EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM059-05661 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Forebrain_E11.5 
Coordinate
chr4:54084450-54087400 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:54085795-54085816CTTTTCTTTTTCTTTCTATTT+6.24
RARAMA0729.1chr4:54085042-54085060GAGCTCTAAAGGTCAAGG+6.58
Enhancer Sequence
ATGTGAGTGA GGCAATGGAT GTGGATGCTC ACGTTTATCA AAGGGTTATT GGTGTATTTA 60
ATAGCAAGGG AAACAATGGA GTGTGTCAGA ATCAGGTGAG AACAGACTTG GATACTTCCA 120
GATGGAAGGG AACTATCTTA GGAGAGTTCT CAGTACCTGG CTGGGCCTCA CTCAGGTCAA 180
CCTGAGAAGC AAGAGGAATT TGGACCATTG TAGAAGGGAT TCTCCTCTGT GTCCAAGCTT 240
AAGGACTGCT CAGGCAATGA CAGGAGGAAG GAGGGGTAGA AACTCGCTGT GCAGCTGCGA 300
TTAAAATCAA GAATGAAGAA GTAATGTCCT TGCCAAGCCT GCCAGGGGAC GAGACGAGTA 360
ACTTCAAATC AAACCTCAGT TGATCCGATC TGAAATAGAT TTAAACCAGT TCCCCAAAGC 420
CTGGGTAGGT TTTTAATCAA AACCTGTGTT TCAGGTTCCT TTTGTTAAAG AAATGCCCTT 480
CCGAGATGGA ACACCAAAAC CTCATTAAAT TGCAAACACT GGACTATAAA AGATGGAGAA 540
TGAGCAATTC CATTTAAATT GTGGCTCTGC ACACTTGCCC CACAAGGACA AGGAGCTCTA 600
AAGGTCAAGG CTACACAGCG CAGGGTGAGT GCTTTTCTCT TTCGAACACT AAAGGCTTGG 660
AAAGTGGCCA GTGTGTGTGT GGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 720
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTC TGTGTGTGTC TGTGTCTGTG TCTCTCTCTG TCTGTCTGTC 780
TCTCTCTCTC TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG AGTGAGAGAG AGAGAGAGTG TGTGTGTGTG 840
TGTGTGAGAG AGAGAGAGAG TGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGTGTG 900
TGTGTGTGTG TGTGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG 960
AGAGAGAGAG AATGTACTGC AGTTAGTCTC CTTCCCAAAC GAAACAACCT TTCCATCCTG 1020
AAGGAAAAAG GAAACGGAGA GCCAAAAGCT GCTAACTAGT TGTCTAGCTG TCTATTTGTG 1080
GACACGTCCT TTCATCTTGT CATATCTTTT GTGCTGTTTG AAATGTTTGG AGCTTAGGAG 1140
TGGAGGAACA CTCAGAGGAG TCCAAACTTT TATCAAAAGG AAGAGAGAGG GAGGCAGCAA 1200
AGTTCTGACA ACAAGAGTGT GTTGAAGATG TGGGGGCCAA ATGCTGCCCA AATACTAAGC 1260
AGAGGAATGG TTTATATTTA GCTAAATGAA TAAAAAAAAG ACTTCTATTA AAAATTGTAG 1320
AGATGATAAC TCAAAGGGAG GCAACCTTTT CTTTTTCTTT CTATTTTGTG TGTGTGTGTG 1380
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA GGCTGCTGAG GGACACAAAT GGACCTTAAG AAGGGGTCGG 1440
AGGAGGAGAG GGGCCTCCTT CCCAGGCTTG GCTAGGGTTC CTTTGTGCTG CTCCATTGCA 1500
ATGCTAATTT CTGCTCCTTT GTAGCACTGT AGCTACTGCT TCGCCTCGCT GGAAGCCCTT 1560
TCTCATTCTC TTGTCTTCCG AGGTCTTCAC CAGCTGCTTC TATTAGCTCA GAGCCTTGGG 1620
AGGCTGTGTT TCCCTCCACG TTGTTTTGCC TGGACCTCTT TTTGATTTGA TCGATCCAAT 1680
CCCTGTATTT GATTTTCTTT CCTCCTTGCG TTCTTCGTCG GGGCTTAAAC TACCAAACGA 1740
TGGGATGGCT TCCTTGTCAA AATTAGAAAC TCAAAAGTGG ACCGTCTTGA GAATCCTGGG 1800
TGTTTTCTTT TCTTTTTTTC TTTTTTGCCT TTGACGTTCA TTTTGGAGGA AATGGAGATT 1860
GAAATCTTAG CTGGAGAATC TCTTCAGGGA CTCTGATTTT TCCCTTTAAG AGGAATGAAG 1920
TTCTGAATTA AAATAAATAC CTAGGCTTCA GATGAGGCAT CAGAGAATCA ACAGAGGCCG 1980
GGAGCCTTTG TTTCTGGCTG GCAGTGTGCA CCATCATTAA GGGGAAAGAG CCGAGGGAAT 2040
TCGAGCGCTC AGCCCCCGTA GCCAGTTTTC TTTTTAAACT GGATCTTAAA CATAATGCTC 2100
AGAAAGTATA TTTGAAAGAC TTCTCTGGGT GCCTGTGGTA CAGTGTAGCA ATGACAGATG 2160
GGCAGAAGCT GGAGAGGCAG ATGGGCTGCG CTTTTCTCAT GTCCCGAAAT ACCAACAGTG 2220
TTTGGTTGAT GCATCTCTGT GGTCCTGAGG GCTTTATACC TGGCCTTACA GTGGTGCATG 2280
CTCTTCTCTT CCATACACCA GAAGCAGTTG CTACAGGACA ATAGGGTAAC ATGGTTGGAA 2340
GAACCCAAGC AAGAGTTACC CAGATATGAC TTCTGCCCAA CATCCTCCAA GGACCTTGTT 2400
TAGGGGCAAA AGTTTGTATA GTAATCTTGA TCGGGGCTCT CCGGGGAAGG AAGATCAGGG 2460
CCCATTGGAG AAGGTGTCTG GCCTGGGCAT GAGGGCTTGC TTTCCCATCT GTCACTGTAA 2520
GACTCTGGTG AGCCTTAGTT TACTGGGACT CCCTGAGTGA ACGACGCAGA GCCAGGAATC 2580
CATGAAAAAA GCAAGAAGAA TTTATTGTTC CAACATGTTG GTGTCGCCCT GCACATGGAG 2640
AGAGAGAGAA CAAACACGCA CAGTGAGCCT TTATACAGTT CTCCAGGTAG CAGCAATTAG 2700
GCACAATGTG ATTGGCAGAA CAGTATGACT TTTAAACTGA TTGCTCTTTA GGGAATAAGG 2760
TAGGTGGTCG CAAAATGTGT CTATGAGCTC TGGACTTACC TTCCCACAGG AGGCTGGAGG 2820
TTGGTCCCTC CTCCCCGTGG TCTGAAGAAT GTAATTAGCC CCTCCCTTCT GGAGGGGAGG 2880
GGTGCCTATG GCCGGTCACT TCTAGGAGTG GAGGGGTCCA GTGGAATCTT CTAAAGTTCC 2940
TGAGCTGACC 2950