TGTCAATCAA GGGTCAGCAG CTTCCTCTCC CACTGGACGC 960
TCACACACAA GCCCCCCCCC CCCCAACACC CGGACCCTCC TCCCCCATCC TGCCAGAAAG 1020
CCAGGCTGTC CTGTTCCTTG GCCACCAAAG GCCAAGGCTT CCCTTGCAGA ATCTCAACGC 1080
AGTTGGTAAC TTCAATCTTG CCAACGCTTC CCACGTTAGT AATCACCAAA TACTAAACAT 1140
GACAAAAATT CAGACAAATA GGGCATCCGT CCGGTGTAAC TCCGTTTGCC GAGAGCCCTC 1200
CAGAATCCGG AGCACAATAG GTCTGTGTTT ATTTTTCCAC CAGTAGCATA ATGTGACTGA 1260
TTTACAAGAG TTTCACTGGA GTGGTAATCT GACAGTGATG AAGGGGCTCC TCACTAGCGC 1320
AGTCGCTCAC ACTATCATAT TAGTTGCCTC TAGCAAGGCA GTGTGGTCGA TAATTGGAAC 1380
GCTTTTATGT CTAGTGGTTC TGACAAACCT CTTCTTCAGG TCACATATGG GCGGTCTAGC 1440
TCTCTACTCA GCCCAACAGT GGCAAATACT TTAGACTGAG AAAGTATTGT TCTCTTCACA 1500
TTGTAGAGCA ATGGCAGTTC AAGGGAAGTG AGGCTGCGTG CCGGCTACCT GCTGGTGTGT 1560
AGTAAAATGA AATGGACATG ATACCGAGCC GGGAGTACAA TTAAATCTAT TTTGCACCAA 1620
TGTGTTGCTG GACAGATGAG TTTCCACATG ACAGAACTTT ATGATCTTTA AGGTAGACTG 1680
AACTAATAGA TTGGTGTGGA GCGCACTGAA GTTACCAAGG ACTGGAAAGC AGGCAGTGGT 1740
ACATTTGAAC TACAGGTTTC TCATATGCCC CGCGTCATGC TGAGTTTTTA TAGCTCCTGG 1800
CTTTCAAAAA GCCTGTTTCA AAGAGGTTTG CGCTAGACTG GGCATGCAGT TTTGCTCTGC 1860
AGATATTGTC GCTGCCGATT TAGTGGAATG CAATTAGGAA GCCTAAATTA AGTGGTAATG 1920
GAGAACCAGC TCTTGAAACT GGGGTTTCCA CGGCAACCGC TGCTTACAAT ACAGCCTTCA 1980
GTTAGTTTTC CCACTTTATC TGCAAAATGC ACAATTGAGC TTTAAAACAG CTCGGTACTG 2040
AAAAACGCAC TGTAAACAAC TGTTTGCAAT GAGAGTTTTA CACTGTCTTT AAATACAACA 2100
AACCATCACA TAAAATTTAC TTGCCCGCAC TAATAATGTG AAATCCGGTT GCGGGTCGGG 2160
TGAGGAATTT TTTTTTTAAT GTGTTATTCC TCTGTCACCA TCGGATTTAT TTTTAAGGAG 2220
AGATGTCACG AGTCATTAGG TCGTTCAACT TTGGTCATCC CTGCACTATT TTCAGCTCCC 2280
CTGACAATCT GTGTATCCCA ACAGTCCTAC ATTAAGACAC ATTTTCTCTC TCAGCACGCA 2340
GAGCATTGTC TTAAATAATT GTATAATGCT CTTTGTCAAT ATTCCTTTTT CTCTAACAAC 2400
ACTTTGTAGA TGTTTCTTGT AGTTTCACCT TTATAGCATA CTGTACACCT GCAAGATTTT 2460
CATATTTACT AATCTGGACT TTTCCTTTCT TCAGATGAGA CCAACATTCC ATCTCTCTAT 2520
ATATTTAAAG GTTAACCAAC CAGGAAGCTC TTGTGCCATT CTAACAGACA AGACAGTTGA 2580
AATATAGCAA GAAGTAGGTG TATTTTCCAC CACACAGTTC TTTGAAGTGA CTATGGGGGA 2640
TTTGCACCTT TGTAAAATTC ATTTTCTTCT ATGGTAGGGA ATCTGTATTT TATTATACAG 2700
GGCTGGCACT TTTGTTTCCC TGTGTCAGGG TTATACGCAT ACTCCCATCA ACGACCCATG 2760
CATACTTTTC TCTGCACAGG AGGAAAAAAA AATCAAATTG AGTTCTGCAA AGAGGAAAGA 2820
AGGATAGAAT CAAATTTGGG GTCTCCTAGC TATAACACTC TGTTTAATTG CCAGTCTTAA 2880
CAGGGTGATC ACTGGAACAT GTCTGGACAG AGCCAAGCAG CTGGTGGGAA CTCATGAATC 2940
CGCCACAGCC CAGAAGGTAA TGTTCCCCGG CAGTTTGTGT TCTCGCAAGG TTGGCGTATT 3000
ATACGTGTGT TATTTTCACT GTGAGAACAT GCAGAGAGAA AGGCATGGGT GGGGGTGGGG 3060
GGGGACAGAA AATGAGACAG GGGGGGGGGA GAGAAGGAGA GAGAGAGATG GAGACAGAGA 3120
CAGAGAGACA GGGAAACACA GAGAGAGACA GAGAGAGAAT AAGACCTGTT ACTCATACGG 3180
TTCAGGTGGA AGGCTACATT CTGGTGGCAA GGGTCATATC TGTGTGTTCT GCATGTTGAT 3240
GCATCAAATT CTCTGTAGCC TTGACACATG CCAGGGAGGG AGTGTGCTCT CCACAGGAAG 3300
TAGATCTCTT CAGCGGCAGC CCTCCCCCCC ACCCCCCACT GTTGGAACCC AGACTTGGTT 3360
GGGGCCTTTA TTTTTGACAT CAGCTGATTT AAATGGCACA GAGGTTTTGT TAAATACTTT 3420