EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM060-00028 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E12.5 
Coordinate
chr1:40002630-40008280 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:40003058-40003076TGAAGAAAGGAAGGAAAA+6.4
FOXP2MA0593.1chr1:40003965-40003976ATGTAAACAAA+6.14
KLF5MA0599.1chr1:40007071-40007081GGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:40007092-40007102GGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr1:40007153-40007163GGGGCGGGGC-6.02
RREB1MA0073.1chr1:40006759-40006779CAACAACCCAACCCAACCCA+6.29
SP2MA0516.2chr1:40007089-40007106AGAGGGGCGGGGCTGAT-6.56
ZNF263MA0528.1chr1:40008224-40008245TACTCCTTCCCTTCCTGCCCC-6.46
ZNF740MA0753.2chr1:40004917-40004930CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr1:40004918-40004931CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr1:40004919-40004932CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr1:40004920-40004933CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01170chr1:39953283-40014004Th_Cells
mSE_02813chr1:39989334-40025728HFSCs
Enhancer Sequence
TTTATTTTTT ATTTTTTTGT TACTCAGAAA TCCGCCTGCC TCTGCCTCCC AAGTGATGGG 60
ATTAAAGGTG TGCACCACCA CTGCCCGGCA GATCATTGAG TATTTTAAAT GGGAAAATAA 120
AACTTTATAA AAACAGTCTG CCATGTAACA GTGGATTTGA TGGTAGAACT CATTGTCTTG 180
GAACATGGTA AATCAGATGT TTTGTGTGTT GTGGTTGTGG CGATAATGCT GTCTTACATC 240
CTTTTTGAAA AAGGGATGGT ACAGAGAGAC TTGAGGATAC CATGATGCTT TTTGTCTTCT 300
CCTCAGTGTC TATATAAAGC TCCCCCAGGT CTCAAGTTGA CTCCCCACTG TTTCCTTGGC 360
ATCCTTTGTC CTGAGGTTCC TATAGCTTGG CCTTAGATGC TTTTCCTTGT ATGAGGAGGT 420
AGCTGGTCTG AAGAAAGGAA GGAAAAGGCT TGAGAAACTC AGCCAGTGTC AGATATAGGG 480
ACATCAGAAG TAACCTGTCA CCTTGCCAGC TTGTTCTCTC AAGTTAAGCA ATCTCGAGTT 540
AAATCAGTCT CTTTTGGGGT CCTCCTGCTA TTAAAAAAGG GGTACTATTT TATTTAGGCT 600
TCTTACTGGA GTGTCTTACA GAGAATCATT GAAAATGATT GTTAAACCAT ATTAAATGTC 660
TGTGCGATCT GAATTCGTGC CCTTTGGTCT CCTTGGTTTT CTCCTAGAAA GAGCTCTTAG 720
ATCCCCACCC CCTCATTTTT GAAGATTCTT GCATAACACC ACCTTTTTAG TATTTCCTTC 780
AAGTTTGTAG ATTTCCTAGG AGAGGCGGGG AGGGAGCTGT TGGTGACAGA GGCAGTGTAA 840
CAGTTCTCAC AAATCCGCCC CCTTTCCTTT TAATGATTGT CTCTGTTTCA CTGAAGTTTT 900
AAAAATGTCT CCATCCAATA TGATCAAAGT ATTAACTGGG TAAAGCAATG TAGTTAAGTG 960
GAGGTTAAGT ATGGTTAGAA AAGTAGAGTT TAAAACAAAA TCTAGCTTAA AGCTGAGTTG 1020
TTTAACTGGA TTAATCAAAG GAATCTTTTG TTTTAGACCT GTGCTGGCCT CAAACTCACA 1080
ATATGGCCAA GTCTTGCTCT TTCTTCCTCT ATCCCTCATG CTGGCTGGGG TCAGATGCAT 1140
CTCCCACTTA GGAGGGACTC AAAGGACCAG TTGTTTTTAT AAATCTTCTG GGAGCAAACT 1200
GTTCAGACAA TAAGGTTTCT ATGCAGCTTT TGTGCTTTAC AAATTACTAT AAACAGTACA 1260
TATTCTACTG CAGCAGTAAG TACAGTGTAA AGAATAAATA TTCTACCGGA GCAGAAATGC 1320
TTTTCTTTGG TTTTGATGTA AACAAAGCAC TTCATTTTCC TGATTATGTT AATGAAGAGT 1380
TGAGGCTTTG TTTTTTTTTT TTTCTTTTAT GGCTGCAGAC AGGATGGCTT GGTTTTTACA 1440
GAGAGACTTG TGAGATATTG CATAAGTAGT TGAGTCTGTG TGTCTGGCAT CGTAGGTGCC 1500
ACATCTGTCA CCTGCGCTGA GTGCACACAG CATGGATCTG GAAGCAGGAC AGGGCAGTCA 1560
CAGTTGGAAG CAGCCAGAGC TCACCTTGGT GAACTCCCTG AACCATGCTG GCCCAGCAGG 1620
TCTGTAGGAC TGGCCAACTT CGACGCTTTT AGTTAGGTTC TTGGCTGGAA AAATAGAACC 1680
AGGAGTCCCT GCTAAGCAAA GTCATTTTCA GGACTAGAAA GCTTGTGATG GGAAGTGAAC 1740
TTTTAACTGA ATGTGGTAAC CGGTGATGCT GTGACCCAGG CGATGATACC AGGGATTGTA 1800
TGTTTCTCAG TTAGAGGTGC CTCATCTTAA GGGTCTAGAC GAAATCCTGA TCCAGAATAT 1860
ACAATATGGT AGGCATCGCG TGGCGATGTG ATGCGTAATC TACGCTGGCT TCGACTTGGC 1920
AAGCCATCCA TGGCTGGCCC AGGTGGCACA GTTGATGTTC CCCCTGCCCT CCCTCTCTTC 1980
CCCTTCTGGC CAGTGAAGAT TTCCCCTTGC ATTGACTTGA AGACTTAGGA TTTGGAGCAG 2040
CAGAGACGCT TTCAAAGGAG GCACTTGTGA ATAGAGCCTC TGTCTGGCCC AGGCCCTGCC 2100
TCTCCCATTC AGCTCAGTAC AGAAGTACTT TTGATGCCAT CTGCTGAGTT GTCAGCTCTT 2160
GTCGAGGTAA AACAGCTGAA GTGGCACAGG GGGAGATTAT TAAGGGCACA ACCATCTAAA 2220
TGGGAGCCCT TTAACAAAAG TCTGGCAATA AACATAATTT CCTCATTCTA AATTGCTGTG 2280
GAGAACACCC CCCCCCCCCC CCCGAAAGCA TGTGGTACAC AAAGCTGTAC TGTTGTCTCA 2340
CTAGGACTAG CAGAGGGCTG AGAGGGTCTC TGACTTAATA CGAATTTCCT CCTCCTGGGC 2400
CCTCAGTACT TAGCCCTCCT TCTGGTGTAA TTGGAAGGAG TAGCGGAGAG GATTATGGGA 2460
AGCAGTGGTC TCTTTGATGC TGGTTCTCAG CAGTTGCTTT GGGTGGGTAG GGGCCGGGAT 2520
ATAATATGTA TGGTAATGAA TTTGAGTAGC TATCATGTAT GGAAAGATGA CAGATGACCA 2580
TCATTTGATA TGTGAGGAAA GAGGCCAGAG CAGCCAGGAT GTCTTCTTAC ACACCTGCCT 2640
TTGATTGAGA CTGGATGCTG GGTCCTAAAT CCACCTAGCC TCAGCACAGC TCCAGAGAAG 2700
GCTCAGTAAG GTGGAGAAGT GTTGCTTCTT TGCACACACC CTCAGCTCCC ACTTCAGTGA 2760
GTGGATGAGG CCCCTGTTCT CAGAGCTGCT TGCTGTAGTT AGCATGTGAG TTGGTTCGTG 2820
GTTTAAAGAG TACAAGCTCA CCCATGGTGT GGATCTCTCA CACCCTTTGG TCCCGTATGT 2880
TGGTCAGAGT TTTTTTTTAG GGTGTTGGCC ACTATATTGT TGGGGCTAGT AAAACAAAAA 2940
TTTCCATCCA GTTAATTTGT TGTAAATAGA GAAGAGCCAG AGTTACTTCC GGAATATGTA 3000
CAAGTACTTT GGGTTTTCAA CCAAGGGGAT TGAGTGAAGC AAACTTTTCT AGAGTTTAAA 3060
GCTAGTAGGT TACATTCAGA GATACGCAAA GGGAGAGAAA TATACTGGAA AATGACAATG 3120
TTTCTATTAG TCTGATGGCC TGCCTTATGT GGCACACAGT TCAGTGGCCT CCATTATGTG 3180
GCAGCACTAT GGGCATGCCT TGATTCAGAG AGGGCTCCTG ACAATGCTAA TCTGAATCAA 3240
GCCAGGTAAA CTTCTGACTA AGAGGAACAA ATTTATCAAC ACAGGTAATA CAAGGGACCA 3300
GTCAGATACA TTCAAAACAT GAGACTGTAT CAAGAAGCCA TCTACTCTCC TTGAGACTTT 3360
GTATCAAGAA GCTGGTCTGC TGTCTTAGGT ACAGAGATGT TTATCTTGGC TGCAGAGTAA 3420
GAAGGGCTAA TAATGATGGG GGTCGGGAGC CCGCTGCCCT GGCTGTTAGT ACTGTTTACT 3480
ATTAGCAAGC AGAAAGTGGA AAGAAAGGGA GGCCTGCCCA CAAAACTCAC CTCTAAGGAC 3540
ATAACTTCCT GGCAAGACTC CTAAGGTCTT AAAGCCGTCC CAGTTAACGC CACCTATGGG 3600
CATGTGTGTG AGGAGGTGTG GCTTTCACAT TTACAGCAAC ACAGTCAAGA GAAGATAGTG 3660
AGGCAGATGG CTGAAGCAAG CTAGAGTGTG GTGTGTGAGT GCAGACTGAT TGGTGGGTAA 3720
TATGGGAATC ATGCTTTCCT CGGCTCTGAT AATTGTGTCT GAAAACTGCT AGGCAGCACT 3780
CTTCCTTTTA GAAAGGGTTG TCTTGATGTC TCATTTGAAC TGGTTCAGGG AGGTCATGTG 3840
TCTTACTAGG AGAAATAGAT CAATGTTTAT GTTAGCAGGT GCTTAATCTA GACAGTAAAC 3900
AATTAGTCAT TACATATAGG GCCATGTGAC TTTTTACTTT TCTATATTTG AACAATTTAA 3960
AATAGACAAA ACGGTATTTT CTGTCCAGCA ACAGTGACTT TTGAGGCTGT GTTTAAAGTG 4020
TAGACCCAGA ATGCTTTTAA GGGACGTCCT TCCCATGTTG ACCTTTCCCC CACTTAGTTT 4080
AAAAAGCCAA AACAAAACAA AAAAATCAAA AATAGCAAAG TAAAGCAAAC AACAACCCAA 4140
CCCAACCCAA ACTTGCTGTA ATGACAAGGG TTATCTGTGG TTCAGGGCAT GCACGGGGTG 4200
CTCCTGCTGT TTCTGCAGGT CCTGGACGGG TCTCACAGAG GACTTCTGTT CTGTGGACCC 4260
ATGCTCTCGT TTTGACTGTT TCTGGGCCGA ATTTCTCTTT TGTTCAGTAA ATTGAACTAA 4320
AGTGGCTGCC TGCTCTCTAT GCTACAAGAA TTTAACATGG AAAAATAGAT CTGACAGATT 4380
GTTACCTCTA CATTCTGAGT GTGTGGTGGT GCCCTCTGGT GCTGTTAAGT GCTGGCAGTG 4440
TGGGGCGGGG CTGACATGGA GAGGGGCGGG GCTGATGGTG ATGGGTGGGG TTGACACGGT 4500
GAGGGGCAGT ACTGAGACAG TGTGGGGCGG GGCTGACACG GGGCAGGGAG GGGCTAGCAG 4560
GGGAAGATGG TGGCTGTGGT CTCATAACCT GGGAGGGATG ATGTTGCCTC AGCAGTTGCC 4620
ACTCACCTGA GTGATAAGCA TGGACATAAA TGTCTTAACT GGATGGTGGA AAGATTCTGG 4680
GGCCTGAGCA GCATCTGTCT CTGCCTCATT GAGGTCTGGC CTTGGTCTTC TTGTCTGTAA 4740
ATGTACCAGC AAGTAGAATT GACTGGGTAT TTGGAAAGAA GCAAACCTTA AGCTTCTAAT 4800
GTCGAGTTGT TGTCTGCTTT GGCACCTCCC CCTTTTCAGG GTTTTCTTTA AAAGGTTAAT 4860
ATTGCTTGTG CTTTTTCTCA TTTGTTTCCA GCTTTGGCAT CTTTGTCTTC ATTTCCCTTT 4920
ATGTTTCCTG TACTGGAATA GTGTTTCTAA ACTCTGCTTG CATAGGTCAG CCAGCTCCTT 4980
TCCACTGAGA GAGGTGTTGA CAAGGTCTGG TCTAATGAGA AAGAACTGCA GTGGTTTGTT 5040
TGAGACTCCT TTCAGAAGTG GAAGTCTGTT ATCTCACTGC ACGGTGAGCG GAAAGGGGCT 5100
GTAATTAACC TGGCTTTTAT TAGATCCTCC CGACTAATTC AGGATTAAAG AGTTTATCAT 5160
TTCTCTTAGT GCCATTTTTT TTTTCTAGCC TCTATTTTGC AGTTAATTTT CAGAATGAGC 5220
CCATGGCTTA TTTTTTGACC AATTTACTTT GGTGCCCTTG GCCTTGGTTG TGCCATAATC 5280
TGTAATCTCC AAAATAGCCA TGCTGTTTAA TCTCAGGCGT TGGGAAGTAC AGCTGTGGTG 5340
CTTTTTGGTG CGAGCCTGAG AGTTACCTTT GGTGGTGCAC CCGGCCCTTT TCTCCAGGCG 5400
ACAGCTTTTG GTGTTGAGAG TGTTCTAGCT GCTGGCTCCA GTAGCCTCCT CCTGTCTTAG 5460
GCACCCCCTT CTAACCGGTG CAGGAATGGC CAGCTGTCTT ATCCTTTACT TAGCTATGAG 5520
ATTTGCTTCA ATGGTTGTTG CTGTCTAGTA ACTGGCCAGT GAGCTGTAAT GTGCACTGCT 5580
GGTACCCAGA GCACTACTCC TTCCCTTCCT GCCCCTACTG CTATCACTGC CCTTTGAGGG 5640
TGGGGTTAAT 5650